Nature:CRISPR实施全基因组筛选鉴定肠道病菌感染靶标

10月20日Nature上刊登的一项研究用CRISPR实施全基因组筛选,鉴定了新兴的威胁生命的胃肠道艰难梭菌(Clostridium difficile)感染的关键靶标。美国波士顿儿童医院的Min Dong博士和Liang Tao博士领导的研究小组的工作揭示了这种细菌最强效的毒素如何进入细胞,这是开发抵抗它的疗法的第一步。 艰难梭菌会导致严重腹泻和肠道炎症。它很难被根除,已成为因胃肠道疾病而死亡的一个主要原因。艰难梭菌往往感染住院病人,并在体内定植。这种感染对医院、长期护理机构和长期接受抗生素治疗的病人而言是一种威胁。 Dong、Tao与来自马萨诸塞大学医学院的研究人员一起发现艰难梭菌的毒素通过一种被称作Frizzled的受体进入细胞中——具有讽刺意味的是,这种受体也是维持结肠健康的信号的入口。 鉴定Frizzled受体艰难梭菌克隆 艰难梭菌产生多种毒素,最为人所知的是毒素A和B。本研究关注毒素B,它即便在毒素A不存......阅读全文

Nature:CRISPR实施全基因组筛选鉴定肠道病菌感染靶标

  10月20日Nature上刊登的一项研究用CRISPR实施全基因组筛选,鉴定了新兴的威胁生命的胃肠道艰难梭菌(Clostridium difficile)感染的关键靶标。美国波士顿儿童医院的Min Dong博士和Liang Tao博士领导的研究小组的工作揭示了这种细菌最强效的毒素如何进入细胞,这

Nature-Medicine:全基因组CRISPR筛选找到“癌中之王”薄弱环节

  胰腺癌生长快而且转移率高,是一种非常致命的恶性疾病,被称为“癌中之王”。胰腺导管腺癌(PDA)是胰腺癌的一个主要类型,它拥有抵御化疗的物理屏障,能诱导多种免疫抑制。多伦多大学的研究人员最近通过全基因组CRISPR–Cas9筛选找到了PDAC细胞的弱点,这项研究于十一月二十一日发表在Nature

Nature:利用CRISPR筛选出潜在的黄病毒药物靶标

  在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学医学院和宾夕法尼亚大学等机构的研究人员发现一种潜在的方法阻止寨卡病毒和类似的病毒在体内扩散的方法。相关研究结果于2016年6月17日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“A CRISPR screen defines a signal peptide pr

华人学者PNAS发表CRISPR新技术

  复杂的生物学现象受到不同基因的协调控制。在人类细胞中系统地鉴定这些基因组合是非常麻烦的,亟需一种可扩展的多重筛选技术。  美国麻省理工的研究人员最近在美国国家科学院院刊PNAS杂志上发布了多重条码的CRISPR-Cas9筛选平台。该平台结合了CRISPR-Cas9和CombiGEM技术,能够在人

Science子刊:用CRISPR攻克致命感染

  Whitehead研究所的研究人员改进了CRISPR-Cas基因组编辑系统,使其能够全面操纵白色念珠菌(Candida albicans)的基因组,这一技术将帮助人们找到更多的新治疗靶标。  “这项研究是很有意义的,”领导这项研究的Gerald Fink教授说。“之前我们对这种致病菌的攻击策略并

食品致病菌快速筛选检验国标实施

  由浙江省杭州市质量技术监督检测研究院承担制定的《食品中沙门氏菌、肠出血性大肠埃希氏菌O157及单核细胞增生李斯特氏菌的快速筛选检验酶联免疫法》(GB/T 22429-2008)国家标准,于2月1日起正式实施。据悉,该检测方法的使用将提升食品中致病菌检测效率50%以上,申请的ZL成果投放市场后,每

科学家拓展CRISPRCas9系统在癌症治疗中的应用

  近日,英国剑桥大学等科研机构的科研人员在Nature上发表了题为“Prioritization of cancer therapeutic targets using CRISPR–Cas9 screens”的文章,研究人员基于功能基因组学,利用CRISPR-Cas9系统对多种癌症治疗的潜在靶标

张锋Nature发表重要突破:用-CRISPR启动基因

  麻省理工的科学家们对目前最热门的基因编辑系统CRISPR/Cas9进行了改造,这一成果发表在十二月十日的Nature杂志上。现在,人们可以用这一技术在活细胞中有效启动任何基因。  这个系统可以让科学家们更简便地研究不同基因的功能,领导这项研究的CRISPR技术先驱张锋(Feng Zhang)说。

Nature新闻:基因组测序追踪超级病菌

  研究人员通过基因组测序最终了解了去年困扰英国剑桥一家新生儿特护病房达数月之久的超级细菌疫情。他们将这一案例报告在11月14日的《柳叶刀传染病》(Lancet Infectious Disease)杂志上,标志着首次科学家们通过测序病原体基因组积极控制了一场持续爆发的疫情。   在两天内Ro

华中农业大学团队找到动物冠状病毒药物研发新靶标

   近日,华中农业大学教授彭贵青团队和赵书红团队合作,鉴定出冠状病毒复制所需的关键宿主因子TMEM41B并阐明了其分子机制,为动物冠状病毒的药物研发和抗病育种提供新的靶标。  冠状病毒“利用”和“劫持”宿主因子来调节细胞内环境,并在细胞内修建一个病毒复制的“老巢”(双层囊泡DMVs)来实现高效复制

彭贵青团队等鉴定出冠状病毒复制所需的关键宿主因子

  近日,华中农业大学彭贵青教授团队和赵书红教授团队合作,鉴定出冠状病毒复制所需的关键宿主因子TMEM41B并阐明了其分子机制,为动物冠状病毒的药物研发和抗病育种提供新的靶标。  冠状病毒“利用”和“劫持”宿主因子来调节细胞内环境,并在细胞内修建一个病毒复制的“老巢”(双层囊泡DMVs)来实现高效复

粪便标本肠道致病菌的分离鉴定流程实验

仪器、耗材 病人粪便标本S-S琼脂平板双糖铁培养基伤寒杆菌和志货菌多价诊断血清载波片实验步骤 1. 标本采集:用无菌棉签取新鲜、无尿液混入的病人粪便(脓血或黏液部分更好),立即送检。2. 将标本直接接种于S-S琼脂平板上,作分区划线分离,置37℃恒温箱培养18~24小时。3. 挑取无色透明或半透明菌

粪便标本肠道致病菌的分离鉴定流程实验

仪器、耗材病人粪便标本S-S琼脂平板双糖铁培养基伤寒杆菌和志货菌多价诊断血清载波片实验步骤1. 标本采集:用无菌棉签取新鲜、无尿液混入的病人粪便(脓血或黏液部分更好),立即送检。2. 将标本直接接种于S-S琼脂平板上,作分区划线分离,置37℃恒温箱培养18~24小时。3. 挑取无色透明或半透明菌落接

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(三)

上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。一、大规模基因功能的筛选尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍然是数量遗传学的一个

科学家开发出新方法筛选新的癌症药物靶标

  在一项新的研究中,来自美国达纳-法伯癌症研究所和波士顿儿童医院癌症与血液疾病中心等研究机构的研究人员开发出一种新的筛查方法,即利用CRISPR-Cas9基因组编辑技术在小鼠体内测试上千个肿瘤基因的功能。他们利用这种方法揭示出新的药物靶标,从而可能潜在地改进PD-1检查点抑制剂(一类新的有前景的癌

科学家找到动物冠状病毒药物研发新靶标

  近日,华中农业大学教授彭贵青团队和赵书红团队合作,鉴定出冠状病毒复制所需的关键宿主因子TMEM41B并阐明了其分子机制,为动物冠状病毒的药物研发和抗病育种提供新的靶标。  冠状病毒“利用”和“劫持”宿主因子来调节细胞内环境,并在细胞内修建一个病毒复制的“老巢”(双层囊泡DMVs)来实现高效复制。

刘小乐教授发布CRISPR实用工具

  必需基因是指细胞生存的关键基因。近年来,研究基因重要性(gene essentiality)的功能基因组技术发展很快。举例来说,大规模shRNA筛选已经被用于多个细胞系,帮助人们寻找必需基因。如果一个转录因子使细胞在特定条件下存活,就可以用ChIP-seq鉴定其调控靶标,进而找出必需基因。最近,

Cell:CRISPR/Cas9再获重要突破

  Whitehead研究所的科学家们首次对顶复门(Apicomplexa)生物进行了全基因组筛选。这项重要的研究成果于九月二日发表在Cell杂志上。顶复门的单细胞寄生虫会引起疟疾、巴贝斯虫病、隐孢子虫病和弓形虫病,但我们对这些家伙还知之甚少。  “我们一直没什么办法研究顶复门寄生虫所有基因的功能,

多国实施全基因组分析计划

  由于基因测序可以探查与特定疾病相关的基因,该疗法正在成为日益受欢迎的诊断方法。  英国计划到2017年对10万人进行基因组测序。  美国加州一对龙凤胎出生后,他们的父母非常忧虑:两个婴儿不仅发育缓慢,而且肌肉松软无力。大脑扫描结果显示,男婴或存在大脑性麻痹;然而医生对造成女婴震颤和癫痫的原因却不

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基

5月三大顶级杂志多篇文章解析CRISPR技术

  CRISPR已经成为了炙手可热的基因组编辑工具,帮助世界各地的研究者们解决实际问题,而且在研究人员完成了人类细胞高效、高特异性的全基因组筛选之后,2014年在增强靶标特异性方面又取得了巨大的进步,这为寻找人类健康和疾病相关的基因功能,开辟了无限的可能性。  本月,Nature,Science,C

病菌感染原因

  病菌感染的原因主要包括细菌、病毒、真菌、立克次体以及寄生虫等微生物的侵入。这些微生物可以通过不同的途径进入人体,例如:  细菌:细菌侵入人体后会释放毒素和刺激性物质,导致炎症反应。常见的细菌感染疾病有肺炎、白喉、百日咳等。  病毒:病毒进入体内后会利用宿主细胞复制自身,引起免疫应答,导致发热、乏

《Cell-Reports》:流感病毒增殖研究方面取得新进展

2022年7月7日获悉,华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院张安定教授团队在《Cell Reports》在线发表了论文。该研究利用A549细胞CRISPR/Cas9全基因组敲除文库,筛选并鉴定了204个禽流感病毒增殖相关的宿主基因,进一步验证了14个在流感病毒吸附、入侵、转录和复制等不同阶段发挥

张锋教授Nature子刊发文:编辑人类基因组需谨慎!

   过去的几天里,CRISPR领域又带来了一波吸引眼球的新闻。上周,MIT科技评论发布了一项重磅消息,俄勒冈健康与科学大学的Shoukhrat Mitalipov使用了CRISPR基因编辑技术首次在美国进行胚胎基因编辑(附:原文链接)。而紧接着,CRISPR技术先驱张锋便在Nature Medic

Nature:基因组编辑新技术-或超越CRISPR

  能够将缺陷基因的功能性拷贝插入到患者的基因组中,对于许多从事遗传疾病治疗的临床医生来说是一个诱人的目标。现在,斯坦福大学医学院的研究人员设计出了一种新方法来实现这种遗传技能。他们的研究论文“Promoterless gene targeting without nucleases amelior

Nature子刊:用CRISPR操控表观基因组

  杜克大学的研究人员开发出了一种新方法,可以精确地控制基因开启及激活的时间。借助这一新技术研究人员可通过化学操控包装DNA的蛋白,来开启特异的基因启动子和增强子——控制基因活性的基因组片段。  研究人员说,拥有操控表观基因组的能力将有助于他们探究特殊启动子和增强子在细胞命运或遗传病风险中所起的作用

PNAS:全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染

  最近,发表在PNAS的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。  该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采取的早期发现和遏

全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染情况

  最近,发表在《PNAS》杂志上的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。  该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采取的早

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍

Nature:肠道感染竟能引发帕金森病产生?

  在一项新的研究中,来自加拿大蒙特利尔大学和麦吉尔大学的研究人员证实在一种缺乏一个与人类帕金森病(Parkinson's disease, PD)相关的基因的小鼠模型中,肠道感染能够导致类似于这种疾病的病理特征。这一发现扩展了他们近期的一项指出帕金森病具有主要的免疫成分的研究,这为开发治疗