Nature子刊:来自人类肠道细菌的小型化Cas9,可用于高效精准的基因组编辑

CRISPR基因编辑技术极大地加速了遗传疾病治疗方法的开发。然而,临床的进一步发展在很大程度上取决于开发多样化工具以应对基因组编辑的挑战。其中,最关键的一个方面是递送,因为Cas核酸酶及其衍生的融合产物(包括碱基编辑器、先导编辑器)的尺寸较大。 腺相关病毒(AAV)是最高效和最广泛使用的体内递送载体,但其载体容纳量仅为4.7 kb,导致其很难与CRISPR系统兼容,最常用的来自化脓性链球菌的SpCas9及其sgRNA和必要的调控区域就无法被单个AAV所装载。一些小型化Cas9核酸酶,例如来自金黄色葡萄球菌的SaCas9和脑膜炎奈瑟菌的Nme2Cas9可以被单个AAV递送,但它们基因编辑效率低于SpCas9。总之,在原核生物(细菌、古菌)中广泛存在的CRISPR-Cas系统的多样性尚未被充分开发。 通过宏基因组测序和宏基因组组装基因组(MAG)重建,已经鉴定了大量的未表征的原核生物物种,其中许多编码系统发育多样性的Cas9......阅读全文

肠道细菌篡改宿主基因

  保持免疫系统平衡是个精妙的复杂事件,遇到外来入侵者时及时发出警报,同时,聪明地区分我军组织和器官不乱杀无辜。  机体有一些帮助免疫系统维稳的工具。人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)和小鼠的主要组织相容性复合物(major histocompatibility

一种碱基编辑器成功修改活小鼠肠道细菌基因

  科学家设计了一种基因编辑工具,可以改变活小鼠肠道微生物组中的细菌。7月10日,相关研究成果发表于《自然》。  该工具是一种碱基编辑器,可以修改小鼠肠道内90%以上大肠杆菌菌落的靶基因。“我们一直梦想能够做到这一点。”法国巴黎生物技术公司Eligo Bioscience的联合创始人、合成生物学家X

转基因细菌清理肠道毒素

  一项日前发表于《科学—转化医学》的研究显示,转基因细菌补充剂可通过清除肠道内的毒素治疗肝脏和肠道疾病。  这种方法,即改造细菌使其能将有害氨变成安全的化合物,已在动物测试和健康人类志愿者身上表现出前景。  如今,很多人每天服用益生菌帮助补充肠道内的有益细菌,尽管目前尚不明确它们真的能带来多少益处

转基因细菌清理肠道毒素

一种新型益生素正在路上 图片来源:Studio 52 film  本报讯 一项日前发表于《科学—转化医学》的研究显示,转基因细菌补充剂可通过清除肠道内的毒素治疗肝脏和肠道疾病。  这种方法,即改造细菌使其能将有害氨变成安全的化合物,已在动物测试和健康人类志愿者身上表现出前景。  如今,很多人每天服用

Nature重磅:首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑

  近年来,微生物组研究揭示了体内的共生细菌表达的基因通过多种机制影响我们的健康。例如,体内的细菌还能够影响癌症免疫疗法的效果;细菌蛋白质与神经退行性疾病和自身免疫性疾病有关;细菌毒素能够引发包括癌症在内的一系列急性和慢性疾病;细菌能够改变或隔离药物,影响治疗效果。这些研究和发现激发了人们对操纵微生

Nature重磅:首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑

  近年来,微生物组研究揭示了体内的共生细菌表达的基因通过多种机制影响我们的健康。例如,体内的细菌还能够影响癌症免疫疗法的效果;细菌蛋白质与神经退行性疾病和自身免疫性疾病有关;细菌毒素能够引发包括癌症在内的一系列急性和慢性疾病;细菌能够改变或隔离药物,影响治疗效果。这些研究和发现激发了人们对操纵微生

治愈人类疾病的一把钥匙:肠道细菌DNA编辑

  “我们称其为拟态(mimicry),”Rockefeller大学基因编码小分子实验室主任Sean Brady说。这项突破性发现发表在《Nature》杂志。  Brady和同事Louis Cohen发现,肠道细菌和人类细胞虽然是两种生物,但它们却互通相同的以配体分子为基础的化学语言。  他们开发了

Nature子刊:基因编辑揭开细菌基因组秘密

  由美国伊利诺伊大学香槟分校化学和生物分子工程系的赵惠民教授(音译,Huimin Zhao)带领的一个研究团队指出,他们利用一种创新的DNA工程技术,发现了隐藏在细菌基因组中的潜在的、有价值的功能。这项研究成果发表在12月5日的Nature Communications杂志上。   每种

人体肠道细菌基因组集研究成果

2019年2月5日上午,深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集(Culturable GenomeReference, CGR)研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组,为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据,同时

Nature:-人类肠道细菌具有获得性细菌防御(AID)基因簇

  近日,美国华盛顿大学的科研人员在Nature上发表了题为“Human gut bacteria contain acquired interbacterial defence systems”的文章,发现肠道中的几种拟杆菌属(Bacteroidales sp.)的细菌具有基因簇防御功能,可以中和

肠道细菌大脑“安家”

  人们知道,肠道中的微生物群对人类健康有着强大影响。相同的细菌能否在大脑中“定居”?在日前于加州圣地亚哥举行的美国神经科学学会年会上,一张海报展示了细菌入侵健康人类大脑细胞并居住于此的高分辨率显微镜图像。人类大脑切片图像揭示了关于“大脑微生物群”的令人好奇但极其初步的证据。  大脑是一个受到保护的

肠道细菌大脑“安家”

  人们知道,肠道中的微生物群对人类健康有着强大影响。相同的细菌能否在大脑中“定居”?在日前于加州圣地亚哥举行的美国神经科学学会年会上,一张海报展示了细菌入侵健康人类大脑细胞并居住于此的高分辨率显微镜图像。  大脑是一个受到保护的环境,通过一个围绕血管的细胞网络将血流中的部分成分阻挡在外。成功进入血

肠道细菌大脑“安家”

  人们知道,肠道中的微生物群对人类健康有着强大影响。相同的细菌能否在大脑中“定居”?在日前于加州圣地亚哥举行的美国神经科学学会年会上,一张海报展示了细菌入侵健康人类大脑细胞并居住于此的高分辨率显微镜图像。  大脑是一个受到保护的环境,通过一个围绕血管的细胞网络将血流中的部分成分阻挡在外。成功进入血

肠道细菌大脑“安家”

  人们知道,肠道中的微生物群对人类健康有着强大影响。相同的细菌能否在大脑中“定居”?在日前于加州圣地亚哥举行的美国神经科学学会年会上,一张海报展示了细菌入侵健康人类大脑细胞并居住于此的高分辨率显微镜图像。  大脑是一个受到保护的环境,通过一个围绕血管的细胞网络将血流中的部分成分阻挡在外。成功进入血

肠道细菌大脑“安家”

  人们知道,肠道中的微生物群对人类健康有着强大影响。相同的细菌能否在大脑中“定居”?在日前于加州圣地亚哥举行的美国神经科学学会年会上,一张海报展示了细菌入侵健康人类大脑细胞并居住于此的高分辨率显微镜图像。  大脑是一个受到保护的环境,通过一个围绕血管的细胞网络将血流中的部分成分阻挡在外。成功进入血

肠道细菌能逃离肠道,引发慢性炎症?

肠道微生物与良好的健康和促进疾病有关,如自身免疫性疾病、炎症性肠病、代谢综合征,甚至神经精神疾病。对这些不良后果的一种流行解释是所谓的“leaky gut”假说——据说具有潜在破坏性的细菌会逃离肠道,引发慢性炎症反应,从而导致各种疾病。耶鲁大学免疫生物学助理教授诺亚·帕尔姆(Noah Palm)说:

基因编辑技术可以编辑所有基因吗

即便当前不能,以后会能的。基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”,实现对特定DNA片段的敲除、加入等。在过去几年中, 以ZFN (zinc-finger nucleases)和TALEN (transcription activator-like effector nucleases)为代表

Nature子刊:来自人类肠道细菌的小型化Cas9,可用于高效精准的基因组编辑

  CRISPR基因编辑技术极大地加速了遗传疾病治疗方法的开发。然而,临床的进一步发展在很大程度上取决于开发多样化工具以应对基因组编辑的挑战。其中,最关键的一个方面是递送,因为Cas核酸酶及其衍生的融合产物(包括碱基编辑器、先导编辑器)的尺寸较大。  腺相关病毒(AAV)是最高效和最广泛使用的体内递

木乃伊肠道现耐药细菌

  耐药基因存在于木乃伊中。图片来源:Michael Luongo/Bloomberg/Getty  来自印加帝国、有着1000年历史的木乃伊体内的肠道细菌,对今天的大多数抗生素都具有耐药性,尽管人类只是在最近100年内才发明了这些药物。  “起初,我们非常惊讶。”加州州立理工大学的Tasha Sa

肠道细菌或导致包括癌症在内的肠道疾病

  不要小看细菌,这些肉眼难以看见的微小生物,它们可能具有破坏性的力量。  据《新科学家》报道,如今越来越多的证据表明,一些肠道癌症是由细菌引起的。这种微生物似乎在人类的DNA中触发了一种不同类型的突变,而这种突变在结肠癌患者中高达十分之一。  “这是我们第一次发现能改变DNA并致癌的细菌。”荷兰H

流程化、更高效的基因编辑工具:打开肠道微生物组“窗口”

  基因,就像是指挥官手里拿着的建筑总图纸,调控着生物体的一切生命活动。这份施工的图纸决定了整个建筑的所有呈现形式。那怎么才能对“图纸”——基因进行编辑呢?CRISPR/Cas编辑系统被认为是最佳的一种工具。  1月6日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所、深圳合成生物学创新研究院戴磊课题

对抗肠道超级细菌有新药

   澳大利亚弗林德斯大学日前宣布,该校研究人员研发出一种新型抗生素,动物实验表明它可有效抑制一种具有耐药性的肠道超级细菌。  细菌通过多种形式抵抗抗生素,逃避被消灭的危险,超级细菌指对多种抗生素都有耐药性的细菌,病人感染超级细菌后缺乏有效治疗药物。据世界卫生组织统计,每年全球约70万人死于超级细菌

肠道细菌也会感染眼睛

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518029.shtm遗传性视网膜疾病,如色素性视网膜炎,影响全球约550万人。2月26日,一项发表于《细胞》的研究表明,长期被认为是纯遗传性的眼病可能部分是由细菌引起的,这些细菌会“逃离”肠道并传播到视网

肠道细菌统治我们的头脑

  这听起来像科幻小说,但似乎居住在我们肠道的细菌,很有可能影响到我们的欲望和情绪,让我们吃这些细菌想要的食物,而这些食物往往驱使我们肥胖。   在杂志BioEssays发表的一篇文章中,加州大学旧金山分校,亚利桑那州立大学和新墨西哥大学研究人员审查了最近的科学文献,发现肠道微生物能影响人类的饮食行

肠道细菌:癌症治疗新帮手

  人体内微生物的数量比细胞的十倍还多,这些微生物发挥着巨大的作用:它们维护人体健康,调节免疫系统,维持消化系统“有活力地”运转。现在,《科学》杂志上的两篇文章指出,这些微生物还有助于治疗疾病。   这些研究以小鼠为研究对象。结果表明,肠道细菌有助于增强3种抗癌疗法的疗效。在每一个案例中,当小鼠体

减肥老反弹?都怪肠道细菌

  一项对小鼠的研究表明,高脂饮食会改变(肠道)菌群并且抑制过胖者自身利用黄酮类化合物的能力。  大家肯定对以下情景很熟悉:我们好不容易减下去几斤,然而随后体重又反弹,如此反复。最近,Nature 杂志报道的一项研究显示,可能是你肠道中的细菌造成了这种“悠悠球效应”。  由以色列魏茨曼科学研究所的

肠道细菌诱发致盲眼病

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519348.shtm近日,《细胞》杂志刊发了一项来自中山大学中山眼科中心牵头组织的最新研究成果。他们历时8年,首次发现肠道细菌介导遗传性视网膜疾病,并提出抗菌/肠道基因治疗的全新防控方法。“我们首次揭示了

肠道细菌帮小鼠克服恐惧

  肠道菌群紊乱的老鼠可能无法摆脱恐怖的记忆——这一发现表明,人类的肠道细菌可能在学习方式中扮演了重要角色。相关成果日前发表于《自然》杂志。  过去10年间,科学家对细菌在保持人类健康方面的作用越来越感兴趣,尤其是那些生活在肠道、口腔和皮肤上的细菌。新兴研究将这些细菌群落的紊乱与免疫系统问题甚至行为

肠道细菌可帮助治疗癌症

肠球菌hirae的扫描电镜图像。   据2项新的报告披露,生活在我们肠道中的细菌群落可帮助确定某些抗癌疗法的功效,其中包括那些先前被认为直接作用于肿瘤细胞的药物。在这两种情况下,肠道微生物群似乎能调节由这些治疗所引发的免疫系统的反应。研究人员发现,在肠道无菌的小鼠中,这些疗法在攻击肿瘤上的效果较差

英研究人员发现肠道细菌改变人体基因的作用机理

  据英国生物技术及生命科学研究理事会(BBSRC)近日消息,来自剑桥附近的巴巴拉姆研究所(Babraham Institute)的研究人员与巴西和意大利研究人员合作,发现肠道内的细菌可以控制人体细胞中的基因信息。这项研究表明,来自细菌的化学信息可以改变人类基因组中关键化学标记物的位置。通过这种沟通