合成工具dCas9在DNA中传递信息
莱斯大学的研究人员已经证明，CRISPR-Cas9作为一种越来越出名的基因编辑工具，可以在人类细胞中以更强大的方式使用。由莱斯大学生物工程师艾萨克斯·希尔顿(Isaac Hilton)和研究生王开元(Kaiyuan Wang)领导的团队使用失活Cas9 (dCas9)蛋白靶向人类基因组的关键片段，并合成触发人类基因的转录。通过使用dCas9招募可以自然启动基因的蛋白质，、团队能够揭示人类启动子和增强子的重要细节——我们的DNA片段在何时以及在何种程度上启动，从而控制我们细胞的行为。Hilton说:“我们正在使用这些合成生物学工具来提高基因表达和人类细胞编程的能力，从而更好地理解我们的基因是如何自然工作的。这些类型的研究很重要，因为从长远来看，这些知识和技术能力可以实现更好的基因和细胞治疗和生物技术。”Hilton表示，《Nucleic Acids Research》的研究突出了基于CRISPR-Cas9的工具在合成基因控制和细胞......阅读全文
Nature－Methods：提高Cas9靶向范围和精度的突破性技术
由麻省大学医学院分子、细胞和癌症生物学副教授Scot A Wolfe领导的一个研究小组报告称，他们开发了一项新技术通过融合可编程的DNA结合结构域(pDBD)和Cas9，可显著提高Cas9的精度及扩大它的靶向范围。这项研究成果发布在10月19日的《自然方法》（Nature Methods）杂志上
齐磊博士Cell发布CRISPRi研究新成果
来自斯坦福大学、加州大学旧金山分校的研究人员报告称，他们利用CRISPR干扰（CRISPRi）技术，对枯草杆菌的必需基因进行了全面的功能分析。这项研究发布在5月26日的《细胞》（Cell）杂志上。 斯坦福大学的齐磊（Lei S. Qi）博士、Kerwyn Casey Huang博士，以及加州大
齐磊博士Cell发布CRISPRi研究新成果
来自斯坦福大学、加州大学旧金山分校的研究人员报告称，他们利用CRISPR干扰（CRISPRi）技术，对枯草杆菌的必需基因进行了全面的功能分析。这项研究发布在5月26日的《细胞》（Cell）杂志上。 斯坦福大学的齐磊（Lei S. Qi）博士、Kerwyn Casey Huang博士，以及加州大
刘小乐教授：CRISPR高通量筛选的新算法
高通量的CRISPR筛选，已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日，华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授，在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualiz
新型的显微镜平台可快速经济地检测致病变异
弗吉尼亚联邦大学物理学系的研究人员Sean R Koebley和Jason Reed采用高速原子力显微镜（HS-AFM）对标记的DNA进行成像，有效分辨率可达15 bp。 新一代测序（NGS）的出现激发了精准医疗或个性化医疗的梦想。如今人们有望根据个人的遗传代码、生活方式和环境来设计最佳的疗法
南京大学黄行许：连发CRISPR/Cas9重要研究成果
南京大学模式动物研究所的黄行许（Xingxu Huang）教授，是近年来基因组编辑领域的风云人物之一。其实验室不仅首次在世界上利用CRISPR/Cas9进行了大鼠的条件性基因敲除，还通过原核注射实现了世界上首次猴基因敲除。这些成果在国际上受到广泛的瞩目。 近期黄行许教授课题组接连在CRISPR
刘小乐、张锋CRISPR最新论文
最近，来自哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究院、哈佛大学统计系和麻省理工学院-哈佛大学布罗德研究所的研究人员，在国际基因组研究权威期刊《Genome Research》发表题为“Sequence determinants of improved CRISPR sgRNA design”
马涵慧博士再发CRISPR研究成果
最近在《Journal of Cell Biology》发表的一项研究中，美国麻省大学医学院的科学家，揭示了“CRISPR-Cas9机器在活细胞内如何运作”的重要新细节，对于开发使用强大基因编辑工具的治疗方法，具有重要的意义。 本文通讯作者、生物化学与分子药理学教授Thoru Pederson
Nature子刊|碱基编辑器新拓展
作为Cas9核酸酶的进化祖先，IscB蛋白作为紧凑RNA引导的DNA内切酶和缺口酶，使其成为碱基编辑的强有力候选者。然而，目标范围狭窄限制了IscB系统的应用;因此，有必要找到更多识别不同靶邻基序(TAMs)的IscB。2024年8月15日，辉大基因张海南、李彤、复旦大学黄锦海、中科院脑科学与智能技
黄行许教授连发CRISPR研究成果
南京大学模式动物研究所的黄行许（Xingxu Huang）教授，是近年来基因组编辑领域的风云人物之一。其实验室不仅首次在世界上利用CRISPR/Cas9进行了大鼠的条件性基因敲除，还通过原核注射实现了世界上首次猴基因敲除，这些成果在国际上受到广泛的瞩目。近期，黄行许教授课题组接连在CRISPR/
常兴团队NatureMethods发布CRISPR新工具
人们已经发现了大量与人类疾病有关的单核苷酸变异，其中许多是功能获得性突变，会导致蛋白质的氨基酸置换或者形成转录因子的新结合位点。然而现有筛选方法（包括CRISPR、CRISPRi和RNAi）只能破坏一个基因或者改变其表达水平，难以引入一系列功能获得性突变进行高通量筛选，亟需能有效作用于哺乳动物细胞的
清华汪小我等人开发CRISPR－sgRNA设计工具
CRISPR/Cas9系统，是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术，包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA（sgRNA）。然而，这仍然是具有挑战性的，因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑，但是目前还没有设计出用于基因调控
详解CRISPR基因编辑技术的利与弊
说到基因编辑，大家都会想起CRISPR技术。这个当年名声大噪的技术，现今依旧热度不减，尤其是我们的CRISPR大神张锋，近期发表的文章频频亮相于知名杂志，又引起一片热议。时过境迁，CRISPR技术并没有销声匿迹，一直在线。但任何事物包括技术有利就有弊，CRISPR技术当然也毫不例外。 CR
复旦研制诱导基因编辑ZFN靶向切除近10kb－全长HIV1前病毒
近日，复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室朱焕章课题组设计并构建出只在HIV感染细胞上才能切除HIV-1前病毒的诱导型锌指蛋白核酸酶（ZFN-Tat），避免了ZFN持续表达可能引起的潜在脱靶效应，为该技术在临床上安全、有效地应用奠定了基础。相关研究结果近日发表在国际知名期刊《Molecu
新型冠状病毒试剂盒研发用CRISPRCas13a蛋白说明书
Cas13a是VI型CRISPR-Cas系统效应蛋白，具有RNA介导的RNA酶切活性，是目前第二大类CRISPR-Cas系统发现的唯一能够降解RNA的蛋白，Cas9, Cpf1, C2c1均是由RNA介导的DNA核酸内切酶，对开发研究RNA工具，扩展CRISPR系统在基因编辑方面的运用具有重大价
Nature重磅：首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑
近年来，微生物组研究揭示了体内的共生细菌表达的基因通过多种机制影响我们的健康。例如，体内的细菌还能够影响癌症免疫疗法的效果；细菌蛋白质与神经退行性疾病和自身免疫性疾病有关；细菌毒素能够引发包括癌症在内的一系列急性和慢性疾病；细菌能够改变或隔离药物，影响治疗效果。这些研究和发现激发了人们对操纵微生
Nature重磅：首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑
近年来，微生物组研究揭示了体内的共生细菌表达的基因通过多种机制影响我们的健康。例如，体内的细菌还能够影响癌症免疫疗法的效果；细菌蛋白质与神经退行性疾病和自身免疫性疾病有关；细菌毒素能够引发包括癌症在内的一系列急性和慢性疾病；细菌能够改变或隔离药物，影响治疗效果。这些研究和发现激发了人们对操纵微生
利用I型CRISPR/Cas系统对人细胞进行靶向转录调节
在一项新的研究中，美国杜克大学生物医学工程副教授Charles Gersbach、Gersbach实验室博士后研究员Adrian Oliver及其团队首次描述了他们如何成功地利用I型CRISPR系统开启和关闭基因，并对人细胞中的表观基因组进行编辑。他们希望这能够极大地扩展生物医学工程师可用的基于
新型免疫疗法有望治疗癌症
近日，耶鲁大学的研究团队开发了一种新的癌症免疫疗法，可利用CRISPR技术激活多个癌症相关内源基因，帮助人体免疫系统识别、攻击并杀死癌细胞。初步研究结果表明，基于CRISPR激活（CRISPRa）平台的多重激活内源基因免疫疗法（MAEGI，Multiplex Activation of Endo
在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术（一）
摘要：CRISPR/Cas9基因组编辑技术和新一代测序技术（也称高通量测序技术），是当今对生命科学研究有重大影响的两项技术。二者并非毫不相干。有效地将二者联用，有时可以大大加速科研进程。两者之间有什么样的联系呢？在哪些研究领域或方向上可以联用呢？上海伯豪生物根据在这两个领域的技术服务经验，对相关内容
多样化C－to－T植物碱基编辑器被开发
近日，电子科技大学张勇教授、马里兰大学YiPing Qi博士、扬州大学张韬教授课题组合作于《Plant Biotechnology Journal》发表了题名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur
人为TAD重组对细胞命运转变起到推动作用
真核细胞染色体通常会有序的折叠，在空间上会形成有序的三维结构。这些三维结构由大到小主要分为区室分隔（compartments）、拓扑相关结构域（Topological-Associated Domains, TADs）以及染色质环状结构（loops）等。细胞命运转变过程中往往伴随着染色体三维结构
CRISPR基因编辑技术的利与弊
说到基因编辑，大家都会想起CRISPR技术。这个当年名声大噪的技术，现今依旧热度不减，尤其是我们的CRISPR大神张锋，近期发表的文章频频亮相于知名杂志，又引起一片热议。时过境迁，CRISPR技术并没有销声匿迹，一直在线。但任何事物包括技术有利就有弊，CRISPR技术当然也毫不例外。CRISPR技术
CRISPR分子诊断技术（七）
39 加上Cas9，它们为分子诊断和基因编辑提供了多样灵活的工具。图片来源：参考资料240 CRISPR分子诊断技术并不是只有Doudna和张锋两家在开发。2019年3月，在Keck Graduate Institute任职的Kiana Aran博士与合作者在Nature Biomedic
详解CRISPR基因编辑技术的利与弊
说到基因编辑，大家都会想起CRISPR技术。这个当年名声大噪的技术，现今依旧热度不减，尤其是我们的CRISPR大神张锋，近期发表的文章频频亮相于知名杂志，又引起一片热议。时过境迁，CRISPR技术并没有销声匿迹，一直在线。但任何事物包括技术有利就有弊，CRISPR技术当然也毫不例外。 CR
热点、新技术、新方法获批自然科学基金项目“新套路”！
国自然每年都会出现新的热点，从gene到miRNA到LncRNA到circRNA，从SNP到GWAS到三代测序到单细胞测序，从坏死到凋亡到自噬到焦亡，以及大火的肠道微生物，外泌体，间充质干细胞等bulabula。从热点出发，将新的热点与自己的研究领域相结合，将为申请到国自然的添加重要砝码。申请国
CRISPR/Cas9成功抑制艾滋病病毒HIV1的多个感染步骤
近日，中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所郭斐课题组在基因治疗领域著名期刊 Human Gene Therapy 杂志发表题为：CRISPR/Cas9 inhibits multiple steps of HIV‐1 infection的研究论文，使用CRISPR/Cas9技术成功抑制
基因“剪刀”－如何撬动几十亿美元大市场
2017年十大科学突破中，“精准定位的基因编辑”榜上有名，研究人员修改了基因编辑工具，做到“精确到点”的修改，这使得基因“剪刀”在未来可能撬动更大的市场。 软软的、十几纳米大小，核酸酶的“微观照”更像一大团“棉花糖”。百科上这样介绍它：它的发现和采用，使基因的“编辑”，包括插入、删失
基因“剪刀”：如何撬动几十亿美元大市场
2017年十大科学突破中，“精准定位的基因编辑”榜上有名，研究人员修改了基因编辑工具，做到“精确到点”的修改，这使得基因“剪刀”在未来可能撬动更大的市场。 软软的、十几纳米大小，核酸酶的“微观照”更像一大团“棉花糖”。百科上这样介绍它：它的发现和采用，使基因的“编辑”，包括插入、删失、融合等操
陈建军/杨建华/何川/黄刚－揭示RNA－m6A由组蛋白修饰决定
近年来，RNA表观遗传学的研究发现RNA甲基化修饰，特别是m6A甲基化修饰，在哺乳动物的转录组中广泛存在，并且在多种生理和病理过程中发挥着重要的生物学功能，引领了RNA以及表观遗传学领域的又一个热潮。高通量测序揭示在人和小鼠的转录组中有1/3-1/2的mRNA转录本具有m6A修饰【1，2】。理论