分子对接技术流程介绍
蛋白与小分子的对接受体结构准备:通过数据库下载或同源建模构建受体三维结构;药物分子准备;对接口袋的确定蛋白与蛋白的对接蛋白结构模型准备:通过数据库下载或同源建模构建受体三维结构;对接,一般生成数万种pose如果知道某些残基参与结合,那么可以对对接pose进行过滤对对接POSE进行重新打分并排序,挑选2000种pose,计算all-against-all RMSD矩阵根据RMSD进行聚类分析根据聚类结果挑选模型进行能量优化,消除原子间的碰撞蛋白复合物的相互作用分析,并作图形成报告交付给客户......阅读全文
幽门螺杆菌抗生素耐药基因的分子检测及分子对接分析
Abstract 摘要Aim: To explore the mutation characteristics of H. pylori resistance-related genes to antibiotics of clarithromycin (CAM), levofloxaci
分子杂交技术的相关介绍
互补的核苷酸序列通过Watson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。 杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总RNA。根据使用的方
分子印迹技术和基本介绍
将各种生物大分子从凝胶转移到一种固定基质上的过程称为印迹技术(blotting)。 Southern在1975年首先提出了分子印渍的概念。他将琼脂糖凝胶电泳分离的 DNA片段在凝胶中进行变性使其成为单链,然后将一张硝酸纤维素(nitrocellulose, NC)膜放在凝胶上,上面放上吸水纸巾
共价化合物的分子对接问答详解三则
A: 有没有人做过共价化合物的分子对接? B:薛定谔有,covalent docking。 A:有没有用过,结果可有价值? B:我有替实验室师兄做过一次,挺大的天然产物去对接,全塞进腔里了,感觉有点不对劲。需要你去定义反应位点,以及化合物的反应基团及类型,比如迈克尔加成。
共价化合物的分子对接问答详解三则
1A: 有没有人做过共价化合物的分子对接?B:薛定谔有,covalent docking。A:有没有用过,结果可有价值?B:我有替实验室师兄做过一次,挺大的天然产物去对接,全塞进腔里了,感觉有点不对劲。需要你去定义反应位点,以及化合物的反应基团及类型,比如迈克尔加成。殷赋科技:@A 你要针对少数化合
沈阳分院与鞍钢集团开展技术对接
8月1日,在辽宁省科技厅组织下,中国科学院沈阳分院、金属研究所、沈阳自动化研究所等单位院士、专家团队赴鞍钢集团公司开展定向科技成果发布和专题对接。中国工程院院士柯伟、沈阳分院副院长马越红、金属所副所长谭若兵等14位沈阳分院系统院士、专家参加了对接活动。来自鞍钢集团公司、鞍山钢铁公司、鞍钢矿业公司
分子对接技术研究化合物1与受体PARP1的结合模式(蛋白...
分子对接采用分子对接技术研究化合物1与受体PARP1的结合模式(图1)。 图1.化合物1的化学结构 2.计算方法从RCSB Protein Data Bank(http://www.rcsb.org)下载PARP1的X-ray晶体结构(PDB 编号:4RV6,分辨率:3.19 Å),以第一个构象作为
短程分子蒸馏装置工作流程
短程分子蒸馏装置适合于进行分子蒸馏,将料液加热使它部分汽化,易挥发组分在蒸气中得到增浓,难挥发组分在剩余液中也得到增浓,这在一定程度上实现了两组分的分离。两组分的挥发能力相差越大,则上述的增浓程度也越大。在工业精馏设备中,使部分汽化的液相与部分冷凝的气相直接接触,以进行汽液相际传质,结果是气相
病毒包装技术6——腺病毒包装流程介绍
1. 细胞的准备 a) 复苏293细胞,传代培养1-2代,调整好细胞状态,务必4代以内完成转染实验。 b) 在转染前1天,用胰酶消化传代,将5×105细胞接种于6孔板或87.5px皿中,加入2ml完全培养基(DMEM+10%FBS+1%P/S+1%Glutamax),摇匀后置于5%
精准对接-“云端”交流-中国—东盟数字技术对接交流研讨会成功举办
12月5日上午,由广西东盟技术转移中心组织开展的2023年中国—东盟数字技术对接交流研讨会在南宁成功举办。活动以“线上+线下”方式举行,共有来自马来西亚、缅甸、越南等东盟国家和中国数字技术领域相关人员参加,参会嘉宾围绕数字技术领域的新技术、新产品和新服务进行深入交流对接,分享最新的技术发展趋势,
高分子絮凝剂——聚丙烯酰胺的技术流程
沉淀是发生化学反应时生成了不溶于反应物所在溶液的物质。从字意上理解就是在重力作用下沉淀去除。污水中的悬浮物质,可以这是一种物理过程,简便易行,效果良好,是污水处理的重要技术之一。根据悬浮物质的性质、浓度及絮聚丙烯酰胺凝性能,沉淀可以分为:自然沉淀,絮凝沉淀,区域沉淀。域沉淀的悬浮颗泣浓度较高(500
分子印迹技术的分类相关介绍
目前,根据模板分子和聚合物单体之间形成多重作用点方式的不同,分子印迹技术可以分为两类: 1.共价键法(预组装方式) 聚合前印迹分子与功能单体反应形成硼酸酷、西夫碱、亚胺、缩醛等衍生物,通过交联剂聚合产生高分子聚合物,用水解等方法除去印迹分子即得到共价结合型分子印迹聚合物。 2.非共价键法(
核酸分子杂交技术的基本介绍
由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。 (1)灵敏度高、特异性强; (2)用于 DNADNA和RNARNA的定性、定量检测。
分子克隆技术的应用介绍
分子克隆技术是70年代才发展起来的,它的出现和应用开辟了分子遗传学研究的新领域,打开了人类了解、识别、分离和改造基因,创造新物种的大门。它的成就对于工业、农牧业和医学产生深远影响,并将为解决世界面临的能源、食品和环保三大危机开拓一条新的出路。在医学方面利用分子克隆技术已将胰岛素,人、牛和鸡的生长激素
高端芯片领域技术创新对接会举行
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519629.shtm高端芯片是人工智能等产业高质量发展的重要硬件基础,成都高端芯片产业如何加快发展形成新质生产力?围绕这一问题,3月22日,由成都市科学技术局、成都高新区科创局主办的高端芯片领域技术创新对
短程分子蒸馏仪的工作流程
当液体混合物沿加热板流动并被加热,轻、重分子会逸出液面而进入气相,由于轻、重分子的自由程不同,因此,不同物质的分子从液面逸出后移动距离不同,若能恰当地设置一块冷凝板,则轻分子达到冷凝板被冷凝排出,而重分子达不到冷凝板沿混合液排出。物料从短程分子蒸馏仪的顶部加入,经转子上的料液分布器将其连续均匀地分布
关于核酸分子杂交技术的特点和技术介绍
1、特点 (1)灵敏度高、特异性强; (2)用于 DNADNA和RNARNA的定性、定量检测。 2、用途 (1)检测特异 DNADNA序列的拷贝数、特定DNADNA区域的限制性内切酶图谱,判定基因的缺失、插入、重排现象; (2)特异基因克隆的筛选; (3)核酸序列的初略分析; (4
分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式
从本期起,小编将带领大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com/)来做一系列计算“文章”。这一期咱们来重现一篇2018年文献[1]的计算结果,看看作者是如何运用分子对接技术来阐明机理、升华文章的。该文献影响因子4.6,是典型的“实验+计算”模式,比较接近大多数科研
实验技术方法流程汇总
目前最好的实验方法站点之一: http://www.protocol-online.org 有近三百种经典实验方法的生物学网站: http://iprotocol.mit.edu/ 目前最完美的生物技术收集网站之一: http://www.bioprotocol.com:包括动植物、果蝇、分子生物、
PAM沉淀的技术流程
沉淀是发生化学反应时生成了不溶于反应物所在溶液的物质。从字意上理解就是在重力作用下沉淀去除。污水中的悬浮物质,可以这是一种物理过程,简便易行,效果良好,是污水处理的重要技术之一。根据悬浮物质的性质、浓度及絮聚丙烯酰胺凝性能,沉淀可以分为:自然沉淀,絮凝沉淀,区域沉淀。域沉淀的悬浮颗泣浓度较高(500
PAM沉淀的技术流程
沉淀是发生化学反应时生成了不溶于反应物所在溶液的物质。从字意上理解就是在重力作用下沉淀去除。污水中的悬浮物质,可以这是一种物理过程,简便易行,效果良好,是污水处理的重要技术之一。 根据悬浮物质的性质、浓度及絮聚丙烯酰胺凝性能,沉淀可以分为:自然沉淀,絮凝沉淀,区域沉淀。域沉淀的悬浮颗泣浓度较高
PAM沉淀的技术流程
PAM沉淀的技术流程沉淀是发生化学反应时生成了不溶于反应物所在溶液的物质。从字意上理解就是在重力作用下沉淀去除。污水中的悬浮物质,可以这是一种物理过程,简便易行,效果良好,是污水处理的重要技术之一。根据悬浮物质的性质、浓度及絮聚丙烯酰胺凝性能,沉淀可以分为:自然沉淀,絮凝沉淀,区域沉淀。域沉淀的悬浮
PAM沉淀的技术流程
沉淀是发生化学反应时生成了不溶于反应物所在溶液的物质。从字意上理解就是在重力作用下沉淀去除。污水中的悬浮物质,可以这是一种物理过程,简便易行,效果良好,是污水处理的重要技术之一。根据悬浮物质的性质、浓度及絮聚丙烯酰胺凝性能,沉淀可以分为:自然沉淀,絮凝沉淀,区域沉淀。域沉淀的悬浮颗泣浓度较高(500
Western-Blot技术实验流程
Western Blot又称为蛋白质印迹,是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的基于抗体抗原之间特异免疫反应的一种定量或定性检测蛋白的实验方法。基本原理:聚丙烯酰胺凝胶电泳将不同分子量的蛋白质样品分离,分离后的蛋白被转移到固相支撑物(杂交膜)上,抗体特异性识别目标蛋白,通过酶促反应或者化学发光等
PAM沉淀的技术流程
沉淀是发生化学反应时生成了不溶于反应物所在溶液的物质。从字意上理解就是在重力作用下沉淀去除。污水中的悬浮物质,可以这是一种物理过程,简便易行,效果良好,是污水处理的重要技术之一。根据悬浮物质的性质、浓度及絮聚丙烯酰胺凝性能,沉淀可以分为:自然沉淀,絮凝沉淀,区域沉淀。域沉淀的悬浮颗泣浓度较高(500
PAM沉淀的技术流程
沉淀是发生化学反应时生成了不溶于反应物所在溶液的物质。从字意上理解就是在重力作用下沉淀去除。污水中的悬浮物质,可以这是一种物理过程,简便易行,效果良好,是污水处理的重要技术之一。 根据悬浮物质的性质、浓度及絮聚丙烯酰胺凝性能,沉淀可以分为:自然沉淀,絮凝沉淀,区域沉淀。域沉淀的悬浮颗泣浓度较高
Western-Blot技术实验流程
Western Blot又称为蛋白质印迹,是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的基于抗体抗原之间特异免疫反应的一种定量或定性检测蛋白的实验方法。 基本原理:聚丙烯酰胺凝胶电泳将不同分子量的蛋白质样品分离,分离后的蛋白被转移到固相支撑物(杂交膜)上,抗体特异性识别目标蛋白,通过酶促反应或
中国东盟技术转移与创新合作大会:重技术需精准对接
作为第13届中国—东盟博览会的重要论坛之一,第4届中国—东盟技术转移与创新合作大会将于9月11日在南宁开幕。8月30日,记者从第4届中国—东盟技术转移与创新合作大会组委会举行的新闻通气会上获悉,大会从整体上更加注重实效,突出东盟各国的技术产业需求,注重技术需求精准对接,将进一步加强技术转移与创新
关于核酸分子杂交技术的基本介绍
由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。
关于分子印迹技术的应用相关介绍
1.用于化学仿生传感器 由于MIPS对于印迹分子的高选择性,故可以作为仿生传感器的分子识别元件;这种分子识别作用可以通过信号转化器(压电晶体、电极、电阻等)输出,然后通过各种电、热、光等手段转换成可测信号,可定量分析各种小分子有机化合物。 2.色谱分离 MIPS最广泛的应用之一是利用其特异