上海药物所药物选择性机理研究取得新进展
5月6日，《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表了中科院上海药物研究所神经药理学研究国际科学家工作站有关药物靶标选择性的研究成果。该项研究突破了通常认为的化合物与靶标蛋白结合与否决定药物选择性的理论。针对靶标的药物发现是目前药物发现的重要手段。药物靶标蛋白通常具有不同亚型，亚型之间有较高的同源性，不同亚型的分布可能具有组织或细胞特异性，因此药物分子的亚型选择性是影响药效和副作用的关键因素。选择性的高低是衡量候选药物成药性的重要指标，追求高亚型选择性成为药物发现的重要目标之一。一般认为，药物的选择性是由其与靶标蛋白结合与否决定的。然而，该项研究显示小分子化合物的亚型选择性直接受胞内信号通路调节，与细胞膜磷脂的水平密切相关。 KCNQ钾通道共有5个亚型，其中KCNQ2-5主要表达在神经系统，介导一种称为M-电流的钾离子流，在神经系统兴奋性的调节中起关键作用。Retigabine和ZnPy均为KCNQ通道的激动剂，但其亚型选......阅读全文
利用“数据+知识+AI”实现新靶标药物虚拟筛选
6月6日，中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《自然-机器智能》（Nature Machine Intelligence）上发表了题为Generic protein–ligand interaction scoring by integrating physical prior knowled
数据+知识+AI，科学家解锁新靶标药物虚拟筛选
6月6日，中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组构建了一种通用蛋白质-配体相互作用评分方法EquiScore，在药物虚拟筛选场景和先导化合物优化场景中，EquiScore对训练未见的新靶标表现出了良好的泛化性能，其可解释性分析为基于结构的药物设计提供了有价值的线索。相关研究发表于《自然—机器智能
Nature：利用CRISPR筛选出潜在的黄病毒药物靶标
在一项新的研究中，来自美国华盛顿大学医学院和宾夕法尼亚大学等机构的研究人员发现一种潜在的方法阻止寨卡病毒和类似的病毒在体内扩散的方法。相关研究结果于2016年6月17日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“A CRISPR screen defines a signal peptide pr
亲和质谱技术：药物靶标配体的高通量筛选
疾病相关的药物靶标蛋白与小分子化合物的亲和作用研究是当今开发新药分子的热点领域。亲和质谱技术（Affinity Selection Mass Spectrometry）作为一种间接筛选小分子配体的方法，已经成功应用于许多受体、酶等靶蛋白的配体的筛选，并且得到了广泛的应用。 亲和质谱分析的基本原
科学家开发出新方法筛选新的癌症药物靶标
在一项新的研究中，来自美国达纳-法伯癌症研究所和波士顿儿童医院癌症与血液疾病中心等研究机构的研究人员开发出一种新的筛查方法，即利用CRISPR-Cas9基因组编辑技术在小鼠体内测试上千个肿瘤基因的功能。他们利用这种方法揭示出新的药物靶标，从而可能潜在地改进PD-1检查点抑制剂（一类新的有前景的癌
蛋白质芯片对于药物筛选的应用
疾病的发生发展与某些蛋白质的变化有关，如果以这些蛋白质构筑芯片，对众多候选化学药物进行筛选，直接筛选出与靶蛋白作用的化学药物，将大大推进药物的开发。蛋白质芯片有助于了解药物与其效应蛋白的相互作用，并可以在对化学药物作用机制不甚了解的情况下直接研究蛋白质谱。还可以将化学药物作用与疾病联系起来，以及药物
蛋白质芯片技术应用于药物筛选
疾病的发生发展与某些蛋白质的变化有关，如果以这些蛋白质构筑芯片，对众多候选化学药物进行筛选，直接筛选出与靶蛋白作用的化学药物，将大大推进药物的开发。蛋白质芯片有助于了解药物与其效应蛋白的相互作用，并可以在对化学药物作用机制不甚了解的情况下直接研究蛋白质谱。还可以将化学药物作用与疾病联系起来，以及药物
绿色荧光蛋白药物筛选应用研究
药物筛选 许多新发展的光学分析方法已经开始利用活体细胞来进行药物筛选，这一技术能从数量众多的化合物中快速筛选出我们所感兴趣的药物。基于细胞的荧光分析可分为三类：即根据荧光的密度变化、能量转移或荧光探针的分布来研究目标蛋白如受体、离子通道或酶的状态的变化。荧光探针分布是利用信号传导中信号分子的迁
药物筛选的定义
广义：是针对特定的要求和目的，通过适当的方法和技术，主要的技术有基因组学、蛋白质组学、代谢组学、计算生物学、生物芯片技术、微流控芯片技术等方法，在一定的可选择范围内，进行药物优选的过程。因此，药物筛选包括新药研究过程中的处方筛选，根据特定目的选择符合要求的药物。狭义：筛选专指采用实验技术进行。
NEJM：癌症药物研发的新型靶标
SALL4基因负责调节胚胎干细胞的自我更新，是许多癌症中的关键基因，例如肝癌。现在，哈佛干细胞研究所HSCI的研究人员，在肝癌模型中对SALL4基因进行研究，找到了阻断其活性的新型药物。这项研究发表在新英格兰医学杂志(New England Journal of Medicine)上。
多臂老虎机助力无序蛋白药物虚拟筛选
最近，北京大学化学与分子工程学院的刘志荣教授课题组将多臂老虎机算法应用于天然无序蛋白质的药物设计问题，大大加速了基于构象系综的配体虚拟筛选过程,相关研究成果发表在Phys. Chem. Chem. Phys. (2021, 23, 6800-6806)上。 一个人在成长过程中会遇到各种各样的选
药物高通量筛选技术
药物高通量筛选技术简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识。一.概念高通量筛选(High throughputscreening，HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础，以微板形式作为实验工具载体，以自动化操作系统执行试验过程，以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据，以计算机对实验数
上海药物所发布免费在线药物靶标预测平台
药物靶标的识别与验证是药物发现过程中至关重要的第一步，在药物研发过程中，30%-40%的在研药物由于药物靶标选择的不恰当而以失败告终。因此，发展一种高效的计算方法来预测新的药物靶标就显得尤其重要。 最近，中国科学院上海药物研究所朱维良研究组发布免费在线药物靶标预测平台D3TPredictor
Cell子刊：详解热点药物靶标
美国Scripps研究所TSRI的科学家确定了一个热点酶与一些重要蛋白相互作用时的结构，这些蛋白涉及了神经退行性疾病和胰岛素抵抗。这种酶就是C- jun氨基末端激酶JNK，它对神经细胞的存活有关键影响，被视为治疗帕金森症、阿尔茨海默症、肌萎缩侧索硬化ALS等大脑疾病最具价值的药物靶点之一。该
Nature：CRISPR实施全基因组筛选鉴定肠道病菌感染靶标
10月20日Nature上刊登的一项研究用CRISPR实施全基因组筛选，鉴定了新兴的威胁生命的胃肠道艰难梭菌（Clostridium difficile）感染的关键靶标。美国波士顿儿童医院的Min Dong博士和Liang Tao博士领导的研究小组的工作揭示了这种细菌最强效的毒素如何进入细胞，这
上海药物所靶标发现技术取得突破
中科院上海药物所蒋华良研究员与大连理工大学力学系王希诚教授合作，针对寻找药物作用新靶标的需求，带领博士后李洪林和高振霆等，发展了以活性小分子为探针、搜寻潜在结合蛋白质的“反向分子对接”方法，相关结果发表在Nucl. Acids Res. (2006, 34, W219-224)，并建立了相应的公共网
内含肽可作为治疗线粒体疾病药物靶标
粒体DNA(mtDNA)突变，将导致mtDNA编码、与氧化磷酸化有关的13种蛋白质的突变，从而起很多罕见的疾病，这也可能是人类衰老的原因之一。由于该13种蛋白质高度的疏水性，通过转基编码表达的有生物活性的蛋白质很难从细胞质中进入线粒体。根据内含肽的作用机制，首先在胞质合成线粒体目标蛋白前体片段序
哪些筛选途径可以发现药物
一般是由天然药化或药物化学专业提取或合成的一系列化合物，送药理进行活性筛选，药理活性筛选一般由体外细胞实验开始，进行活性的初步筛选，一般过程是培养细胞-造成病理模型-给予化合物-检测指标。初步筛选的方法一般有MTT法，生化试剂盒。如果初步筛选有疗效，可以再进行一些其他的生化实验加以确证，如weste
生物芯片用于药物筛选
利用基因芯片分析用药前后机体的不同组织、器官基因表达的差异。如果再cDNA表达文库得到的肽库制作肽芯片，则可以从众多的药物成分中筛选到起作用的部分物质。还有，利用RNA、单链DNA有很大的柔性，能形成复杂的空间结构，更有利与靶分子相结合，可将核酸库中的RNA或单链DNA固定在芯片上，然后与靶蛋白孵育
高通量药物筛选的简介
1. 化合物样品库化合物样品主要有人工合成和从天然产物中分离纯化两个来源。其中,人工合成又可常规化学合成和组合化学合成两种方法。2.自动化的操作系统自动化操作系统利用计算机通过操作软件控制整个实验过程。操作软件采用实物图像代表实验用具，简洁明了的图示代表机器的动作。自动化操作系统的工作能力取决于系统
筛选稳定表达细胞株转染后多久药物筛选
稳定细胞株筛选是一个长期的过程，稳定细胞株筛选优化，有许多条件需要摸索，而且是从源头开始①在构建载体时，目的基因直接整合到细胞染色体组上，最好不要通过先瞬转在筛选稳定细胞株的这种方法，因为转染效率没有保证②高表达载体的构建，哺乳动物表达量一直是它自身的缺点，最好根据高表达载体定向的驯化细胞，提高蛋白
血糖研究热门靶标：糖化白蛋白研究
白蛋白是一类球蛋白，最常见的是血清白蛋白。白蛋白家族的所有蛋白质都是水溶性的，在浓盐溶液中有一定的溶解性。白蛋白通常存在于血浆中，与其他血液蛋白的不同之处在于它们没有糖基化。含有白蛋白的物质，如蛋清，称为类白蛋白。许多血液转运蛋白是进化相关的，包括血清白蛋白，甲胎蛋白，维生素D结合蛋白等。糖化白蛋白
HDAC组蛋白去乙酰化酶活性测定及药物筛选方案
选方案组蛋白去乙酰化酶（histone deacetylase,HDAC）是一类蛋白酶,对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用。一般情况下,组蛋白的乙酰化有利于DNA与组蛋白八聚体的解离，核小体结构松弛，从而使各种转录因子和协同转录因子能与DNA结合位点特异性结合，激活基因的转录。在细胞核
HDAC组蛋白去乙酰化酶活性测定及药物筛选方案
组蛋白去乙酰化酶（histone deacetylase,HDAC）是一类蛋白酶,对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用。一般情况下,组蛋白的乙酰化有利于DNA与组蛋白八聚体的解离，核小体结构松弛，从而使各种转录因子和协同转录因子能与DNA结合位点特异性结合，激活基因的转录。在细胞核内
上海药物所发现戊二酸尿症潜在药物靶标
记者从中科院上海药物所获悉，该所化学蛋白质组学研究中心科研人员首次发现了与遗传代谢性疾病戊二酸尿症相关的体内蛋白修饰新型通路——赖氨酸戊二酰化，并发现了治疗此疾病的潜在新药物靶标。相关研究论文日前已发表于《细胞·代谢》。 近年来，代谢性疾病患病率逐渐增高，严重影响了人们的生活质量。据统计，
什么是高通量筛选技术？什么是高内涵药物筛选？
【导读】高通量筛选是指以分子或和细胞水平的实验方法为基础，采用不同密度的微孔平板作为实验载体和自动化工具操作实验步骤，通过快速灵敏的检测装置在同一时间内对海量样品进行生物活性测定、采集实验数据和数字化分析处理，并以相应的信息管理软件支持整个系统正常运转的技术体系。高内涵筛选是指在保持细胞结构和功能完
新的抗癌药物靶标——脂质化学信使
一半以上的人类癌症都具有脂质代谢化学信号异常上调，但这些信号在肿瘤形成过程中是如何被调控的仍没有得到充分的理解。 近日，宾夕法尼亚大学Youhai Chen博士等人发现：TIPE3（一种新近被新发现的致癌蛋白），通过靶向这些脂质信号途径促进癌症。 第二信使--脂质在细胞膜外信号到细胞内部的传
华人学者《Cancer－Cell》解析癌症药物新靶标
目前，美国北卡罗莱纳大学（UNC）医学院的研究人员发现，蛋白质RBM4——对基因剪接过程至关重要的一个分子，在多种形式的人类癌症中急剧下降，包括肺癌和乳腺癌。相关研究结果发表在2014年9月8日的《Cancer Cell》杂志，为开发某种治疗方法，来阻止使癌细胞增殖和扩散的遗传通路变化，提供了一
我所发展高效药物靶标鉴定新方法
原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202210/t20221024_6538609.html 近日，我所生物分离分析新材料与技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队和吉林大学胡良海教授团队、我所分子模拟与设计研究组（1106组）李国辉研究员团队合作，利用蛋
叶明亮：发展高效药物靶标鉴定新方法
近日，大连化物所生物分离分析新材料与技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队和吉林大学胡良海教授团队、我所分子模拟与设计研究组（1106组）李国辉研究员团队合作，利用蛋白质结合药物以后对变性引起的沉淀具有更高的耐受性原理，发展了一种新型的药物靶标蛋白质鉴定方法。 靶标蛋白的发现对药物作用机制的