OxfordNanopore携手BioMérieux合作开发进军传染病IVD检测领域
近日，Oxford Nanopore 公司和BioMérieux宣布合作开发传染病体外诊断（IVD）检测。本次交易的财务条款没有披露。 该公司表示，他们正在研究将纳米孔测序引入传染病诊断市场的机会，初步合作包括开发一种用于确定抗生素耐药性结核病的体外诊断测试。这是一种在正常无菌的临床样本中识别病原体的分析检测，并用BioMérieux的EpiSeq应用程序来验证Oxford Nanopore的测序平台，在患者护理期间用于感染爆发的快速监测。 Oxford Nanopore公司的发言人在一封电子邮件中写道，这一合作关系“标志着Oxford Nanopore在诊断领域向前迈出了重要一步，这也是我们第一款使用纳米孔测序开发和制造的诊断测试”。......阅读全文
SMRT测序和Nanopore测序有哪些相同点和差异
第一代DNA测序技术（又称Sanger测序）在1975年，由Sanger等人开创，并在1977年完成第一个基因组序列（噬菌体X174），全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进（如使用了不同策略的作图法、鸟枪法），2001年完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的San
体外诊断IVD简单了解分子诊断之FISH技术（T15）
分子诊断的主要技术有核酸分子杂交(FISH)、聚合酶链反应（PCR）、基因检测技术和生物芯片技术（gene chip）。荧光原位杂交技术（fluorescence in situ hybridization，FISH）：是一种应用非放射性荧光物质依靠核酸探针杂交原理在核中或染色体上显示DNA序列位置
全球IVD企业20强！看看中国企业有哪些入围
2023年年底，Medtech Insight发布了2024全球医疗器械100强榜单，对全球头部医疗器械企业从多个不同维度进行了排名，其中也包括IVD。 本文数据主要来自Medtech Insight，只对迈瑞、Hologic的排名进行了调整，大部分IVD企业排名没有动。事实上，除了迈瑞202
新DNA测序方法每秒识别660亿碱基
美国国家标准与技术研究所（NIST）模拟了一个新型快速测序概念：通过将DNA从超薄的石墨片层结构的孔洞中拉动，通过测量石墨孔洞边缘产生的电位变化，从而实现高速、高精度、高效率的DNA测序，该方法每秒可识别660亿个碱基，准确度为90%且无假阳性。 DNA测序经历了Sanger测序、二代测序（高通
国内首个菊花脑基因组测序纳米孔测序再发高分论文
菊属植物种类繁多，又含多种栽培种，兼具观赏和药用价值，且染色体组结构从2n=18到8n=72之间，十分复杂，多年来难以攻破。 中药所所长陈士林研究员、副研究员宋驰博士等利用ONT平台解析了可能代表栽培菊属祖先基因组的二倍体菊花脑基因组，分析表明其演化受重复序列爆发和近期WGD事件的驱动，该基因
普译生物完成B轮融资－万孚生物再出手
近日，国产纳米孔测序企业北京普译生物科技有限公司（以下简称“普译生物”）宣布完成B轮融资，本轮投资由多家头部机构联合完成。作为A轮投资方的广州万孚生物技术股份有限公司（以下简称“万孚生物”）再度出手，继续加码增资，进一步深化双方战略协同，共同加速国产纳米孔测序技术的商业化进程。 作为国内体外诊
第三代DNA测序技术
测序技术在近两三年中又有新的里程碑。以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies纳米孔单分子测序技术，被称之为第三代测序技术。与前两代相比，他们最大的特点就是单分子测序，测序过程无需进行PCR扩增。其中PacBio SMRT技术其实也应用了边合成边测序的思想
基因测序技术产业新浪潮
基因测序也称DNA测序，是现代生物学研究中重要的手段之一。基因测序技术经过了三个发展阶段。第一代DNA测序技术是1975年由桑格（Sanger）和考尔森（Coulson）提出的链终止法。第一代技术准确率高，读取长，是至今唯一可以进行“从头至尾”测序的方法，但存在成本高、速度慢等方面的
新一代体外诊断抗体开辟IVD试剂新赛道
灵敏度（Diagnostic sensitivity）和特异性（Diagnostic specificity）是临床定性检测试剂常用的性能评估指标，反映了体外诊断试剂正确识别某一特定疾病相关标志物存在与否的能力。灵敏度也称为真阳性率，用100×真阳性值/（真阳性值+假阴性值）表示；特异性也称为真阴性
2016《MIT科技评论》全球「最聪明」公司评选公布
《MIT科技评论》一年一度的评选活动又开始了。每次评选，《MIT科技评论》都会选出那些在技术或者模式上有创新，给社会的发展和进步带来巨大机会的公司。今年有14家与医疗健康相关的公司，其中一大半都涉及基因领域，由此可以看出基因领域应该是未来医疗健康产业发展的主要方向。同时，免疫治疗、微生物和深度学
两大牛人携手发布新测序技术
经济高效的单分子测序平台能为人们提供很大的帮助，比如破解完整基因组序列、确定单倍型和鉴定mRNA可变剪接。为此，哥伦比亚大学的车靖岳（Jingyue Ju）和哈佛大学的George Church教授合作开发了基于纳米孔的单分子边合成边测序（SBS）系统。 他们给四种核苷酸分别标记上不同的聚合物
170万！复旦大学纳米孔测序仪招标项目
项目概况 复旦大学纳米孔测序仪 招标项目的潜在投标人应在复旦大学采购与招标管理系统（网址为：https://czzx.fudan.edu.cn）获取招标文件，并于2023年12月21日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：1069-234Z20234618
让基因组测序绕过PCR扩增
在基因组测序中，PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而，PCR也带来一些问题，包括不均匀扩增，导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序（NGS）平台而言，测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR
让基因组测序绕过PCR
在基因组测序中，PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而，PCR也带来一些问题，包括不均匀扩增，导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序（NGS）平台而言，测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-
真核基因组的组装，有纳米孔就够了
生物通报道 农业生物技术公司KeyGene近日只利用纳米孔测序仪MinION生成的序列，组装了立枯丝核菌（Rhizoctonia solani）的基因组。立枯丝核菌是一种农业害虫，感染一些重要的经济作物，包括玉米、水稻和大豆。 在BioRxiv网站的预印本上，KeyGene的Martin de
英科学家提出可6小时准确识别下呼吸道病原体的新方案
英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。 近日，英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。该优化后的方案针对细菌性下
Science及Nature共述：口袋里的DNA测序仪，可实时诊断
纳米孔测序的想法起始于25年前， 2012年5月4日《Science》首次报道了Oxford Nanopore公司研制的纳米孔测序仪样机——MinION，用于破译病毒DNA。然而MinION的发展历程并不那么顺利，英国牛津大学基因组学中心基因组学家Rory Bowden说，“众所周知，在每次读取
干货丨新冠病毒Nanopore测序标准操作流程
2019新型冠状病毒Nanopore测序标准操作流程-PCR扩增测序版简介 新近在武汉出现的新型冠状病毒引发的肺炎疫情引起了社会各界的极大关注。对新型冠状病毒进行测序不仅能够为病原鉴定、病毒溯源与变异、传播力和传播机理等研究提供切实可靠的基因组信息，还能够为识别病毒传播方式和确定暴发范围提供重要的
洞察科技完成天使轮融资，加速实时检测和基因测序研究
近日，广州洞察科技有限公司（以下简称“洞察科技”）宣布完成数千万元天使轮融资。此次融资由Forcefield Ventures (IMO Ventures)领投，天图资本和雅亿资本等机构跟投，多维资本担任本轮融资独家财务顾问。洞察科技成立于2022年1月，基于固态纳米孔单分子检测技术，自主研发准确、
利用纳米孔测序技术揭示基因表达的染色质调控基础
作为染色质的基本单元，核小体由大约147 bp的DNA和组蛋白八聚体（H2A, H2B, H3和H4）组成。核小体的动态定位和折叠组织会产生两种不同的染色质状态：“开放”（open）和“闭合”（closed）。核小体的定位和染色质状态的动态变化对以DNA为模板的生物学过程（比如，转录、DNA复制
2020年全球体外诊断（IVD）市场将达747亿美元
联合市场调研(Allied Market Research,AMR)近日发布一份最新报告指出，在未来7年内，全球体外诊断市场（IVD）将以5.34%的年度复合增长率（CAGR）增长，并在2020年达到747亿美元。该市场在2013年的价值为533亿美元。 不断增加的公众健康意识、据成本效益的诊
聚焦IVD创新与发展－－2019先进体外诊断行业峰会举办
分析测试百科网讯 2019年3月15日，2019（第七届）先进体外诊断行业峰会在上海好望角大饭店举办。大会将邀请了来自政府机构、学会的专家，国内外IVD龙头企业的高层管理者以及国内三甲医院的临床检验人员等，围绕国内IVD产业存在的实际问题和实际需求探讨产业发展和创新，共同讨论IVD各领域法规、产
全面解读第四代测序技术
纳米孔测序技术（又称第四代测序技术）是最近几年兴起的新一代测序技术。目前测序长度可以达到150kb。这项技术开始于90年代，经历了三个主要的技术革新：一、单分子DNA从纳米孔通过；二、纳米孔上的酶对于测序分子在单核苷酸精度的控制；三、单核苷酸的测序精度控制。目前市场上广泛接受的纳米孔测序平台是Oxf
长读长测序技术：拯救基因组组装项目
随着高精度长读长测序技术的出现，基因组难以组装的状态正在改变。《Nature Methods》杂志上近日发表了一篇文章，介绍了基因组组装项目如何受益于这种技术。 自测序技术问世以来，利用DNA序列的片段来组装人类、动植物或微生物的基因组就一直是难题。许多参考基因组都存在缺陷，如组装错误或存在缺
U盘大小的DNA测序仪证实可用于检测病原体
由华大基因和生物医学中心（BioMed Central）联合创办的大数据期刊《GigaScience》3月26日报道了掌上手持型DNA测序仪的最新成果，这种测序仪可以在短短6个小时时间里区分细菌和病毒的种类。 去年，由英国Oxford Nanopore公司开发的，仅4英寸长、普通U盘大小Min
新发明－牙刷可测是否患癌和阿尔茨海默症
英国科学家研发出一种新款牙刷，可以检测使用者是否罹患癌症或阿尔茨海默氏症（俗称老年痴呆症）等疾病。据英国《每日邮报》4月25日报导，研发人员设计出一种名叫“纳米孔定序器”（Nanopore sequencers ）的微型芯片。芯片很小，可以植入牙刷。在人刷牙时，芯片能够分析接触到的dna，并将其
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
新华社布鲁塞尔５月９日电（记者潘革平）比利时校际微电子中心（ＩＭＥＣ）９日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测ＤＮ
科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来，直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在，氨基酸序列破译结果并非完全正确，甚至与真实序列有很大差异。近期，荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法，该技术能够读取蛋白质信息内容，
一种全新的高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来，直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在，氨基酸序列破译结果并非完全正确，甚至与真实序列有很大差异。近期，荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法，该技术能够读取蛋白质信息内容，
科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来，直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在，氨基酸序列破译结果并非完全正确，甚至与真实序列有很大差异。近期，荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法，该技术能够读取蛋白质信息内容，