Nature：复杂生命难道不需要非编码DNA？
非编码DNA仅占据丝叶狸藻基因组3%的组成成分，这是否证明了对于复杂生命来说，非编码DNA并不需要呢? 自从科学家们首次发现超过95%的人类基因组是由非编码元件组成以来(非编码元件是指不会编码任何特殊蛋白质的 DNA 片段)，他们就一直致力于了解这种所谓的“垃圾” DNA 的作用。在过去这几年里，ENCODE 项目中的研究人员提出一种新观点，即非编码 DNA 并不完全没有用处，实际上它们是关键的调控元件，有助于编码 DNA 完成任务，构成复杂生命的形状及功能。 然而如今一组由多国研究人员组成的研究组提出了不同观点，指出一种称为丝叶狸藻：Ultricularia gibba 即使其基因组中只有3%是非编码DNA，但仍然能生长。 文章的第一作者之一，布法罗大学的一位分子进化生物学家 Victor Albert 认为 U. gibba 讲述了一个奇妙的进化基因组故事，“为什么植物基因组通常都有10......阅读全文
Science：宏基因组研究挑战DNA编码规则
人们一直认为DNA编码的指令是所有生命通用的，例外情况极少。但本期Science杂志上的一项新研究显示，自然界中的生物又一次打破了既定的规则。 美国能源部联合基因组研究所的Edward Rubin领导研究团队，获得来自1776种环境（包括17个人体区域）的微生物宏基因组数据，以便在其中寻找重编
Nature：复杂生命难道不需要非编码DNA？
非编码DNA仅占据丝叶狸藻基因组3%的组成成分，这是否证明了对于复杂生命来说，非编码DNA并不需要呢? 自从科学家们首次发现超过95%的人类基因组是由非编码元件组成以来(非编码元件是指不会编码任何特殊蛋白质的 DNA 片段)，他们就一直致力于了解这种所谓的“垃圾” DNA 的作用。在过
迄今最全面的非编码基因组图谱问世
生命科学 非编码 DNA 延伸段在发育和基因调控中发挥着关键作用。2 月 3 日发表在《自然》（Nature）上的一项新研究称，来自美国麻省理工学院（MIT）的研究团队发表了迄今为止最全面的非编码基因组图谱，EpiMap（Epigenome Integration across Multi
非编码DNA可用于开发癌症特异性疫苗
癌症疫苗，是科学家们五十多年来一直潜心研究的疑难课题，但直到最近的一项研究才得以证明这种疫苗是有效的。 近日，加拿大蒙特利尔大学免疫和癌症研究所(IRIC)的一个研究团队证明了癌症疫苗可以起作用。不仅如此，它还可以成为一种非常有效、非侵入性以及低成本的抗癌工具。这项研究刚发表在《Science
基因组所发表长非编码RNA分类问题综述文章
近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队，与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)开展科研合作，对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述，相关论文在RN
Nature子刊：长非编码RNA可模拟DNA起作用
长期以来，人们一直认为基因组的大部分区域属于“禁飞区”。这些区域不编码任何蛋白，因此细胞的基因读取机器很少接近。然而近年来科学家们发现，许多非编码序列其实能够转录成RNA，Gas5就是其中之一。 GAS5是一段基因间的长非编码RNA（lincRNA），它来自于非编码的“垃圾DNA”或“基因组的
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs, lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27
基因组密码被解锁：深度学习模型破解非编码区奥秘
人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区，这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达，最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性，目前解读非编码变异的分子效应仍是重大挑战。现有深度学习模型在预测功能基因组特征时，往往在输入序列长度与预测分辨率之间难以兼顾
新发现！非编码DNA突变也可引发癌症－|－Nature子刊
基因与癌症的关系远比人类已了解的更加复杂。近日，美国科学家在一项新研究中鉴定出了近200个在不同的癌症中发挥作用的非编码DNA突变。 image.png 图片来源：Nature Genetics（doi:10.1038/s41588-018-0091-2） 在人类基因组中，有9
新发现！非编码DNA突变也可引发癌症－|－Nature子刊
基因与癌症的关系远比人类已了解的更加复杂。近日，美国科学家在一项新研究中鉴定出了近200个在不同的癌症中发挥作用的非编码DNA突变。 图片来源：Nature Genetics（doi:10.1038/s41588-018-0091-2） 在人类基因组中，有98%的信息是看似无用的“垃
“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”
“垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的，用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列，而在学术上被称为非编码DNA序列。 由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键，而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因，于是“垃圾DNA”这一观念便形
“垃圾DNA”或是编码DNA的“保镖”
"垃圾DNA"的概念源自上世纪70年代，用来形容基因组中不是编码蛋白质的DNA序列，在学术上被称为非编码DNA序列。 非编码DNA"开关说"究竟是个啥？ 科学家们发现，人类基因组中包含多达400万个基因开关和功能调节因子，它们的载体便是"垃圾DNA"。这强烈地冲击了"DNA序列=生物性
非编码区的定义
基因是由成千上万个核苷酸对组成。组成基因的核苷酸序列可以分为不同区段。在基因表达的过程中,不同区段所起的作用不同。能够转录为相应信使RNA,进而指导蛋白质合成(也就是能编码蛋白质)的区段叫做编码区。不能编码蛋白质的区段叫做非编码区。非编码区位于编码区前后,同属于一个基因,控制基因的表达和强弱 。
非编码区的作用
非编码区虽然不能编码蛋白质,但对于遗传信息表达是不可缺少的。在它上面有调控遗传信息表达的核苷酸序列,是有遗传效应的。比如RNA聚合酶结合位点。非编码区对目的基因是不可缺少的。非编码区上有与RNA聚合酶的结合位点,具有调控作用。基因非编码区的碱基的插入、缺失和替代也属于基因突变事件,尽管大多数的研究是
NAR：人类基因组中或含有超过20％的非编码基因
近日，一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中，来自美国国家癌症研究中心的科学家们通过研究发现，高达20%的编码基因可能根本就无法进行编码，因为这些基因具有非编码或伪基因（即过时的编码基因）的特征，由此导致的人类基因组的缩小或许会对生物医学领域产生重要的影响，
人类癌症基因组非编码区域中鉴别出关键的致癌突变
近日，一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中，来自加拿大安大略省癌症研究所的科学家们通过研究在人类癌症基因组中的大量非编码区域（也被称之为人类癌症DNA的“暗物质”）中发现了一种新型的致癌突变；这种突变或能作为一种新型潜在的治疗靶点，帮助科学家们开发治疗多种类型癌症的新型疗法，包括脑癌、肝
Cell惊人发现：谁说非编码RNA不编码？
来自德克萨斯大学西南医学中心的Eric Olson和同事们在分析梳理肌肉特异性的长链非编码RNAs(lncRNAs)以了解它们的功能时，发现了一种在骨骼肌中特异性表达的lncRNA。尽管这一RNA以往被归类为是非编码RNA，它的序列中包含的一小段却看上去好像一个编码区域。这一研究发现发布在《细胞
基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员，带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT（Parallel Alignment and back-Translation）”。该研究成果发表在Biochemical and Biop
北京基因组所合作开发完成长非编码RNA数据库
长非编码RNA（Long non-coding RNA, lncRNA）是近年来国际研究的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病发生密切相关，在疾病诊疗方面表现出了潜在的重大应用价值。虽然长非编码RNA表达量相对较低，但由于其在转录、基因组印记、翻译、可变剪切、转录后表达调控、蛋白运输与定位等过程的
简述非编码RNA的成熟
多数生物体中的非编码基因（ncRNA）被转录为需要进一步加工的前体。核糖体RNA（rRNA）通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。转移RNA（tRNA）的5'和3'端序列分别被RNase P和tRN
非编码序列的定义
中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定 义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
非编码序列的概念
中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定 义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
我国发现一类新型长非编码RNA－基因组“暗物质”不断“正名”
国际著名学术期刊Molecular Cell近日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新进展。该研究发现，一类新型长非编码RNA，或与小胖威利综合征的发生发展密切相关。 人类基因组中存在大量被称为基因组“暗物质”的非编码序列，包括基因
自闭症或因父亲基因突变－非编码区DNA结构变体潜藏祸端
《科学》杂志官网近日消息称，一项探索非编码DNA的新研究发现，调节基因活性区域的改变也可能导致自闭症，令人惊讶的是，这些变化倾向于从非自闭症的父亲那里继承而来。 过去十年中，研究人员已经发现了数百种可能影响大脑发育，从而增加自闭症风险的基因变异，但这些变异主要来自直接编码蛋白质的DNA中。此外
基因组DNA的提取
第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中，可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部，
基因组DNA的提取
基因组DNA的提取概 述 基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分
基因组DNA的定义
中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定 义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇非编码小RNA
中文名称：非编码小RNA英文名称：small non-messenger RNA;snmRNA定 义：细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科：生物化学
长非编码RNA与肺癌转移
我们体内的大多数DNA(约80%)并没有编码蛋白，不过它们会转录为RNA。这些非编码的RNA分子负责在细胞中实现多种功能。microRNA等小RNA已经被研究得很多了，近年来人们又发现了一类长非编码RNA，这些RNA拥有两百个以上的核苷酸。 长非编码RNA对细胞周期、细胞生长和细胞死亡等细
Nature解析癌症与非编码RNA
人类基因组可生成1万多种长链非编码RNA(lncRNA) 分子，但人们至今却只知道其中几十种转录物的功能。在发表在8月14日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究中，来自加州大学的杨柳青(Liuqing Yang，音译)等研究人员揭示，两种lncRNAs结合并控制了雄激素受体的功能。