Structure:损伤DNA末端降解过程机制
2022年7月15日,浙江大学生命科学学院赵烨教授、华跃进教授联合浙江大学医学院郭江涛教授团队在CellPress旗下的Structure杂志发表了题为“Mechanisms of helicase activated DNA end resection in bacteria”的研究成果。该论文使用冷冻电镜首次解析了细菌中的损伤DNA末端降解复合体HerA-NurA完整八聚体复合物的结构,并结合生化实验发现NurA延伸到中央孔径的N端区域(ENR)调节了HerA-NurA的解旋酶和核酸酶活性,揭示了细菌中有别于古菌的DNA末端切除机制。内源性和外源性的胁迫会造成各种类型的DNA损伤,其中DNA双链断裂(DSB)被认为是最为严重的一种DNA损伤类型,如不能及时修复将极大的影响基因组的稳定性,导致早衰,恶性肿瘤等重大疾病的发生。同源重组修复途径是DSB修复的重要方式之一,其首先依赖于对损伤DNA的末端降解步骤(end resect......阅读全文
什么是DNA末端复制
端粒是染色体末端的DNA重复序列,作用是保持染色体的完整性。细胞分裂一次,由于DNA复制时的方向必须从5'方向到3'方向,DNA每次复制端粒就缩短一点(参见冈崎片段)。一旦端粒消耗殆尽,染色体则易于突变而导致动脉硬化和某些癌症。因此,端粒和细胞老化有明显的关系。一直以来都知道精、卵细
DNA双链末端的概念
中文名称平端英文名称blunt end定 义DNA双链末端平齐而无突出单链。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
末端标记DNA探针技术
现以Klenow片段标记3'末端为例说明末端标记的方法。1、材料:待标记的双链含凹缺3'末端的DNA。2、设备:高速台式离心机,水浴锅等。3、试剂:(1)3种不含标记的dNTP各为200mmol/L。(2)合适的限制酶。(3)[α-32P] dNTP:3000Ci/mmol, 10m
Structure:损伤DNA末端降解过程机制
2022年7月15日,浙江大学生命科学学院赵烨教授、华跃进教授联合浙江大学医学院郭江涛教授团队在CellPress旗下的Structure杂志发表了题为“Mechanisms of helicase activated DNA end resection in bacteria”的研究成果。该论文使
DNA测序——双脱氧链末端终止法
实验方法原理DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3'-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3'-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3'-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。 本实验根据此原理,将待测DNA片段插入单链噬菌体M13载体,
向平末端DNA连接合成接头实验
实验方法原理 接头是指合成的能够自身互补的 DNA 片段,一般长 8~16 个核苷酸,互补的片段复性后可形成平末端的含有一个酶切位点的双链分子。 实验材料
向平末端DNA连接合成接头实验
实验方法原理 接头是指合成的能够自身互补的 DNA 片段,一般长 8~16 个核苷酸,互补的片段复性后可形成平末端的含有一个酶切位点的双链分子。实验材料 T4 噬菌体连接酶T4 噬菌体多聚核苷酸激酶限制性内切核酸酶外源或目的 DNA 片段试剂、试剂盒 乙酸胺ATP乙醇10X 接头激酶缓冲液MgCl2
向平末端DNA连接合成接头实验
接头是指合成的能够自身互补的 DNA 片段,一般长 8~16 个核苷酸,互补的片段复性后可形成平末端的含有一个酶切位点的双链分子。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理接头是指合成的能够自身互补的 DNA 片段,一般长 8~16 个核苷酸,互补的片段复性后可形成平末端的含有一个
线形质粒DNA-5粘性末端去磷酸实验
实验材料 质粒试剂、试剂盒 CIAPEDTABUFFER酚-氯仿乙醇TE仪器、耗材 水浴锅抽干机实验步骤 1、质粒DNA和CIAP以及BUFFER 37 ℃水浴30min 2、补充CIAP 再37 ℃水浴30min 3、加入50 mM EDTA至终浓度5 mM 75 ℃加热10min 失活CIAP
末端标记法介绍DNA探针的标记方法
末端标记法不是将DNA进行全长标记,只在其5'端或3’端导入标记物进行部分标记。该标记方法可得到全长DNA探针,因为携带的标记分子较少,所以标记比活性不高。
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验——标记DNA的3‘末端
实验方法原理选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量标志物。放射自显影带的强度与片段长度无关,标记DNA可稳定数月之久。 实验材料DNA试剂、试剂盒dNTP仪器、耗材水浴锅实验步骤1. 在20 μl 反应体积中,用可产生5’突出端的限制性内切酶消化0.1~0.4 μg DNA。 2.
线形质粒DNA-5粘性末端去磷酸实验——抽提法
实验材料质粒试剂、试剂盒CIAPEDTABUFFER酚-氯仿乙醇TE仪器、耗材水浴锅抽干机实验步骤1、质粒DNA和CIAP以及BUFFER 37 ℃水浴30min 2、补充CIAP 再37 ℃水浴30min 3、加入50 mM EDTA至终浓度5 mM 75 ℃加热10min 失活CIAP 4、冷却
双脱氧ATP末端标记双链DNA的3突出端
实验材料 限制性内切核酸酶 小牛胸腺末端转移酶 模板 DNA 试剂、试剂盒 乙酸铵
DNA损伤修复机制——非同源末端链接NHEJ和同源重组HR
生命极其脆弱,我们每天在电子辐射、紫外线、雾霾等等各种外部环境及细胞代谢产物等内源因素影响下,我们生命的核心-DNA都会受到不同程度的损伤,其中DNA双链断裂(DSBs,Double strand breaks)是损伤中最为严重的一种,然而生命却又极其强大,我们无时无刻不在受伤,也无时无刻不在自
DNA损伤修复机制——非同源末端链接NHEJ和同源重组HR
生命极其脆弱,我们每天在电子辐射、紫外线、雾霾等等各种外部环境及细胞代谢产物等内源因素影响下,我们生命的核心-DNA都会受到不同程度的损伤,其中DNA双链断裂(DSBs,Double strand breaks)是损伤中最为严重的一种,然而生命却又极其强大,我们无时无刻不在受伤,也无时无刻不
DNA损伤修复机制——非同源末端链接NHEJ和同源重组HR
【干货】拯救你受伤的DNA-NHEJ与HR生命极其脆弱,我们每天在电子辐射、紫外线、雾霾等等各种外部环境及细胞代谢产物等内源因素影响下,我们生命的核心-DNA都会受到不同程度的损伤,其中DNA双链断裂(DSBs,Double strand breaks)是损伤中最为严重的一种,然而生命却又极
高容量载体中基因组DNA片段末端的分离(小载体PCR)
实验方法原理 许多真核生物的基因所包含的 DNA,远非单个重组子所能容纳得了的。对于大多数染色体来说,更是如此。因此,必须构建一套重叠的 DNA 克隆,这些克隆的 DNA 按次序排列能形成叠连序列(叠连群),可以涵盖一个很大的基因或目的区域。实验材料 T4 噬菌体 DNA 连接酶限制性内切核酸酶 P
高容量载体中基因组DNA片段末端的分离(小载体PCR)
许多真核生物的基因所包含的 DNA,远非单个重组子所能容纳得了的。对于大多数染色体来说,更是如此。因此,必须构建一套重叠的 DNA 克隆,这些克隆的 DNA 按次序排列能形成叠连序列(叠连群),可以涵盖一个很大的基因或目的区域。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理许多真核生物
高容量载体中基因组DNA片段末端的分离(小载体PCR)
实验方法原理 许多真核生物的基因所包含的 DNA,远非单个重组子所能容纳得了的。对于大多数染色体来说,更是如此。因此,必须构建一套重叠的 DNA 克隆,这些克隆的 DNA 按次序排列能形成叠连序列(叠连群),可以涵盖一个很大的基因或目的区域。
PCR扩增在扩增DNA产物末端引入限制性核酸内切酶酶切位点
实验方法原理实验材料噬菌体 T4 DNA 连接酶限制性内切核酸酶靶 DNA试剂、试剂盒氯仿EDTA乙醇酚氯仿乙酸钠TE仪器、耗材琼脂糖凝胶水浴箱实验步骤一、材料1. 缓冲液与溶液氯仿EDTA ( 0.5 mol/L, pH 8.0)乙醇酚:氯仿(1:1,V/V)乙酸钠(3 mol/L, pH 5.2
5’末端DNA探针同位素([γ32P]ATP)激酶标记试剂盒
5’末端DNA探针同位素([γ32P]ATP)激酶标记试剂盒产品说明书(中文版) 主要用途 5’末端DNA探针同位素([γ32P]ATP)激酶标记试剂是一种旨在针对目标片段DNA、寡核苷酸引物、衔接体(LINKER)、线性载体等,使用多聚核苷酸激酶的正向反应,进行5’末端同位素标记处
PCR扩增在扩增DNA产物末端引入限制性核酸内切酶酶切位点
实验方法原理 实验材料 噬菌体 T4 DNA 连接酶 限制性内切核酸酶 靶 DNA
什么是还原末端?
还原末端是指寡糖或多糖链中有游离半缩醛羟基或半缩酮基的一端。
突出末端的结构
中文名称突出末端英文名称protruding terminus定 义由限制性内切酶作用于DNA产生的黏性末端的突出单链部分。有5`端突出和3`端突出两种情况。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验——修复突出的3’或5‘末端
Klenow酶是大肠杆菌八聚合酶I的羧基端片段,它具有DNA聚合酶和3’到5’方向的外切酶活性,不含5’到3”方向的外切酶活性。实验材料DNA试剂、试剂盒限制性内切酶EDTA仪器、耗材水浴锅实验步骤1. 在20 μl 反应体积中,用限制性内切酶消化0.1~4 μg DNA。2. 加入1 μl 0
通过PCR扩增在扩增DNA产物末端引入限制性核酸内切酶酶...
通过PCR扩增在扩增DNA产物末端引入限制性核酸内切酶酶切位点实验方法原理 实验材料 噬菌体 T4 DNA 连接酶限制性内切核酸酶靶 DNA试剂、试剂盒 氯仿EDTA乙醇酚氯仿乙酸钠TE仪器、耗材 琼脂糖凝胶水浴箱实验步骤 一、材料1. 缓冲液与溶液氯仿EDTA ( 0.5 mol/L, pH 8.
末端标记的定义
定义1:如借助多核苷酸激酶将ATP的γ位32PO4基团或克列诺酶将生物素标记的单核苷酸加到核酸的末端,以供作示踪检测等。定义2:在DNA或RNA链末端(3'或5'端)添加放射性或其他可检测的标记。
末端开口的采样探子
符合GB/T 6679-2003《固体化工产品采样通则》国家标准。 适用于粉末、小颗粒、小晶体等固体化工产品采样。 材质是不锈钢、黄铜、铝合金等。除末端开口的采样探子外还可根据用户要求生产各种规格的采样探子,如:末端封闭的采样探子,可封闭的采样探子和窗口关闭式采样探子。 符合G
末端酶的定义
中文名称末端酶英文名称terminase定 义在病毒DNA包装过程中,催化特异性地切割病毒DNA连环体,产生单位长度的基因组,并参与基因组包装的酶类。DNA病毒(如疱疹病毒)、双链DNA噬菌体均有相应的末端酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)
细胞化学词汇末端缺失
在染色体的长臂或短臂接近末端的一个节段发生一次断裂,造成该染色体远侧节段缺失的现象。如果同一染色体的两臂同时发生断裂,而余下的两臂断裂端重接,便可形成环状染色体,又称着丝粒环,在肿瘤细胞中比较常见。