科学家绘制调控人类大脑基因功能的网络图

一组研究人员绘制了有精神障碍以及无精神障碍的人脑中最大、最先进的基因调控网络多维图谱。这些图谱详细描述了协调大脑生物通路和细胞功能的许多调节元件。这项由美国国立卫生研究院(NIH)支持的研究使用了2500多名捐赠者的死亡后脑组织,绘制了大脑发育不同阶段和多种与大脑相关疾病的基因调控网络。 “这些突破性的发现促进了人们对遗传风险在哪里、如何以及何时导致精神分裂症、创伤后应激障碍和抑郁症等精神障碍的理解。”NIH国家心理健康研究所(NIMH)所长Joshua A. Gordon说,“此外,这些免费共享的关键资源将帮助研究人员确定可能在精神疾病中起因果作用的遗传变异,并确定新疗法的潜在分子靶点。” 近日,相关成果发表在《科学》《科学进展》和《科学报告》的15篇论文中。 这些论文按照几个关键主题报告了研究结果:在发育的大脑和成年大脑中,将遗传变异、调节元件和表达基因的不同分子形式与细胞水平的调节网络联系起来的群体水平分析;被诊......阅读全文

3种常用基因功能验正方法简述

  科研人员在分析项目的过程中,碰到这样的问题:通过各种手段(选择清除分析、比较基因组学分析、转录组分析)获得的行驶某种功能的某基因,如果进行实验的验正呢?一般分为:基因上调(基因转染法)、基因下调(基因干扰法)后看蛋白表达水平、细胞功能改变、在体动物模型中相关功能的变化等。   相信大家也有

河科大附医:通过比较SHEE和SHEEC细胞系构建ceRNA网络图

  长链非编码RNA(lncRNA)在调节各种生物过程中发挥着关键和复杂的作用,包括染色质修饰,转录和转录后加工。更有趣的是,一些lncRNAs可以作为吸引miRNA的“海绵”,在转录后调控中抑制其与miRNA靶基因的相互作用。这意味着它们可以被认为是竞争内源性RNA(ceRNA)。  在这项研究中

SARSCoV2蛋白互作网络图为老药新用提供新思路(一)

前不久,来自加州大学旧金山分校(UCSF),西奈山医院(Mount Sinai),法国巴斯德研究所(Institut Pasture),欧洲分子生物实验室(EMBL)等49个研究单位的125位研究人员合作完成了对SARS-CoV-2蛋白互作网络的分析。这项研究的结果于4月30日以标题 “A

SARSCoV2蛋白互作网络图为老药新用提供新思路(二)

靶向SARS-CoV-2人源宿主因子的现有药物借助化学信息学工具,研究者们找到了靶向SARS-CoV-2人源宿主因子的16个批准药物,3个在研药物(临床实验阶段),以及18个临床前候选药物;另外,通过基于靶点和信号通路的文献搜索,他们还发现了13个批准药物,9个临床实验阶段的在研药物(INDs),和

SARSCoV2蛋白互作网络图为老药新用提供新思路(三)

病毒滴度检测(巴斯德所)病毒的滴度是通过蚀斑实验来检测的。将Vero E6细胞以7.5x10^4/孔的密度接种于24孔板。第二天,加入10倍稀释的含病毒培养基,于37˚C孵育1小时。随后,加入0.005%琼脂糖形成半固体覆盖层。于37˚C孵育3天后用4%多聚甲醛固定和结晶紫染色,肉眼观察和计数每

Nature扩展教科书,基因功能研究的新层面

  就像一个管弦乐队中的音乐家们,他们拥有相同的乐谱,却在不同的间隔时间内开始和结束演奏。细胞也拥有相同的基因,却在基因组中的不同位点启动和完成对它们的转录。来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员,第一次描述了由于这样的起点和终点变化所导致的信使RNAs (mRNAs)惊人的多样性。他们

CompresstomeTM应用II-基因功能研究:组织学连续切片

关键词:组织学(Histology), 基因功能(Gene Function), 免疫组织化学(Immunohistochemistry), 连续切片(Serial Sections),振动切片机(Vibratome) 在基因功能的研究中,为了研究某种基因的功能或基因调控网络时需要同时在一个动物上对

Sci-Rep:揭秘新基因功能及癌症疗法靶点

  弗吉尼亚联邦大学医学院的研究人员最新发现,精子相关抗原6(SPAG6) 有了某些新的功能, 以前这种基因被认为只对纤毛的能动性有重要作用。该基因的缺陷与男性不育相关,尽管新的发现可能会对某些癌症的诊断和治疗有影响。   “精子抗原6调节成纤维细胞的生长、形态、迁移和纤毛发生。”该研究发表在11月

Cell子刊:单倍体干细胞加速基因功能分析

  科学家们开发了全面鉴定基因功能的快速方法,这一技术能够大大增进我们对许多疾病的理解,例如心脏病、肝脏疾病和癌症等。   该方法利用只含一组染色体的干细胞,为研究人员揭示了干细胞分化时发生的遗传学改变。研究指出,该方法还可以用来研究许多其他的生物学过程。   胚胎干细胞通过特定的基因作用路径,

发现不同农作物-基因功能差异新机制

  玉米作为一种具有重要经济价值的模式作物,具有丰富的遗传资源,在揭示驯化和植物改良的遗传途径方面具有重要意义。然而,美国加州大学伯克利分校植物和微生物学系的董朝滨(音译)等研究人员,发现驯化玉米和影响其他禾本科作物产量的一些重要途径。在一些情况下,密切相关的禾本科农作物基因之间存在功能差异,似乎不

JakSTAT信号通路相关基因功能介绍CBL基因

这个基因是一个原癌基因,编码一个无名指E3泛素连接酶。编码蛋白是蛋白酶体降解底物所需的酶之一。该蛋白介导泛素从泛素结合酶(E2)转移到特定底物。该蛋白还包含一个N端磷酸酪氨酸结合域,使其与许多酪氨酸磷酸化底物相互作用,并以蛋白酶体降解为靶点。因此,它作为许多信号转导途径的负调节器发挥作用。该基因在包

Cell子刊:为什么长寿基因功能多样化?

  人类对于“长寿”的向往溯源已久,包括端粒、长寿药等在内的研究一直在进行中。世界各地的科研工作者们试图通过多种手段延长寿命、减少疾病负担。其中,长寿基因Sirtuin1(SIRT1)一直是该领域的研究热点。  长寿基因SIRT1  SIRT1是一种依赖于NAD+的组蛋白去乙酰化酶,是Sirtuin

JakSTAT信号通路相关基因功能介绍MPL基因

MPL基因编码的蛋白为促血小板生成素受体,与NF-κB以及JAK/STAT信号通路相关。

JakSTAT信号通路相关基因功能介绍AXL基因

酪氨酸蛋白激酶受体UFO是一种人类由AXL基因编码的酶。 该基因最初被命名为UFO,因为这种蛋白质的功能不明。 然而,自其发现以来的几年中,对AXL表达谱和机制的研究使其成为一个越来越有吸引力的目标,特别是对于癌症治疗。 近年来,AXL已成为癌症细胞免疫逃逸和耐药性的关键促进因素,导致侵袭性和转移性

JakSTAT信号通路相关基因功能介绍SRC基因

SRC基因编码的蛋白属于SRC家族激酶(SFKs),该家族由9个成员组成,分别是SCR、LYN、FYN、LCK、HCK、FGR、BLK、YRK和YES,其中SRC是目前研究最多的成员,也是与人类疾病联系最为密切的蛋白。SRC蛋白是非受体酪氨酸激酶,可被多条信号转导途径所激活,而激活后的SRC激酶又通

复旦大学最新综述:基因功能富集分析研究

  “核心刊物”迎来了新期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英

SORBS2基因功能缺失导致心脏结构畸形发生

  先天性心脏病是最常见的出生缺陷,是当前面临的公共卫生问题之一。  记者9日获悉,国家儿童医学中心(上海)、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心傅启华教授团队和张臻研究员团队的合作研究阐明了SORBS2基因功能缺失导致心脏结构畸形发生的分子机制。  据介绍,先天性心脏病是多基因疾病,个案的发病原

JakSTAT信号通路相关基因功能介绍mTOR基因

雷帕霉素(mTOR)的哺乳动物靶标,也称为雷帕霉素和FK506结合蛋白12-雷帕霉素相关蛋白1(FRAP1)的机制靶标,是人类中由MTOR基因编码的激酶。 mTOR是蛋白激酶的磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶家族的成员。 mTOR与其他蛋白质结合,并作为两种不同蛋白质复合物的核心成分,mTOR复合物1和m

斑马鱼——CRISPR高通量基因功能研究新平台

  近日,来自美国NIH的研究人员进行了一项研究,他们利用CRISPR-CAS9技术靶向斑马鱼特定DNA序列进行基因功能探索和人类治病基因的发现研究,相关研究成果在线发表在国际学术期刊genome research。  在这项研究中,研究人员发现利用基因编辑技术CRISPR-CAS9进行斑马鱼基因靶

JakSTAT信号通路相关基因功能介绍EGFR基因

EGFR编码的蛋白是一种跨膜糖蛋白,也是表皮生长因子受体家族中的一员,该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也属于受体酪氨酸激酶家族。EGFR作为细胞表面蛋白可与配体如表皮生长因子(EGF)结合,EGFR可被激活,

JakSTAT信号通路相关基因功能介绍CREBBP基因

该基因广泛表达,参与多种不同转录因子的转录共激活。首先作为一种结合cAMP反应元件结合蛋白(creb)的核蛋白被分离出来,该基因通过将染色质重塑与转录因子识别结合,在胚胎发育、生长控制和体内平衡中发挥关键作用。该基因编码的蛋白质具有固有的组蛋白乙酰转移酶活性,也作为支架稳定与转录复合物的额外蛋白质相

JakSTAT信号通路相关基因功能介绍MYC基因

该基因编码的蛋白质是一种多功能的核磷蛋白,在细胞周期进展、凋亡和细胞转化中起到作用。作为调节特定靶基因转录的转录因子发挥作用。这种基因的突变、过度表达、重排和易位与多种造血肿瘤、白血病和淋巴瘤,包括伯基特淋巴瘤有关。有证据表明,来自上游、非aug(cug)帧和下游aug起始位点的选择性翻译起始导致两

《Cell》:世界首张小鼠微型“扰动图谱”,解密基因功能

7月22日,上海科技大学生命学院池天课题组在《细胞》(Cell)杂志在线发表论文,报道了一种崭新的小鼠基因打靶技术iMAP(inducible Mosaic Animal for Perturbation),快速鉴定了90个基因在39种组织的基本功能,构建了世界首张小鼠微型“扰动图谱”。早在2001

精神分裂症或源于一个基因功能下降

  精神分裂症的病因目前还没有彻底弄清。日本一个研究小组报告说,一个与调节神经活动有关的基因功能出现下降可能是精神分裂症的发病原因。这个发现有望促进研发治疗精神分裂症的新方法。   日本金泽大学等机构研究人员在新一期《美国精神病学杂志》上报告说,大脑中有一种特殊细胞负责调节周围神经细胞的活动,可以

大脑中的“化学英雄”,时刻警惕着大脑失控

我们的大脑充斥着各种无名的“化学英雄”,它们能够确保到处传播的电信号不会失控。一项新的小鼠研究现在详细介绍了一对蛋白质的功能,有助于人们更好地理解从癫痫到精神分裂症的一系列神经系统疾病。这两种蛋白质--被称为RIM1和SRPK2的酶,共同作用于修改神经之间称为突触间隙的信息传输。研究发现,如果没有它

黑科技!大脑网眼植入物-防止大脑老化

  在老鼠实验中,注射性探头可产生短暂的免疫响应,通过添加刺激性电极,网眼结构和大脑结构能够与探头融合在一起。研究人员能够获得反馈信息,克服年龄增长产生的认知能力减退。图B是网眼电子技术的原理图,独立网眼电子结构漂浮在水性溶液中,可以装在一个玻璃针中。图C是网眼电子物注入老鼠大脑,部分网眼结构下垂进

打造最强大脑:关于大脑的25个事实

  1.大脑喜欢色彩。  平时使用高质量的有色笔或使用有色纸,颜色能帮助记忆。  2.大脑集中精力最多只有25分钟。  对成人而言,学习20到30分钟后就应该休息10分钟,效果会更好。  3.大脑需要休息,才能学得快,记得牢。  如果你感到很累,先拿出20分钟小睡一会儿再继续学习。  4.大脑是一个

大脑在30岁开始衰老-大脑年轻才能长寿

  近日,《美国医学协会杂志》刊登了一项最新研究,发现长寿老人大脑中“皮质层”厚度是普通老人的两倍;皮质层越厚,大脑衰老速度越慢。研究人员认为,了解长寿者的大脑秘密有利于我们维护健康、延年益寿。  长寿者大脑有先天优势  研究指出,大脑皮质层就像一张被揉皱的报纸,伸展后的面积和厚度决定着脑容量。皮质

张锋博士Nature子刊再发CRISPR重要成果

  规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,原本是细菌抵御病毒的重要武器,现在这一组合已经成为了一个通用工具,被用于在真核生物中进行位点特异性的基因组编辑。  由于这种基因组编辑技术更易于操作,也具有更强的扩展性,CRISPRs-Cas9迅速成为了科研领域的新宠儿。  日前,麻省

-Nat-Commun:科学家成功绘就大鼠基因功能图谱

11种器官和4个发育阶段的大鼠基因功能图谱被成功绘制        记者从复旦大学获悉,该校药学院石乐明课题组与美国食品药品监督管理局国家毒理学研究中心、洛马林达大学等单位合作,成功绘制出涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠基因功能图谱。相关成果日前发表于《自然—通讯》杂志。   据介绍,大鼠是一种