半制备规模单链RNA纯化

引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,用于基因敲除、基因分型和诊断目的寡核苷酸通常需要在合成后进行纯化。适合实验室规模寡核苷酸纯化的经济可行的解决方案很少,而现有的方法(比如离子交换色谱分析法和聚丙烯酰胺凝胶电泳法)通常比较繁琐和费时。在本应用说明书中,我们介绍了一种成本低、速度快的中等数量材料的纯化方法,单次进样载量高达140 nmoles,采用沃特世 ACQUITY UPLC?系统和寡核苷酸分离技术(OST)色谱柱化学技术可达到95%以上的最终纯度。所提出的纯化规模与标准的寡核苷酸合成规模匹配良好(50至250 nmol)。下述方法可在15至30分钟时间内......阅读全文

半制备规模单链RNA纯化

引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,

半制备规模单链RNA纯化

  寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,

半制备规模单链RNA纯化(二)

图2中所示被选中的馏份收集窗表示不同的质量负荷。峰值采集后,样品可以根据需要对等分和干燥,以便长期储存。TEAA的挥发性使离子对缓冲组分的去除非常容易。溶剂蒸发后被纯化的寡核苷酸实际上是不含盐的。 UPLC条件纯化RNA寡核苷酸的纯度通过ACQUITY UPLC系统来验证。如图3所示,我们的纯化方法

半制备规模单链RNA纯化(一)

Sean M. McCarthy and Martin GilarWaters Corporation, Milford, MA, U.S.引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一

单链RNA的结构特点

中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定  义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与

细胞化学词汇单链RNA

中文名称:单链RNA英文名称:single-stranded RNA;ssRNA定  义:只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科)

单链RNA的基本信息

中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定  义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与

单链RNA的基本信息介绍

  一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。 (1)正链RNA病毒(如脊髓灰质炎病毒)的ssRNA可直接起mRNA作用,转译早期蛋白质,包括RNA多聚酶和抑制宿主细胞合成代谢的调控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下,以ssRNA(正链)为模板

纯化RNA实验——从组织中纯化总RNA

实验材料组织试剂、试剂盒RNA 抽提缓冲液氯仿实验步骤1. 从动物取下组织,直接进行第 2 步或在液氮中快速冷冻新鲜解剖的组织。冷冻后的组织可以贮存在 -70℃。2. 组织(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提缓冲液中匀浆。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均匀,冰浴 15 分钟

纯化RNA实验

从培养的细胞中纯化总RNA 从组织中纯化总RNA             实验材料 细胞

研究揭示正单链RNA病毒编码小蛋白新策略

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510524.shtm

Science:重大进展!开发出单链DNA/RNA折纸术

  DNA折纸术科学家们正在梦想着各种各样的比人的头发小一千倍的形状,并希望这些形状有朝一日引发计算、电子学和医学变革。  如今,在一项新的研究中,来自美国亚利桑那州立大学和哈佛大学的研究人员在DNA纳米技术上取得一项重大的新进展。他们开发出的一种被称作单链折纸术(single-stranded o

利用-Marligen-总-RNA-快速纯化系统纯化总-RNA-实验

由 Marligen Biosciences 提供的 Rapid Total RNA System 可从各种样品中提取 RNA,且产量和质量非常稳定。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇β-巯基乙醇仪器、耗材转子-定子均化器或类似设备Marligen Rap

纯化RNA实验——从培养的细胞中纯化总RNA

实验材料细胞试剂、试剂盒RNA 提取缓冲液变性液水饱和酚仪器、耗材培养皿Falcon 2063 管实验步骤1. 取 1 个细胞已长满的 100 ml 培养皿,吸出培养液,加 2 ml RNA 提取缓冲液,用橡胶刮棒刮下细胞。RNA 提取缓冲液:变性液,20 mlβ-巯基乙醇,0.144 ml2 mo

利用-Marligen-总-RNA-快速纯化系统纯化总-RNA-实验

试剂、试剂盒 乙醇β-巯基乙醇仪器、耗材 转子-定子均化器或类似设备 Marligen Rapid Total RNA System实验步骤 一、材料1.缓冲液、溶液和试剂乙醇,70%和100%β-巯基乙醇2.特殊设备转子-定子均化器或类似设备3.其他Marligen Rapid Total RNA

利用-Marligen-总-RNA-快速纯化系统纯化总-RNA-实验

            试剂、试剂盒 乙醇 β-巯基乙醇 仪器、耗材 转子-定子均化器或类似设备 Marligen Ra

RNA提取与纯化

实验概要掌握RNA提取的基本技术,了解RNA提取过程中的各种注意事项。实验原理RNA提取是分子生物学实验中难度较大的实验技术。 RNA提取和DNA提取有类似的地方,因为它们都是核酸,都具有较好的水溶性。提取RNA首先破碎细胞,然后用提取液将RNA溶出,反复抽提去除蛋白质,加入乙醇沉淀RNA,将RNA

分离纯化总RNA

1)      用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取纯化组织和细胞中的RNA1.      选取从组织细胞或细胞中提取RNA的适宜方法组织a.       分离组织并立即置于液氮中。b.      将约100 mg冰冻组织含液氮的研钵中,用研棒研磨。研磨过程中可加入液氮使组织保持冰冻状态。c.       

新型跨界侵染植物与真菌负单链RNA病毒被发现

西北农林科技大学植物保护学院教授孙丽英课题组发现了一种新型跨界侵染植物与真菌的负单链RNA病毒(VmNSRV1),相关研究成果近日发表在PNAS上。  ?该研究发现的新型真菌病毒VmNSRV1分离自苹果树腐烂病的病原菌(Valsa mali)。(课题组供图)该研究发现的新型真菌病毒VmNSRV1分离

新型跨界侵染植物与真菌负单链RNA病毒被发现

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519441.shtm西北农林科技大学植物保护学院教授孙丽英课题组发现了一种新型跨界侵染植物与真菌的负单链RNA病毒(VmNSRV1),相关研究成果近日发表在PNAS上。   ?该研究发现的新型真菌

使用-Trizol-纯化-RNA-实验

RNA 分离的酚基试剂的生产以 Chomczynski 方案为基础。这些方案在从富含 RNA 酶的组织如胰腺中获取 RNA 时最有用。这里介绍的是随 Invitrogen 的 Trizol 试剂出售的方案的摘要,经 Invitrogen 允许做了修改。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:

RNA的分离与纯化

包括Northern杂交在内的许多分子生物学实验均是以RNA为材料,mRNA的制备也需要一定质量的总RNA样品,RNA的数量、纯度与完整性将直接影响这些实验的结果。RNA中rRNA的数量最多,占总量的80%~85%;tRNA及核内小分子RNA占15%~20%;mRNA仅占1%~5%。由于各种rRNA

Poly(A)+RNA的分离纯化

1)      Poligo(dT)-纤维素层析法提取poly(A)+RNA装柱与填柱1.      取oligo(dT)-纤维素0.5~1.0 g,用0.1 mol/L NaOH重悬。2.      用oligo(dT)-纤维素(0.5~1.0 ml柱体积)灌注DEPC处理过的一次性柱子(或塞以无

使用-Trizol-纯化-RNA-实验

实验材料 磨细的组织试剂、试剂盒 Trizol氯仿异丙醇乙醇DEPC处理过的水实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂Trizol(Invitrogen)氯仿异丙醇乙醇,75%,用焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的水配制DEPC 处理过的水2. 细胞和组织50~100 mg 已磨细的组织二、方法1

使用-Trizol-纯化-RNA-实验

            实验材料 磨细的组织 试剂、试剂盒 Trizol 氯仿 异丙醇 乙醇

生物素化寡聚脱氧胸苷链亲和素磁珠纯化带-Poly(A)+RNA

用磁性微球代转纤维索作为介质,这种方法比较常用且已商品化。试剂、试剂盒GTC 抽提缓冲液稀释缓冲液 β-巯基乙醇无 RNase 水20XSSC0.5XSSC1XPBS。仪器、耗材亲和素-磁珠 (SA-PMP)生物素标记的 oligo(dT) 探针磁架75℃ 水浴50 ml 无菌 Corex 离心管1

生物素化寡聚脱氧胸苷链亲和素磁珠纯化带-Poly(A)+RNA

生物素化寡聚脱氧胸苷-链亲和素磁珠纯化带 Poly(A)+RNA             试剂、试剂盒 GTC 抽提缓冲液   稀释

生物素化寡聚脱氧胸苷链亲和素磁珠纯化带-Poly(A)+RNA

试剂、试剂盒 GTC 抽提缓冲液 稀释缓冲液 β-巯基乙醇 无 RNase 水 20XSSC 0.5XSSC 1XPBS。仪器、耗材 亲和素-磁珠 (SA-PMP)生物素标记的 oligo(dT) 探针 磁架 75℃ 水浴50 ml 无菌 Corex 离心管 15 ml 螺旋盖锥形离心管 Tissu

动物组织RNA提取及纯化

实验概要提取样品组织中的RNA并消除DNA污染实验原理Trizol裂解细胞使RNA释放beta巯基乙醇一直RNase活性酚-氯仿抽提分离RNARNase-Free DNase消除DNA污染主要试剂Trizol无水乙醇氯仿(三氯甲烷)异丙醇RQ1 RNase-Free DNase(Promega,M6

样品RNA的分离与纯化

含106个细胞液加等量纯化溶液[4mol/L胍基硫氰酸盐,25mmol/L柠檬酸pH7.0,0.5%肌氨酸(sarcosyl),0.1mol/l 2-巯基乙醇]。总体积为细胞沉淀4-5倍,混匀。加0.1体积2ml/L乙酸钠(pH4.1),1体积酚(重蒸水上封),0.2体积CIAA,混匀器剧烈