大数据：助力判定癌症驱动基因！
目前已知超过100个新的癌症驱动基因，帮助解释了怎样的肿瘤驱动会造成：相同的癌症基因导致不同的病患！ 在一项由Sanford Burnham Prebys医学发现研究所(SBP)引导下的协作研究中,研究人员结合两个公开的“组学”数据库创建一个新的目录“癌症驱动者”。当癌症驱动基因的改变造成癌症的继续。研究人员通过改变正常的蛋白质相互作用(PPI)的接口，使用癌症突变和蛋白质结构数据库来判定患者的肿瘤突变。这项研究发表在近期的PLos的计算机生物学版面上，已鉴定超过100个新的癌症驱动基因，帮助解释了怎样的肿瘤驱动造成：相同的癌症基因导致不同的病患。 “这是第一次将蛋白质三维的特性用于识别在大型癌症基因数据集的癌症驱动基因,如质子泵抑制剂,”据文章作者，SBP的博士后研究员爱德华博士说, SBP博士后研究员。“我们发现71年以前未被识别的蛋白质作为癌症驱动基因,代表了潜在的新癌症预测标记和/或药物靶点。我们的分析同时也辨认......阅读全文
大数据：助力判定癌症驱动基因！
目前已知超过100个新的癌症驱动基因，帮助解释了怎样的肿瘤驱动会造成：相同的癌症基因导致不同的病患！ 在一项由Sanford Burnham Prebys医学发现研究所(SBP)引导下的协作研究中,研究人员结合两个公开的“组学”数据库创建一个新的目录“癌症驱动者”。当癌症驱动基因的改变造成癌症
《Nature》：癌基因“地震扩增”，驱动多种癌症！
染色体外DNA（ecDNA）是一类特殊的从正常基因组上脱落下来的游离于染色体外的环状DNA。早在1964年，人们就在神经母细胞瘤细胞中观察到了ecDNA的存在 ，但由于技术受限，人们对于ecDNA在肿瘤发生发展中发挥的具体作用未能有更进一步认识。 2017年Paul Mischel团队在《自然
Nature子刊揭示新型癌症驱动基因
研究人员发现了一种基因驱动了1%癌症患者的肿瘤形成。这是首次证实CUX1基因与癌症形成存在广泛的联系。 研究小组发现，当CUX1失活时激活了一种促进肿瘤生长的生物信号通路。当前有一些抑制这一信号通路的药物正在临床使用或进入研发阶段，因此为携带这种致癌突变的患者提供了一种潜在的靶向新疗法。
美国推进癌症基因数据共享
美国麦利亚德基因公司(Myriad Genetics)拥有关于乳腺癌和卵巢癌的两个基因的ZL，这让它们垄断乳腺癌检测的行业多年。虽然美国最高法院在去年六月已经对这两个基因的ZL做了无效判决，但该公司仍然掌握这独有的130万份的检测数据。这些信息则使得麦利亚德公司在检测结果解释上有巨大优势。但是遗
三分钟读懂癌症驱动基因
驱动基因，是与癌症发生发展相关的重要基因，找到驱动基因后癌症的治疗就事半功倍。 在2012年的亚洲肿瘤大会上，广东省人民医院副院长吴一龙教授提出“驱动基因”这个概念。与癌症发生发展相关的重要基因称为驱动基因，驱动基因决定了这个癌症的最主要的原因。当驱动基因突变后，就会把癌细胞“驱动”起来。
一滴血可测出癌症驱动基因
癌症为何可以轻易打倒我们？我们又该如何反击？科学界和医学界一直在努力探索。昨天，由南京医科大学第一附属医院（暨江苏省人民医院）肿瘤中心主办的第七届“南京肿瘤临床与转化医学论坛暨金陵肿瘤学高峰论坛”在宁召开。参会专家认为，现代癌症高发，除了老龄化的实际问题，和现代人的生活习惯和心态有着很大关系。据
Science：癌症基因数据提出技术质疑
据美国国立癌症研究所的一位病理学家David Levens称，在PubMed数据目录上有超过25,000篇关于Myc基因的论文，这种基因与转移性癌症有关，但是现在由于一项最新研究成果，因此都需要重新再评估，这项研究指出了Myc的致癌作用比大多数人认为的都要更广泛，而目前的实验方法具有缺陷，也
转座因子驱动癌基因在人类癌症中广泛表达
近日，华盛顿大学医学院等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Transposable elements drive widespread expression of oncogenes in human cancers”的文章，发现转座因子驱动癌基因在人类癌症中的广泛表达。
PNAS：科学家鉴别出新型癌症驱动基因
近日，一篇发表于Proceedings of the National Academy of Sciences上题为“Leveraging protein dynamics to identify cancer mutational hotspots using 3D structures”的研究报
“三驾马车”驱动癌症
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/4/477944.shtm 加拿大研究人员近日在《代谢物》发表的一项综述研究认为，虽然癌症是一种遗传疾病，但遗传因素只是谜题的一部分，人们还需要考虑环境和代谢因素。 阿尔伯塔大学生物科学系和计算机科学系
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium，简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症，加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
研究发现低氧驱动癌症生长
《分子细胞生物学期刊》(Journal of Molecular Cell Biology)2012年第3期“复杂疾病的系统生物学研究”专辑中发表了一篇美国佐治亚大学生物化学与分子生物学系徐鹰教授题为“Hypoxia and miscoupling between reduced ene
研究提出可用于癌症驱动基因识别的图机器学习模型
当前，全球癌症患者数量呈逐年上升趋势。癌症驱动基因识别在探讨癌症的发生机制中扮演着重要角色，能够为个性化精准治疗提供策略。而现有方法在泛化性和可解释性方面面临挑战。中国科学院新疆理化技术研究所科研团队与合作者，提出了可用于癌症驱动基因识别的图机器学习模型。这一模型融合人工智能与生物医学的优势，具备可
全球最大癌症基因数据库发布
美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库，为研究者们提供了迄今为止最全面的方式，搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称，基于基因组学研究的新数据库，将对全球开放获取，预计将有助于研究人员加快新药的开发，同时能够更
GEN：大数据挖掘对癌症治疗的四大影响
2016年1月在瑞士达沃斯召开的世界经济论坛上的一个panel讨论中，美国副总统Joe Biden当场要求临床医生和研究者举例表示人类在抗击癌症中突破的障碍。当几个重要话题浮现时，最重要的议题是“大数据”，具体而言，即“大数据”的收集、分析和应用。 研究者表示：“大数据”是有效的，这是因为有重
首张癌症驱动突变图谱绘成
新突变图谱揭示关键癌症基因的微小变化如何显著改变肿瘤生长模式。图片来源：美国《每日科学》网站癌症驱动突变是指某些基因突变能直接推动正常细胞向癌细胞转化。一个国际科研团队绘制出全球首张完整的癌症驱动突变图谱，揭示了癌症关键基因中数百种突变如何影响肿瘤生长。当与真实患者数据比对时，这张图谱能准确预测癌症
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望，数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望：“让我们测序你的肿瘤，或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过，现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
各类癌症基因检测技术优劣势大对比
提到基因检测，前几年，临床医生在向患者推荐时还心存疑虑，而近两年，基因检测已成为癌症诊疗的标准动作，基本上每一个癌症患者都有一套自己的基因检测报告。 不得不说，一个患者一套方案的个体化诊疗时代已经到来。比如，一位患者患了癌症，不仅要做病理诊断还要做全基因检测，发现突变位点，进而为患者制定包括化疗
Nature：肿瘤抑制蛋白竟驱动恶性癌症
近日，来自宾夕法尼亚大学等处的科学家通过研究发现，恶性肿瘤的生长及DNA序列未发生改变的基因活性的变化往往和突变的p53蛋白质直接相关，相关研究结果刊登于国际著名杂志Nature上，该研究或为开发应对难以治疗的癌症的新型策略提供帮助。 TP53是所有人类癌症中频繁突变的基因，其可以编码一种名为
香港理工研发大数据分析平台揭示癌症基因关系
记者23日从香港理工大学获悉，该校癌症基因组的大数据分析取得重大突破，通过建立一个创新的大数据分析平台，分析基因之间的相互作用，揭示在癌症中基因网络的失控机制。 这项突破是理大医疗科技及资讯学系讲座讲授翁一鸣、陈颖志和黄思铨联同哈佛大学生物统计学专家所组成的研究团队所取得的成果。 研究团队还
基于八大基因组学数据库－构建迄今最完整的癌症eRNA图谱
增强子RNA（eRNA）是一种从增强子转录的非编码RNA。目前，科学家已经在人类细胞中鉴定出数以万计的eRNA，其中许多都在RNA转录过程中发挥重要作用，以介导靶基因的激活。在人类癌症中，癌基因或致癌信号通路的激活通常引起增强子的激活和eRNA的产生。例如，ESR1的激活可以整体上增加乳腺癌中e
《科学》：基因调节驱动进化
耶鲁大学的研究人员发表在8月10日的《科学》杂志上的文章显示，他们通过采用新方法分析基因启动子序列变异，而且对基因调节推动进化分歧有了新的了解。 之前完成的基因组测序工作显示，人类和黑猩猩的蛋白质编码基因有99％是相同的。目前生物学家面临的挑战是解释导致人和猩猩之间明显差异的原因。通常认为，如果
高教政策制定应以“数据驱动”为基石
当地时间11月18日，美国加州大学总校教务长布朗在董事会议上宣布，加州大学将不再使用任何标准化考试成绩作为招生选拔录取依据，并且拒绝任何美国大学入学考试（SAT/ACT）替代方案。该表态为加州大学持续3年的标准化考试存废之争画上了句号。 作为最负盛名的公立大学系统与SAT/ACT等标准化考试的
高教政策制定应以“数据驱动”为基石
当地时间11月18日，美国加州大学总校教务长布朗在董事会议上宣布，加州大学将不再使用任何标准化考试成绩作为招生选拔录取依据，并且拒绝任何美国大学入学考试（SAT/ACT）替代方案。该表态为加州大学持续3年的标准化考试存废之争画上了句号。作为最负盛名的公立大学系统与SAT/ACT等标准化考试的最大用户
从微阵列数据发现癌症相关基因的新分析法
日前，美国德克萨斯大学和达特茅斯学院的研究人员开发出一种识别癌症基因的新型基因表达分析方法。相关研究结果以“How to get the most from microarray data： advice from reverse genomics”为题发表在2014年3月21日的《BMC Ge
美大规模评估癌症病人临床和基因组数据
英国《自然·遗传学》杂志1月15日在线发表的一项大型研究称，美国癌症中心展开了大规模癌症晚期患者临床数据和基因组数据评估，结果显示癌细胞的突变水平与患者接受检查点抑制剂治疗后的存活率相关。该研究意味着这一现象普遍存在于众多类型的癌症中，或有助于预测哪些患者将对这种免疫疗法应答良好。 人们一直致
“驱动细胞”可能是癌症转移的关键
乔治城大学伦巴第综合癌症中心的科学家近日报告称，肿瘤中的一小部分细胞可以激活并招募附近其他类型的细胞，使癌症扩散到身体的其他部位。他们发现，“驱动细胞”在侵袭性肿瘤中只占20%甚至更少。 这项成果于2021年6月16日发表在《Cancer Research》杂志上。 通讯作者Anna R
Cell重要论文：驱动癌症的旁路途径
结肠癌是美国癌症相关死亡的主要原因之一。这一疾病的风险因子多种多样，包括老年和饮食等因素。科学家们希望找到大多数病例共有的一些至关重要的特征，利用它们来开辟新的治疗。在几乎所有病例中，结肠肿瘤的DNA均发生了与某一关键性的细胞内信号途径相关的突变，从而导致了某些蛋白质累积，驱动细胞失控性生长。
FDA给力！首个NGS癌症大panel基因检测获批
今日，美国食品和药物管理局（FDA）宣布，已批准纪念斯隆·凯特琳癌症研究中心（Memorial Sloan Kettering Cancer Center，简称MSK）基于二代测序技术的癌症基因检测分析平台MSK-IMPACT™，为癌症基因检测未来的学术研究及商业开发开创了先河，进一步拓宽了个体
大panel癌症基因检测纳入全美医保，治疗方式就此变革
去年11月30日，FDA跟医疗保险和医疗补助服务中心（CMS）同时批准Foundation Medicine公司旗下产品——FoundationOne CDx（F1CDx）用于泛癌症临床伴随诊断，这款产品包含了315个基因的所有变异形式的检测，这是首款突破性的基于NGS的体外伴随诊断产