大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等,与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作,提出了利用原位化学交联-质谱技术(in vivo XL-MS),解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息,结合in vivo XL-MS数据与多种结构计算方法评估结构与交联信息的匹配度,重构了细胞内多种蛋白质,尤其是多结构域蛋白质和固有无序蛋白质(intrinsically disordered protein,IDP)的原位动态结构。为剖析蛋白质在细胞微环境中发挥功能的分子机制提供技术支撑。 活细胞内蛋白质的原位动态结构对于揭示其生物学功能至关重要。随着深度学习算法助力蛋白质结构预测的发展迭代,AlphaFold2实现了对蛋白质结构的全面预测,而该方法对柔性区域的结构预测仍面临挑战。近年来,in vivoXL-MS以高通量、高灵敏、......阅读全文

活细胞工作站的应用

一、研究背景大部分哺乳动物的组蛋白都以序列特异性的方式结合到DNA的连接序列上,连接处的核小体会因此产生高度有序的染色质结构来精确的调节基因的表达。H1foo是卵细胞中特异表达的组蛋白H1家族成员,从减数分裂胚泡期卵母细胞到晚期两细胞胚胎的发展过程中全程表达。而且它的表达对小鼠卵母细胞的成熟所必需的

关于活细胞计数的相关介绍

  活细胞计数是培养的细胞在一般条件下要求有一定的密度才能生长良好,所以要进行细胞计数。计数结果以每毫升细胞数表示。细胞计数的原理和方法与血细胞计数相同。  培养的细胞在一般条件下要求有一定的密度才能生长良好,所以要进行细胞计数。计数结果以每毫升细胞数表示。细胞计数的原理和方法与血细胞计数相同。  

浅谈DeltaVision-Elite活细胞成像系统

我们知道以往的固定组织或固定细胞成像揭示了非常多的自然秘密,给了我们很大的启示,但现在的科学研究则希望在最真实的条件下观察细胞。纵观显微镜的发展历史,直到15年前,科学家主要还是处理死细胞。现在,活细胞研究的重要性已经越来越被意识到。加拿大McGill大学成像实验室主任Claire M. B

基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队,研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者,蛋白质通过相

新技术实现活细胞内线粒体蛋白质的原位构象和相互作用解析

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505668.shtm

我国科学家开发活细胞蛋白质稳定性光遗传学控制技术

  活细胞蛋白质操纵方法是生命科学基础与应用研究的重要工具,对蛋白质丰度进行精确地时间和空间控制的光遗传学工具在研究各种复杂的生物过程中发挥着重要作用。华东理工大学研究团队开发出活细胞蛋白质稳定性光遗传学控制技术。该研究成果于近日发表在《Nature Communications》杂志上,题为:Co

我国科学家开发活细胞蛋白质稳定性光遗传学控制技术

  活细胞蛋白质操纵方法是生命科学基础与应用研究的重要工具,对蛋白质丰度进行精确地时间和空间控制的光遗传学工具在研究各种复杂的生物过程中发挥着重要作用。华东理工大学研究团队开发出活细胞蛋白质稳定性光遗传学控制技术。该研究成果于近日发表在《Nature Communications》杂志上,题为:Co

独品是只能在活细胞中真实的核酸蛋白质复合体包括什么

核糖核蛋白复合体,简写为RNP,是由特定蛋白与特定RNA形成的复合体。小的核糖核蛋白复合体有:信号识别颗粒、端粒酶、核糖核酸酶P等;大的核糖核蛋白复合体如核糖体。1.信号识别颗粒signal recognition particle (SRP)在真核生物细胞质中一种小分子RNA和六种蛋白的复合体,此

活细胞与死细胞在代谢上的差异

  采用美蓝染料鉴定酵母细胞死活的依据。美蓝是一种无毒染料,氧化型为蓝色,还原型为无色。由于活细胞中新陈代谢的作用,使细胞内具有较强的还原能力,能使美蓝从蓝色的氧化性变为无色的还原型,蓝处于氧化态,从而被染成蓝色或淡蓝色。  荧光素双醋酸酯(FDA)是一种常用的培养动植物细胞以及植物细胞原生质体的生

如何判断细胞是活细胞的常见方法

1.活体染色剂—亚甲基蓝溶液以前的教材中,活体染色剂亚甲基蓝溶液可用来鉴别所有有新陈代谢的细胞,利用交换吸附的原理,只有活细胞才能完成交换吸附。2.胚的染色—红墨水细胞膜在细胞存活时有选择透过性,所以有机染料一般不会吸收,所以用它可以鉴定种子的死活,如玉米细胞是活的,胚没被染红,胚乳被染红。3.显微

乙醇难道不会使蛋白质或多肽失活吗

乙醇沉淀蛋白实际上是乙醇在水中的溶解度比蛋白质大,高比例的乙醇和蛋白质争夺水分子破坏了蛋白质表面的水膜,使得蛋白质沉淀下来。实质上此时的蛋白质并未彻底变性,仅仅是失水而已。在重新获得水后还是可以复性的,就和冻干成干粉的蛋白重新溶解到水中是一样的。但这个也不是绝对的,主要是看目标蛋白或者多肽的特性,有

乙醇难道不会使蛋白质或多肽失活吗

乙醇沉淀蛋白实际上是乙醇在水中的溶解度比蛋白质大,高比例的乙醇和蛋白质争夺水分子破坏了蛋白质表面的水膜,使得蛋白质沉淀下来。实质上此时的蛋白质并未彻底变性,仅仅是失水而已。在重新获得水后还是可以复性的,就和冻干成干粉的蛋白重新溶解到水中是一样的。但这个也不是绝对的,主要是看目标蛋白或者多肽的特性,有

中科院大连化物所开发蛋白质复合物原位解析新技术

  近日,中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者,蛋白质通

关于活细胞培养法的优点

  ①能精确地控制材料、环境与药物对组织细胞的效能;  ②可从细胞水平上通过观察推算出对活组织的作用时间;  ③能区别药物对细胞的直接作用还是通过免疫系统、内分泌系统发挥间接作用;  ④药物用于临床前可不需用人体作试验,直接用人细胞作为实验对象,起到了从动物试验过度到人体临床试验的桥梁作用;  ⑤该

如何用台盼兰计数活细胞?

用无血清培养基把细胞悬液稀释到200~2000个/毫升,在0.1毫升细胞悬液中加0.1毫升0.4%的台盼兰溶液。轻轻混匀,数分钟后,用血球计数板计数细胞。活细胞排斥台盼兰,因而染成蓝色细胞是死细胞。

实时动态活细胞成像分析仪

  实时动态活细胞成像分析仪是一种用于药学领域的医学科研仪器,于2019年9月25日启用。  技术指标  IncuCyte Zoom HD/2CLR的相差光源和荧光光源均为LED光源,有高灵敏度CCD成像系统及高清晰度光学元件,10倍物镜的成像分辨率为1.22µm/像素,像素1392×1040,输出

活细胞培养法的作用介绍

  不仅可以检查细胞系(株)对药物的敏感性,而且还可作体内和体外敏感性的比较,同时也可观察到体外细胞不同药物所引起的形态结构和生理、代谢的变化,如铵盐和腺苷均可使细胞浆内形成空泡。脓绿素可增加细胞对氧的吸收,抑制细胞核的分裂,一定剂量的复方丹参能阻碍细胞贴壁,可影响人食管癌细胞对基质附着的作用,故有

活细胞成像用哪种显微镜

活细胞成像可以选择共聚焦显微镜,共聚焦与传统显微镜的原理差别在于照明方式不同:传统显微镜是一次性照明整个视野中的样品,因此可以用眼睛直接观察或者用CCD获取图像,没有时间延迟;而共聚焦显微镜是逐点成像,无法用CCD获取图像,只能用探测器收集每个象素点的信号,再通过软件重构图像,有一定的时间延迟。共聚

活细胞中去糖基化的方法

  1、衣霉素在体内阻断N-连糖;  2、将内切神经氨酸酶注入发育中的视网膜提示了多唾液酸的特异性作用--将高纯度酶注入细胞内+恰当的对照;  3、将糖基修饰酶的cDNA在活细胞或动物中表达;  4、在培养环境中加入凝集素或抗体把特异的聚糖封闭掉。

四种活细胞提取技术概述

最新的贴壁活细胞提取技术——Cytosurge多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT 当今,对细胞内表达物的监控对于研究细胞分化、细胞衰老以及细胞病变、药物代谢等领域中发挥着越来越重要的作用。本文将对常用的几种活细胞提取技术进行概括为什么要进行活细胞提取?在传统的细胞提取技术中往往使用化学、

活细胞中去糖基化的方法

活细胞中去糖基化的方法:1,衣霉素在体内阻断N-连糖; 2,将内切神经氨酸酶注入发育中的视网膜提示了多唾液酸的特异性作用--将高纯度酶注入细胞内+恰当的对照;3,将糖基修饰酶的cDNA在活细胞或动物中表达; 4,在培养环境中加入凝集素或抗体把特异的聚糖封闭掉。

美制成首个活细胞激光器

  美国马萨诸塞州综合医院研究人员成功利用表达了绿色荧光蛋白(GFP)的肾脏细胞产生了一种纳秒级的激光脉冲,首次用单个活细胞作为增益介质产生了激光。相关论文将于近日发表在《自然·光子学》杂志上。   产生激光通常要有3个要素,第一是光源,第二是受激产生激光的“增益介质”,第三是将所产生的光聚拢到一

活细胞间接免疫荧光法

一.实验器材:1.  器材:40孔塑料板、40孔板离心机、微量加样器、振荡器、盖玻片、荧光显微镜等2.  试剂:单抗隆抗体(单抗)、荧光标记抗鼠免疫球蛋白、PBS(pH7.2-7.4)、甘油、叠氮钠(NaN3)等二.方法(微量法)1.  将分离好的单个核细胞用PBS洗2次,1000rpm每次10分钟

无需活细胞的蛋白合成新技术

  来自美国能源部橡树岭国家实验室(Oak Ridge National Laboratory)的研究人员研发出了一种无需细胞培养,人工合成蛋白质的新系统,这一研究成果公布在12月22日的Small杂志上。  这个生物反应器采用的是一种混合液,其中包含有大肠杆菌细胞提取物,一种绿色荧光蛋白DNA编码

活细胞成像和数据分析系统

  活细胞成像和数据分析系统是一种用于生物学领域的分析仪器,于2018年11月26日启用。  技术指标  光源:IncuCyte Zoom HD/2CLR的相差光源和荧光光源均为LED光源。 物镜倍数:IncuCyte Zoom HD/2CLR的物镜倍数是4倍或10倍或20倍,可由用户自行更换。 成

无需活细胞的蛋白合成新技术

  来自美国能源部橡树岭国家实验室(Oak Ridge National Laboratory)的研究人员研发出了一种无需细胞培养,人工合成蛋白质的新系统,这一研究成果公布在12月22日的Small杂志上。  这个生物反应器采用的是一种混合液,其中包含有大肠杆菌细胞提取物,一种绿色荧光蛋白DNA编码

荧光染料CFSE活细胞标记的特点

荧光染料CFSE(CFDA-SE),是一种可对活细胞进行荧光标记的新型染料,可以标记活体细胞。其基本原理如下:CFSE能够轻易穿透细胞膜,在活细胞内与胞内蛋白共价结合,水解后释放出绿色荧光。在细胞分裂增殖过程中,它的荧光强度会随着细胞的分裂而逐级递减,标记荧光可平均分配至两个子代细胞中,因此其荧光强

细胞复苏后不活怎么回事

细胞复苏后不活怎么回事齐氏生物认为复苏细胞是否贴壁跟你冻存时的操作有直接关系。而且细胞的传代数越多,即细胞越老,越禁不起低温的折腾。复苏后,细胞有个休眠期,大约7-14天不等。只要不死,你就慢慢养着。突破了某个时间点,你会发现细胞又神奇的康复了。但要等到细胞状态良好,传2代以上再做实验。尤其是流式、

DAPI的属性介绍活细胞毒性

DAPI可用于固定细胞染色,但是因为活细胞染色对DAPI浓度有严格要求,它很少被用于活细胞染色。DAPI能快速进入活细胞中与DNA结合,因此DAPI对生物体而言,也被视为一种毒性物质与致癌物。然而在MSDS中它被标记为无毒。尽管DAPI没有显现出对E.coli的诱变性,它在机器制造商提供的信息上被认

如何用台盼兰计数活细胞?

将样品适当稀释后,用稀释后的样品和0.4%的台盼兰溶液按1:1混合后,用移液枪点样到血球计数板,置于倒置显微镜下观察、计数,其中蓝色细胞是死细胞,因活细胞排斥台盼兰,不被染色。