科学家利用生物分子模拟预测代谢酶新功能

近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员李国辉团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作,揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能够行使蛋白磷酸酶的功能,并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键作用。相关成果发表在《细胞研究》上。大连化物所供图 有研究表明,磷酸化可溶性代谢物的代谢酶,也可以作为蛋白质激酶磷酸化各种蛋白质底物,进而调节细胞周期、细胞凋亡和许多其他的细胞过程。 合作团队针对这一研究现象,拟先通过理论计算挖掘可作为蛋白质去磷酸化的代谢物磷酸酶。李国辉团队通过分子对接和分子动力学(MD)模拟对57种代谢物磷酸酶进行了高通量筛选,发现糖异生途径中的催化果糖1,6-二磷酸(F-1,6-BP)水解为果糖6-磷酸(F-6-P)的关键代谢酶FBP1,可作为蛋白质磷酸酶。鉴于此,实验合作团队进一步通过磷酸化蛋白质组学分析,......阅读全文

分子逻辑门生物传感研究获进展

  近日,中科院广州生物医药与健康研究院曾令文研究组模拟电子逻辑门运算机理,利用ATP和凝血酶为两种输入信号,依赖核酸适体作为分子识别元件,试纸条检测卡是否出T线为输出信号(有T线说明是阳性结果,有输出信号;没有T线说明是阴性结果,没有输出信号),成功构建了基于核酸适体

分子生态学词汇转基因生物

中文名称:转基因生物外文名称:transgenic Organisms定      义:“转基因生物”一词的最初来源是英语“Transgenic Organisms”,因为在上世纪70年代,重组脱氧核糖核酸技术(rDNA)刚开始应用于动植物育种的时候,常规的做法是将外源目的基因转入生物体内,使其得到

有机分子可在非生物环境下形成

   据英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项天文学研究,在实验室的标准天体物理学条件下,美国科学家在紫外线辐射冰混合物后产生的残留物中,检测到了2-脱氧核糖(DNA的糖组分)和若干脱氧糖衍生物。这项研究还首次在碳质陨石样本中鉴定出了若干脱氧糖衍生物,但目前无法明确证实更大的糖类(如2-脱氧核糖)的存

生物大分子浓缩、干燥及保存

一、样品的浓缩    生物大分子在制备过程中由于过柱纯化而样品变得很稀,为了保存和鉴定的目的,往往需要进行浓缩。常用的浓缩方法的:        1、减压加温蒸发浓缩  通过降低液面压力使液体沸点降低,减压的真空度愈高,液体沸点降得愈低,蒸发愈快,此法适用于一些不耐热的生物大分子的浓缩。      

有机分子可在非生物环境下形成

  据英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项天文学研究,在实验室的标准天体物理学条件下,美国科学家在紫外线辐射冰混合物后产生的残留物中,检测到了2-脱氧核糖(DNA的糖组分)和若干脱氧糖衍生物。这项研究还首次在碳质陨石样本中鉴定出了若干脱氧糖衍生物,但目前无法明确证实更大的糖类(如2-脱氧核糖)的存在

生物大分子的结构与功能

   生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展,使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。蛋白质分子的结构分4个层次,其中二级

生物大分子的色谱纯化方法

一、生物大分子色谱纯化方法的选择思路通常在做纯化前对自己的目标物质特性了解越多对纯化将会越有利,如果不太了解,也可以通过电泳知道目标物质和杂质的情况,找到一种简单的鉴定方法,此外在纯化前必须先建立可靠的活性测定的方法。如果是未知的蛋白,那么通常可以有几种简单的摸索:1. 凝胶过滤色谱。这个方法很常用

生物分子实验室仪器配置

  生物分子实验室仪器配置必需品:   冰箱:   根据药品、试剂及多种生物制剂保存的需要,必须具备不同控温级别的冰箱,最常使用的有:4℃、-20℃、-80℃冰箱。4℃适合储存某些溶液、试剂、药品等。   -20℃适用于某些试剂、药品、酶、血清、配好的抗生素和DNA、蛋白质样品等。   -8

大环生物分子快速合成有新法

  美国范德堡大学官网近日发布公告称,该校生化学院化学系教授杰夫瑞·约翰斯顿与其学生开发出一种全新合成技术,能将生物体内重要的环状分子——环缩肽的合成步骤从之前的14步缩减到6步,而且产量更高,环状分子尺寸更大。新化合过程将开启全新的化学运用,更大环状缩肽具有独特的生物特性,可用来开发更高效抗生素、

分子生物学先驱逝世

   近日,分子生物学先驱Sydney Brenner去世,享年92岁。Brenner最著名的成就之一是在20世纪六七十年代将秀丽隐杆线虫转变为人类疾病研究的模型系统,这带来了一个新的研究领域。  为此,他与生物学家John Sulston及Robert Horvitz分享了2002年诺贝尔生理学或

分子生物学绪论(二)

  (二)现代分子生物学的建立和发展阶段  这一阶段是从50年代初到70年代初,以1953年Watson和Crick提出的DNA双螺旋结构模型作为现代分子生物学诞生的里程碑开创了分子遗传学基本理论建立和发展的黄金。DNA双螺旋发现的最深刻意义在于:确立了核酸作为信息分子的结构基础;提出碱基配对是核酸

生物大分子制备的前处理

生物大分子制备的前处理 生物大分子制备的前处理(生物材料的选择、细胞破碎、生物大分子的提取) 1 生物材料的选择  制备生物大分子,首先要选择适当的生物材料。材料的来源无非是动物、植物和微生物及其代谢产物。从工业生产角度选择材料,应选择含量高、来源丰富、制备工艺简单、成本低的原料,但往往这几方面的要

分子生物学绪论(三)

  2 基因组研究的发展  目前分子生物学已经从研究单个基因发展到研究生物整个基因组的结构与功能。1977年Sanger测定了ΦX174-DNA全部5375个核苷酸的序列;1978年fiers等测出SV-40DNA全部5224对碱基序列;80年代λ噬菌体DNA合部48502碱基对的序列全部测出;一些

蛋白质与生物小分子结合

生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物(生物大分子)主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与

生物大分子的结构与功能

    生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展,使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。蛋白质分子的结构分4个层次,其中二

脂质是生物大分子吗

  关于生物大分子,人教版教材说:“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子,都是由许多基本的组成单位连接而成的,这些基本单位称为单体,这些生物大分子又称为单体的多聚体。”由于没有明确脂质。造成一线老师对于脂质是不是生物大分子争论不休。其他版本的教材比如北师大版明确以标题的形式出现:贮存能量的大分子——脂

分子生物学绪论(一)

  一、分子生物学的基本含义  分子生物学是从分子水平研究生命本质为目的的一门新兴边缘学科,它以核酸和蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信息和细胞信息传递中的作用为研究对象,是当前生命科学中发展最快并正与其它学科广泛交叉与渗透的重要前沿领域。分子生物学的发展为人类认识生命现象带来了前所未有的机会,也

胃动素分子生物学特性

1 分子生物学特性    1.1 MTL分子结构及分布 MTL是由22个氨基酸组成的单链多肽,由Brown等于1966年在研究十二指肠pH变化和胃动力间关系过程中发现的,并于1972年将其分离并提纯,因能刺激胃小体运动而得名。MTL的化学结构为苯丙-缬-脯-异亮-苯丙-苏-酪-甘-谷-亮-谷酰-精-

焦磷酸酶的功能

此酶的功能乃是在脂代谢(包括脂合成与分解)、钙吸收以及骨形成和DNA合成中扮演重要角色,其他生物化学转化也是如此。

磷酸酶-a-的测定实验

实验方法原理4-α-D-葡聚糖:正磷酸-α-D-葡萄糖基转移酶。酶断裂多糖的α-1,4-糖苷键:(葡萄糖)n+Pi →(葡萄糖)n-1+葡萄糖-1-P实验中反应与葡萄糖磷酸变位酶偶联:葡萄糖-1-P → 葡萄糖-6-P并且 6-磷酸葡萄糖脱氢酶催化:葡萄糖-6-P+NADP+ → 葡萄糖酸-6-P+

焦磷酸酶的功能

此酶的功能乃是在脂代谢(包括脂合成与分解)、钙吸收以及骨形成和DNA合成中扮演重要角色,其他生物化学转化也是如此。

如何提高磷酸酶水平?

  改善饮食习惯:增加富含健康脂肪的食物,如鳕鱼肝油、椰子油和玉米油,有助于提高磷酸酶水平。同时,增加蛋白质的摄入,例如多吃鱼肉、鸡肉、苹果和黄瓜,也有助于提升身体内的酶含量。  补充营养元素:确保日常饮食中含有足够的锌元素,锌是许多酶合成所必需的微量元素。食物来源包括牡蛎、红肉、家禽、豆类和坚果等

磷酸酶-a-的测定实验

基本方案             实验方法原理 4-α-D-葡聚糖:正磷酸-α-D-葡萄糖基转移酶。酶断裂多糖的α-1,4-糖苷键:(葡萄糖)n+Pi →(葡萄糖)n-1+葡萄糖-1

磷酸酶的催化机制

半胱氨酸依赖的磷酸酶通过形成磷酸-半胱氨酸中间体来催化磷酸酯键的断裂,具体过程如下(以磷酸化的酪氨酸去磷酸化过程为例,参见右图)[1]首先,酶活性位点上的自由的半胱氨酸亲核基团进攻磷酸基团中的磷原子并成键;然后,连接磷酸基团与酪氨酸的P-O键接受位置合适的酸性氨基酸(如天冬氨酸)或水分子所提供的质子

如何预防磷酸酶过低?

  改善饮食习惯:建议多吃动物的肝脏,促进身体对铁质的吸收,多吃新鲜的蔬菜,通过补充叶酸,促进红细胞的生成,达到辅助造血的功能。如果磷酸酶过低是由慢性疾病导致的,需要针对疾病进行治疗。  定期进行相关检查:如果您的磷酸酶水平低于正常值,建议定期进行肝功能测试或其他血液检查,以便及时发现问题并采取相应

酸性磷酸酶染色

  经染色后,细胞浆内可见棕色或棕黑色颗粒或片状沉淀,为阳性反应。  中性粒细胞,单核细胞、T-淋巴细胞、浆细胞、网状细胞、组织细胞(包括吞噬细胞、多毛细胞、组织嗜碱细胞)呈阳性反应。  红细胞系列、巨核细胞及血小板等一般为阴性反应。B-淋巴细胞、非T-非B淋巴细胞亦呈阴性。  【临床意义】  用以

蛋白酪氨酸磷酸酶

蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)是一组酶,它们具有具有磷酸酪氨酸特异性磷酸水解酶活性的催化结构域。PTP能够以正向和负向方式改变受体酪氨酸激酶的活性。PTPs可以使RTKs上激活的磷酸化酪氨酸残基去磷酸化,这实际上导致信号终止。涉及PTP1B的研究表明,PTP1B是一种广为人知的参与细胞周期和细胞因子受体

磷酸酶活性如何检测?

  比色法:这种方法利用酶促反应产生的游离酚或其衍生物与特定试剂发生颜色反应,然后通过分光光度计测定反应混合物的吸光度来评估酶活性。例如,碱性磷酸酶(ALP)可以通过在碱性条件下使磷酸苯二钠水解生成游离酚,再与4-氨基安替比林反应并形成醌类化合物,其颜色的深浅与ALP活性成正比。  连续监测法:这种

碱性磷酸酶的测定实验_哺乳动物碱性磷酸酶

正磷酸单酯磷酸水解酶(最适碱度)。正磷酸单酯+H2O → 醇+Pi这个酶可以从各种渠道得来,如细菌和哺乳动物肠黏膜。每个酶分子有两个 Zn2+离子键。碱性的磷酸酶频繁地与抗体配位,例如在 Westernblots 中及酶联免疫鉴定(ELISA)中。细菌酶的最适 pH 是 8.0,哺乳动物的要较高一点

微生物分子生物学检测新技术问世

  日前,中国地质科学院水环所经过积极探索,反复试验,建立了适合土样和地下水样的微生物分子生物学检测高新技术。   微生物分子生物学检测技术通过对不同样品微生物DNA的提取,将提取的DNA进行扩增并识别,来确定样品中微生物的多样性和种属,具有先进性和准确性,免去了烦琐、需时长的培养过程,可检出传统