大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等,与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作,提出了利用原位化学交联-质谱技术(in vivo XL-MS),解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息,结合in vivo XL-MS数据与多种结构计算方法评估结构与交联信息的匹配度,重构了细胞内多种蛋白质,尤其是多结构域蛋白质和固有无序蛋白质(intrinsically disordered protein,IDP)的原位动态结构。为剖析蛋白质在细胞微环境中发挥功能的分子机制提供技术支撑。 活细胞内蛋白质的原位动态结构对于揭示其生物学功能至关重要。随着深度学习算法助力蛋白质结构预测的发展迭代,AlphaFold2实现了对蛋白质结构的全面预测,而该方法对柔性区域的结构预测仍面临挑战。近年来,in vivoXL-MS以高通量、高灵敏、......阅读全文
科学团队创制荧光探针-实现蛋白质成簇/解聚活细胞监测
华东理工大学化学与分子工程学院、费林加诺贝尔奖科学家联合研究中心教授郭志前团队,创制了激活型化学遗传学荧光探针,首次在活细胞中监测蛋白质成簇/解聚的精确状态。相关研究近日作为VIP(Very Important Paper)论文发表于《德国应用化学》,并被评为热点论文(Hot Paper)。在蛋白质
活细胞和死细胞的区别
新陈代谢主要可以看细胞能否和外界进行物质交换。血小板有吞噬病毒、细菌和其他颗粒物的功能,所以是活细胞。花粉能在适宜的条件下发育成种子,所以也是活的。而植物的导管,筛管和木纤维则是植物细胞死亡后留下的细胞壁构成的中空的结构,所以是死细胞。 能够进行生命活动的细胞是活的,不能的就是死的 ,能够进行
快速活细胞成像系统
快速活细胞成像系统是一种用于材料科学领域的大气探测仪器,于2019年7月13日启用。 技术指标 有效像素数量512×512,单位像素面积16μm×16μm,最大读出速率70-1000 fps,光电转换量子效率90%(峰值),模/数转换器16 bit(全频率),冷却温度-65℃至-100℃;固
走进活细胞浓度监测
活菌细胞浓度测量在发酵过程中具有非常重要的作用。通过它可以了解生物反应器中菌体或细胞生长状况,也可以了解一些描述菌体或细胞生长或生产能力的间接参数,如比生产速率,比基质消耗速率,细胞代谢流衡算等。 然而由于活细胞浓度传感技术的困难,传统的测量方法还是通过手工取样测量。操作复杂,滞后时间长
活细胞直接观察实验
实验方法原理 培养的活细胞在一般显微镜下观察时,细胞是透明的,反差很小,难以观察到细胞清晰结构,只有应用附有相差装置的显微镜,才能使目的物与背底反差增强,能够看清细胞的轮廓和一些微细结构如线粒体、核仁、染色质等。实验材料 细胞仪器、耗材 相差聚光器相差接物镜实验步骤 一、相差装置的使用相差装置或显微
走进活细胞浓度监测
活菌细胞浓度测量在发酵过程中具有非常重要的作用。通过它可以了解生物反应器中菌体或细胞生长状况,也可以了解一些描述菌体或细胞生长或生产能力的间接参数,如比生产速率,比基质消耗速率,细胞代谢流衡算等。 然而由于活细胞浓度传感技术的困难,传统的测量方法还是通过手工取样测量。操作复杂,滞后时间长
什么是活细胞荧光
没有听说过这个术语,不过应该很好猜测,就是用荧光技术标记活细胞,可以是只有活细胞才能吸收的荧光物质,该物质被活细胞吸收后,该活细胞就发出荧光可用于观测了。而死细胞不吸收就观测不到荧光,可以区分细胞死活。
活细胞直接观察实验
相差观察和摄影方法 实验方法原理 培养的活细胞在一般显微镜下观察时,细胞是透明的,反差很小,难以观察到细胞清晰结构,只有应用附有相差装置的显微镜,才能使目的物
活细胞培养系统
活细胞培养系统能够为大多数细胞培养准确地提供所需的温度、湿度及CO2浓度。适用培养皿(35mm、50/60mm)、多孔板。同时系统也配备Z轴防漂移系统,可以自动补偿显微镜Z轴焦点漂移,始终红外检测目标细胞,保证长时间(几小时到数天)观察,视野始终处于清晰状态,并可实现细胞追踪功能。
活细胞直接观察实验
实验方法原理培养的活细胞在一般显微镜下观察时,细胞是透明的,反差很小,难以观察到细胞清晰结构,只有应用附有相差装置的显微镜,才能使目的物与背底反差增强,能够看清细胞的轮廓和一些微细结构如线粒体、核仁、染色质等。实验材料细胞仪器、耗材相差聚光器相差接物镜实验步骤一、相差装置的使用相差装置或显微镜都由两
全新光学显微成像技术帮科学家看到活细胞蛋白质
这些技术为研究人员插上前进的翅膀。 荧光标签和光片成像相结合,产生超分辨率图像。图片来源:Wesley R. Legant 生物物理学家Joerg Bewersdorf说,2006年是荧光显微镜学的奇迹之年。而与之相媲美的另一个年份是1905年,当时爱因斯坦以相对论、量子论和原子物理学变革
活细胞工作站系统
活细胞工作站系统是一种用于基础医学、临床医学领域的分析仪器,于2010年11月15日启用。 技术指标 荧光激发装置为120W长寿命高压金属灯,液体光导管导入,单光子级EMCCD:实现6D图象采集(XY-Z-λ-T-P);配置CO2显微镜用培养小室,保持温度、湿度、CO2浓度,进行长达96小时
活细胞成像显微镜
活细胞成像显微镜是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年3月15日启用。 技术指标 固态光源SSI(含7条激发谱线),高精度电动载物台(X、Y:20nm,Z:5nm),CalSnapHQ2 CCD.EMCCD.湿控及CO2系统装置,自动对焦装置(焦距时间100ms,精度25nm)。10×
活细胞成像工作站
活细胞成像工作站是一种用于生物学领域的分析仪器,于2015年5月13日启用。 技术指标 1.三维液压微调控制系统:X-,Y-,Z-轴,移动范围最大10mm;操纵杆移动(X-,Y-轴):最大2mm;控制手移动:250um;规格:驱动单元、控制单元、万向节、磁性金属板等。2.显微操纵器粗调系统:
活细胞的鉴别方法
区分死细胞和活细胞的方法有 ①、活细胞能发生质壁分离而死细胞则不能。②进行培养,活细胞能繁殖,死细胞则不能,光镜下观察有多个细胞。③、进行染色,死活细胞呈现不同的结果④、直接观察细胞结构。
活细胞成像实验总结,必看!
近年来,活细胞成像活跃于生物学的各个领域。在它的加持下,研究者们可以实时或者在一段时间内观察细胞内部结构和细胞生理过程,从而加深对细胞运作过程的认识。但在各种实验操作和成像条件下,想要成功做好活细胞成像实验并不容易。1、实验前我们先了解一下,什么是活细胞成像,它有哪些作用?通常,我们把使用延时成像技
活细胞的鉴别方法
区分死细胞和活细胞的方法有 ①、活细胞能发生质壁分离而死细胞则不能。②进行培养,活细胞能繁殖,死细胞则不能,光镜下观察有多个细胞。③、进行染色,死活细胞呈现不同的结果④、直接观察细胞结构。
活细胞质量测定综述
细胞质量、体积和生长速率是细胞生长发育和内稳态维持的重要生物物理参数。从1952年开始,人类就开始了活细胞质量测定的研究,但直到21世纪,随着电脑科学和精密制造工业的发展,使得精确测定细胞质量成为可能,同时也出现了多种活细胞质量测定的仪器。细胞质量、体积和生长速率影响细胞的大小,而细胞大小的调控在细
活细胞邮寄后怎么处理
邮寄回来后先在显微镜下看看细胞状态,如果你是贴壁细胞,发现细胞已经全部悬浮,那就先离心一下,再转移到新的培养皿培养,不过一般情况下要重新买了;假如细胞没有脱壁,一般先在培养箱里放置5-12个小时,让细胞适应环境,然后传代培养。关键是你的快递公司有没有特殊的照顾你的细胞。因为有的公司邮的过程中动作生猛
PRP自体活细胞童颜术
“人活一张皮,佛争一炷香”。“面子”问题是所有人都非常重视,良好的形象带来的不仅是年轻的外表,更是直接竞争力。因此,“面子”的衰老问题更不容忽视,而PRP-ACR自体细胞再生除皱系统能有效解决一切“面子”衰老及老化的问题,受到了人们的关注和追捧。 PRP (Platelet Rich Plas
活细胞“内部时钟”首次找到
据物理学家组织网9月11日报道,美国科学家利用先进的荧光显微镜技术,首次对人体活细胞内细胞核的形状变化进行了动态研究,发现细胞核表现出快速波动性,这种“内部时钟信号”标志着人类首次找到表征细胞周期改变的物理特性,为理解生命物质构成和疾病成因提供新途径。 之前的相关研究,只能将发育到生命周期某个
Ex-Vivo-Human-Primary-Mesenchymal-Stem-Cells-(MSCs)-Culture
Human bone marrow contains mesenchymal progenitors (mesenchymal stem cells, MSCs). MSCs produce adventitial cells in the human bone marrow microenvir
南京大学刘震团队:scPISA用于活细胞低拷贝数蛋白质分析
细胞是生物体结构和生命活动的基本单位,基于细胞的研究是生命科学的基础。然而,由于细胞体积极小,一些重要组分含量极低,细胞微环境的复杂性等等因素使得单细胞分析成为一项十分具有挑战性的工作。通常的生命科学研究主要以大量细胞为研究对象,但是,这种细胞群体水平的分析掩盖了细胞个体间存在的显著微观不均一性
武汉病毒所建立研究活细胞内蛋白质互作的新方法
近日,中国科学院武汉病毒研究所/病毒学国家重点实验室胡志红、王曼丽研究团队在蛋白质相互作用的研究方法方面取得新进展,相关研究成果以Mito-docking: A novel in vivo method to detect protein-protein interactions(《线粒体锚定:
活细胞与死细胞的差异性
细胞膜通透性的差异 活细胞的细胞膜是一种选择性膜,对细胞起保护和屏障作用,只允许物质选择性的通过;而细胞死亡之后,细胞膜受损,通透性增加,常用的以台盼蓝鉴别细胞死活的方法就是利用了这一性质。台盼蓝,又称锥蓝,是一种阴离子型染料,不能透过完整的细胞膜。所以经台盼蓝染色后只能使死细胞着色,而活细胞
分离活细胞的介质要求
用一定的介质在离心管内形成一连续或不连续的密度梯度,将细胞混悬液或匀浆置于介质的顶部,通过重力或离心力场的作用使细胞分层、分离。这类分离又可分为速度沉降和等密度沉降平衡两种。密度梯度离心常用的介质为氯化铯,蔗糖和多聚蔗糖。分离活细胞的介质要求:1)能产生密度梯度,且密度高时,粘度不高;2)PH中性或
Science:实时监测活细胞DNA动态
来自美国的研究人员开发了一种新方法,研究了活细胞中的DNA损伤及由此造成的染色体易位。这一研究成果发表在8月9日的《科学》(Science)杂志上。 由于正常的细胞过程及辐射等环境因素的影响,活细胞中常常会发生DNA损伤。细胞会不断地修复这些DNA损伤,但是如果修复失败,DNA双链就有可能
分离活细胞的介质要求
用一定的介质在离心管内形成一连续或不连续的密度梯度,将细胞混悬液或匀浆置于介质的顶部,通过重力或离心力场的作用使细胞分层、分离。这类分离又可分为速度沉降和等密度沉降平衡两种。密度梯度离心常用的介质为氯化铯,蔗糖和多聚蔗糖。分离活细胞的介质要求:1)能产生密度梯度,且密度高时,粘度不高;2)PH中性或
关于活细胞计数的相关介绍
活细胞计数是培养的细胞在一般条件下要求有一定的密度才能生长良好,所以要进行细胞计数。计数结果以每毫升细胞数表示。细胞计数的原理和方法与血细胞计数相同。 培养的细胞在一般条件下要求有一定的密度才能生长良好,所以要进行细胞计数。计数结果以每毫升细胞数表示。细胞计数的原理和方法与血细胞计数相同。
活细胞工作站的应用
一、研究背景大部分哺乳动物的组蛋白都以序列特异性的方式结合到DNA的连接序列上,连接处的核小体会因此产生高度有序的染色质结构来精确的调节基因的表达。H1foo是卵细胞中特异表达的组蛋白H1家族成员,从减数分裂胚泡期卵母细胞到晚期两细胞胚胎的发展过程中全程表达。而且它的表达对小鼠卵母细胞的成熟所必需的