科学家完成古DNA实验方案相关污染物的评估

近年来,古DNA研究技术发展迅速,特别是单链DNA文库构建实验方案和机器人自动化液相处理实验的应用,极大地提高了古DNA研究的效率。这些技术在古DNA研究中应用广泛,但是目前尚不清楚不同实验方案在实际应用中产生的背景污染情况,这一直是古DNA领域面临的巨大挑战之一。 近日,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所分子古生物学实验室付巧妹研究员团队完成了关于不同古DNA实验方案中相关实验室背景污染物的系统评估。相关研究论文题为:“Assessment of contaminants associated with gold-standard ancient DNA protocols”,近期在线发表于Science Bulletin。 此前,通过对低生物量微生物组研究中存在的污染进行梳理,并对微生物组研究中井间污染的量化研究表明,实验室中的样本污染是来自井间交叉污染和背景污染的组合,不同实验室的污染程度不同,不同的实验方案......阅读全文

古DNA帮你看清剑齿虎

  研究人员分析了两种剑齿虎科动物的完整线粒体基因组,他们对这些动物在过去5万年里的历史有了新视角。近日,发表在《当代生物学》杂志上的数据表明,在2000万年前,剑齿虎与现存猫类有共同的祖先。但这两种剑齿虎大约在1800万年前就分道扬镳了。  德国波茨坦大学Johanna Paijmans说:“从线

大洋海底首次发现古DNA

海底世界中,不仅有化石,还有微小生物的古DNA。图片来源: F. Lejzerowicz等,《生物学快报》   在广阔的南大西洋中,有一片海域几乎没有生命迹象:没有鸟类,极少的鱼类,甚至浮游生物也不多见。但是研究人员日前报道,他们发现了埋藏在海底的珍宝:海床之下淤泥中的古DNA。   古DNA来

古DNA技术如何“浪里淘金”

  重建已灭绝古人类——尼安德特人和丹尼索瓦人的全基因组、绘制全球人群迁徙交流历史、挖掘最古老东亚现代人“田园人”的遗传结构、揭示东亚人群末次盛冰期前后适应性基因的变化、追溯中国南北方人群格局的形成、溯源南岛语系人群的中国南方起源……在过去十余年里,研究人员利用古DNA技术发掘出那些遗落了成千上万年

古DNA-图谱描绘人类农业“黎明”

考古学和遗传学证据表明,1.2万年前的某个时候,中东的游牧狩猎采集者完成了人类历史上最重要的转变之一——不再游荡,开始定居务农。这种转变后来也独立出现在世界其他地区,被称为新石器革命(农业及畜牧出现)。古代基因组学研究曾暗示,这些“中东农民”起源复杂,涉及不同地方的狩猎采集群体,具有不同的遗传序列。

古DNA技术如何“浪里淘金”

  重建已灭绝古人类——尼安德特人和丹尼索瓦人的全基因组、绘制全球人群迁徙交流历史、挖掘最古老东亚现代人“田园人”的遗传结构、揭示东亚人群末次盛冰期前后适应性基因的变化、追溯中国南北方人群格局的形成、溯源南岛语系人群的中国南方起源……在过去十余年里,研究人员利用古DNA技术发掘出那些遗落了成千上万年

古DNA考古将改变整个行业

一项铁器时代的大规模屠杀考古发现,正在改变学界对史前暴力的认知,也凸显古DNA技术如何重塑整个考古行业。在塞尔维亚北部的戈莫拉瓦(Gomolava)遗址,研究者发现一处埋葬着77名以上遇难者的墓葬,其中多数是妇女与儿童。 这些个体约在2800年前被合葬。他们身上的钝器创伤与刺伤表明,死于一场研究者

古DNA分析将改变整个行业

一项围绕英国南部罗马时期古人类遗骸“比奇角女性”(Beachy Head Woman)的长期谜团,如今终于有了更清晰的答案。最新的高质量DNA分析显示,这位年轻女性很可能是一位来自罗马时期不列颠本地的普通女性,而非此前学界长期猜测的撒哈拉以南非洲或地中海后裔。这一结论借助更先进的基因测序技术与新近发

古DNA揭示埃及人祖先

在一项研究中,科学家对埃及一座墓葬中的一名古埃及人进行了全基因组测序。这些数据可追溯至古埃及第三至第四王朝,揭示了其与北非及中东地区,包括美索不达米亚古人群的亲缘关系,为早期埃及人的遗传多样性研究提供了新线索。科学家在7月2日出版的《自然》杂志报道了这一研究成果。古埃及的古王国时期(公元前2686-

古DNA揭示神秘迦南人命运

  迦南人到底怎样了?众所周知,他们在圣经记载的就耶利哥城而起的最著名的一场冲突中输掉了。迦南人生活在更北的地方,但由于他们的领土在古代遭到多次入侵,因此其最终的命运一直是个谜。如今,科学家在居住在黎巴嫩的现代人群中发现了迦南人的DNA。相关成果日前发表于《美国人类遗传学杂志》。  很多考古学家执迷

古DNA揭示美洲人的“根”

  大约1.3万年前,古人类在美洲迅速扩张。而且,这个故事延续了数千年,人类在北美和南美之间进行了数次大规模迁徙。然而,并没有文献记录下这些历史。  几十年来,科学家只能笼统地描述美洲人的历史演变情况,但这些古老人类何时以及如何分布在这片大陆上一直成谜。  近日,发表在《细胞》和《科学》的两项独立研

古DNA揭示美洲人的“根”

  大约1.3万年前,古人类在美洲迅速扩张。而且,这个故事延续了数千年,人类在北美和南美之间进行了数次大规模迁徙。然而,并没有文献记录下这些历史。  几十年来,科学家只能笼统地描述美洲人的历史演变情况,但这些古老人类何时以及如何分布在这片大陆上一直成谜。  近日,发表在《细胞》和《科学》的两项独立研

古DNA揭示德系犹太人起源

一个国际科学家小组从人类遗骸牙齿中提取了古代DNA,研究了德国埃尔福特一个曾经繁荣的中世纪德系犹太人社区的生活。相关成果近日发表于《细胞》,证明埃尔福特犹太社区的基因多样性比现代德系犹太人要多。“今天,如果你比较来自美国和以色列的德系犹太人,你会发现他们在基因上非常相似,就像是同一群人,无论他们住在

古DNA研究照亮斯瓦希里人种起源

一千年前,在季风和地理因素的推动下,非洲东部的斯瓦希里(Swahili)海岸成了水上贸易网络的关键节点,该贸易网络连接了来自非洲、中东和南亚的商人。在斯瓦希里海岸有一个名叫“石头城(stone towns)”的地方,这里是贸易交易往来的核心地之一,遍布着用珊瑚块建造的房子,这座繁荣的城市从索马里摩加

古DNA破解美第奇家族谋杀之谜

1587年10月一个温暖的日子,意大利托斯卡纳大公弗朗切斯科·德·美第奇因高热不治而亡。接诊医生初步判定死因是疟疾,但很快坊间流言四起,不少人猜测他是遭心怀嫉妒的弟弟费迪南多下毒谋害。如今,全新的科学证据彻底敲定了罪魁祸首,为这桩百年迷案画上句号。近日发表于iScience的一项研究,通过分析包括弗

研究显示:古DNA技术揭示史前家族关系

乌普萨拉大学研究团队通过分析瑞典哥特兰岛5500年前的墓葬DNA,发现史前狩猎采集者社会中扩展亲属关系扮演着重要角色,许多合葬者并非直系亲属而是二三级亲属,颠覆了此前的假设。 一位年轻女子与两个小孩合葬在一起。多年来,人们自然地认为他们是母子关系。但DNA检测讲述了一个不同的故事——两个孩子之

古DNA显示玛雅人用男童献祭

位于墨西哥的奇琴伊察是古玛雅城邦遗迹,废墟上布满了祭祀仪式的痕迹。这座古城的球场附近有一幅版画,绘有一个被砍下的头颅,鲜血喷涌而出。数百名受难者的遗骸已经从一个60米宽的天坑“圣井”中找到。现在,来自奇琴伊察最年轻受害者的古DNA为这个故事增添了新线索。6月12日,发表于《自然》的一项研究分析了从现

古DNA揭秘新疆人群的五千年

   公元前2世纪末,丝绸之路途经新疆,使后者正式成为了亚欧大陆东西部文化传播、经济贸易以及人群交流的桥梁。可事实上,很久以前新疆就是不同人群交汇的“十字路口”。  青铜时代人群是新疆早期的古代人类遗存,这些古老“居民”究竟从哪里来?他们如何与“邻里”互动?考古学家、人类学家都非常好奇。  由中国科

最大规模古DNA分析揭示英国历史

  近日,美国哈佛大学、英国约克大学和奥地利维也纳大学等机构领导的一项迄今为止最大规模的古代DNA分析显示,青铜时代晚期,大批人口从现在的法国迁移到英格兰和威尔士,同时可能将凯尔特语传播到了英国。相关研究结果发表于《自然》。铁器时代凯尔特山丘堡垒  在此之前,英国曾发生过两次大规模的人口迁移,第一次

古DNA研究揭示东亚家猪母系遗传历史

  12月11日,《遗传学报(英文版)》以研究论文形式在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、中国社会科学院考古所和陕西省考古研究院共同主导完成的古代东亚家猪线粒体全基因组研究成果。研究获取了42例来自于黄河流域的中国古代猪线粒体基因组数据,发现有部分类型从新石器时代早期直到现在连续存在于中国

为何古DNA破解万年谜团引发关注

为何一份埋藏万年的古人类遗骸,能帮我们破解一种罕见遗传病的起源?答案来自古 DNA 与现代临床遗传学的联手,两种看似相距甚远的学科在此交汇。由维也纳大学(University of Vienna)与列日大学医院中心(Liège University Hospital Centre)领衔的国际团队,在

陈旧动物皮张古DNA提取方法比较研究获进展

  5月18日,《动物学研究》(Zoological Research)发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所分子古生物学实验室付巧妹研究团队主导,与云南大学、新疆文物考古研究所、大理大学等合作,完成了以《陈旧动物皮张的古DNA提取方法比较的研究》为题的研究成果。  保存在博物馆中的动物标本通常是

古DNA研究揭示青藏高原人群演化历史

记者从中国科学院古脊椎动物与古人类研究所获悉,该所付巧妹科研团队和西藏自治区文物保护研究所、四川大学考古科学中心、西北大学文化遗产学院等合作,针对青藏高原地区古人群开展的大规模、系统性古基因组研究取得重要成果,该成果北京时间3月18日在线发表于综合性科学期刊Science Advances(《科学进

葡萄籽古DNA揭开4000年法国酿酒之谜

  法国科学家通过跨越4000年的葡萄籽古代DNA揭示了法国葡萄的驯化、种植和贸易情况。研究发现,一份中世纪样本与现代黑皮诺葡萄在基因上完全一致,表明该品种已有近600年的连续种植历史。相关研究近日发表于《自然-通讯》。  法国拥有悠久的葡萄种植和酿酒历史,被视为世界领先的葡萄酒生产国之一。尽管以往

古DNA研究对东亚豹母系遗传历史提出新见解

  1月15日,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、西北大学和湖南省文物考古研究院共同主导完成的题为《古DNA准确鉴定湖南老司城遗址残缺头骨以及东亚豹母系遗传历史新见解》(Ancient DNA unravels species identification from Laosicheng site

《Cell》付巧妹:细数古DNA技术发展史

在过去的10年里,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的付巧妹领导的研究人员利用古DNA (aDNA)技术,挖掘出了古人类,尤其是东亚古人类的历史。作为他们工作的一部分,研究人员重建了两个已经灭绝的古人类群体——尼安德特人和丹尼索瓦人的整个基因组;绘制了全球人口迁移和相互作用的历史地图;揭示了最古老的

古线粒体DNA加深对尼安德特人演化认识

  一根在德国西南部发现的古人类股骨,被证明携带了大约27万年前尼安德特人的线粒体DNA(mtDNA)。相关成果7月4日发表于《自然—通讯》,它进一步精确了非洲基因流动至尼安德特人的时间。  对核DNA的分析预测,现代人类从距今约76.5万年前到55万年前在演化上与尼安德特人和丹尼索瓦人分离,而线粒

古DNA研究对东亚豹母系遗传历史提出新见解

  1月15日,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、西北大学和湖南省文物考古研究院共同主导完成的题为《古DNA准确鉴定湖南老司城遗址残缺头骨以及东亚豹母系遗传历史新见解》(Ancient DNA unravels species identification from Laosicheng site

尼安德特人古DNA研究取得重大进展

一项发表于《Current Biology》的国际新研究,对从波兰斯塔伊尼亚洞穴(Stajnia Cave)出土的八颗尼安德特人牙齿中提取的古代线粒体DNA进行了分析。借助这些材料,研究人员成功重建了一小群尼安德特人的遗传画像——它们生活在同一地点、喀尔巴阡山脉以北的同一时期。这是科学家首次在该地区

云南马鹿洞“蒙自人”古DNA研究新进展

  云南位于中国西南山地、东喜马拉雅山地和印缅山地三个世界生物多样性热点的交汇地带。云南独特的地质地貌构造、季风气候环境和水文水系条件,使云南成为第四纪冰期生物的“避难所”,并成为蕴育新物种的摇篮,造就了当地从史前到现在极其复杂的生物多样性和人类文化多样性。云南见证了“寒武纪生物大爆发”的奇迹,目睹

古DNA技术揭示150年前沉船“生命史”

一艘沉没于150年前的船经历了怎样的航程?科研人员从出水瓷瓶内的沉积物中,“打捞”出了它的生命史。通过对长江口二号沉船出水青花双耳瓶中的土壤沉积物进行环境因子与沉积物古DNA分析,来自复旦大学、华东师范大学和上海市文物保护研究中心的团队重建了150年前船货包装、装载与沉没环境等历史细节。相关论文近日