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半制备规模单链RNA纯化

引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,用于基因敲除、基因分型和诊断目的寡核苷酸通常需要在合成后进行纯化。适合实验室规模寡核苷酸纯化的经济可行的解决方案很少,而现有的方法(比如离子交换色谱分析法和聚丙烯酰胺凝胶电泳法)通常比较繁琐和费时。在本应用说明书中,我们介绍了一种成本低、速度快的中等数量材料的纯化方法,单次进样载量高达140 nmoles,采用沃特世 ACQUITY UPLC?系统和寡核苷酸分离技术(OST)色谱柱化学技术可达到95%以上的最终纯度。所提出的纯化规模与标准的寡核苷酸合成规模匹配良好(50至250 nmol)。下述方法可在15至30分钟时间内......阅读全文

RNA提取纯化的注意事项

由于RNA酶的广泛存在与难以灭活的顽固特性。使得RNA的提取纯化和后续工作变得非常困难。关于 RNA and RNases,你应该了解些什么?RNases 是非常稳定和活跃的一种酶,一般不需要辅助因子的功能,因而在实验室内 RNA 很容易被降解如果不预先消除可能的 RNase 污染,请不要使用任何塑

RNA制备的问题与解答

1、塑料制品、玻璃和金属物品的处理(a)塑料制品:尽可能使用无菌,一次性塑料制品。已标明RNase-Free 的塑料制品,如没有开封使用过,通常没有必要再次处理。对于国产塑料制品,原则上都必须处理方可使用。处理方法如下:(1)在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使DEPC的终浓度为0.1%。注意:

体液样本核酸提取纯化

无细胞体液包括:血浆或血清,脑脊液 ,尿液,其他无细胞体液,细胞培养上清液。QIAamp Viral RNA Mini Kit —— 从无细胞体液中纯化病毒 RNA1)快速纯化高品质病毒 RNA(见图 1)2)无需有机提

赛默飞世尔公司参与推出禽流感快速高通量检测新技术

        赛默飞世尔公司产品KingFisher系列自动化磁珠提取纯化仪器,联合Invitrogen公司Ambion病毒RNA提取试剂盒,将传统方法的禽流感检测由21天缩短至4小时左右。此技术经过美国国家兽医服务实验室(NV

RNA的分离与纯化

包括Northern杂交在内的许多分子生物学实验均是以RNA为材料,mRNA的制备也需要一定质量的总RNA样品,RNA的数量、纯度与完整性将直接影响这些实验的结果。RNA中rRNA的数量最多,占总量的80%~85%;tRNA及核内小分子RNA占15%~20%;mRNA仅占1%~5%。由于各种rRNA

凝胶迁移实验(EMSA)——凝胶迁移

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)可以:(1)研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用;(2)可用于DNA定性和定量分析;(3)用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。实验方法原理一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初

特殊样本核酸纯化方案

快速、方便、高效的纯化实验方案创新的 InhibitEX buffer 高效去除 PCR 抑制剂灵敏度高,适合多种下游应用可在 QIAcube 上自动操作图 22. 从不同粪便样本纯化 DNA 产量从 7 个不同的粪便样本中同时利用 QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit

Thermo Fisher推出最新RNA纯化试剂盒

来自纽约8月3日的消息,Thermo Fisher Scientific这一世界领先的科技公司宣布推出SurePrep™ RNA Purification Kits,这一试剂盒可以从生物样品中捕获所有大小的RNA分子,比如经纯化的全长大分子RNAs,或者是在信号途径中调控基因表达,在细胞死亡,器官发

FFPE样本核酸(DNA/RNA)制备

福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织切片的存档代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料。随着越来越多的研究人员转向 FFPE 样品的分子分析,开发特定的操作步骤,考虑这些样品的独特性质就变得越来越重要。QIAGEN 在 FFPE 样本纯化及下游检测整个流程中都提供完善的解决方案。QIAamp

体外转录合成单链RNA探针

实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 1977)。虽然 DNA 探针仍普遍地应用于 No

体外转录合成单链RNA探针

            实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更

FFPE组织样品的DNA和RNA纯化

福尔马林固定后石蜡包埋的组织简称为FFPE样品。将组织在 4–10% 的福尔马林中迅速固定。 固定时间限制在 14–24 小时 (越长的固定时间将越容易导致DNA的片段化,对下游实验不利)。将固定组织彻底脱水 (彻底脱去福尔马林残余,因为其阻碍蛋白酶K的作用)。 纯化DNA时,使用新鲜从石蜡块上切下

凝胶迁移实验(EMSA)

实验方法原理 凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列

凝胶迁移实验(EMSA)

            实验方法原理 一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的

RNA提取操作注意事项

RNA抽提纯化是分子生物学研究的基本工作内容。但是由于RNA酶的广泛存在和难以灭活的顽固本性,使得RNA的抽提纯化和后续工作特别困难。虽然 Trizol试剂和各类RNA抽提纯化试剂盒的广泛应用使得RNA抽提和纯化不再特别困难,但是涉及RNA的工作仍然是分子生物学研究中最让人头痛的。归根结底,RN

DNA 污染的柱上去除实验

该方案可用于使用硅基 RNA 结合柱的 RNA 分离策略,例如方案 6。然而,可能不会 实现 100% 除去 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒DNA 酶 I 缓冲液DNA 酶 I仪器、耗材细胞裂解液实验步骤一、材料1. 酶和酶缓冲液DNA 酶 I,扩

DNA 污染的柱上去除实验

            试剂、试剂盒 DNA 酶 I 缓冲液 DNA 酶 I 仪器、耗材

DNA 污染的柱上去除实验

试剂、试剂盒 DNA 酶 I 缓冲液 DNA 酶 I仪器、耗材 细胞裂解液实验步骤 一、材料1. 酶和酶缓冲液DNA 酶 I,扩增级(无 RNA 酶)DNA 酶 I 缓冲液,10X2. 细胞和组织利用总 RNA 纯化试剂盒(例如 Madigen 总 RNA 快速纯化系统)获得的细胞裂解液。二、方法1

常规组织样本核酸(DNA/RNA)提取纯化

20 分钟内快速纯化高品质,高产量,即用型 DNA(见图 20)多种规格可选择:Mini Kit 可处理 25 mg 组织,Micro Kit 可处理小于 10 mg 组织完全去除污染物和抑制剂可在 QIAcube 上进行自动化纯化表1 QIAamp DNA Mini Kit纯化各类样本的核酸产量样

小分子RNA——microRNA综述(2)

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted-disruption缺失miRNA序

micro RNA(miRNA)综述-3

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted- disruption缺失miR

核酸提取产品的市场概况和主要品牌

市场概况:2019年,全球核酸分离和纯化市场规模估计为24亿美元,预计在预测期内(2020 - 2027)复合年增长率为7.2%。几个RNA物种代表了一个广泛的、未被开发的生物分子类别,在疾病发展过程中发挥着至关重要的作用。这增强了RNA治疗的渠道,反过来,又推动了核酸分离和纯化方法在药物开发中的应

RT2 Profiler PCR Arrays新手小技巧及注意事项

RT2 Profiler PCR Arrays新手小技巧及注意事项(做了几百次PCR Array的Matt Finley博士的经验之谈) RNA纯化和分析: 起始RNA样品的质量是成功实验的最重要的因素之一。我强烈推荐使用QIAGEN的RNA纯化试剂盒来进行RNA纯化。RNA样品必须进行柱上DNa

生物芯片入门(三):基因表达谱芯片实验操作1

待检测样品制备生物样品往往是非常复杂的生物分子混合体,除少数特殊样品外,一般不能直接与芯片反应,必须将样品进行生物处理。从血液或活组织中获取的DNA/mRNA样品在标记成为探针以前必须扩增以提高阅读灵敏度,但这一过程操作起来却有一定的难度。比如在一个癌细胞中有成千上万个正常基因的干扰,杂合癌基因的检

植物组织RNA提取的难点及对策

植物组织RNA提取的难点及对策  从植物组织中提取RNA是进行植物分子生物学方面研究的必要前提。要进行Northern杂交分析,纯化mRNA以用于体外翻译或建立cDNA文库,RT-PCR及差示分析等分子生物学研究,都需要高质量的RNA。因此,从植物组织中提取纯度高、完整性好的RNA是顺利进行上述研究

植物组织RNA提取的要点与技巧

从植物组织中提取RNA 是进行植物分子生物学方面研究的必要前提。要进行Northern杂交分析,纯化mRNA 以用于体外翻译或建立cDNA文库,RT-PCR及差示分析等分子生物学研究,都需要高质量的RNA 。因此,从植物组织中提取纯度高、完整性好的RNA 是顺利进行上述研究的关键所在。从文献报道上看

多羟基反应单克隆抗体的鉴定、生产和使用

所有形式的亲和层析法都需要两个组分间形成特异性相互作用,通过这种作用可以纯化其中一种组分。免疫亲和层析即利用抗原和抗体的特异性相互作用,是遵循亲和层析原理的一个分类 [综述见 Subramanian(2002)]。事实上,免疫亲和层析是免疫沉淀程序规模放大的拓展应用,不同的部分在于, 层析后需要回收

多羟基反应单克隆抗体的鉴定、生产和使用——免疫亲和层析

实验步骤 一、多羟基反应单克隆抗体 我们最先使用了一类特殊的单克隆抗体, 并将其用于免疫亲和层析。这些抗体可以用于温和的免疫亲和层析, 因为洗脱条件只需要联合使用无离液盐和低分子质量的多羟基化合物 (多元醇),此条件下蛋白质呈非

抗原的制备方法-2

表2-1 室温下由S1提高到S2时每升加固体硫酸铵的克数  0.10 0.20 0.25 0.30 0.35 0.40 0.45 0.50 0.55 0.60 0.65 0.70 0.75 0.80 0.85 0.90 0.95 1.00 0 55 113 114 175 209 242

抗原的制备-2

 2.核酸的分离纯化  从细胞中提取核酸后,仍混杂着蛋白质、多糖和各种大小分子核酸同类物。除去这些“杂质”的过程,也就是核酸提纯过程。在核酸的分离纯化时,为防止核酸大分子的变性降解,必须在0~4℃的低温条件下操作。核酸酶的水解作用,是过去制备具有活性核酸大分子的严重障碍,现普遍采用加入去污剂或加入E