基于循环肿瘤DNA甲基化特征的结外NK/T细胞淋巴瘤诊断预测模型
结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)是非霍奇金淋巴瘤的一种少见亚型,多数病例发生在鼻腔和咽喉部以上部位,又称鼻型NK/T细胞淋巴瘤。ENKTL的诊断依赖于病理学检查,然而坏死组织的存在以及发病部位的解剖学复杂性为病理采样带来了挑战。目前临床使用Ann Arbor分期标准和NK/T细胞淋巴瘤预后指数(PINK指数)指导精确治疗,然而其效能并不令人满意。因此,当前急需开发基于体液活检的ENKTL诊断和预后预测技术。 中山大学肿瘤防治中心研究团队在《Cell Reports Medicine》期刊上发表题为“Diagnostic performance and prognostic value of circulating tumor DNA methylation marker in extranodal natural killer/T cell lymphoma”的研究文章。该研究构建了基于循环肿瘤DNA(ctDNA)甲基......阅读全文
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
基因测序技术原理
基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。[2] 自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。[2] 虽然这种方法检测可靠,但是价格不菲也是有目共睹的,一台仪
基因测序产生背景
史蒂夫·乔布斯曾接受过全基因测序 基因测序,本是一种实验室研究技术手段,因“名人效应”应用于高端体检、产前诊断等领域,价格不菲。基因测序最广为人知的,是影星安吉丽娜·朱莉通过基因检测,选择手术切除乳腺以降低患乳腺癌风险。2011年去世的苹果公司创始人史蒂夫·乔布斯患癌时,也曾接受过全基因测序。
什么是基因测序
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。 基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术[1]。
基因测序应用行业
基因检测目前主要有三大细分领域,分别是生殖与遗传健康、肿瘤个性化诊断、以及健康人群疾病预防与监测。■生殖与遗传健康基因检测在生殖与遗传健康领域具有广阔的发展前景。当前主要的产品是通过对母体血液中的胎儿DNA(cfDNA)进行测序,检测胎儿染色体13,18,21等是否出现异常,从而排除胎儿患有Pata
基因测序的步骤
PCR产物直接测序技术现已成为分子生物学和基因组学研究中的一个重要技术,广泛用于基因突变检测、遗传性疾病诊断、单核苷酸多态性研究、基因组重叠序列群等.与传统克隆测序技术相比较,直接对PCR扩增的DNA进行测序,省去了耗时的克隆步骤,避免了传统的细菌培养,模板提取等重复性操作,可以从少量的原始样品中得
基因测序仪分类
根据电泳类型分为平板型电泳和毛细管电泳两类: 1. 平板型电泳:平板型电泳的凝胶灌制在两块玻璃板中,聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄,因此又称为超薄片层凝胶电泳。是经典的电泳技术,具有样品判读序列长(600-900bp)、一块凝胶板上可同时进行多个样品测序的优点。 2. 毛细管电泳:将凝胶
基因测序技术展望
DNA测序技术从最开始的简单检测逐渐演变到今天的高通量测序,在过去的30年里,数据生成呈指数增长,而过去10年里,由于高通量测序,数据产生量呈超指数增长。并且,基因测序产生的数据已经在基础生物学等诸多领域产生了革命性的影响,应用范围渗透到考古学、刑事调查和产前诊断等多个行业。那么,未来基因测序会取得
基因测序技术(一)
什么是基因测序 基因组携带了个体的全部遗传信息,基因测序能够加深对疾病尤其是恶性肿瘤的分子机制理解,在诊断与治疗方面都发挥着重要作用。从1953年沃森和克里克发现DNA分子双螺旋结构到2001年首个人类基因组图谱的绘制完成,越来越多的人们意识到基因测序在生物医学中的重要作用。 所谓基因测
基因测序仪原理
目前DNA测序仪的工作原理主要基于Sanger发明的双脱氧链末端终止法或Maxam-Gilbert发明的化学降解法。这两种方法在原理上虽然不同,但都是根据在某一固定的位点开始核苷酸链的延伸,随机在某一个特定的碱基处终止,产生以A、T、C、G为末端的四组不同长度的一系列核苷酸链,在变性聚丙烯酰胺凝
什么是基因测序
基因测序又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和ZL。 例如H7N9等病毒,就是ZG科学家通过基因测序等技术手段,发现的
基因测序仪定义
基因测序仪又称DNA测序仪,是测定DNA片段的碱基顺序、种类和定量的仪器。主要应用在人类基因组测序、人类遗传病、传染病和癌症的基因诊断、法医的亲子鉴定和个体识别、生物工程药物的筛选、动植物杂交育种等方面。
单个循环肿瘤细胞RNA测序结果
由麻省总医院,哈佛大学主持的一项最新研究发现了前列腺癌细胞对一种常见的癌症治疗方法产生抗性的原因,研究人员完成了前列腺癌单个循环肿瘤细胞的RNA测序,其中找到了非经典Wnt信号所起的关键作用。 这一研究成果公布在9月18日的Science杂志上。 Androgendeprivationthe
肿瘤测序行业箭在弦上-蓄势待发
21世纪之所以能成为生物学的世纪,这是因为随着百姓生活水平的提高,温饱问题早已解决,并催生了“大健康产业”成为永不落幕的朝阳产业。2012年全世界共新增1400万癌症病例并有820万人死亡,癌症已经成为世界性难题。由于基因突变导致肿瘤形成,人以群分,肿瘤以基因突变分,二代测序为绘制肿瘤基因突变谱
中国科学家Nature-Genetics发表淋巴瘤研究新成果
上海交通大学领衔的系统生物医学协同创新中心联合来自我国血液/肿瘤临床多中心研究机构(M-HOPES)的17家医院,最近在淋巴瘤发病原理和临床预后研究方面获得了重要的标志性成果,充分体现了多中心多学科协同创新、造福患者的宗旨。自然杀伤/T细胞淋巴瘤(natural killer T-cell ly
基因检测指导淋巴瘤治疗
在以实验血液学进展为主题的中国青年科学家论坛上,来自国内血液系统恶性肿瘤诊疗、造血干细胞移植等领域的专家们交流了最新研究成果,其中“淋巴瘤预后相关基因”的研究引起了与会者浓厚的兴趣。 抗生素治淋巴瘤不是没可能 一项由北京大学第三医院血液科主任克晓燕教授与北大医学部病理系
肿瘤动物模型的构建——淋巴瘤篇
淋巴瘤(Lymphoma)是一种原发于淋巴结和淋巴组织的恶性肿瘤。近年来其发病率正以每年4%的速度上升。初期往往仅因表现为持续发烧或淋巴结肿大,而被大家忽视。加上淋巴瘤亚型(>80种)众多,治疗困难重重。因此迫切需要建立正确的动物模型,这对于研究淋巴瘤的发病机制和治疗手段十分重要。淋巴瘤为全身性肿瘤
Nature子刊:首张Burkitt淋巴瘤遗传图谱
在第一张绘制的伯奇氏淋巴瘤(Burkitt"s lymphoma)广泛遗传图谱中,杜克大学医学院的科学家以及他们的合作者们发现了70个突变,其中一些从前并未显示与癌症相关,其中一个新突变为这一疾病所独有。 针对Burkitt淋巴瘤(一种侵袭性淋巴瘤形式)的基因测序结果可用于开发新药,或
探索肿瘤防治的三级模式
尽管首都北京医疗资源丰富,顶尖的医疗机构林立,但似乎并没有遏制恶性肿瘤的发病率攀升的趋势。 《北京市居民恶性肿瘤发病及生存报告》显示,2013年,北京市癌症新发病例达到4.13万人,平均每天新增113人。恶性肿瘤从2007年开始一直位居北京居民死因首位,平均每死亡4人中就有1人死于癌
探索肿瘤防治的三级模式
尽管首都北京医疗资源丰富,顶尖的医疗机构林立,但似乎并没有遏制恶性肿瘤的发病率攀升的趋势。 《北京市居民恶性肿瘤发病及生存报告》显示,2013年,北京市癌症新发病例达到4.13万人,平均每天新增113人。恶性肿瘤从2007年开始一直位居北京居民死因首位,平均每死亡4人中就有1人死于癌症。 在
肿瘤防治需警惕三大“夺命杀手”
4月15日至21日是第29个全国肿瘤防治宣传周。近年来,与癌症相关的健康问题受到公众广泛关注。肺癌新发和死亡高居前列,何种情况需要警惕?国家癌症中心2022年发布数据显示,在我国406.4万人的新发癌症患者中,肺癌发病人数为82.8万,在241.4万因癌症死亡的人群中,有65.7万人罹患肺癌。无论是
肿瘤相关基因
癌基因(英语:Oncogene,亦称为致癌基因)是细胞遗传物质的一部分, 它们参与细胞从正常生长状态到肿瘤的过程。它们通过诱导或突变被激活。 致癌基因原癌基因是参与细胞生长、细胞分裂和细胞分化的正常基因。但当其发生突变后,就会变成致癌基因。它们会在诸如放射性物质,化学物质和病毒的作用影响下过渡成引发
解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983
基因测序与基因检测的区别
基因测序是测出DNA上的碱基是A,C,G,T中的哪一个;而基因检测是通过杂交或测序等方法来确定DNA序列中是否含有特定的一段序列,来明确相关的基因某些功能。基因测序只是测定DNA的序列,和站在机器前拍一张X光片是一样的。基因测序的结果拿到一个由A、G、C、T组成的文件。没有对测序结果进行分析和判断,
单分子测序:基因测序不再遥不可及
如果说二代测序的使命是使成本降低到1000美元/基因组的话,那么三代测序的使命就是使成本降低到100美元/基因组,进一步促进测序发展为临床的常规检测技术,在临床诊疗上发挥更大的作用。 在年初的J.P.Morgan健康医疗大会上,美国基因测序公司Illumina宣布将创建一个新公司——Grail
单分子测序:基因测序不再遥不可及
在年初的J.P.Morgan健康医疗大会上,美国基因测序公司Illumina宣布将创建一个新公司——Grail,致力于开发一种不超过1000美元的血液检测,用于多类型癌症的早期筛查。这种肿瘤DNA测序的主要目的是在无症状的个体中诊断各种各样的癌症,从而实现提前预防或治疗。 随着技术的不断进步,
单分子测序:基因测序不再遥不可及
如果说二代测序的使命是使成本降低到1000美元/基因组的话,那么三代测序的使命就是使成本降低到100美元/基因组,进一步促进测序发展为临床的常规检测技术,在临床诊疗上发挥更大的作用。在年初的J.P.Morgan健康医疗大会上,美国基因测序公司Illumina宣布将创建一个新公司——Grail,致力于
肿瘤愈后监控:一个可能被忽略的基因测序刚需市场
2015年被业内称为基因测序临床应用的元年。 4月8日,浙江迪安诊断技术股份有限公司(下称“迪安诊断”)发布公告称,其全资子公司杭州迪安医学检验中心有限公司取得了第一批“肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床应用试点”资格。 “公司将积极研究肿瘤筛查与靶向药物伴随诊断技术等,为肿瘤病人设计
基因测序-发展前景
2015年3月9日,罗氏、基础医学以及其他很多癌症研究人员都认为从数据角度分析癌症是最终战胜这种可怕疾病的理想方式。根据罗氏和基础医学签署的协议,罗氏可以访问基础医学的数据库。他们的数据库收录了3.5万名癌症患者的肿瘤DNA序列,以及这些患者服用的药物和药物在遏制癌症方面产生的功效等信息。[13]
基因测序-主要问题
基因测序是把双刃剑基因测序虽然是一种很好的治疗手段,但是中国科学院北京基因组研究所教授甄二真表示,目前从应用的角度来说,科学家只确定了部分的基因位点与疾病的确切关系,也就是说真正可以用于临床诊断和指导治疗的基因检测并不多。要想真正用基因来诊病,还需要时间。[8] 基因测序就像一把双刃剑,如果运用得不