科学家利用生物分子模拟预测代谢酶新功能
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员李国辉团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作,揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能够行使蛋白磷酸酶的功能,并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键作用。相关成果发表在《细胞研究》上。大连化物所供图 有研究表明,磷酸化可溶性代谢物的代谢酶,也可以作为蛋白质激酶磷酸化各种蛋白质底物,进而调节细胞周期、细胞凋亡和许多其他的细胞过程。 合作团队针对这一研究现象,拟先通过理论计算挖掘可作为蛋白质去磷酸化的代谢物磷酸酶。李国辉团队通过分子对接和分子动力学(MD)模拟对57种代谢物磷酸酶进行了高通量筛选,发现糖异生途径中的催化果糖1,6-二磷酸(F-1,6-BP)水解为果糖6-磷酸(F-6-P)的关键代谢酶FBP1,可作为蛋白质磷酸酶。鉴于此,实验合作团队进一步通过磷酸化蛋白质组学分析,......阅读全文
生物分子的透析分离法
一、生物分子透析分离的原理:天然或人工半透膜只允许小分子通过而阻碍大分子通过,当膜的两侧存在小分子浓度差时,小分子从高浓度一侧向低浓度一侧扩散直到平衡。通过离心机分离不断去除扩散出来的小分子,从而达到分离纯化的目的。二、影响生物分子透析分离的因素:1、半透膜的通透性:半透膜的通透性取决于膜孔径的大小
高效测量多个生物分子结合参数
方案优势 MicroCal Auto-iTC200集MicroCal iTC200的高灵敏度—量热仪的核心—和唾手可得的自动化于一身,以满足繁忙的研究和药物发现实验室的生产力需求。 系统直接测量生物化学结合过程中释放或吸收的热量,然后计算出结合亲和力(KD)、化学计量(n)、
生物分子核酸核磁共振光谱
“核酸核磁共振”是利用核磁共振光谱学获得关于多核酸如DNA或RNA的结构和动力学的信息。截至2003年,所有已知RNA结构中近一半已通过核磁共振波谱法确定。核酸和蛋白质核磁共振波谱相似但存在差异。核酸具有较小的氢原子百分比,这是在NMR光谱学中通常观察到的原子,并且因为核酸双股螺旋是刚性的且大致线性
生物大分子样品的保存
生物大分子制成品的正确保存极为重要,一旦保存不当,辛辛苦苦制成的样品失活、变性、变质,使前面的全部制备工作化为乌有,损失惨重,全功尽弃。影响生物大分子样品保存的主要因素有:⑴空气:空气的影响主要是潮解、微生物污染和自动氧化。空气中微生物的污染可使样品腐败变质,样品吸湿后会引起潮解变性,同时也为微生物
脂肪是生物大分子吗
脂质是油、脂肪、类脂的总称。食物中的油性物质主要是油和脂肪,一般把常温下是液体的称作油,而把常温下是固体的称作脂肪。脂肪由C、H、O三种元素组成。脂肪是由甘油和脂肪酸组成的甘油三酯,其中甘油的分子比较简单,而脂肪酸的种类和长短却不相同。 脂肪是由甘油和脂肪酸组成的三酰甘油酯,其中甘油的分子比较
分子诊断在分子生物学中的应用
分子诊断可对多种病原体如细菌、病毒等进行快速、灵敏、准确的诊断,不仅能提早发现疾病,确定病因,还可以及时阻断细菌、病毒的传播,在感染病检测和预防方面有着较为明显的优势。目前主要应用在HBV、HCV、HIV、HSV、TB沙眼衣原体(CT)、淋球菌(NG)、解脲支原体等检测。 例如,
分子生物学实验的品质选择——分子生物学实验用水
Merck Millipore 是世界*超纯水生产品牌,生产产品具有始终如一的高品质,实验重复性优异。纯水是一种生化试剂,为了给广大实验者在日常实验中提供便利,保证无意外发生,Millipore推出了分子生物学瓶装水。该瓶装水具有以下特点可以保证您的分子生物学实验顺利进行:
磷酸酶-a-的测定
实验方法原理 4-α-D-葡聚糖:正磷酸-α-D-葡萄糖基转移酶。酶断裂多糖的α-1,4-糖苷键:(葡萄糖)n+Pi →(葡萄糖)n-1+葡萄糖-1-P实验中反应与葡萄糖磷酸变位酶偶联:葡萄糖-1-P → 葡萄糖-6-P并且 6-磷酸葡萄糖脱氢酶催化:葡萄糖-6-P+NADP+ → 葡萄糖酸-6-P
磷酸酶制备实验
蛋白丝/苏氨酸磷酸酶,1型和2A型(PP-1和PP-2A) 膜蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP) 实验材料 细胞
磷酸酶制备实验
蛋白丝/苏氨酸磷酸酶,1型和2A型(PP-1和PP-2A)膜蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)实验材料细胞 试剂、试剂盒缓冲盐清洗液
磷酸酶制备实验
实验材料 细胞试剂、试剂盒 缓冲盐清洗液抽提缓冲液实验步骤 一、组织/细胞制备和提取1. 配制下列溶液:(1) 缓冲盐清洗液:20 mmol/L 的 MOPS 缓冲液,pH 7.5(配成 100 ml)5 mmol/L 的 EDTA5 mmol/L 的 EGTA120 mmol/L 的 NaCl(2
广州生物院分子逻辑门生物传感研究取得进展
近日,中科院广州生物医药与健康研究院曾令文研究组模拟电子逻辑门运算机理,利用ATP和凝血酶为两种输入信号,依赖核酸适体作为分子识别元件,试纸条检测卡是否出T线为输出信号(有T线说明是阳性结果,有输出信号;没有T线说明是阴性结果,没有输出信号),成功构建了基于核酸适体-靶分子自组装生物分子逻辑门,
微生物分子生物学检测技术
微生物分子生物学检测技术通过对不同样品微生物DNA的提取,将提取的DNA进行扩增并识别,来确定样品中微生物的多样性和种属,具有先进性和准确性,免去了烦琐、需时长的培养过程,可检出传统方法不可培养的微生物,并能原位反映微生物群落结构的真实情况。微生物分子生物学技术的建立,突破了长期以来一直采用的传统微
碱性磷酸酶的测定实验_细菌碱性磷酸酶
实验材料酶样品试剂、试剂盒Tris-HCl磷酸硝基苯仪器、耗材分光光度计实验步骤实验混合物25℃ 时,于 405 nm 处吸收值降低,ε405=18.5×103 l/(mol·cm)。
分子逻辑门生物传感研究获进展
近日,中科院广州生物医药与健康研究院曾令文研究组模拟电子逻辑门运算机理,利用ATP和凝血酶为两种输入信号,依赖核酸适体作为分子识别元件,试纸条检测卡是否出T线为输出信号(有T线说明是阳性结果,有输出信号;没有T线说明是阴性结果,没有输出信号),成功构建了基于核酸适体
生物大分子色谱仪种类
生物大分子色谱仪种类有多种。1、按功能可分:分析型生物大分子色谱仪和制备型生物大分子色谱仪。2、按灵敏性可分:生物大分子微量色谱仪和生物大分子痕量色谱仪。3、按应用范围可分:专用型生物大分子色谱仪和通用型生物大分子色谱仪。4、按固定相性质可分:键合固定相生物大分子色谱仪和硅胶固定相生物大分子色谱仪等
生物大分子的结构与功能
生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展,使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。蛋白质分子的结构分4个层次,其中二级
生物大分子色谱仪种类
生物大分子色谱仪种类有多种。1、按功能可分:分析型生物大分子色谱仪和制备型生物大分子色谱仪。2、按灵敏性可分:生物大分子微量色谱仪和生物大分子痕量色谱仪。3、按应用范围可分:专用型生物大分子色谱仪和通用型生物大分子色谱仪。4、按固定相性质可分:键合固定相生物大分子色谱仪和硅胶固定相生物大分子色谱仪等
生物大分子浓缩、干燥及保存
一、样品的浓缩 生物大分子在制备过程中由于过柱纯化而样品变得很稀,为了保存和鉴定的目的,往往需要进行浓缩。常用的浓缩方法的: 1、减压加温蒸发浓缩 通过降低液面压力使液体沸点降低,减压的真空度愈高,液体沸点降得愈低,蒸发愈快,此法适用于一些不耐热的生物大分子的浓缩。
生物大分子制备的干燥方法
生物大分子制备得到产品,为防止变质,易于保存,常需要干燥处理,最常用的方法是冷冻干燥和真空干燥。真空干燥适用于不耐高温,易于氧化物质的干燥和保存,整个装置包括干燥器、冷凝器及真空干燥原理外,同时增加了温度因素。在相同压力下,水蒸汽压随温度下降而下降,故在低温低压下,冰很易升华为气体。操作时一般先将待
大环生物分子快速合成有新法
美国范德堡大学官网近日发布公告称,该校生化学院化学系教授杰夫瑞·约翰斯顿与其学生开发出一种全新合成技术,能将生物体内重要的环状分子——环缩肽的合成步骤从之前的14步缩减到6步,而且产量更高,环状分子尺寸更大。新化合过程将开启全新的化学运用,更大环状缩肽具有独特的生物特性,可用来开发更高效抗生素、
分子生物学先驱逝世
近日,分子生物学先驱Sydney Brenner去世,享年92岁。Brenner最著名的成就之一是在20世纪六七十年代将秀丽隐杆线虫转变为人类疾病研究的模型系统,这带来了一个新的研究领域。 为此,他与生物学家John Sulston及Robert Horvitz分享了2002年诺贝尔生理学或
脂质是生物大分子吗?
关于生物大分子,人教版教材说:“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子,都是由许多基本的组成单位连接而成的,这些基本单位称为单体,这些生物大分子又称为单体的多聚体。”由于没有明确脂质。造成一线老师对于脂质是不是生物大分子争论不休。其他版本的教材比如北师大版明确以标题的形式出现:贮存能量的大分子——脂
有机分子可在非生物环境下形成
据英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项天文学研究,在实验室的标准天体物理学条件下,美国科学家在紫外线辐射冰混合物后产生的残留物中,检测到了2-脱氧核糖(DNA的糖组分)和若干脱氧糖衍生物。这项研究还首次在碳质陨石样本中鉴定出了若干脱氧糖衍生物,但目前无法明确证实更大的糖类(如2-脱氧核糖)的存
有机分子可在非生物环境下形成
据英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项天文学研究,在实验室的标准天体物理学条件下,美国科学家在紫外线辐射冰混合物后产生的残留物中,检测到了2-脱氧核糖(DNA的糖组分)和若干脱氧糖衍生物。这项研究还首次在碳质陨石样本中鉴定出了若干脱氧糖衍生物,但目前无法明确证实更大的糖类(如2-脱氧核糖)的存在
蛋白质与生物小分子结合
生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物(生物大分子)主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与
生物大分子的结构与功能
生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展,使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。蛋白质分子的结构分4个层次,其中二
脂质是生物大分子吗
关于生物大分子,人教版教材说:“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子,都是由许多基本的组成单位连接而成的,这些基本单位称为单体,这些生物大分子又称为单体的多聚体。”由于没有明确脂质。造成一线老师对于脂质是不是生物大分子争论不休。其他版本的教材比如北师大版明确以标题的形式出现:贮存能量的大分子——脂
蛋白质芯片技术生物分子反应
使用时将待检的含有蛋白质的标本如尿液、血清、精液、组织提取物等,按一定程序做好层析、电泳、色谱等前处理,然后在每个芯池里点入需要的种类。一般样品量只要2-10μL即可。根据测定目的不同可选用不同探针结合或与其中含有的生物制剂相互作用一段时间,然后洗去未结合的或多余的物质,将样品固定一下等待检测即可。
脂质是生物大分子吗?
脂质不属于生物大分子。 脂质包括的范围广泛,其分类方法亦有多种。通常根据脂质的主要组成成分分为:简单脂质、复合脂质、衍生脂质、不皂化脂类。 脂质包括多种多样的分子,其特点是主要由碳和氢两种元素以非极性的共价键组成。由于这些分子是非极性的,所以和水不能相容,因此是疏水的。严格地说,脂质不是大分