基因检测助力肿瘤精准医疗,精准定位FGFR抑制剂敏感的患者人群

成纤维细胞生长因子受体(FGFR)在多种恶性肿瘤中存在异常激活,并与肿瘤的发生发展密切相关,已成为目前“不限癌种”的热点研究靶标之一。目前国外已有靶向FGFR的抑制剂上市,用于胆管癌、尿路上皮癌等适应症。佩米替尼作为国内首款获批上市的FGFR抑制剂,填补了国内胆管癌靶向治疗的空白,也开启了胆管癌精准靶向治疗新纪元。 作为肿瘤精准治疗的基础,基因检测同样是关注度极高的话题。那么如何能精准找到FGFR突变的患者?这一靶点如何进行检测?检测有何难点?本文将详细解读。01 FGFR2融合主要发生在肝内胆管癌,明确分子诊断是精准医学的新需求 胆管癌是一种恶性程度高且进展迅速的疾病,目前唯一有效的治愈方法是根治性手术。然而,大多数患者(约65%)在被诊断时已处于晚期,错过了手术切除的机会。即使进行手术切除,5年生存率仅约为20%~35%[1]。 不可切除或复发转移的胆管癌患者应选择系统治疗。根据ABC-02研究数据,一线标准化疗方......阅读全文

测序技术如何助推精准医学?

主要应用领域基因测序的一个重要应用是测出生缺陷,包括单基因病、遗传病、无创产前、基因检测,这是目前应用的最多、最成熟的产业。整个肿瘤基因组结构非常复杂,一个肿瘤基因组数据量大约有几十个G,要完整地测一个肿瘤单细胞,则需要更多工具,数据量也更大。移植配型白血病、骨髓配型,包括基因身份证和整个的器官移植

ASCO发布会推荐:除了精准全面有效,二代测序

  2018美国肿瘤学会年会(ASCO)将于当地时间6月1日于芝加哥举行,当地时间5月16日中午12点,ASCO在亚历山大总部召开了会前新闻发布会,公布了LBA研究发布及报告的日程。   ASCO主席 Bruce E. Johnson和首席医务官Richard L. Schilsky共同介绍、推荐

二代测序技术

人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面:1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表达什么听

二代测序原理

第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序,而二代测序开创性的引入了可逆终止末端,从而实现边合成边测序(Seque

风口上的精准医学,相信但不能迷信“基因测序”

  2016年6月29日,第三届中国IVD产业投资与并购CEO论坛在美丽富饶的钱塘江畔、充满活力的下沙新城召开。本届大会由包括来自产业界、投资界和其他专业领域的超过300人的嘉宾参与,是三届以来规模最大的一次。  来自华大基因的执行总裁尹烨作为此次论坛的主席,他在开幕式中介绍道:基因测序、干细胞、生

不卑不亢看待二代测序

  人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面:  1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表

二代测序及其应用

二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二代测序应用如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454:油包

二代测序及其应用

二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二代测序应用如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454:油包

曹雪涛院士:精准医学不应以基因测序为导向

  从年初奥巴马提出将精准医学纳入美国国策以来,精准医学就成为一项热门概念。在中国工程院院士、清华长庚医院管理咨询委员会的委员曹雪涛看来,精准医学的最终目的是更好地为病人服务,它只是精准定义病因的“利器”,并不是万能,也不应以基因测序作为导向。  曹雪涛表示,目前的医疗理念发展越来越呈现个性化、精确

对“精准医学”要精准理解

   “精准医学”这一概念,自2015年年初被美国总统奥巴马重提以来,一直被广泛推崇,成了医学未来发展趋势的代名词。不过,也是自那时起,大家做什么都想要与它挂钩,商家更是喜欢炒作这个概念。最近《自然》与《新英格兰医学杂志》分别发表的有关精准医学评论文章引发了不小的争论,让人不得不认真地思考“到底应如

诊断性二代测序指南

   通过二代测序(next-generation sequencing,NGS)能够快速地对某个个体患者的数千个甚至数百万个DNA碱基对进行测序。这一技术快速出现并且获得成功,这预示着一个遗传学诊断的新的时代的到来。但是,新技术也带来了新的挑战,一方面是技术层面上的,即数据处理问题,另一方

二代测序分析未来如何

二代测序数据分析越来越热但是我觉得虽然在这个大环境下还是应该冷静思考一下。数据分析和数据分析员,我觉得要先弄清这两者的区别,数据分析,现在注重的算法和生物学的结合,优化现有的分析流程和对大数据背景下的深度挖掘(其实对计算机和算法的要求更高一些),如果数据分析员其实说白了就是一个重复分析流程的搬砖工。

什么是基因二代测序

第二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。第二代测序技术的核心思想是边合成边测序(Sequencing by Synthesis),即通过捕捉新合成的末端的标

二代测序原理及应用

二代测序原理及应用如下:一、原理二代测序原理也就是文库构建,PCR产生的片段或基因组打断的片段两端需要添加接头修饰才能进行测序。1、末端修饰。打断的片段是随机断裂,其末端可能是不平的。因此,建库第一步是补齐不平的末端。2、添加接头。经过末端修饰后的DNA片段3’末端具有突出的A尾,而接头具有突出的T

什么是二代测序技术

二代测序技术又称为高通过量测序技术,是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序,可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势,在生命科学领域已经被

什么是二代测序技术

二代测序技术又称为高通过量测序技术,是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序,可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势,在生命科学领域已经被

高通量测序技术——第二代测序技术

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(de

一代测序和二代测序的区别

一、含义不同:第一代测序:指双脱氧末端终止法,扩增后通过毛细管电泳读取序列,每次获取数据量少。第二代测序:为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二、作用不同:San

一个超级DNA测序大国-如今将转战精准医学研究领域

  6年前,中国成为DNA测序的全球领导者,而这多数归功于华大基因(BGI)公司的贡献,位于深圳的华大基因公司已经购买了128台全球最快的测序机器,而公司解析DNA的能力已经超过全球50%,BGI组成了一支非常年轻的生物信息学家团队,并且同全球的研究者进行合作,如今已经发布了从古人类到大熊猫等各个物

中国:一个超级DNA测序大国-将转战精准医学研究领域

  6年前,中国成为DNA测序的全球领导者,而这多数归功于华大基因(BGI)公司的贡献,位于深圳的华大基因公司已经购买了128台全球最快的测序机器,而公司解析DNA的能力已经超过全球50%,BGI组成了一支非常年轻的生物信息学家团队,并且同全球的研究者进行合作,如今已经发布了从古人类到大熊猫等各个物

第二代DNA测序技术

DNA总的说来,第一代测序技术的主要特点是测序读长可达1000bp,准确性高达99.999%,但其测序成本高,通量低等方面的缺点,严重影响了其真正大规模的应用。因而第一代测序技术并不是最理想的测序方法。经过不断的技术开发和改进,以Roche公司的454技术、illumina公司的Solexa,His

单基因检测和二代测序

在肺癌患者中,有一批携带驱动基因突变的患者,在治疗上可以针对突变的基因采用靶向治疗。在预后上,这部分患者也往往具有较长的生存期。目前,指南推荐了9个靶向治疗的相关基因,他们分别是:EGFR、ALK、ROS1、Her2、KRAS、MET、RET、BRAF和最近一年刚进入指南的NTRK基因。为了识别这一

第二代测序(NGS)技术

  二代测序是一个强大的功能平台,它可以同时给数以万计的DNA分子进行测序。由于这种可以多个样本同时测序的能力,在个性化医疗、遗传疾病和临床诊断等方面,二代测序也就是高通量测序开创了革命性的领域。  早在1900年代就发明的Sanger测序法,成为了DNA测序的黄金法则,即便到了今天它仍被广泛用来进

什么是精准医学?一文看懂精准医学的“前世今生”

精准医学的“前世今生”图片来源于网络  目前世界技术更新换代速度非常快,各行各业都不断出现新的模式、新的亮点。例如在医学界,精准医学( Precision Medicine)的模式就吸引了众多人的眼球,这种模式改变了以往治疗方案普适化的特点,强调了针对不同患者提出不同治疗方案的特性。例如,十年前,哈

一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点

一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点分别介绍如下:一代测序优点是读长较长、准确性高。缺点是测序成本高、通量低,使得de novo测序、转录组测序等应用难以普及。二代测序优点是相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内。缺点是序列读长方面

一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点

一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点分别介绍如下:一代测序优点是读长较长、准确性高。缺点是测序成本高、通量低,使得de novo测序、转录组测序等应用难以普及。二代测序优点是相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内。缺点是序列读长方面

中科院精准医疗项目取得突破性进展

记者19日从中科院合肥物质科学研究院了解到,该院强磁场科学中心将高通量基因测序与高通量药敏检测技术体系相结合,在恶性肿瘤的精准诊断与治疗上取得突破性进展。临床实验显示,该技术体系提供的精准治疗方案为克服传统治疗手段针对性低、毒副作用明显等不足,提高恶性肿瘤治疗疗效和患者生活质量提供了

让精准医学更精准——组学大数据与医学的完美结合

  奥巴马的精准医学计划意在大规模测定癌症病人的全基因组,挖掘癌症驱动基因,实现个性化精准用药,解决癌症对人类的威胁。然而,科学家呼吁:生命活动的实际承担者、大部分的疾病标志物、绝大多数的药物治疗靶标都是蛋白质,因此,精准医学离不开蛋白质组。以蛋白质组、代谢组为重点的多组学为基因组提供了更接近表型的

精准有道,医学无涯-|-精准医学新发展系列在线研讨会

  精准医学涵盖疾病“研究”、“诊断”和“个性化治疗”等诸多方面,需借助多维度的先进技术与成果进行不断创新和发展,同时结合临床病理学特征和大数据,加快科研成果临床转化,并在实践中不断推进个体化用药与治疗。精准医学作为健康中国2030的计划中重要规划方向之一,日益受到重视并吸引越来越多的科研临床机构和

301医院王成彬:精准医学、精准检验与检验精准

  精准医学是指利用患者的遗传组成和生活环境信息,对患者进行量身定制的医学治疗,以期获得理想化的治疗效果,减少不必要的治疗和避免副作用。精准医学是基于人类基因测序、生物医学分析等技术的发展和大数据分析工具的出现提出来的。这些技术的进步能够对庞大的遗传信息进行更快速的解读,更准确地了解患者的疾病状态,