X射线晶体学的多重同晶置换(MIR)概念

把对X射线散射能力大的重金属原子作为标识原子。这种置换入重原子的大分子应与无重原子时的原晶体有相同的晶胞参数和空间群,且绝大多数原子的位置相同,故称同晶置换。从这些含重原子晶体的衍射数据,利用基于派特逊法的方法可解出重原子的位置,据此算出其结构因子和相角,进而利用相角关系计算出没有重原子的原晶体的相角,解出结构。经常使用不只一种重原子进行置换,以得几种同晶置换衍生物, 称多对同晶置换法。......阅读全文

X射线晶体学的多重同晶置换(MIR)概念

把对X射线散射能力大的重金属原子作为标识原子。这种置换入重原子的大分子应与无重原子时的原晶体有相同的晶胞参数和空间群,且绝大多数原子的位置相同,故称同晶置换。从这些含重原子晶体的衍射数据,利用基于派特逊法的方法可解出重原子的位置,据此算出其结构因子和相角,进而利用相角关系计算出没有重原子的原晶体的相

多重同晶置换的原理和方法特点

中文名称多重同晶置换英文名称multiple isomorphous replacement;MIR定  义在蛋白质的X射线衍射研究中,为解决衍射相问题,将多个具有同晶性质而不改变蛋白质构象的重原子引入蛋白质,比较引入重原子前后的衍射图,即能从多个相角所测的数据解释衍射图。应用学科生物化学与分子生物

关于X射线单晶体衍射仪的同晶置换法介绍

  这种方法是设法把对X射线散射能力大的重金属原子,如Hg,Pb,Se等引入生物分子中,作为标识原子。这种置换入重原子的大分子应与无重原子时的原晶体有相同的晶胞参数和空间群,且绝大多数原子的位置相同,故称同晶置换。从这些含重原子晶体的衍射数据,利用基于派特逊法的方法可解出重原子的位置,据此算出其结构

多重同晶置换和多波长反常散射两种方法的差异

两者的相同点:都是利用重原子的特性来解决相角问题。两者的差别:MAD是基于MIR的基础之上的,采用多种波长完备所需的信息。

X射线晶体学的多波长反常散射(MAD)概念

晶体衍射中有一条弗里德耳定律, 就是说不论晶体中是否存在对称中心,在晶体衍射中总存在着对称中心,也即有FHKL=FHKL。但是当使用的X射线波长与待测样品中某一元素的吸收边靠近时,就不遵从上述定律,也即FHKL≠FHKL。这是由电子的反常散射造成的, 利用这一现象可以解决待测物的相角问题。 一般,

X射线晶体学的研究步骤

①蛋白或DNA样品纯化②结晶③衍射、数据收集④确定蛋白结构衍射数据→数据处理→相位解析→建模→模型修正→模型检验⑤理解结构与功能的相互关系

X射线晶体学的原理和方法

原理:蛋白质晶体内部结构为三维空间周期、有序、重复排列,要求每个结晶重复单位(分子或其复合体)的化学组成与分子构象是均一的。方法:为了获得可供衍射的单晶,就需要将纯化后的生物样品进行晶体生长。晶体生长的方法有很多,如气相扩散法、液相扩散法、温度渐变法、真空升华法、对流法等等,而目前应用最广泛的晶体生

X射线晶体学的研究对象和目的

X射线晶体学是一门利用X射线来研究晶体中原子排列的学科。更准确地说,利用电子对X射线的散射作用,X射线晶体学可以获得晶体中电子密度的分布情况,再从中分析获得原子的位置信息,即晶体结构。对很多余结构相关的问题如整体折叠、配体或底物结合、作用的原子具体信息提供可靠的答案。运用X射线晶体学可以了解大分子如

x射线测厚仪概念

X射线测厚仪工作原理、结构特性:   X射线测厚仪利用X射线穿透被测材料时,X射线的强度的变化与材料的厚度相关的特性,从而测定材料的厚度,是一种非接触式的动态计量仪器。它以PLC和工业计算机为核心,采集计算数据并输出目标偏差值给轧机厚度控制系统,已达到要求的轧制厚度.    适用范围:生产铝板、铜板

X射线粉晶衍射仪(XRD)

1.仪器设备简介【仪器名称】X射线衍射仪【生产公司】德国Bruker AXS D8-Focus【仪器型号】D8-FOCUS【测试条件】CuKα射线,Ni滤波,40kV,40mA,LynxEye192位阵列探测器,扫描步长0.01°2θ,扫描速度每步0.05秒,λ=        1.5405

X射线晶体学揭示代谢调控新机制

  来自普渡大学、霍华德休斯医学研究所的研究人员,运用X射线晶体学方法,揭示了大肠杆菌抑制麦芽糖转运蛋白摄入麦芽糖的机制,相关论文公布在6月16日的《自然》(Nature)杂志上。   领导这一研究的是普渡大学生物学系陈觉(Jue Chen)教授,其早年毕业于上海同济大学,2002年受聘于普渡

x射线粉晶衍射仪的工作原理

x射线粉晶衍射仪主要应用在晶体材料的物相(包括元素、化合物、固溶体)分析,材料的晶格计算,残余应力等方面。主要原理是依据布拉格方程,利用已知波长的X射线照射在样品表面,获得图谱,从而得到所要信息。样品可以是块状也可以是粉末状

X-射线显微镜的概念

X 射线显微镜是X 射线成像术的一种,也是显微成像技术,即将微观的、肉眼无法分辨看出的结构、图形放大成像以便观察研究的器械。X 射线成像的衬度原理、设备的构造与主要组成部件( 如X射线源、探测器等),但主要是从宏观物体的成像( 如人体器管的医学成像、机械制品的缺陷探伤、机场车站的安全检查等) 出发的

X射线荧光光谱的概念

X射线荧光光谱(XRF):X射线荧光光谱按 分 离 特 征 谱 线 的 方 法 分 为 波 长 色 散 型(WD-XRF)和 能 量 色 散 型(ED-XRF)两种。WD-XRF与ED-XRF的区别在于前者是用分光晶体将荧光光束进行色散,而后者则是借助高分辨率敏感半导体检测器与多道分析器将所得信号按

粉晶X射线衍射定性相分析

11.3.2.1 粉晶X射线定性相分析的基本原理和方法粉晶X射线定性相分析(物相鉴定)是指用X射线粉晶衍射数据对样品中存在的物相(而不是化学成分)进行鉴别。其理论根据是:任何一种结晶物质都具有特定的晶体结构,在一定波长的X射线照射下,每种晶体物质都有自己特有的衍射花样,即衍射谱线,不可能存在衍射花样

小角X射线散射技术测定非晶合金的介绍

  非晶合金也称金属玻璃,它是急冷得到的亚稳定合金,在加热过程中会产生一系列的转变,逐渐由亚稳态转变到稳定态。在这个过程中会发生相分离以及晶化过程。已有许多学者利用小角X射线散射技术来研究非晶合金中的这些转变。  用原位小角X 射线散射研究了块体非晶合金Zr55Cu30Al10Ni5的退火行为。研究

置换反应的概念

置换反应是单质与化合物反应生成另外的单质和化合物的化学反应,是化学中四大基本反应类型之一,包括金属与金属盐的反应,金属与酸的反应等。它是一种单质与一种化合物作用,生成另一种单质与另一种化合物的反应。氧化还原反应不一定为置换反应,置换反应一定为氧化还原反应。

激发X射线荧光分析法的概念

当α 、β、γ或X射线作用于样品时,由于库仑散射,轨道电子吸收其部分动能,使原子处于激发状态。由激发态返回基态时发射特征X射线,根据此特征X射线的能量和强度来分析元素的种类和含量。其灵敏度很高,用途很广。

用X射线能谱(TEM)分析晶界偏析的方法

本文利用EM400T透射电子显微镜和EDAX9100能谱仪研究微量元素在晶界的偏聚。通过本文采用的电子束直径小到40A的微探针,低背底样品台,沿晶界拉长束斑,分段积分等措施,明显地提高了分析灵敏度。用这种方法测量了含磷820ppm的Si-Mn高强度钢和含镁94ppm的GH169高温合金中P和Mg的晶

X-射线晶体学与冷冻电镜在结构生物学上如何互补?

小刘同学的故事好感慨的题目,基本上就是小刘同学大学生活的变迁2012年,小刘同学刚刚结束了高考。满怀对生命科学的憧憬,心想,二十一世纪是生命科学的世纪。他现在也这样觉得。于是背上小小的行囊,告别了家乡和爹娘;只身来到了帝都,前去某知名985高校学一门手艺。希望能功成名就,回老家盖房子,娶媳妇。小刘同

X射线粉末衍射仪的概念和作用

XRD即X射线衍射,通常应用于晶体结构的分析。X射线是一种电磁波,入射到晶体时在晶体中产生周期性变化的电磁场。引起原子中的电子和原子核振动,因原子核的质量很大振动忽略不计。振动着的电子是次生X射线的波源,其波长、周相与入射光相同。基于晶体结构的周期性,晶体中各个电子的散射波相互干涉相互叠加,称之为衍

X射线单晶体衍射仪的反常散射法介绍

  晶体衍射中有一条弗里德耳定律,就是说不论晶体中是否存在对称中心,在晶体衍射中总存在着对称中心,也即有FHKL=FHKL。但是当使用的X射线波长与待测样品中某一元素的吸收边靠近时,就不遵从上述定律,也即FHKL≠FHKL。这是由电子的反常散射造成的,利用这一现象可以解决待测物的相角问题。一般,这一

通过X射线晶体学确定甜叶菊莱鲍迪甙A(RebA)蛋白的结构

  6月10日发表在《美国科学院院刊(PNAS)》上的一项研究,揭示了甜叶菊高强度甜味背后的分子机制,研究结果可用于设计新的无热量产品,且不含任何不良余味。该研究由美国华盛顿大学圣路易斯分校领导。  尽管负责甜叶菊合成生化途径中的基因和蛋白质几乎已完全为人所知,但根据这项新研究的作者称,这是首次发表

基因置换的概念和功能

基因置换就是用正常基因通过体内基因同源重组,原位替换病变细胞内的致病基因,使细胞内的DNA完全恢复正常状态。属于基因治疗的一种方法。

基因平均置换时间的概念

中文名称基因平均置换时间英文名称average gene substitution time定  义一个等位基因被另一个等位基因替换的平均世代数。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)

肌红蛋白的三级结构介绍

  肌红蛋白( myoglobin,Mb)是哺乳动物细胞主要是肌细胞贮存和分配氧的蛋白质。潜水哺乳类如鲸海豹和海豚的肌肉中肌红蛋白含量十分丰富,以致使它们的肌肉呈棕红色。由于肌红蛋白贮存氧使这些动物能长时间地潜在水下。肌红蛋白是由一条多肽链和一个辅基血红素构成,相对分子质量为16700,含153个氨

X射线管中X射线的产生原理

实验室中X射线由X射线管产生,X射线管是具有阴极和阳极的真空管,阴极用钨丝制成,通电后可发射热电子,阳极(就称靶极)用高熔点金属制成(一般用钨,用于晶体结构分析的X射线管还可用铁、铜、镍等材料).用几万伏至几十万伏的高压加速电子,电子束轰击靶极,X射线从靶极发出.

同主族元素单质间的置换反应举例

钠置换钾【Na+KCl==高温==NaCl+K↑】(一般是774℃)钠置换氢【2Na+2H2O====2NaOH+H2↑】氧置换硫【O2+2H2S====2S↓+2H2O】碳置换硅【2C+SiO2==高温==Si+2CO↑】氟置换氯【F2+2HCl====2HF+Cl2】(Cl2不标气体符号)

软X射线源上X射线能谱与X射线能量的测量

本文介绍了国内首次利用针孔透射光栅谱仪对金属等离子体Z箍缩X射线源能谱的测量结果及数据处理方法。同时用量热计对该源的单脉冲X射线能量进行了测量并讨论了其结果。

X射线晶体学之常见问题-蛋白糖基化修饰影响蛋白结晶?

  1. 蛋白质修饰如糖基化会不会影响蛋白结晶?  在蛋白结晶过程中,糖基化一般被认为会影响蛋白的均一性和表面熵,从而阻碍蛋白结晶。但是也有实验表明糖基化不会影响蛋白质结晶(10.1021/cg7006843),应该无差别对待。如果糖基化蛋白不能形成晶体,那么就应该尝试将糖链给去掉。有好几种方法可以