数字PCR在CRISPRCas9基因编辑结果验证的应用
CRISPR-Cas9技术的发明，是基因编辑技术的一大突破，但如何验证实验是否成功，仍需要高灵敏度的检测方法，数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测，但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。......阅读全文
数字PCR在CRISPRCas9基因编辑结果验证的应用
CRISPR-Cas9技术的发明，是基因编辑技术的一大突破，但如何验证实验是否成功，仍需要高灵敏度的检测方法，数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测，但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。
数字PCR在基因表达差异研究的应用
数字PCR由于检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量，因而可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究，尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况，如：mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析；等位基因的不平衡表达；单细胞基因表达分析；外泌体核酸分子定量分析等。
数字PCR在基因型鉴定的应用
PCR也可以用于检测一个生物中是否存在某特定DNA序列，这被称为基因型鉴定。例如，基因型鉴定可通过发现样品中是否存在某种群特异性序列来判断样本的真实性。基因型鉴定还可用于法医分析判断在现场发现的DNA样品是否和嫌疑人的吻合，令凶手无处遁形。
数字PCR在－药物基因组检测的应用
能够通过PCR技术实现药物基因组的检测，提高合理用药水平，具有通量较高，操作简单，仪器设备易普及等优点。 数字PCR冷知识：胎儿性别不是只有B超可以看出来，一只精通数字PCR的科研狗，也可以测出来。
Nacia数字PCR在基因表达分析中的应用
华盛顿大学医学院儿科和加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院儿科的研究人员建立了一个稳定可靠的基于RNA磁珠提取和数字PCR的方法，可从粪便样本中检测与EE（热带肠病）关联的人mRNA，灵敏度可达20拷贝GAPDH mRNA/200mg粪便样本。已有报道表明病人粪便中存在人mRNA，可作为反应病人消化道病
数字PCR在临床和预后融合基因检测的应用
众所周知，融合基因检测对临床诊断及预后指导都具有十分重要的意义。那么究竟什么是融合基因呢？融合基因的发现始于上个世纪60年代，它是指染色体断裂后又重新拼接。如果恰巧拼接时发生了错误，使两个不同基因互相融合，大多数情况下，它会造成某些序列或功能异常的蛋白表达，亦或者是某些基因表达失调，从而促进肿瘤的发
数字PCR在转基因食品或成分检测中的应用
目前在确定转基因作物或成分的含量时采取定量PCR的标准曲线法，这种方法需要依赖于已知浓度的标准品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。ddPCR绝对定量的方式可以彻底解决这些标准物质的定标工作，从而确保安全和品质。
CRISPRCas9基因编辑的两种不同编辑实验流程的应用（一）
IDT Alt-R® CRISPR-Cas9基因编辑系统 IDT（Integrated DNA Technologies）作为核酸定制合成领域的知名企业，依托30年来的技术研发，推出了Alt-R®系列CRISPR-Cas9基因编辑产品，通过对gRNA序列、Cas9核酸酶优化，对RNP转染效率、同
CRISPRCas9基因编辑的两种不同编辑实验流程的应用（三）
Alt-R® CRISPR-Cas9实例分析1、特别优化的crRNA/tracrRNA/sgRNA长度，提高编辑性能以HPRT基因中的12个位点为靶点，分别使用Alt-R® crRNA:tracrRNA、Alt-R® crRNA XT:tracrRNA、Alt-R® sgRNA，与Alt-R®
CRISPRCas9基因编辑的两种不同编辑实验流程的应用（二）
【方法二】1、（用IDT工具）设计sgRNA，使其Spacer与DNA靶序列互补，提交给IDT定制合成sgRNA；2、将sgRNA与Cas9蛋白混匀，形成RNP；3、将RNP通过电转染等导入细胞或细胞核；4、通过sgRNA的Spacer识别DNA靶序列，通过Cas9蛋白识别PAM序列，对DNA进行剪
CRISPRCas9基因编辑技术简介
CRISPR-Cas9是继ZFN、TALENs等基因编辑技术推出后的第三代基因编辑技术，短短几年内,CRISPR-Cas9技术风靡全球, 成为现有基因编辑和基因修饰里面效率最高、最简便、成本最低、最容易上手的技术之一，成为当今最主流的基因编辑系统。一、什么是CRISPR-Cas系统CRISPR-Ca
数字PCR在环境监测的应用
基因目标的环境监测，需要对复杂样品中低浓度的目标进行准确检测。ddPCR每次运行中能创建数千个PCR反应室，带来了目标的准确测定，即使它们浓度很低，因此可以实现对土壤、污水、淤泥、酒泥等为样本的环境生物学研究和病原微生物监测。
数字PCR在肠道菌群分析的应用
数字PCR技术直接计算目的序列的拷贝数，对样品中的微生物实现了绝对定量，可用于微生物检测，以便进一步研究肠道菌群的结构、功能以及数量。
数字PCR在移植排斥监控中的应用
为了降低器官移植中移植物排斥导致的风险，数字PCR技术通过监测受体中移植器官供体的循环DNA水平来检测早期移植排斥。
数字PCR在早期精准检验疫情的应用
2016年，全球首例数字PCR动物疫病检测试剂研发成功，包括禽流感、禽流感H7N9、蓝耳病、高致病性美州株、猪的流行性腹泻等动物疫病检测试剂盒。此项技术的推出，将有助于在食品安全的源头及早发现疫情，尽早处理避免更大面积的传染，更好地控制漏检，减少传染人的几率；也将有助于国家建立规范化、规模化的动
数字PCR在病毒临床检测中的应用
概述2015年刚成历史，2016年已在眼前。就这样，年复一年间沧海成桑田。生命科学领域，新方法层出不穷，老方法不断升级，好不热闹。也如孔子的感叹：逝者如斯夫，不舍昼夜。就拿PCR技术来说，荧光定量PCR作为一种进行基因表达分析的技术，截至目前最大的应用市场是病原微生物的核酸体外诊断。展望未来，作为q
数字PCR在食品安全检测的应用
食品安全日益成为一个重要的公共卫生问题, 受到社会及国家的高度重视。食源性疾病、食品原料造假、转基因食品等逐渐呈现出普遍增长的趋势。食源性疾病是指通过摄食而进入人体的有毒有害物质等致病因子所造成的疾病。比如常见的食物中毒、肠道传染病、人畜共患传染病、寄生虫病等。食源性疾患的发病率居各类疾病总发病率的
基因编辑在肾脏疾病中的应用
英国纽卡斯尔大学的研究人员在细胞和小鼠模型中表明，基因编辑可用于Joubert综合征，以阻止携带CEP290缺陷基因对患者肾脏造成损害。Joubert综合征是一种脑部疾病，引起不同程度的身体、精神和视觉障碍。大约80000个新生儿中有一个会得这种病，其中的三分之一患者会导致肾衰竭。 并非所有J
数字PCR在精准医学领域的十大应用
数字PCR是一种新的核酸检测和定量方法，借助微液滴或微坑，通过单个模板分子的PCR扩增，可实现不依赖于标准曲线和参照样本的准确、绝对定量。数字PCR使得反应更灵敏、结果更可靠、展示更直观，尤其适用于微量或痕量DNA检测与定量。下面我们就目前已经比较明确的数字PCR应用方向做个介绍。基因表达差异研究数
数字PCR在肿瘤的液体活检中的应用
肿瘤学研究是数字PCR的重要应用领域，该技术作为极为重要的工具，能够识别DNA突变（例如EGFR）、肿瘤患者用药监控、基因扩增检测、循环肿瘤细胞（CTC）特性研究、长链非编码RNA检测、液体活检中循环的核酸（cfDNA）和肿瘤细胞（CTC）的绝对定量等研究中。
数字PCR在肿瘤治疗的伴随诊断的应用
常用体液来源（如血液，胸腹水，唾液及尿液等）的待检标本中的DNA，有正常脱落体细胞和病变脱落细胞两种来源，前者的量远大于后者。通过微液滴处理能在每个微液滴中有效减少正常体细胞DNA的干扰，实现肿瘤标记物的有效检测，如EGFR，ALK，ROS1，KRAS、BRAF等基因的突变检测、乳腺癌/胃癌的HE
基因编辑工具CRISPRCas9遭遇新挫折！
在一项新的研究中，来自德国明斯特大学的研究人员发现，在小鼠进行常规的CRISPR-Cas9基因插入过程中，不必要的DNA重复频率很高。相关研究结果发表在2020年2月21日的Science Advances期刊上，论文标题为“Pervasive head-to-tail insertions o
CRISPRCas9基因编辑系统在灵长类中不会导致明显脱靶效应
CRISPR-Cas9基因编辑系统已被广泛应用于生物和医学研究，研究人员正在尝试利用这一系统进行人类疾病的基因治疗。然而，CRISPR-Cas9系统在临床前的安全性却缺少全面的评估。之前有研究表明，CRISPR-Cas9系统在小鼠中会造成大量脱靶突变。此外，对细胞系的研究发现，Cas9编辑细胞的
机器可预测基因组修复结果－实现精准无模板CRISPRCas9编辑
英国《自然》杂志8日在线发表了一项人工智能及生物技术研究：科学家报告了一种方法，可通过机器学习对致病基因变异实现精准且可预测的编辑。这项成果为研究遗传疾病，开发潜在疗法提供了新的可能性。 虽然CRISPR-Cas9彻底改变了用于研究的基因组编辑技术，但目前认为，保证这项技术的准确性尤其重要。 C
数字PCR应用（三）
Fluidigm公司于2006年底推出了基于集成流体通路（IFC）芯片的Bio-Mark™ 高通量基因剖析系统。 其创新在于集成液体通路技术：应用集成电路制造工艺（光刻）在硅片或石英玻璃上刻上许多微管和微腔体，经过不同的控制阀门控制溶液在其中的活动来完成生物样品的分液、混合、PCR扩增。图8. Bi
数字PCR应用（一）
一． PCR的发展历史 PCR技术自问世以来，在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。第一代 PCR在进行扩增后通过凝胶电泳进行定性分析。 随着生物分子荧光技术的发展，1992年实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR, qPCR) 应运
数字PCR应用（二）
4、能够有效区分浓度差异（变化）微小的样品：更好的准确度、精密度和重复性，可以用于精确测定靶基因的相对表达，基因拷贝数变异分析等。图4. qPCR和dPCR的对比 四．dPCR的多指标检测的实现 如同qPCR一样，dPCR中实现多指标的并行检测能显著降低检测成本，获取更丰富的检测信息。 不同于qPC
数字PCR在甲基化含量鉴定的应用
作为表观遗传学研究中重要的一个研究方向——甲基化程度分析，现阶段有不同的方法或技术来进行研究：如传统的亚硫酸氢盐处理后的克隆测序法、抗体检测法、定量PCR检测法等受限于方法学的问题，不能获得甲基化程度的精确定量，而数字PCR系统通过对样品的微液滴处理及目标分子的绝对拷贝数定量，为甲基化程度的精确定量
数字PCR在糖尿病治疗中的应用
数字PCR技术目前在糖尿病中的研究热点，通过定量检测非甲基化DNA的水平，对I型糖尿病β细胞死亡进行定量，从而监控病情发展。
数字PCR和HRM在肿瘤样本中的应用
摘要：Vogelstein和Kinzler（美国国家科学院院刊，1999年）第一次描述了Digital PCR（dPCR）的概念，一种在微量细胞群中（如原发性肿瘤组织）鉴定突变的方法。通过稀释样品DNA到一个单个分子水平，它可以把PCR自然模拟指数转化为数字信号。当PCR成功的扩增出这些单个