科学家开发一款多功能植物小RNA分析工具
近日，《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果，他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。 sRNAminer软件整体功能概览。课题组供图 据介绍，植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要调控分子。目前已有的分析工具多数依赖于命令行环境，且功能较单一，无法有效支持研究人员对植物小RNA生物功能的深度探索。 该团队开发的sRNAminer包含了常用的植物小RNA数据分析功能。其功能主要分为四大部分：一是数据预处理，包括接头去除，数据去冗余，去除目标外的非编码RNA和质体污染以及读段回帖；二是植物三种主要类型小RNA的鉴定与表达量计算；三是包括小RNA靶位点预测、介导PHAS位点产生的小RNA trigger预测、降解组测序数据分析等常用的功能；四是小RNA位点可视化。其中，sRNAminer的IGV-sRNA模块让用户......阅读全文
植物病毒RNA提取
大多植物病毒RNA为单链RNA，并且其极性与mRNA极性相同，植物病毒RNA提取较为简单，一般使用酚氯仿即可获得满意结果。 一、材料 提纯TMV病毒液（10mg/ml）。 二、设备 冷冻台式离心机，低温真空干燥仪，电泳仪，电泳槽。 三、试剂 TE-饱和酚:氯仿（1:1），氯仿
分离植物总RNA
实验概要认识真核生物RNA的组成及分离的原理；学习RNA提取过程中抑制RNA酶活性的方法。实验原理真核生物的RNA包括rRNA、tRNA和mRNA。一个典型的真核细胞约含有10-5~10-6mg的RNA，其中80-85%为rRNA，其余15-20%主要由各种低分子量RNA组成（如tRNA、核内小分子
提取植物rna方法
提到RNA的提取，是不是充满了心酸和无奈呀，抽提过程中已十分小心谨慎了，但是有时候还是会出现RNA污染、降解的悲剧。别怕，今天小编给您介绍一种新的RNA提取方法，比以前的方法更快、更有效和更可靠，让您从此不用再担心的RNA的抽提了。 众所周知：获得纯净、完整的RNA样品，是对一种植物的活性基因
植物RNA提取实验
直接研磨法 液氮研磨法 实验方法原理 通过裂解液β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶，植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离
植物RNA提取实验
实验方法原理 独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶，植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离心去除，然后用乙醇调节结合条件后，RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜，再通过一系列快速的漂洗－离心的步骤，去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物，蛋白等杂质去除，
植物RNA的制备实验
酚/SDS法 实验材料 RNA 试剂、试剂盒
植物RNA的制备实验
实验材料 RNA试剂、试剂盒 TELiCl无水乙醇乙酸钠氯仿仪器、耗材 匀浆器离心管离心机水浴锅实验步骤 1. 研钵和研棒先用液氮冷却，称出15 g 冻结植物组织于研钵中（加液氮保持冻结）。2. 用研棒磨成粉末，立即转移到一个盛有150 ml，研磨缓冲液和50 ml TLE缓冲液平衡酚的500
植物总RNA的分离
实验概要认识真核生物RNA的组成及分离的原理；学习RNA提取过程中抑制RNA酶活性的方法。实验原理真核生物的RNA包括rRNA、tRNA和mRNA。一个典型的真核细胞约含有10-5~10-6mg的RNA，其中80-85%为rRNA，其余15-20%主要由各种低分子量RNA组成（如tRNA、核内小分子
多功能植物小RNA分析工具|一站式小RNA分析及可视化
日，《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果，他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。 据介绍，植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要调控分子。目前已有的分析工具多数依赖于命令行环境，
酚/SDS法制备植物RNA
试剂、试剂盒 液氮 研磨缓冲液 TLE 缓冲液平衡酚) 氯仿 IiCl 溶液 (DEPC 处理） 乙酸钠 (DEPC 处理）
酚/SDS法制备植物RNA
试剂、试剂盒 液氮 研磨缓冲液TLE 缓冲液平衡酚)氯仿IiCl 溶液 (DEPC 处理）乙酸钠 (DEPC 处理） 无水乙醇DEPC 处理水仪器、耗材 Folytron 匀浆器（BrinkmarmPT10 35)实验步骤 一 材料与设备1) 液氮2) 研磨缓冲液 18mol/LTris，0.09m
植物总RNA的提取实验
研磨法 实验方法原理 在液氮中研磨植物材料, 使部分细胞破碎, 进一步使植物细胞在裂解液中裂解, 用醋酸钠和氯仿沉淀蛋白质, 异丙醇沉淀核酸, 溶解后经氯化锂
植物总RNA的提取实验
实验方法原理 在液氮中研磨植物材料, 使部分细胞破碎, 进一步使植物细胞在裂解液中裂解, 用醋酸钠和氯仿沉淀蛋白质, 异丙醇沉淀核酸, 溶解后经氯化锂沉淀总RNA, 洗涤后得到高质量的RNA。本实验旨在了解和掌握植物总RNA 的分离和纯化方法。实验材料 植物RNA试剂、试剂盒 尿素Tris-HClN
植物总RNA的提取规程
一、实验目的掌握植物总RNA提取的原理和方法二、实验原理RNA的提取：破坏细胞膜—除去蛋白—除去DNA—除去盐离子。RNase是一类生物活性极其稳定的酶类，能耐高温、耐酸、耐碱，高压灭菌处理也不能使其完全失活。在提取RNA实验中，要尽量抑制RNase的活性。•DEPC（焦磷酸二乙酯）是很强的RNas
植物组织总RNA的提取
实验概要由于RNA分子的结构特点，容易受RNA酶的攻击反应而降解，加上RNA酶极为稳定且广泛存在，因而在提取过程中要严格防止RNA酶的污染，并设法抑制其活性，这是本实验成败的关键。所有的组织中均存在RNA酶，人的皮肤、手指、试剂、容器等均可能被污染，因此全部实验过程中均需戴手套操作并经常更换（使用一
植物病毒(plant－viruses)RNA提取
大多植物病毒RNA为单链RNA，并且其极性与mRNA极性相同，植物病毒RNA提取较为简单，一般使用酚氯仿即可获得满意结果。 一、材料 提纯TMV病毒液（10mg/ml）。 二、设备 冷冻台式离心机，低温真空干燥仪，电泳仪，电泳槽。 三、试剂 TE
2.2.1－酚/SDS法制备植物RNA
酚/SDS法比较适合于从RNA含量较丰富.易提取的植物材料中制备RNA试剂、试剂盒液氮研磨缓冲液TLE 缓冲液平衡酚)氯仿IiCl 溶液 (DEPC 处理）乙酸钠 (DEPC 处理）无水乙醇DEPC 处理水仪器、耗材Folytron 匀浆器（BrinkmarmPT10 35)实验步骤一 材料与设备1
植物中的RNA沉默的分类
植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(tra
植物中的RNA沉默额定分类
植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(tra
植物总RNA的提取实验技术
一、实验目的 通过本实验学习从植物组织中提取RNA的方法 二、实验原理 RNA是一类极易降解的分子，要得到完整的 RNA，必须最大限度地抑制提取过程中内源性及外源性核糖核酸酶对RNA的降解。高浓度强变性剂异硫氰酸胍，可溶解蛋白质，破坏细胞结构，使核蛋白与核酸分离，失活RNA酶，所以RNA从细胞中释
植物RNA提取实验——直接研磨法
植物RNA提取可应用于：（1）进行植物分子生物学方面的研究；（2）进行Northern杂交分析、纯化mRNA以用于体外翻译或cNDA文库构建等研究。实验方法原理通过裂解液β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶，植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离心去除，然后用乙醇调节结合条件
植物RNA提取实验——液氮研磨法
实验方法原理独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶，植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离心去除，然后用乙醇调节结合条件后，RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜，再通过一系列快速的漂洗－离心的步骤，去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物，蛋白等杂质去除， 最后
植物RNA的分离（总RNA的分离和mRNA的分离）
1. 总RNA的分离总RNA分离的方法很多，常采用的是异硫氰酸胍和b-巯基乙醇这两种RNase 抑制剂来抑制RNase的活性，同时，异硫氰酸胍与十二烷基肌氨酸钠（sarcosyl）共同作用可以破坏核蛋白复合体，使RNA顺利地解脱出来溶进缓冲液。由于RNA在碱性条件下不稳定，因而在整个提取过程中体
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液，用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀，每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚，充分混匀，于 60
遗传发育所开发完成植物小分子RNA整合分析软件psRobot
植物小分子RNA主要包括microRNA和小干扰RNA，在基因的转录和转录后调控过程中具有重要作用。第二代测序技术的逐渐成熟和广泛应用极大地推动了小分子RNA相关研究的发展，对不同组织和材料中的小分子RNA进行深度测序已成为研究小分子RNA的常规手段。因此，针对这些数据的生物信息学分析成为了研究
RNAplant植物RNA提取试剂使用说明
简介：RNAplant试剂可从植物组织，特别是富含多酚或淀粉的植物组织中（如马铃薯块茎，白松松针或嫩苗，和西红柿叶等）提取高纯度的总RNA。每100 ml可处理100 mg组织200次。保存条件：室温运输，4℃保存，可保存6-12个月。 准备试剂：液氮，研钵，无RNase离心管，5 M NaCl（无
绿色叶片植物叶线粒体RNA的分离
实验方法原理 利用差速离心，将线粒体从其他亚细胞结构中分离出来，再用蔗糖梯度离心进一步纯化得到线粒体。用核糖核酸酶 A 处理从中去除叶绿体 RNA，然后加入高浓度硫氰酸胍灭活核糖核酸酶 A，硫氰酸胍作为一种蛋白变性剂可非常有效的灭活核糖核酸酶 A。通过 CsCl 梯度离心，线粒体 RNA 沉
绿色叶片植物叶线粒体RNA的分离
实验方法原理 利用差速离心，将线粒体从其他亚细胞结构中分离出来，再用蔗糖梯度离心进一步纯化得到线粒体。用核糖核酸酶 A 处理从中去除叶绿体 RNA，然后加入高浓度硫氰酸胍灭活核糖核酸酶 A，硫氰酸胍作为一种蛋白变性剂可非常有效的灭活核糖核
植物组织RNA提取的难点及对策
植物组织RNA提取的难点及对策 从植物组织中提取RNA是进行植物分子生物学方面研究的必要前提。要进行Northern杂交分析，纯化mRNA以用于体外翻译或建立cDNA文库，RT-PCR及差示分析等分子生物学研究，都需要高质量的RNA。因此，从植物组织中提取纯度高、完整性好的RNA是顺利进行上述研究
植物总RNA的提取实验_研磨法
在液氮中研磨植物材料, 使部分细胞破碎, 进一步使植物细胞在裂解液中裂解, 用醋酸钠和氯仿沉淀蛋白质, 异丙醇沉淀核酸, 溶解后经氯化锂沉淀总RNA, 洗涤后得到高质量的RNA。本实验旨在了解和掌握植物总RNA 的分离和纯化方法。实验方法原理在液氮中研磨植物材料, 使部分细胞破碎, 进一步使植物细胞