基因组所与昆明动物所在家犬起源进化研究中取得新进展

5月14日,中科院北京基因组研究所与中科院昆明动物研究所在家犬起源进化合作研究中取得重要进展,相关论文在最新一期《自然·通讯》在线发表。该研究成果从全基因组层面上阐述了狗的起源进化,并首次将其进化历史和人类的近期演化联系了起来。 在昆明动物所张亚平教授和基因组所吴仲义教授的带领下,昆明动物所王国栋博士与基因组所翟巍巍博士,利用大规模基因组测序对分布于世界范围内的多个野生灰狼、中国地区的土狗以及世界各地的多只品种狗进行了大规模的重测序。研究人员发现:家犬的起源时间比领域内先前的估计(一万六千年)要早一倍,同时提示家犬的起源可能比原先理解的伴随农业起源的模式要丰富很多。研究人员通过家犬和野生灰狼的基因组比较,发现很多交配繁殖、消化代谢以及神经功能基因在家犬的驯化过程中受到了强烈的人工选择。值得关注的是这些基因和人在近期的适应性进化存在较多的重合。 家犬作为最早被驯化的家养动物,其驯化在人类历史上具有十分重要的意义。家......阅读全文

同功酶遗传标记分析

实验概要1. 掌握聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 2. 同工酶遗传标记的分析实验原理同工酶是一类由具有不同分子结构和大小但具有相同催化功能的酶,其分子的多种形式是由基因决定的,即基因表达的直接产物。由同一基因座的不同等位基因编码的各种同工酶又称为等位酶,它们从分子水平上反映了等位基因的相对差异。因此,同工酶

细菌和噬菌体的遗传分析-3

方法: 苏氨酸 亮氨酸 叠氮化钠 噬菌体 乳糖 半乳糖 链霉素 Hfr:thr+ leu+ azir tonr lac+ gal+ strs

细菌和噬菌体的遗传分析-4

(2)重组发生在部分二倍体中; (3)只出现一种重组子,不出现相反的重组子(如gal-消失,只剩下gal+)。 三、噬菌体遗传分析 噬菌体是指浸染细菌、放线菌以及真菌的病毒。包括温和、烈性两种,都没有细胞结构,由一个蛋白质外壳包围一段DNA或RNA(烟草花叶病毒为RNA病毒)

单基因病的遗传方式分析(二)

  (2)不完全显性:有时杂合子(Aa)的表现型较纯合子轻,这种遗传方式称为不完全显性(incomplete dominance)或半显性(semi-dominance),也称中间型遗传(intermedeate inheritance)。这里,杂合子(Aa)中的显性基因A和隐性基因a的作用

单基因病的遗传方式分析(四)

  男性患者(XHY)与正常女性(XhXh)结婚,所生子女中,儿子全部正常,女儿全部发病;女性患者(XHXh)与正常男性(XhX)结婚,子女中正常与患者各占1/2。  图4-7是抗维生素D佝偻病系谱,女性患者I1(XHXh)产生两种配子,她与正常男性结婚,理论上子女正常与患者各占1/2,故Ⅱ1、Ⅱ2

重测序(RADseq)做群体遗传分析套路

构建的群体,或自然群体,如各地方品种。提取DNA后,构建文库,简要步骤如下:① 限制性内切酶TaqI酶切;② 连接P1接头;③ DNA随机打断片断化;④ 目的片段回收与末端修复;⑤ 连接P2接头;⑥ RAD片段富集;⑦ 上机测序。参考: Rapid and cost-effective polymo

关于遗传代谢病的病因分析

  遗传代谢病致病原因定位在13q14.3,其发病机制迄今未名,现认为其基本代谢缺陷是肝脏不能正常合成血浆铜蓝蛋白,铜与铜蓝蛋白的结合力下降以致自胆汁中排出铜量减少。人铜蓝蛋白基因位于3q23—25,其基因突变与本病相关,目前发现6种移码突变导致编码蛋白功能障碍铜蓝蛋白无法与铜结合。铜是人体所必需的

华大基因等Cell子刊首次全基因组水平解析等级表观遗传

  来自华大基因,纽约大学医学院,宾州大学医学院等多处研究机构组成的研究小组发表了题为“Genome-wide and Caste-Specific DNA Methylomes of the Ants Camponotus floridanus and Harpegnathos salta

遗传发育所在小麦DNAfree基因组编辑方法研究中取得进展

  CRISPR/Cas9是目前应用最为广泛的基因组编辑技术,已在作物基因功能研究以及品种改良中取得了巨大的成功。常规植物基因组编辑手段多通过农杆菌或基因枪的方法将CRISPR/Cas9 DNA表达框转入并整合到植物基因组中,进而发挥功能对目的基因进行编辑。但是这些方法多存在许多不足,如较高的潜在脱

现代玉米杂种优势群遗传演化基因组学基础获揭示

 玉米种质资源的杂种优势群划分。中国农科院供图 近日,中国农业科学院作物科学研究所玉米优异种质资源发掘与创新利用团队联合华南农业大学、中国农业科学院生物技术研究所等单位研究揭示了玉米父、母本杂种优势群趋同与趋异选择的遗传规律,解析了玉米基因组分化特征及其对杂种优势的贡献。该团队通过总结过去,将玉

Science:发布首个全分辨率的人类基因组遗传图谱

  在一项新的研究中,来自冰岛基因解码公司(deCODE genetics)、冰岛大学和雷克雅未克大学的研究人员发布了首个使用全基因组序列数据开发出来的全分辨率人类基因组遗传图谱。  该图谱提供了迄今为止关于人类进化的两个关键驱动因素之间的位置、速率和关联性的最详细观察:重组(recombinati

遗传发育所在植物基因组编辑突变体筛选方法研究取进展

  如何快速高效进行突变体检测和鉴定是植物基因组编辑技术迅速发展面临的重要问题之一。目前植物基因组编辑突变检测方法主要包括PCR/RE、T7EI错配切割、临界退火温度PCR (ACT-PCR)、Sanger测序和二代测序(NGS)等。以上所有的检测方法都基于PCR反应,且都有各自的不足之处。PCR/

揭示玉米杂种优势群遗传改良与分化基因组学基础

近日,华南农业大学生命科学学院教授王海洋团队联合中国农业科学院作物科学研究所玉米优异种质资源发掘与创新利用团队和中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组创新团队揭示了玉米父、母本杂种优势群趋同与趋异选择的遗传规律,解析了玉米基因组分化特征及其对杂种优势的贡献,为新时期玉米自交系创制和杂种优势利用提

Science:全基因组遗传筛选揭示了人类色素沉着的决定因素

  斯坦福大学Joanna Wysocka团队在Science 在线发表题为“A genome-wide genetic screen uncovers determinants of human pigmentation”的研究论文,该研究利用黑色素的光散射特性对黑色素形成的调节因子进行了全基因组

科学家破译金丝猴基因组,解析植食性遗传机制

  中国科学院动物研究所和诺禾致源共同合作,在国际上率先完成了金丝猴的基因组序列图谱的构建,为解析金丝猴适应植食性的分子机制、系统发育和进化提供了遗传基础,该研究成果于2014年11月2日在线发布于国际著名期刊Nature Genetics上。  川金丝猴(Rhinopithecus roxella

在玉米全基因组水平上解析玉米籽粒淀粉含量的遗传基础

  近期,中国农业大学国家玉米改良中心杨小红团队在国际学术期刊Plant Biotechnology Journal上在线发表了题为“Genetic basis of kernel starch content decoded in a maize multi-parent population”的

遗传发育所利用CRISPRCas系统对植物进行定点基因组编辑

  CRISPR-Cas系统是继锌指核酸酶(ZFNs)和TALEN核酸酶之后的另一个可精确定点编辑基因组DNA的新技术,具有设计构建简单快速等优点。目前已在人类细胞系、斑马鱼、小鼠、果蝇和酵母等多个物种中利用,但CRISPR-Cas系统能否在植物中使用尚无报道。   中国科学院遗传与发育生物学研究

群体基因组分析发表Nature子刊

  脂肪有着顺滑的口感,香甜的味道和充足的饱腹感,很多动物对脂肪都垂涎三尺,人类也不例外。但是,我们知道摄入脂肪太多会影响心血管健康,所以对冰淇淋和油炸食品等富含脂肪的食物需要浅尝而止。可是,总有些人无论吃多少高脂肪的食物,也不会得心血管疾病。为什么呢?  研究人员找到了罗伯塔莫斯(Mylopota

法国拟建高速基因组测序分析平台

  法国总理菲利普17日在巴黎宣布,法国在法兰西岛大区(又称“巴黎大区”)和中部奥弗涅—罗讷—阿尔卑斯大区启动建设两个高速基因组测序分析平台,以推动法国基因组相关研究的发展。  法国政府去年6月提出“法国基因组医学2025”计划,这两个基因组测序分析平台的建设就隶属该计划,预计将于2018年正式开始

基因组DNA甲基化分析方法

早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基

基因组数据分析的“金标准”

  五月十八日,美国安大略癌症研究所、俄勒冈健康与科学大学、赛智生物网络(Sage Bionetworks)、分布式DREAM 团体(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大学圣克鲁兹分校的癌症研究人员,在《Nature M

宏基因组分析和诊断技术概述

近年来,造成人类感染的病原微生物日益复杂,种类增多,抗菌药物滥用致使细菌耐药,病原微生物已成为全球关注的焦点。感染是急危重症患者死亡的主要原因之一,随着新发病原微生物的出现、耐药病原微生物的增多以及免疫抑制宿主的增加,感染的发病率和死亡率居高不下。据WHO统计,在全球,感染性疾病导至患者死亡占全部死

编程菜鸟的理想基因组分析平台

  近年来基因组测序技术出现了迅猛的发展,测序通量在不断地提高,而测序成本在持续下降。然而,海量测序数据的产生也给数据分析带来了不小的挑战。  对于那些毫无编程背景的生物学研究者来说,衔接多个生物信息学工具是一件相当头疼的事情。加州大学、Broad研究所和斯坦福大学的研究团队日前在Nature Me

基因组足迹分析的方法和应用

中文名称基因组足迹分析英文名称genomic footprinting定  义通过检测DNA在结合有蛋白质可以被保护而免受内切核酸酶降解的区域,对基因组中蛋白质结合位置及其核苷酸序列进行的分析。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

直链淀粉分析仪对直链淀粉含量遗传的分析

  所谓龙生龙,凤生凤在植物的遗传学上也都有表现。只有选择高营养高品的种子,才能培育出高品质的作物。直链淀粉在各种食物中都有体现。直链淀粉分析仪分析出直链淀粉的含量受作物本身的遗传影响。直链淀粉主要是由颗粒结合型淀粉合成酶Ⅰ(GBSS1)催化合成,而支链淀粉主要是由可溶性淀粉合成酶、淀粉分支酶和淀粉

郑果所解析桃高质量基因组及果实香气遗传进化机制

  桃汁多、味美,受到全世界广大消费者的喜爱。然而,随着长期以来育种家培育出大果、高糖和耐贮藏品种,消费者反映果实香气变淡、桃没桃味。利用基因组是研究果实重要农艺性状的有力工具。7月26日,Plant Journal在线发表了中国农科院郑州果树所王力荣和曹珂研究员为通讯作者的题为“New high-

新活检方法出现新发现遗传物质可准确代表肿瘤基因组

  根据英国《自然》杂志近日发表的一项最新成果,美国癌症专家报告一种新发现的遗传物质,可准确代表肿瘤基因组。研究人员表示,这种脑脊液(CSF)中肿瘤源DNA的检测,可用于追踪一些胶质瘤的进展。而这种液体活检方法可作为一种微创方法,替代脑组织取样。  胶质瘤是成年人中最常见的癌性脑肿瘤。监测胶质瘤进展

我国完成桑蚕大规模基因组重测序和遗传变异图谱构建

  北京时间8月28日凌晨2时,由深圳华大基因研究院与西南大学合作的研究成果“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”在国际权威学术刊物《科学》上发表,这是科学家继2003年在家蚕基因组研究领域取得进展后的又一重要成果。   据悉,科学家共获得了40个家蚕突变品系和中国野桑蚕的全基因

首次发现!人类基因组中的表观遗传缺陷或普遍存在

  近日,一项刊登在国际杂志American Journal of Human Genetics上的研究报告中,来自西奈山医院等机构的科学家们通过研究首次揭示了人类基因组中普遍存在的表观遗传缺陷,同时还揭示了引发遗传性疾病的数百个基因中所发生的表观遗传缺陷。图片来源:Pixabay/CC0 Publ

冠状动脉钙化机制揭示:基因组学研究发现新的遗传因素

由美国马萨诸塞州总医院等中心的研究人员领导的国际团队已经找到了导致冠状动脉钙化(CAC)的新的和已知的遗传因素,这是一种由动脉粥样斑块标志的病症,可能增加患心脏病的风险。马萨诸塞州总医院心脏病学家,MGH心血管研究中心的研究员、共同资深作者和共同通讯作者拉吉夫·马尔霍特拉(Rajeev Malhot