大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等,与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作,提出了利用原位化学交联-质谱技术(in vivo XL-MS),解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息,结合in vivo XL-MS数据与多种结构计算方法评估结构与交联信息的匹配度,重构了细胞内多种蛋白质,尤其是多结构域蛋白质和固有无序蛋白质(intrinsically disordered protein,IDP)的原位动态结构。为剖析蛋白质在细胞微环境中发挥功能的分子机制提供技术支撑。 活细胞内蛋白质的原位动态结构对于揭示其生物学功能至关重要。随着深度学习算法助力蛋白质结构预测的发展迭代,AlphaFold2实现了对蛋白质结构的全面预测,而该方法对柔性区域的结构预测仍面临挑战。近年来,in vivoXL-MS以高通量、高灵敏、......阅读全文

大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略

  近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等,与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作,提出了利用原位化学交联-质谱技术(in vivo XL-MS),解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息

Measuring-PLD-Activity-In-Vivo

Phospholipase D (PLD) hydrolyzes structural phospholipids like phosphatidylcholine (PC) and phosphatidylethanolamine (PE) into phosphatidic acid

In-Vivo-Luciferin-Imaging-Procedure

Mice are injected by an intraperitoneal route with a Luciferin solution (15 mg/mL or 30 mg/kg, in PBS, dose of 150 mg/kg) that is allowed to distribut

In-Vivo-Ubiquitination-Assay-by-Agroinfiltration

The ubiquitination/proteasome system is involved in nearly all plant signaling processes. Many signaling components are degraded by the 26S protea

活细胞蛋白质标记与成像研究获进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504935.shtm近日,华东理工大学光遗传学与合成生物学交叉学科研究中心杨弋、朱麟勇、陈显军团队在活细胞蛋白质标记与成像研究中取得重要进展,相关研究在《细胞发现》发表。   ?人造荧光蛋白及荧光

活细胞蛋白质光遗传控制技术获重要进展

  近日,华东理工大学药学院教授杨弋团队在《自然—通讯》发表论文,描述了一种超高灵敏的光诱导蛋白质稳定标签,可用于调控活细胞蛋白质稳定性。  基因编辑、转录调控和RNA干扰是目前广泛应用的活细胞蛋白质操纵方法,可以用于研究特定蛋白在复杂生物过程中的功能。作为一种灵活而强大的基因组编辑工具,CRISP

Cell:阐明活细胞中蛋白质凝缩的新工具

  一种利用光来控制活细胞内物质的工具,已经开始为我们解释“蛋白质如何组装成不同的液体和凝胶状固态”,这对于理解许多关键的细胞运转,是至关重要的。延伸阅读:Science:新结构揭示细胞的蛋白质生产机器是如何组装的。  由于极大的复杂性,宿主细胞会同时发生成千上万的化学反应。一些反应发生在专门的隔间

活细胞蛋白质光遗传控制技术获重要进展

基因编辑、转录调控和RNA干扰是目前广泛应用的活细胞蛋白质操纵方法,可以用于研究特定蛋白在复杂生物过程中的功能。作为一种灵活而强大的基因组编辑工具,CRISPR-Cas系统近年来得到了广泛应用。然而,这些技术是在基因或mRNA水平对蛋白质进行控制,而mRNA转录生成和翻译均需要时间,使得这些方法在表

In-Vivo-Imaging-of-Far3

To determine the minimum dose of Katushka plasmid needed to give detectable fluorescent intensity, we decreased the amount of pTurboFP635 to 0.5 and

In-Vivo-Imaging-of-Far1

In Vivo Imaging of Far-red Fluorescent Proteins after DNA Electrotransfer to Muscle TissueDNA electrotransfer to muscle tissue yields long-term, high

In-Vivo-Imaging-of-Far2

In vivo bio-imaging   Mice were anesthetized and placed in a custom-made bed, which allowed stable and reproducible imaging of the legs. In vivo scann

富集活细胞

            实验方法原理 在 25 ml 缧口盖离心管中加人6 ml Ficoll-Hypaque溶液,将 9 ml 含 2×107 个细胞的培养基加在上面,离心,从交界部位收集活细胞。 实验材料

富集活细胞

实验方法原理在 25 ml 缧口盖离心管中加人6 ml Ficoll-Hypaque溶液,将 9 ml 含 2×107 个细胞的培养基加在上面,离心,从交界部位收集活细胞。实验材料细胞悬液                                                        

活细胞计数

  活细胞计数是培养的细胞在一般条件下要求有一定的密度才能生长良好,所以要进行细胞计数。计数结果以每毫升细胞数表示。细胞计数的原理和方法与血细胞计数相同。  培养的细胞在一般条件下要求有一定的密度才能生长良好,所以要进行细胞计数。计数结果以每毫升细胞数表示。细胞计数的原理和方法与血细胞计数相同。  

富集活细胞

实验方法原理在 25 ml 缧口盖离心管中加人6 ml Ficoll-Hypaque溶液,将 9 ml 含 2×107 个细胞的培养基加在上面,离心,从交界部位收集活细胞。实验材料细胞悬液D-PBSA试剂、试剂盒Ficoll-Hypaque溶液或其他类似物仪器、耗材离心管或常规容器生长培养基注射器移

活细胞计数

  活细胞计数是培养的细胞在一般条件下要求有一定的密度才能生长良好,所以要进行细胞计数。计数结果以每毫升细胞数表示。细胞计数的原理和方法与血细胞计数相同。  培养的细胞在一般条件下要求有一定的密度才能生长良好,所以要进行细胞计数。计数结果以每毫升细胞数表示。细胞计数的原理和方法与血细胞计数相同。  

鉴别活细胞

染色法分化学染色法和荧光染色法,根据染色机理的不同,染料或使死细胞着色,或使活细胞着色。死活细胞在生理机能和性质上的差异主要包括:死活细胞细胞膜通透性的差异:活细胞的细胞膜是一种选择性膜,对细胞起保护和屏障作用,只允许物质选择性的通过;而细胞死亡之后,细胞膜受损,通透性增加。常用的以台盼蓝鉴别细胞死

乌得勒支大学和布鲁克合作开发4D结构蛋白组学方法

Albert Heck 和Richard Scheltema团队与布鲁克共同推进PhoX交联剂和TIMS/PASEF技术联合增强交联质谱(XL-MS)研究  近日,布鲁克宣布与乌得勒支大学合作,共同推进质谱在蛋白质3D结构与相互作用方面的研究工作。在蛋白质组学、用质谱研究蛋白质结构和相互作用方面,合

活细胞成像技术活细胞工作站介绍

我们知道以往的固定组织揭示了非常多的自然秘密,给了我们很大的启示,现在的科学研究则向在最真实的条件下观察自然发展。纵观显微镜的历史,直到15年前,科学家主要还是处理死细胞。现在,活细胞的应用已经非常普及了。 加拿大McGill大学成像实验室主任Claire M.Brown表示,要达到这个研究目的,我

活细胞提取及应用——单个细胞级别的活细胞提取

由于细胞异质性的存在,单细胞层面的分析就变得十分重要。目前对于单细胞分析的方法主要还是通过化学、生物学的方法进行裂解后,提取内容物进行分析,然而这种方法往往会对样本造成一些损伤。直接提取活细胞具有诸多优点,但是操作苦难。如今一种全新使用FluidFM科技的技术新报道有望提供一种活细胞提取新型的简易方

ex-vivo-expanded-endothelial-progenitor-cells

Cell Culture. 1. Total hPBMCs were isolated from blood of human volunteers by density gradient centrifugation. 2. Cells were plated on culture dishes

Preparation-of-Luciferin-for-In-Vitro-and-In-Vivo-Bioluminescent-Assays

Preparation of Luciferin forIn Vitro Bioluminescent AssaysMaterials• D-Luciferin Firefly, potassium salt, 1.0 g /vial(Caliper Life Sciences Part Numbe

Preparation-of-Luciferin-for-In-Vitro-and-In-Vivo-Bioluminescent-Assays

实验概要Reagent  for immunoassay, ligand binding assay and ligand receptor assay in  which luciferin is covalently bonded to a molecule having biological

Preparation-of-Luciferin-for-In-Vitro-and-In-Vivo-Bioluminescent-Assays

实验概要Reagent  for immunoassay, ligand binding assay and ligand receptor assay in  which luciferin is covalently bonded to a molecule having biological

活细胞的简介

  活细胞就是能进行新陈代谢、繁殖、复制的细胞。例如:筛管细胞,酵母菌,花粉,精子,血小板等。活细胞也称作活化细胞。

活细胞的简介

  活细胞就是能进行新陈代谢、繁殖、复制的细胞。例如:筛管细胞,酵母菌,花粉,精子,血小板等。活细胞也称作活化细胞。

酵母活细胞染色

实验步骤展

富集活细胞实验

实验方法原理 在 25 ml 缧口盖离心管中加人6 ml Ficoll-Hypaque溶液,将 9 ml 含 2×107 个细胞的培养基加在上面,离心,从交界部位收集活细胞。实验材料 细胞悬液D-PBSA试剂、试剂盒 Ficoll-Hypaque溶液或其他类似物仪器、耗材 离心管或常规容器生长培养基

监测活细胞浓度,

  活细胞浓度测量在发酵过程中具有非常重要的作用。通过它可以了解生物反应器中菌体或细胞生长状况,也可以了解一些描述菌体或细胞生长或生产能力的间接参数,如比生产速率,比基质消耗速率,细胞代谢流衡算等。    然而由于活细胞浓度传感技术的困难,传统的测量方法还是通过手工取样测量,操作复杂,滞后时间长

活细胞和死细胞的区别

  新陈代谢主要可以看细胞能否和外界进行物质交换。血小板有吞噬病毒、细菌和其他颗粒物的功能,所以是活细胞。花粉能在适宜的条件下发育成种子,所以也是活的。而植物的导管,筛管和木纤维则是植物细胞死亡后留下的细胞壁构成的中空的结构,所以是死细胞。  能够进行生命活动的细胞是活的,不能的就是死的 ,能够进行