基因组育种大数据计算新工具“天权”发布
近日，国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）发表了华中农业大学动物遗传育种团队开发的基因组育种大数据计算新工具HIBLUP，中文名为“天权”。相关论文被期刊评为“突破性进展”论文。 该研究系统分析了已有遗传评估算法特点，针对现有算法在处理快速增长的基因组育种大数据时面临的瓶颈问题，首创基于V矩阵的“HE+PCG”策略，可完全避免遗传评估计算过程中的大矩阵求逆，开发出更适合基因组育种大数据时代的高性能计算新工具HIBLUP。与现有工具相比，“天权”计算速度最快且消耗内存最少，而且基因分型个体在群体中占比越大，优势愈明显。此外，“天权”软件功能丰富、操作便捷，可运行于Windows、Linux、macOS等平台，并且全面适配国产Kunpeng（鲲鹏）生态。 遗传评估是育种的基础，随着基因组育种时代的来临，育种数据规模快速增长，评估算法的计算速度已成为育种中的关键限制因素。遗传评估主要包括方差......阅读全文
华大参与：复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法，都依赖于与参考基因组的对比，但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog
5大玩家竞逐下一代基因测序数据游戏
【导语】美国化学学会(ACS)出版的新闻周刊C&EN以基因测序为主题发表了封面文章“下一代基因测序是一场数据游戏”，文中指出：2013年基因测序市场规模为13亿美元，其中Illumina市场占有率为71%；被赛默飞世尔收购的Life Tech居第二；罗氏排名第三；另外文中还公布了影响用户购买测线
2014大数据与数据科学进展主题论坛在京举行
12月27日，2014年大数据与数据科学进展主题论坛在京举行。包括徐宗本等5位院士在内的来自学界、商界和政府部门的60多名专家学者参加了论坛，围绕今年国际上大数据与数据科学的最新进展和面临的挑战展开了研讨。 本次论坛由中国计算机学会主办，中国计算机学会大数据专家委员会、中科院虚拟经济与数据科学
2022大数据科技传播奖揭晓
由中国科技新闻学会、湖南省科协、衡阳市人民政府联合开展的2022年大数据科技传播奖评选活动近日揭晓，共评出特殊贡献奖7名，作品奖9件，团体奖13个，个人奖28名。本次评选活动经郭华东、李兰娟、褚君浩等院士担纲的大数据科技传播奖评审委员会严格评选审定，依照《大数据科技传播奖奖励办法》规定，评选中国工程
三大数据展现南水北调工程效益
新华社北京8月25日电 题：三大数据展现南水北调工程效益新华社记者刘诗平8月25日，南水北调中线穿黄工程通过水利部主持的设计单元工程完工验收。至此，南水北调东、中线155个设计单元工程全部通过水利部完工验收。据统计，如今南水北调工程累计调水超过560亿立方米、受益人口超过1.5亿人，充分展现了这一工
谷歌致力于基因数据市场，整合Tute Genomics基因数据库
谷歌希望凭借人类基因组云端服务Google Genomics在基因组研究市场占有一席之地，如今，公司正忙于用最好的工具来填满这个工具箱。 Google Genomics是谷歌2013年推出的一项云端服务，帮助大学实验室和医院等机构将患者或科研对象的生物基因储存到云端上，推进人类基因组信息的存
基因测序技术大升级
DNA就像是漆黑的夜里萤火虫发的光，第二代测序技术无法辨别每一只萤火虫，所以就把上千只萤火虫放在同一个袋子里，才能收集到它们的光。但第三代技术却可以辨别每一只萤火虫，而且可以同时测量很多个DNA片断。 日前，南方科技大学生物系副教授贺建奎与另外几名中美科学家联合在生物医学杂志BioRxiv上
缺乏数据使用指导原则，基因组数据共享遇阻
基因组数据共享将生物医学研究推向快车道，但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性，另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。 在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来，这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用
郭华东：大数据+大科学=大发现
中科院遥感与数字地球所所长 郭华东院士 “大数据是财富，是资源，是科研的战略高地。大数据正在改变人们的研究方式，是人类认识自然和行星地球的新钥匙。” 这是中国科学院院士、中科院遥感与数字地球所所长郭华东于日前在北京召开的大数据与科学发现国际研讨会上做出的判断。从数据发展历史看，19世纪70年代
美国推进癌症基因数据共享
美国麦利亚德基因公司(Myriad Genetics)拥有关于乳腺癌和卵巢癌的两个基因的专利，这让它们垄断乳腺癌检测的行业多年。虽然美国最高法院在去年六月已经对这两个基因的专利做了无效判决，但该公司仍然掌握这独有的130万份的检测数据。这些信息则使得麦利亚德公司在检测结果解释上有巨大优势。但是遗
基因芯片数据的分析方法
研究背景：基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测，探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义，这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据，其分析方法和思路都大同小异，这里分享一个多组实验设
大数据：助力判定癌症驱动基因！
目前已知超过100个新的癌症驱动基因，帮助解释了怎样的肿瘤驱动会造成：相同的癌症基因导致不同的病患！ 在一项由Sanford Burnham Prebys医学发现研究所(SBP)引导下的协作研究中,研究人员结合两个公开的“组学”数据库创建一个新的目录“癌症驱动者”。当癌症驱动基因的改变造成癌症
群众基因数据：揭示疾病病因
本月月初，来自40个国家的研究人员和提倡者成立了一个全球联盟来开启安全共享的基因组和临床数据库，目的是为了在这个时代结束时可以使人类能够利用遗传数据。 英国政府，凯萨医疗机构及美国共同努力收集和整理了大量的遗传数据。但是随着全球的联盟，有一天临床医生可以广泛使用遗传数据，全世界的研究者可以
基因芯片数据的分析方法
研究背景：基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测，探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义，这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据，其分析方法和思路都大同小异，这里分享一个多组实验设
6大亮点！12所“双一流”高校就业数据大起底
谈起应届毕业生就业的话题，双一流人才的去向是其中一个备受瞩目的风向标。 日前，清华、北大等12所双一流高校陆续发布了《2021年毕业生就业质量报告》。在刚刚过去的一年，面对疫情形势反复、行业政策调整等种种变局，应届研究生的就业方向产生了一些刻着鲜明“时代烙印”的新变化。 而对大多数高校毕业生
医疗大数据何去何从 听听几位大咖的前瞻
当大数据遇上医疗，到底会产生怎样的火花？11月28-29日，2015中国医疗健康大数据峰会暨智慧医疗专家委员会年会在京召开，来自医疗界、产业界的专家学者们齐聚一堂，畅聊医疗大数据激起的改变以及日后的无限可能。 贵州省卫计委卫生信息中心主任严刚：建起国内首个大数据中心 国家发改委于2011年提
嵌入式大容量数据存储解决方案
方案简介随着高性能嵌入式微处理器价格的逐渐降低以及芯片级存储介质的存储密度的提高，采用以高性能嵌入式微处理器为系统核心，结合大容量存储芯片，实现高性能、低功耗、低成本、小体积的嵌入式大容量数据存储，具有无可比拟的优势…详细信息：成功案例某单位舰载信息黑匣子消防主机监控与采集终端应用背景随着32位嵌入
COD测定时数据不准，偏差大的原因
数据不准，偏差大：1、选用仪器的低量程档测量；2、氯离子的影响，如果水样中氯离子超过1000mg/L，可将水样稀释后测量；如果稀释后COD浓度很低，可能为试剂的问题，试剂过期或者保存不当变质，或者非原厂试剂；空白样的问题，空白样不准确对测量结果影响很大；蒸馏水不纯，或者选用其他类型水（如桶装水、矿泉
谷歌将提供基因数据在线服务
近日，谷歌公司宣布将开始提供由生物医学研究机构 Broad 研究所开发的DNA 分析软件的云服务版本。 Broad 研究所是由来自哈佛大学、麻省理工学院和哈佛大学附属医院的科学家组成的。该机构的基因组分析工具包GATK，可用于分析基因组测序数据，并已被研究人员和企业下载20000 次。谷
基因数据噪音或可保护患者隐私
大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过，对于贡献了DNA的人来说，这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示，黑客能利用网络上公开可用的信息，从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。 为解决这些担忧，一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berger
Science：癌症基因数据提出技术质疑
据美国国立癌症研究所的一位病理学家David Levens称，在PubMed数据目录上有超过25,000篇关于Myc基因的论文，这种基因与转移性癌症有关，但是现在由于一项最新研究成果，因此都需要重新再评估，这项研究指出了Myc的致癌作用比大多数人认为的都要更广泛，而目前的实验方法具有缺陷，也
冰岛基因公司数据挖掘计划泡汤
图片来源：基因解码公司 因采集冰岛人DNA用于发现基因和疾病之间关系而著名的基因解码公司遇到了一个棘手问题。近日，《科学》杂志报道称，冰岛负责监督数据保密性的国家机构驳回了基因解码公司的请求——该公司希望可以使用计算机方法分析该国的宗系记录，以估算28万名并未同意参与该公司的研究，
基因数据分析的主流软件
基因组测序在过去的几年中，许多生物的基因组完成了测序工作，如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用，正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具，已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取，那些基于
基因数据分析的主流软件
在过去的几年中，许多生物的基因组完成了测序工作，如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用，正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具，已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取，那些基于表达序列同
2020年大数据产业规模将达千亿元
大数据作为信息经济必备的战略资源，已成为引领信息时代的重要基石，云计算作为信息技术应用和服务模式创新的集合体，是支撑大数据深化应用的基础平台。为提升创新创业能力，疏解非首都功能、构建“高精尖”经济结构，昨日，市政府常务会审议通过《北京市大数据和云计算发展行动计划（2016-2020年）》。 该
手持式烟气流速仪大容量数据存储
一、产品概述DL-6600SG型烟气流速检测仪(以下简称检测仪）为便携式监测仪，广泛应用于锅炉、炉窑以及各种排风管道的气体流速、气体流量、气体动压、静压及温度等参数的测定。二、适用范围本仪器采用皮托管法测量管道中气体流速,可对各种锅炉、工业炉窑以及排风管道的气体流速、温度、压力等参数进行检测，仪器采
手持式烟气流速仪大容量数据存储
一、产品概述 DL-6600SG型烟气流速检测仪(以下简称检测仪）为便携式监测仪，广泛应用于锅炉、炉窑以及各种排风管道的气体流速、气体流量、气体动压、静压及温度等参数的测定。 二、适用范围 本仪器采用皮托管法测量管道中气体流速,可对各种锅炉、工业炉窑以及排风管道的气体流速、温度
数据中心电力浪费大 行业有何办法应对？
电力行业的浪费主要在两个部分，服务器利用不足和错误的激励方向，后者则主要出现在多租户数据中心。在多租户数据中心，激烈的对象应该是能源效率策略制定者以及能源费用支付者，NRDC建议采取措施来加速能源节省步伐及规模。 激励需要用对地方 虽然多租户设施被认为比自建设施更具备能源效率，但是NRDC表
大容量恒温摇床具有强大的数据处理功能
大容量恒温摇床采用微电脑全智能控制系统，功能强大，抗干扰能力强，可实现昼夜1-24个时间段的温度和光照度参数的自由组合，达十段编程。 整机静音设计，静电喷塑箱体，配有钢化玻璃观察视窗，随时观察箱内的温及光照状况，内置式顶部光照，专用生物光源，光谱特性好，强度高，发热小，特别适合实验要求，超温声光
数据安全谁来保障？美国：我有4大法宝
7月6日消息，当地时间周二，美国国家标准与技术研究院（NIST）对后量子密码标准化项目进行第三轮筛选后公布了四项加密算法，目的是在量子计算机成熟到足以破解当前加密技术时仍能确保计算机数据安全。科学家已经证实，如果量子计算机技术持续发展，总有一天能破解现行加密技术。NIST设计和测试后量子密码技术的目