Nature：用单细胞基因组探索多样性
宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而，环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装，因此，大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今，两个新的大规模研究利用单细胞基因组，直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。 Rinke等人利用荧光活化性细胞分选从9个环境样本中隔离了9，600个单细胞，包括海水、淡水、热液以及沉积物，其中3，330个单扩增基因组(SAG)是通过多重置换扩增得到的。为了识别代表未经培养有机体的基因组，SAG被16S rRNA基因PCR进行了筛选，并且201个SAG被挑选出来按照平均估计40%的基因组完整性进行测序以及草图基因组装配。对这些单细胞基因组进行的系统发育分析揭示了许多新的组群，包括两个新的提议超级类群：Patescibacteria，包含有类群Microgenomates、 Parcubacteria和Gracilibacteria;还有D......阅读全文
古细菌向达尔文叫板
走极端的小怪物 世界上的生物有千千万万，我们熟悉的那些生物往往都是肉眼所见的动植物，比如一些家畜、农作物、观赏树等。其实我们人类属于体型很大的生物了，所以我们站在自己大动物的角度上观察生物界，难免有失偏颇。 201808231534989602349.jpg 比如，很少有人知道
古细菌会感染人类
新华社电 日本研究人员日前宣布，他们发现脑脊髓炎患者体内感染了古细菌。这是医学界首次发现古细菌能感染人类。这一发现有望帮助人们弄清原因不明的慢性病和炎症的原因。 在深海的火山口、陆地的热泉以及盐碱湖等生命难以生存的地方，却生活着一群鲜为人知的古怪微生物——古细菌。它们是一种古老的生物，是地球
古细菌的结构和特征
古细菌(archaeobacteria)（又可叫做古生菌、古菌、古 核细胞或原细菌）是一类很特殊的细菌，多生活在极端的生态环境中。具有原核生物的某些特征，如无核膜及内膜系统；也有真核生物的特征，如以甲硫氨酸起始蛋白质的合成、核糖体对氯霉素不敏感、RNA聚合酶和真核细胞的相似、DNA具有内含子并结合组
探秘婆罗洲巨型洞穴网－发现远古细菌
北京时间9月28日消息，据美国国家地理网站报道，30多年前，科学家在马来西亚的婆罗洲沙捞越姆鲁山国家公园地下发现了一个天然洞穴网络。今年5月，一个英国探险小组对沙捞越姆鲁山洞穴系统进行了新的研究和考察，继续绘制这个蜿蜒曲折的地下网络的结构图。根据他们公布的最新照片，这个洞穴系统确
Science：极端环境下嗜热古细菌的奥秘
发表于国际杂志Science上的一篇研究论文中，来自约克大学的研究人员通过研究揭示了嗜热微生物如何将自身DNA从一代传递给下一代，该研究或为进一步理解超级细菌提供一定思路。 硫化叶菌是古细菌王国的一名成员，其个细菌相似是一种单细胞有机体，可以在日本北海道的温泉中分离得到；一些古细菌往往在平凡的
Nature：用单细胞基因组探索多样性
宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而，环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装，因此，大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今，两个新的大规模研究利用单细胞基因组，直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。 Rinke等人利用荧光活化性细胞分
揭秘古老的古细菌如何帮助解释复杂生命的起源
近日，来自日本的科学家们首次捕捉到了一种非常特殊的微生物，其与可能产生地球上所有复杂生命的微生物相似，相关研究成果发表于国际杂志bioRxiv上，研究者表示，如今他们已经能从古细菌单细胞微生物的一个古老谱系中分离并培养出微生物了，这些微生物表面上看起来像细菌，但实则与只从基因组序列中发现的微生物
研究人员把GCMS用于古细菌化石研究
分析测试百科网讯 研究人员相信，他们使用常用于法医学的GC-MS分析方法，发现了新古典分子化石。 根据微生物学家卡尔·沃斯（Carl Woese）设计的系统，地球上有三个生物领域：细菌、古细菌和真核生物。到目前为止，古细菌的分布情况仍然不清楚，特别是对于可追溯到200多万年的地质时期。这是因为
NAR：古细菌NSun6识别tRNA底物的分子机理
中国科学院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新发表了题为“Archaeal NSun6 catalyzes m5C72 modification on a wide-range of specific tRNAs”的文章，揭示了PH1991确实是P. horikoshii tRNA:m5
Nature解析水平基因转移
尽管在许多真核生物中是突变和有性繁殖驱动了遗传创新，对于生命中独特的单细胞领域：古细菌和细菌而言，水平基因转移是获得新性状的一种关键机制。 水平基因转移, 又称横向基因转移, 指不同于常规的由亲代到子代的垂直基因传递, 能跨越种间隔离, 在亲缘关系或远或近的生物有机体间进行的遗传信息转移. 通
PLOS－Genet：单分子测序技术助力原核生物DNA甲基化研究
近日，刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一项研究论文中，来自美国能源部联合基因组研究院的研究人员对230种古细菌和细菌基因组进行了测序，旨在研究DNA甲基化在原核生物中所扮演的关键角色。 细胞的表观基因组是基因组DNA特殊剪辑发生改变的一个特殊集合，这些表观基因组的改变会影响基因组的
解析古老的单细胞基因组
单细胞的古细菌用肉眼根本看不到，甚至在使用显微镜时，也必须特别用心才能观察到它们。近日由丹麦奥尔胡斯大学地质微生物学中心领导的一个国际研究人员小组，却成功地从海底淤泥中获得了四个古细菌细胞，并绘制出了每个细胞的基因组图谱。这一突破性研究成果发表在著名的《自然》(Nature)杂志上。 “直
张文宏受聘南大！
7月2日上午，南京大学病毒与感染病研究所正式成立。国家传染病医学中心主任、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏，被聘为兼职教授和名誉所长，并现场做了《人类传染病的过去现在及未来》的主题演讲。 演讲中，张文宏提到，从人类与传染病的斗争史来看，病毒将长期存在，今天有新冠病毒，明天可能还会有其他病毒
科学家揭秘古老的古细菌如何帮助解释复杂生命的起源
近日，来自日本的科学家们首次捕捉到了一种非常特殊的微生物，其与可能产生地球上所有复杂生命的微生物相似，相关研究成果发表于国际杂志bioRxiv上，研究者表示，如今他们已经能从古细菌单细胞微生物的一个古老谱系中分离并培养出微生物了，这些微生物表面上看起来像细菌，但实则与只从基因组序列中发现的微生物
宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用
中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水（Acid mine drainage, AMD）中的微生物群落进行研究，相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。 本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样
苏州纳米所用仿生学手段揭示古细菌的酸适应机制
古细菌是一类结构简单、不含细胞核和膜包围细胞器的单细胞生物，常常生存于高温、高盐、高压和极端pH值等极端环境中。古细菌对极端环境的适应机制一直是微生物领域的研究热点之一，但由于受到研究手段的限制，嗜酸古细菌对质子的防御、适应机理尚未完全揭示。 中科院苏州纳米技术与纳米仿生研究所
张文宏：不是我说的
据东方网报道，12月20日下午开始，一段疑似张文宏的音频流传在微信朋友圈中，音频谈到当前新冠感染威胁、家庭防护推荐等多方面话题。但细心的网友发现，此段音频中包含有一些和张文宏医生之前观点相反的意见，甚至还有推销产品的嫌疑，因此，该段音频遭到质疑。这段音频是张文宏医生说的吗？张文宏向东方网回复：“不是
四川农大最新综述介绍CRISPR/Cas系统的研究进展
广泛存在于细菌和古细菌中的CRISPR/Cas系统是通过介导外源DNA降解来实现抵抗病毒和外源DNA入侵的一种适应性免疫保护机制，也是新近发展起来的基因组定点编辑技术。近期来自四川农业大学动物科技学院等处的研究人员从基本结构、作用机制、分类、运用等方面详细地介绍了CRISPR/Cas系统，并分析
张文宏：莫忽视科研行为本身
“创新本身不能被预先设计，也没有既定的方向。”近日，在复旦大学管理学院医疗健康产业峰会圆桌对话环节，国家传染病医学中心主任、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏，围绕“细胞与基因领域技术创新的产业化和国际化”主题，发表了自己的看法。 创新转化为什么有时候很快，有时候又很慢？张文宏认为，如果仅仅
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章，介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为，单分子测序数据能降低测序费用，并带来更多完整的基因组，改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降，测序项目的数量也在不断上升。G
张文宏等获评2020“最美教师”
为热烈庆祝第36个教师节，由中宣部、教育部、中央广播电视总台举办的“闪亮的名字——2020寻找最美教师”发布仪式日前在京举行。在发布仪式上，公布了10位最美教师、1个最美教师团队的先进事迹。 荣获2020年“最美教师”称号的教师有：复旦大学教授张文宏，中国人民大学教授王易，北京航空航天大学教
张文宏称新冠已成常驻病毒
我们都知道新冠肺炎病毒已经存在长达大半年之久了，但是病毒依旧还在传染并未消停，更有消息表示新冠肺炎病毒以后将会成为常伴的病毒，近来张文宏称新冠已成常驻病毒跟着小编一起来看看是怎么回事吧! 转眼已是秋冬季，全球已与新冠病毒抗争了大半年。在预测第二波疫情成为必然、疫情还要延续相当长的时间之后，复旦
南京疫情跨省传播，@张文宏医生－解读！
7月29日凌晨，@张文宏医生 在微博上发声： 南京疫情促使全国经受压力测试，为未来疫情防控提供更多思考。 近期南京疫情跨省传播，成为输入性疫情引发国内传播的新模式。在严格管控疫情和加速疫苗接种的今天发生多省疫情扩散引发公众对于未来的巨大不安，这份不安其实来自对于未来巨大不确定性的不安。 1
刘宏涛：做科普当先立品牌
金秋十月，中国科学院武汉植物园一年一度的“斗菊”大赛又进入了白热化的阶段。 “我们每年都到社区里去，给老百姓赠送菊苗。到秋天举办菊花展时，市民再把自己养的菊花带过来，参加我们的斗菊擂台赛。”中科院武汉植物园园艺中心主任刘宏涛说，“几年下来，这个活动已经发展成很受欢迎的品牌。” 200
陈啸宏：药师要确保合理用药
卫生部副部长陈啸宏发言 第二届中国药师大会在北京召开。卫生部副部长陈啸宏指出，广大药师要以深化医药卫生体制改革为契机，保证生产、流通、使用各环节的药品质量，开展以患者为中心的药学服务等方面发挥重要作用。 为了进一步落实医改各项政策，深入探讨我国医改过程中的有关问题，推动药品生产、经营、使用领域药
刘畊宏新书：别让健康走错路
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506304.shtm8月8日是我国第15个全民健身日，“全民健身，练就对了”新书首发发布会暨全民健身日活动在北京举办，活动邀请《练就自由：开启无限可能的人生》（以下简称《练就自由》）作者、健身教练刘畊宏和
华中农大：利用I型及III型CRISPRCas系统实现基因组编辑
CRISPR-Cas系统广泛存在于细菌和古细菌中，近年来科学家们针对它们的分子机制开展研究促使开发出了基于II型系统的一些基因编辑技术(延伸阅读：中科院Cell发表CRISPR-Cas研究新成果 )。然而，却未有研究报道利用I型及III型系统来实现基因组编辑。 来自华中农业大学的研究人员报告称
科学家发现耐受强酸的“异形生物”
在科幻电影《异形》中，描绘了一个能承受极端酷热和毒性的外星生物。在现实中，具有类似特征的微生物是存在的，例如一种叫做Galdieria的红藻类微生物。 在美国国家黄石公园的热泉环境中，Galdieria能够通过光合作用产生糖类物质。在黑暗的废旧矿坑中，Galdieria以细菌为食，能生活在像电
陈宏础：重视血常规的复检工作
目前血细胞分析仪己经普及到县医院或卫生院，这对提高血细胞常规的准确性和重复性，减轻工作人员劳动强度起促进作用。但是我们应该认识到血细胞分析仪还是一个过筛工具，至今最先进的全自动血细胞分析仪还不能完全取代人工检查，仍然有部分标本需要复检。据我所知有的医院有了血细胞分析仪，把人工操作的工具
许智宏：翩翩江南客－依依草木情
许智宏，1942年10月出生于江苏无锡，植物生理学家，中国科学院院士。现任中国人与生物圈国家委员会专家咨询委员会主席、中国植物园联盟咨询委员会主任、北京大学现代农学院教授；曾任中国科学院副院长、北京大学校长、国际植物组织培养和生物技术协会主席、中国植物生理学会理事长、中国细胞生物学会理事长、北京大学