清华大学仪器共享平台Harmony数据分析工作站

仪器名称:Harmony数据分析工作站仪器编号:A23000084产地:英国生产厂家:PerkinElmer型号:Operetta CLS出厂日期:20230928购置日期:20230928所属单位:医研院>生物医学测试中心>细胞生物学平台>细胞平台光镜机组放置地点:医学科学楼C119固定电话:010-62799145固定手机:固定email:联系人:汪晶晶(010-62799145,18514213047,sapphireking@mail.tsinghua.edu.cn)孙悦(010-62799145,13121649797,sunyue@mail.tsinghua.edu.cn)分类标签:图像处理 高内涵分析 数据分析 Harmony技术指标:38个预制分析模块:如细胞计数或核计数、活/死细胞计数、质膜标志物定量、胞质向核转位、胞质向膜转位、Spot分析、有丝分裂指数、细胞周期分类、神经细胞分析、脂滴形成......阅读全文

史上最全的QPCR数据分析

  用参照基因 ( 如GAPDH 或 ß-actin)能准确量化初始材料的载量,尤其当初始材料量常常受限时,进行相对基因表达分析实验十分方便。缺点是这个方法要求得到一个或多个在所有测试样本中恒定表达的已知参照基因,而且表达水平不受研究条件下处理方式的影响。确定这样的参照基因十分重要,最近有报道提出在

直流耐压测试数据分析

  由于直流耐压测试有可能会对被测电缆造成损坏,所以为了保证测试的可靠性,在开始测试之前还需要进行一定的非破坏性实验,确认电缆的绝缘状态在开始直流高压测试之前是良好的。非破坏性实验通常要求电缆在耐压 5 min 情况下的电流泄露数值低于耐压 1 min 情况下的电流泄露数值,同时还要求电缆绝缘三相间

高通量测序数据分析

  1. 是不是一定要用大型计算机?  除了序列拼接组装以外,其它分析不是一定要大型计算机,在普通的PC上也可以进行一些处理,当然,买一台或几台高性能的工作站电脑,能显著加快数据处理的速度。  2. 是不是一定要用Linux系统?  也不一定非用Linux不可,在Window下可以完成部分数据处理。

数据分析介绍(I)-主成份分析法

华联于 2012 年 7 月~ 9 月的科技专题中,介绍芯片实验设计时,概略介绍了一些常用的数据分析方法,有许多客户及好学的读者纷纷来信,希望我们另辟单元,仔细教学这些对他们很有帮助的分析软件;数据分析素来是华联的强项之一,我们很乐意也很兴奋地开辟这个新单元 - 数据分析教学,本期以主成份分析法

数据分析介绍(I)-主成份分析法

数据分析介绍(I) 主成份分析法

基因表达数据分析主成分分析-PCA

DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Princ ipal Component Analysis , PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m

质谱仪数据处理的分析离子流累积测量数据的处理

离子流累积测量数据的处理质谱测量中,将需要测量的质量峰按顺序采集一遍称为一个循环或称一个扫描(scan),几个循环划成一组,取一组数据(平均值与标准偏差),多组数据进行统计计算后得到最终结果(平均值与标准偏差)。平均值和标准偏差的计算公式为:离子流累积测量要求在测量的间隙同时测量本底数据,用累积数据

质谱仪质谱仪数据处理的分析扫描质谱数据的处理

对于逐点扫描得到的一段质谱数据,数据处理的首要任务是峰位置的判别。其实质是峰数据与既有模型的匹配过程,这与质谱仪的特性、扫描参数以及数据的统计信息等多种因素有关系。简单情况下,连续几个数据都大于设定的阈值(如最大值5%)即可认为该段数据是峰数据,而剩余的数据可认为是本底。在峰位置判别的基础上,根据本

质谱仪质谱仪数据处理的分析离子流测量数据的处理

离子流累积测量数据的处理质谱测量中,将需要测量的质量峰按顺序采集一遍称为一个循环或称一个扫描(scan),几个循环划成一组,取一组数据(平均值与标准偏差),多组数据进行统计计算后得到最终结果(平均值与标准偏差)。平均值和标准偏差的计算公式为:离子流累积测量要求在测量的间隙同时测量本底数据,用累积数据

如何分析real-time-PCR的数据结果

  学习做Realtime PCR, 实验结果是出来了,得到的内参、目的基因的Ct 值在15-25 之间,熔融曲线基本上也是单峰,但不太会处理这个结果,对着数据发愁。。。不同的处理方法得到不同的结果。。。做的是相对定量,SYBR Green, 选用2^(-△ △ Ct)法内参基因:对照组1、对照组2

苔藓物种监测系统数据的分析方法

苔藓物种监测系统数据的分析方法包括以下几种:描述性统计分析:计算数据的均值、中位数、标准差、方差等统计量,以描述苔藓物种的分布、数量、生长状况等特征的集中趋势和离散程度。相关性分析:研究苔藓物种特征与环境变量(如污染物浓度、气候条件、土壤性质等)之间的相关性,判断哪些因素对苔藓物种有显著影响。主成分

染发剂配方的数据分析

统计学软件的开发 多年以来,数据分析软件Statistica就在Henkel公司不同的检测分析中使用了;因此丰富这一行之有效的解决方案是非常合情合理的。另一个使用Statistica的理由是:把Visual Basic的一些功能和自定义的应用程序嵌入到显示窗口中。因此,Henkel

如何分析real-time-PCR的数据结果

学习做Realtime PCR, 实验结果是出来了,得到的内参、目的基因的Ct 值在15-25 之间,熔融曲线基本上也是单峰,但不太会处理这个结果,对着数据发愁.不同的处理方法得到不同的结果.做的是相对定量,SYBR Green, 选用2^(-△ △ Ct)法内参基因:对照组1、对照组2、对照组3实

恒温摇床的实验数据分析处理

  恒温摇床:恒温摇床是一种常用的实验室设备,属于实验室仪器,广泛用于对温度和振荡频率有较高要求的细菌培养、发酵、杂交、生物化学反应以及酶和组织研究等。实验室常用的液体摇匀,微生物、细菌和细胞培养。1、方便快捷的追溯实验过程,优选实验方法,优化实验条件,极方便、快捷地追溯实验过程,完成实验报告,筛选

5种常见的数据分析方法

1、对比分析法:常用于对纵向的、横向的、最为突出的、计划与实际的等各种相关数据的。例如:今年与去年同期工资收入的增长情况、3月CPI环比增长情况等。2、趋势分析法:常用于在一段时间周期内,通过分析数据运行的变化趋势(上升或下降),为未来的发展方向提供帮助。例如:用电量的季节性波动、股市的涨跌趋势等。

“上帝粒子”最新数据分析结果公布

大型强子对撞机设备内部,该设备在去年7月份发现一种新的粒子,极有可能是有上帝粒子之称的希格斯玻色子  近日有关欧洲核子中心大型强子对撞机发现希格斯玻色子一事终于发布了新的进展消息。  本周来自全世界各国的物理学家们齐聚意大利召开为期两周的会议,讨论粒子物理学和宇宙学领域的最新进展。3

活细胞成像和数据分析系统

  活细胞成像和数据分析系统是一种用于生物学领域的分析仪器,于2018年11月26日启用。  技术指标  光源:IncuCyte Zoom HD/2CLR的相差光源和荧光光源均为LED光源。 物镜倍数:IncuCyte Zoom HD/2CLR的物镜倍数是4倍或10倍或20倍,可由用户自行更换。 成

如何进行转录组数据分析

首先您做的事芯片呢?还是转录组测序呢? 芯片我不是太了解,可能是封闭系统,目前看对于发现新转录本不是很有利。 若是做转录组测序,首先去除 序列,然后片段重叠。然后将将每一个read 到基因组,取得GO值,功能注释,转录水平评估,功能富集及pathway分析,若对新发现的转录本感兴趣还可以做转录本的功

Oligo芯片的构建及数据分析

实验概要本实验在生物素标记cRNA片段化的基础上,提供了小鼠全基因组Oligo芯片的构建及数据分析流程。实验步骤1. 芯片杂交使用Affmetrix Hybridization Oven 640,先进行Test芯片的杂交、清洗染色、扫描和分析,根据Test芯片的结果再杂交Real芯片。    1)

绝对荧光定量PCR的数据分析

现在最常用的两种分析实时定量PCR实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝数;相对定量方法则是比较经过处理的样品和未经处理的样品目标转录本之间的表达差异。2-△△CT方法是实时定量PCR实验中分析基因表达相对变化的一种简便方法,即相对定量的一种简便方法。本文介绍了该

基因数据分析的主流软件

基因组测序在过去的几年中,许多生物的基因组完成了测序工作,如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用,正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具,已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取,那些基于

绝对荧光定量PCR的数据分析

现在最常用的两种分析实时定量PCR实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝数;相对定量方法则是比较经过处理的样品和未经处理的样品目标转录本之间的表达差异。2-△△CT方法是实时定量PCR实验中分析基因表达相对变化的一种简便方法,即相对定量的一种简便方法。本文介绍了该

CEMS数据精准性实践分析研究

  【前言】CEMS是专业术语“固定污染物在线监测系统”的英文简写。CEMS系统已经成为我国环境废气排放监测的主要手段和环境指标评价的重要依据。在当前环保政策法规和标准规范越来越严厉的新形势下,企业自身必须做到自觉合规运作和达标排放。以下为各参数从采样测量、传输、终端显示的各个环节的基本关系链路。 

如何进行转录组数据分析

芯片我不是太了解,可能是封闭系统,目前看对于发现新转录本不是很有利。若是做转录组测序,首先去除污染序列,然后片段重叠。然后将将每一个read定位到基因组,取得GO值,功能注释,转录水平评估,功能富集及pathway分析,若对新发现的转录本感兴趣还可以做转录本的功能预测及细胞定位。希望有高手来评价--

热膨胀仪处理分析数据的特点

  热膨胀仪测量数据即时显示在计算机屏幕上并连续存储在硬盘中可进行后期的数据分析。所有测量和程序的关键参数以及系统修正、标准数据(必要时)也都存储在每一个数据文件系统中,便于日后的不同样品的结果比较。  热膨胀仪数据处理分析及报告,可对存储的数据用各种统计方法进行自动处理,数据分析包括多项式曲线拟合

EDS分析结果有原始数据吗

当然有原始数据!(如果你是和SEM一起测的话)在你保存文件的文件夹里有个Untitled文件夹,你的数据就在里面,这个就是EDS的原始文件。通过一个专业的软件(这个软件是什么我不知道)才能将这个Untitled文件夹里的数据(View什么什么的格式的数据)转换成word格式的。

细胞试验的mtt数据应该怎么分析

用什么样的数据统计主要看你的实验要求。直接用OD值、细胞存活率、细胞抑制率都可以。文献中上述几种表示方法都有,你可以看看。自己绘制曲线完全可以,用EXCEL或SPSS都可以。我的方法:测得各组的OD值后,求每组的平均值,再用以下公式计算各组的细胞增殖率:细胞增殖率(%)=(本组OD均值-调零组OD均

AzureSpot-软件分析-western-数据操作方法

AzureSpot分析软件介绍AzureSpot提供分析凝胶和印迹的工具,使复杂分析成为一个简单的过程。AzureSpot软件分为全自动或手动分析,为您的数据分析提供了灵活性和准确性。  工具: AzureSpot包括: >   自动泳道和条带检

基因数据分析的主流软件

在过去的几年中,许多生物的基因组完成了测序工作,如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用,正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具,已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取,那些基于表达序列同