科学家利用生物分子模拟预测代谢酶新功能

近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员李国辉团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作,揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能够行使蛋白磷酸酶的功能,并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键作用。相关成果发表在《细胞研究》上。大连化物所供图 有研究表明,磷酸化可溶性代谢物的代谢酶,也可以作为蛋白质激酶磷酸化各种蛋白质底物,进而调节细胞周期、细胞凋亡和许多其他的细胞过程。 合作团队针对这一研究现象,拟先通过理论计算挖掘可作为蛋白质去磷酸化的代谢物磷酸酶。李国辉团队通过分子对接和分子动力学(MD)模拟对57种代谢物磷酸酶进行了高通量筛选,发现糖异生途径中的催化果糖1,6-二磷酸(F-1,6-BP)水解为果糖6-磷酸(F-6-P)的关键代谢酶FBP1,可作为蛋白质磷酸酶。鉴于此,实验合作团队进一步通过磷酸化蛋白质组学分析,......阅读全文

基于生物分子构象变化的生物传感策略研究获进展

利用DNA分子构象变化发展新型生物传感策略  近日,权威化学综述杂志Accounts of Chemical Research发表了中国科学院上海应用物理研究所物理生物学实验室樊春海课题组撰写的邀请综述文章 (Target-responsive structures for nucleic acid

低温保存对生物样本及其生物大分子的影响

引言生物样本库主要是指收集和应用健康及疾病生物体的生物分子、细胞、组织和器官等,包括人体器官、组织、体液或处理过的样本(DNA、RNA、蛋白等),以及与这些样本相关的临床资料、质控、管理等生物应用系统。在医学研究中,生物样本是联系分子信息与疾病的桥梁。根据使用目的的区别,样本的保存要求也会有所差别。

碱性磷酸酶的测定实验_哺乳动物碱性磷酸酶

正磷酸单酯磷酸水解酶(最适碱度)。正磷酸单酯+H2O → 醇+Pi这个酶可以从各种渠道得来,如细菌和哺乳动物肠黏膜。每个酶分子有两个 Zn2+离子键。碱性的磷酸酶频繁地与抗体配位,例如在 Westernblots 中及酶联免疫鉴定(ELISA)中。细菌酶的最适 pH 是 8.0,哺乳动物的要较高一点

生物活性分子体内原位构筑超分子组装体研究获新进展

  随着纳米生物技术和纳米医药的发展,生物活性分子体内原位构筑超分子组装体的概念越来越受人们的重视。实现对聚合物的可控组装调控,对改进材料在体内的生物效应和安全性,具有重大意义。但是,由于生物医用材料在体内的生物过程极其复杂,如何实现聚合物在病生理条件下的组装调控,是医用高分子领域极具挑战性的科学问

距今6.5亿年古生物分子化石现身

  据澳大利亚国立大学(ANU)官网8月17日消息,该校科研团队在澳大利亚中部古代沉积岩中找到了距今6.5亿年的古代生物分子化石,并据此认为此前的“雪球地球”时期与更复杂的生命演化有关。研究成果发表在最新一期的《自然》杂志上。  消息称,该校地球科学研究学院的科学家将古代沉积岩粉碎成粉末,并从中提取

噬菌体让生物分子进化增速100倍

  据美国物理学家组织网近日报道,美国科学家在《自然》杂志上撰文指出,他们利用噬菌体,在实验室中让生物分子的进化速度提高了100倍。新研究有望让制药业使用实验室培育出来的蛋白质、核酸和其他成分按需制药。   该研究的领导者、哈佛大学化学和生化教授戴维·刘说,大多数现代药物都由有机小分子制成,但某

《自然》:研究揭示生物钟的分子“开关”

这是迄今为止得到的关于人体生理节奏研究最明确的信息 调节人体内部生物钟的遗传机制一直是科学家研究的热点问题。近日,美国科学家发现了触发这一机制的化学“开关”。这是迄今为止得到的关于人体生理节奏(circadian rhythms)研究最明确的信息,为失眠以及其它相关疾病的药物治疗确定了精确的标靶。

分子生物学技术的应用

  分子生物学技术:可应用于遗传性疾病的研究和病原体的检测及肿瘤的病因学、发病学、诊断和治疗等方面的研究提高到了基因分子水平。  生物学定义:生物学是研究生命现象和生物活动规律的科学。  据研究对象分为动物学、植物学、微生物学、古生物学等;依研究内容,分为分类学、解剖学、生理学、细胞学、分子生物学、

生物大分子的结构特点和功能

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

生物分子蛋白质核磁共振光谱

利用核磁谱研究蛋白质,已经成为结构生物学领域的一项重要技术手段。X射线单晶衍射和核磁都可获得高分辨率的蛋白质三维结构,不过核磁常局限于35kDa以下的小分子蛋白,尽管随着技术的进步,稍大的蛋白质结构也可以被核磁解析出来。另外,获得本质上非结构化(Intrinsically Unstructured)

新型潜在分子或可用于检测生物老化

  近日,Doug博士说:“鉴于早期干预的需要,许多当前治疗阿尔茨海默氏症的药物正在疾病的早期阶段被测试,甚至在症状开始之前就已经开始测试了。进一步的研究可以帮助我们发现新的治疗方法,让更容易患阿尔茨海默氏症的人来参与临床试验。”  “先前的研究已经确定了阿尔茨海默氏症患者的血液标记,但他们在定期研

分子生物学技术的分类

  目前,常用的分子生物学技术有如下几种[1]:  PCR单链构象多态性分析  PCR-单链构象多态性分析(PCR -single strand conformation analysis,PCR -SSCP) 是近年来在基因突变检测中运用最广泛的方法之一。PCR -SSCP 技术凭借突变可引起单链

口蹄疫分子生物学诊断技术

近年来,由于分子生物学技术的迅速发展及其在FMD诊断中的应用,建立了各种FMD的分子生物学诊断技术,主要包括以下几种方法,核酸杂交、等电点聚焦电泳、寡核苷酸指纹图谱分析、聚丙烯酰胺凝胶电泳、聚合酶链式反应、单克隆抗体技术等。(1)核酸探针 核酸探针即应用FMD的cDNA克隆片段,用32P或生物素等标

葵花盘小分子肽-神奇的生物炸弹

  说起痛风,马上联想到的便是无法忍受的疼痛、肿胀的关节、无休止的结石,这还不是最可怕的,若发展到肾功能损害以至尿毒症便会危及生命。   “越是经济发达的国家,得痛风的就越多,经济发达,生活方式发生改变,所以痛风发病趋势正在上涨,尽管医疗水平日趋发达,但是针对痛风,依然束手无策。”吉林大学生命科学

分子生物学常用试剂配置

一、分子生物学常用贮存液的配制1、30%丙烯酰胺溶液【配制方法】将29g丙烯酰胺和1g N,N'-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml.用滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。【注意】丙烯

分子生物学实验诊断技术

一、酸杂交技术检验方法建立的基本要素是特异性和灵敏度,在复杂的物体中,使无法感觉的特定物质进入人类的观察范围。核酸杂交检测技术就是利用核酸碱基严格配对的特异性,核酸标记物的灵敏度而建立的检测核酸结构与功能的方法。该法建立以来已有二十年,目前研究实验室用得多,临床实验室用得较少,除成本高外,关键是操作

分子技术快速检测食品有害微生物

食品污染大多数是因为病原微生物引起的,传统的检验病原体的方法主要依靠具体的微生物学和生物化学免疫识别技术,比如培养基方法、分子生物学方法和免疫技术检测,这些方法都能定量定性分析病原体,但它们耗时、花费大,且需要专业的技术人员。而新的分子技术如生物传感器、微阵列、电子鼻子和纳米装置等能更快更准确地检测

分子生物学的应用范围

现代生物学研究的目标是要在分子水平上阐明细胞活动的规律,揭示生命的本质。分子水平的生物学研究已经广泛的应用于组织学、细胞学、解剖学、胚胎学、遗传学、生理学和进化论等各个传统的生物科学领域。

深海微生物抗癌分子机制发现

北京3月22日,根据21日发表在《自然·化学生物学》上的论文,美国加州大学圣地亚哥分校斯克里普斯海洋研究所研究人员揭示了一种被称为salinosporamide A(又名马里佐米)的海洋微生物是如何制造出有效抗癌分子的,他们首次了解了激活该分子的酶驱动过程。 19

分子生物学实验小技术

当找到可能的重组质粒且条带清晰时可直接切下含DNA 的凝胶条带,用胶回收DNA 的方法回收质粒并进行酶切鉴定,如果DNA 量太少则需重提质粒。 用QIAprep Miniprep Spin 小量提质粒注意以下事项可提高得率A.用含抗生素的培养基培养细菌会有较高的得率。B.收菌时用tips吸干净残余的

关于生物分子核磁共振光谱的介绍

  1、蛋白质  利用核磁谱研究蛋白质,已经成为结构生物学领域的一项重要技术手段。X射线单晶衍射和核磁都可获得高分辨率的蛋白质三维结构,不过核磁常局限于35kDa以下的小分子蛋白,尽管随着技术的进步,稍大的蛋白质结构也可以被核磁解析出来。另外,获得本质上非结构化(Intrinsically Unst

土壤的分子生物学特性

在我们的实验室里,最难搞的样品类型之一就是土壤。在开发提取土壤中微生物DNA、RNA的试剂盒和构思提取方法的过程中,我们需要收集记录大量各种类型土壤的有机物含量、质地、pH以及采集地。这些因素与土壤微生物含量息息相关,同样地也影响着提取DNA、RNA的得率。下文,我将介绍一些影响土壤DNA、RNA提

你了解生物大分子的类型吗

什么是生物大分子(biomacromolecules)?有的教科书认为生物大分子包括核酸、蛋白质、糖类和脂质等4类物质,而有的教科书上只提到核酸、蛋白质和糖类等3类物质。那么究竟如何界定生物大分子的涵义呢?大分子(Macromolecule)这一术语最先是由德国化学家、诺贝尔奖获得Hermann S

分子生物学指的是什么

分子生物学是指在分子水平上研究生命现象的科学,从生物大分子(核酸、蛋白质)的结构、功能和生物合成等方面来阐明各种生命现象的本质。研究内容包括各种生命过程,如光合作用、发育的分子机制、神经活动的机理、癌的发生等。生物大分子,特别是蛋白质和核酸结构功能的研究,是分子生物学的基础。

深海微生物抗癌分子机制发现

北京3月22日,根据21日发表在《自然·化学生物学》上的论文,美国加州大学圣地亚哥分校斯克里普斯海洋研究所研究人员揭示了一种被称为salinosporamide A(又名马里佐米)的海洋微生物是如何制造出有效抗癌分子的,他们首次了解了激活该分子的酶驱动过程。    1990年,斯克里普斯海洋研究

生物大分子的分离纯化技术概述

生物大分子是指蛋白质(包括酶)、多聚糖和核酸类化合物,分子量从几千到几百万,广泛存在于各种生物体内,与各种生命活动息息相关。生物大分子具有十分重要的生理功能和应用价值,研究生物大分子的结构、功能和应用已成为生命科学的一个关键问题。不论是从动植物和微生物体内提取的生物大分子产品,还是用生物工程制备的生

生物大分子样本的贮存方法

生物大分子的稳定性与保存方法的很大关系。干燥的制品一般比较稳定,在低温情况下其活性可在数日甚至数年无明显变化,贮藏要求简单,只要将干燥的样品置于干燥器内(内装有干燥剂)密封,保持0-4度冰箱即可,液态贮藏时应注意以下几点。1、样品不能太稀,必须浓缩到一定浓度才能封装贮藏,样品太稀易使生物大分子变性。

分子生物学常用溶液配制

分子生物学常用溶液配制一、分子生物学常用贮存液的配制1.30%丙烯酰胺溶液【配制方法】将29g丙烯酰胺和1g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。用滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温

生物大分子的化学进行过程介绍

从有机小分子物质形成生物大分子物质。在原始还原性大气中生成的生物小分子(如氨基酸等)被雨水冲淋,溶解于原始海洋中,这些生物小分子要进一步变为生物大分子(如氨基酸变为蛋白质),就必须脱水缩合;而在原始海洋中进行脱水缩合,就像要使泡在水中的葡萄变干那样困难。科学家提出种种假说试图解决这个难题,比较可信而

几种生物大分子的特异性

  [摘 要]本文将探讨高中生物教材上经常涉及到的几种生物大分子的特异性:载体蛋白的特异性、酶的特异性、DNA分子的特异性、受体的特异性以及抗原—抗体结合的特异性。   [关键词]特异性 生物大分子 选择透过性 诱导契合 碱基排序   配体 浆细胞   1.载体蛋白的特异性    载体蛋白是几乎所有