天津工生所发布反应酶挖掘与评估平台
在代谢路径设计领域，寻找能够催化非天然反应的候选酶是具有挑战性的工作。虽然现有一些方法可以根据相似反应识别潜在酶，但在反应类型识别和后续酶筛选评估等方面存在不足，难以有效帮助实验科学家快速筛选候选酶进行实验验证。 近日，中国科学院天津工业生物技术研究所生物设计中心发布了集成的反应酶挖掘与评估平台——REME（https://reme.biodesign.ac.cn）。该平台结合底物原子到产物原子映射、原子类型变化识别和反应相似性计算，实现了相似反应的计算、快速排序和可视化。用户可以根据功能基团筛选相似反应，并进一步通过酶号或序列同源性筛选或扩展候选酶。REME平台结合多种人工智能方法对候选酶进行多角度评估，帮助科研人员迅速识别潜在酶。REME平台为非天然反应的酶挖掘和评估提供了新的解决方案。 相关研究成果发表在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上。研究工作得到国家自然科学基金、中国科学院战略性先......阅读全文
酶膜反应器的分类介绍
酶膜反应器可以根据酶的存在状态、液相数目、膜组件型式、膜材料类型、反应与分离耦合方式、传质推动力等的区别,分为不同的类型: （1）根据酶的存在状态,可将酶膜反应器分为游离态和固定化酶膜反应器。前者酶均匀地分布于反应物相中,酶促反应在接近本征动力学的状态下进行,但酶易发生剪切失活或泡沫变性,装置
PCR）聚合酶链式反应
PCR技术可用于：（1）检验感染性疾病是否处于隐性或亚临床状态;（2）有效检测癌基因的突变，准确检测癌基因的表达量;（3）临床应用于检测地中海贫血的基因突变。 实验方法原理 PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。 PCR由变性--退火--
反向聚合酶链反应的定义
中文名称反向聚合酶链反应英文名称inverse PCR;iPCR定 义用于扩增已知序列的DNA旁侧未知序列的方法。即先用在已知DNA序列上没有识别位点的限制内切酶，切出包含已知DNA、而两端带有未知序列的区段，将切出的DNA区段环化，然后再按已知的DNA序列设计一对引物进行扩增。应用学科细胞生物学
聚合酶链式反应（PCR）
PCR技术可用于：（1）检验感染性疾病是否处于隐性或亚临床状态；（2）有效检测癌基因的突变，准确检测癌基因的表达量；（3）临床应用于检测地中海贫血的基因突变。实验方法原理基本原理类似于DNA的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成
聚合酶链反应的控制方式
PCR反应的缓冲液 提供合适的酸碱度与某些离子镁离子浓度 总量应比dNTPs的浓度高，常用1.5mmol/L底物浓度 dNTP以等摩尔浓度配制，20～200umol/LTaqDNA聚合酶 2.5U(100ul）引物 浓度一般为0.1 ～ 0.5umol/L反应温度和循环次数变性温度和时间 95℃，3
聚合酶链反应构建重组DNA
2016年09月12日 15:27 来源:上海江林生物科技有限公司>>进入该公司展台 实验材料DNA试剂、试剂盒TE无水乙醇DNA聚合酶CTP仪器、耗材电泳仪离心机PCR仪实验步骤1. 制备模板DNA，如DNA不是经氯化铯梯度纯化的，100℃煮沸10 min 以灭活核酸酶。 2. 制备寡核苷
PCR反应后为什么要酶切
在设计pcr引物时，会将酶切位点设计在引物里面，但是pcr后的片段是双链平末端，需要将设计的酶切位点粘性末端暴露出来，所以需要酶切处理。
逆转录聚合酶链反应
逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction，RT-PCR)的原理是：提取组织或细胞中的总RNA，以其中的mRNA作为模板，采用Oligo（dT）或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增，而获得
聚合酶链反应的污染来源
1、标本间交叉污染：标本污染主要有收集标本的容器被污染，或标本放置时，由于密封不严溢于容器外，或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染；标本核酸模板在提取过程中，由于吸样枪污染导致标本间污染；有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散，导致彼此间的污染。2、PCR试剂的污染：主要是由于在PCR
使用胰酶的不良反应介绍
1.本药可引起颊部及肛周疼痛、消化道的任何部位出血、过敏或刺激引起呼吸道症状（如喷嚏、流泪、皮疹、鼻炎甚至哮喘）。 2.囊性纤维化的患者应用本药治疗时，可见尿中尿酸增多，且与剂量相关。 3.偶见腹泻、便秘、胃不适感、恶心及皮疹。
定量聚合酶链反应的定义
中文名称定量聚合酶链反应英文名称quantitative PCR;qPCR定 义将某种已知含量的DNA模板作为内标准进行PCR反应，对待测模板进行定量分析的方法。更灵敏的定量PCR是采用实时PCR方法。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞生物学技术（二级学科）
关于脱氢酶的反应原理介绍
大多数脱氢酶的天然受体是NAD+或NADP+〔以下用NAD（P）+表示〕，例如苹果酸脱氢酶，异柠檬酸脱氢酶等 。脱氢酶的底物经这类脱氢酶的催化使NAD（P）+还原生成NAD（P）H。另一些脱氢酶以黄素为辅基，辅基在催化反应中进行氧化还原。例如琥珀酸脱氢酶，还原型烟酰胺腺嘌岭二核苷酸（NADH）脱
聚合酶链反应构建重组DNA
基本方案 实验方法原理 利用聚合酶链式反应（PCR），任何两个DNA片段可连接成一个新的重组DNA分子。通过在PCR引物中引入的额外非同源的核苷酸，可在连接处
酶反应器流动状态的控制
在反应器中酶的催化效率和反应器的寿命都与反应器中流体流动状态有关。酶反应器在运行时，流动方式的改变会使酶与底物接触不良，造成反应器生产率降低，同时还会造成返混程度变化，为副反应的发生提供了机会。影响流动状态的因素主要有：载体填充不规则、底物上柱不均匀、载体自压缩、固体和胶体物质沉积造成壅塞等。解
QM/MM酶催化反应机制研究
酶反应机理研究是化学、生物学中的核心问题之一，长期以来受到广泛关注。不过酶催化反应研究相当复杂，无论实验还是计算模拟都充满挑战，这主要是因为酶反应过程的多尺度特性[1]： 如图1所示，反应底物化学键断裂与生成、蛋白局部氨基酸残基的运动往往在飞秒到皮秒的时间尺度，若要描述溶剂分子例如水的动力学行为至少
聚合酶链式反应（PCR）
实验概要聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法，为最常用的分子生物学技术之一。典型的PCR由（1）高温变性模板；（2）引物与模板退火；（3）引物沿模板延伸三步反应组成一个循环，通过多次循环反应，使目的DNA得以迅速扩增。
酶切反应(Setting－Up－a－Restriction－Endonuclease－Reaction)
一、 建立一个标准的酶切反应目前大多数研究者遵循一条规则，即10个单位的内切酶可以切割1μg不同来源和纯度的DNA。通常，一个50μl的反应体系中，1μl的酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好的DNA。如果加入更多的酶，则可相应缩短反应时间；如果减少酶
温度对酶反应速度的影响
一方面是温度升高，酶促反应速度加快。另一方面，温度升高，酶的高级结构将发生变化或变性，导致酶活性降低甚至丧失。因此大多数酶都有一个最适温度。在最适温度条件下，反应速度最大。
聚合酶链反应克隆的原理
中文名称聚合酶链反应克隆英文名称PCR cloning定 义应用聚合酶链反应的技术获得DNA分子克隆的方法。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级学科）
聚合酶链[式]反应的定义
中文名称聚合酶链[式]反应英文名称polymerase chain reaction;PCR定 义通过DNA互补双链解链、退火和聚合延伸的多次循环来扩增DNA特定序列的方法。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞生物学技术（二级学科）
影响酶反应的主要因素
1、抑制剂的影响抑制剂是对酶反应速度有十分重要的影响。抑制可分为不可逆抑制和可逆抑制。常用的抑制剂中不可逆抑制剂有2种,一种是专一地和特定(侧链氨基酸)基团反应的试剂;另一种是根据酶的作用机制修饰酶的特定位点的专一性试剂。2、pH值的影响酶反应是在一定的条件下进行的,酸、碱既能影响酶的稳定性,也能直
纤维素酶的反应条件
不同来源的纤维素酶有不同的最佳反应条件。常见的纤维素酶产生菌中,如曲霉、青霉及木霉,产生的酶一般为酸性酶,酶的最适温度大多在45~65℃之间,最适pH值大多在4.0~5.5之间。一些嗜碱和耐碱性的细菌,如Bacillus属中的某些种,可以产生在碱性条件下保持较高活性的纤维素酶。至于海洋细菌,王玢等分
影响酶反应的主要因素
1.1、抑制剂的影响 抑制剂是对酶反应速度有十分重要的影响。抑制可分为不可逆抑制和可逆抑制。常用的抑制剂中不可逆抑制剂有2种,一种是专一地和特定(侧链氨基酸)基团反应的试剂;另一种是根据酶的作用机制修饰酶的特定位点的专一性试剂。 1.2、pH值的影响 酶反应是在一定的条件下进行的,酸、碱既
α醋酸萘酚酯酶染色的正常反应
1）单核细胞系统原始单核细胞为阴性反应或弱阳性反应；幼单核细胞和单核细胞为阳性反应，这种反应可被氟化钠抑制。2）粒细胞系统各期粒细胞为阴性反应，有时少数粒细胞可呈弱阳性反应，此反应医学敎^育^网收集整理不被氟化钠抑制。3）巨核细胞和血小板为阳性反应。4）其他血细胞幼红细胞和淋巴细胞一般为阴性反应，有
多聚酶链式反应的原理
多聚酶 链式反应的原理类似于DNA的天然 复制过程。在待扩增的DNA片段两侧和与其两侧互补的两个寡 核苷酸 引物，经 变性、退火和延伸若干个 循环后，DNA扩增2n倍。 1．变性：加热使模板DNA在 高温下（94℃）变性，双链间的氢键断裂而形成两条单链，即变性阶段。 2．退火：使溶液温度降至
内切酶PCR反应中的活性
酶切反应条件如下：在20 µl PCR产物混合体系中加入5U的内切酶，按相应的反应温度温育1小时。通常20 µl PCR产物体系中含有1 µg底物DNA，1单位的Vent DNA聚合酶，1× ThermoPol Buffer [10 mM KCl， 20 mM Tris-HCl （PH 8.8@25
挖掘菌群“社交网”－ 揪出疾病“黑手”
百年前，诺贝尔生理学或医学奖获得者梅契尼科夫曾指出：肠道健康的人身体才健康。然而，复杂的肠道菌群究竟如何影响人体的疾病与健康？ 近年来，关于肠道菌群与人体健康和疾病关系的研究越发丰富，尤其是随着测序技术、基因组研究等的发展，大量研究为该领域积累了海量的生物数据信息。如何从海量零散的数据中，挖掘出
冰岛基因公司数据挖掘计划泡汤
图片来源：基因解码公司 因采集冰岛人DNA用于发现基因和疾病之间关系而著名的基因解码公司遇到了一个棘手问题。近日，《科学》杂志报道称，冰岛负责监督数据保密性的国家机构驳回了基因解码公司的请求——该公司希望可以使用计算机方法分析该国的宗系记录，以估算28万名并未同意参与该公司的研究，
华大基因：挖掘基因测序的“超级金矿”
日前公布的2012年度深圳市科学技术奖拟奖名单上，奖金高达100万元的“市长奖”拟颁给一个37岁的年轻人;去年底，英国《自然》杂志评选出2012年科学界年度十大人物，他又是唯一入选的中国人。这个年轻人，就是华大基因研究院院长王俊。 他所在的深圳华大基因，没有享受到任何财政拨款，却坐上了《自
肠道菌群的秘密仍有待挖掘
“虽然国内外有关肠道菌群的研究如火如荼，但它仍有很多不为人知的秘密没有被发现。”近日，意大利ReGenera Res抗衰老研究中心主任、维元诊所首席专家马洛塔在接受《中国科学报》采访时表示，人体肠道菌群的细胞数量是整个人体的十倍，肠道神经细胞的数量仅次于大脑。庞大的菌群不仅仅会影响肠道的生态环