南师大研究测序揭示小龙虾免疫相关miRNA
克氏原螯虾(Procambarus clarkii)，俗称“小龙虾”，是存活于淡水中一种像龙虾的甲壳类动物，也叫红螯虾或者淡水小龙虾。小龙虾是甲壳类中分布最广的外来入侵物种，因其杂食性、生长速度快、适应能力强而在当地生态环境中形成绝对的竞争优势，近年来，小龙虾在中国已经成为重要的经济养殖品种。但就是这种坚强的物种，一旦受中华鳌蟹螺原体(Spiroplasma eriocheiris)感染(民间说的抖抖病)，死亡率近乎100%，给养殖业造成了严重损失。 近日, 南京师范大学江苏省生物多样性与生物技术重点实验室在期刊Fish & Shellfish Immunology上发表了题为“Transcriptome-wide identification and characterization of the Procambarus clarkii microRNAs potentially relate......阅读全文
南师大研究测序揭示小龙虾免疫相关miRNA
克氏原螯虾(Procambarus clarkii)，俗称“小龙虾”，是存活于淡水中一种像龙虾的甲壳类动物，也叫红螯虾或者淡水小龙虾。小龙虾是甲壳类中分布最广的外来入侵物种，因其杂食性、生长速度快、适应能力强而在当地生态环境中形成绝对的竞争优势，近年来，小龙虾在中国已经成为重要的经济养殖品种
测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA
中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼
测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制
海参（Apostichopus japonicus），是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物，以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临，上层海水由于太阳光强烈照射，温度上升。此时，海底的小生物都浮到海面，进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参，迫于夏季食物中断，进入夏眠，此时，其基础代谢率明
中海大：测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制
海参（Apostichopus japonicus），是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物，以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临，上层海水由于太阳光强烈照射，温度上升。此时，海底的小生物都浮到海面，进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参，迫于夏季食物中断，进入夏眠，此时，其基础代谢
DNA测序的测序技术
高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（Next-generation sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等，主要有以
miRNA－mimics－miRNA－inhibitor
miRNA mimics 是模拟生物体 内源的miRNAs，运用化学合成的方法合成，能增强内源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。近年来人工合成的miRNA（artificial miRNA，amiRNA）已经成功应用于沉默预期靶
检测血液中miRNA的简便技术
癌变肿瘤会脱落一些微小的指示遗传分子，称为microRNAs。最近，密歇根大学的研究人员开发出一种有效的方法，能在血液中检测到它们。相关研究结果发表在六月二十二日的《Nature Biotechnology》。 研究人员称，他们这种方法可通过一种廉价的血液测试，同时对多种类型的癌症进行筛选——
miRNA海绵—长效抑制miRNA
随着研究的深入，已知miRNA的数量与日俱增，目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过，大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中，最有效的方法是阻止特定基因的功能，然后了解其后果。miRNA同样如此。然而，相比之下，miRNA的功能研究要困难得多。为什么
miRNA海绵—长效抑制miRNA
miRNA海绵随着研究的深入，已知miRNA的数量与日俱增，目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过，大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中，最有效的方法是阻止特定基因的功能，然后了解其后果。miRNA同样如此。然而，相比之下，miRNA的功能研究要困
DNA测序技术的测序规律
生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组寡核苷酸都有固定的起点，但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等，因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物，这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸
DNA测序技术的测序原理
化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段，造成碱基的特异性切割，产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物，经凝胶电泳分离。化学切割反应：包括碱基的修饰，修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物
DNA测序技术
目前还有一种基于半导体芯片的新一代革命性测序技术——Ion Torrent。该技术使用了一种布满小孔的高密度半导体芯片， 一个小孔就是一个测序反应池。当DNA聚合酶把核苷酸聚合到延伸中的DNA链上时，会释放出一个氢离子，反应池中的PH发生改变，位于池下的离子感受器感受到H+离子信号，H+离子信号再直
Nature新成果：ddPCR技术助力定量miRNA
来自Bio-Rad公司，Fred Hutchinson癌症研究中心等处的研究人员发表了题为“Absolute quantification by droplet digital PCR versus analog real-time PCR”的文章，证明了液滴数字PCR( Droplet D
DNA测序技术的测序的规律
生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组寡核苷酸都有固定的起点，但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等，因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物，这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸
测序技术及测序仪器的比较
自sanger测序技术发明以来，经人类基因组计划的促进，测序技术有了跨越式的发展，以实验方法与实验仪器的改进为标志,测序技术经历了三代的发展，同时测序技术向着高通量测序，单分子测序，低价格测序的方向发展，目前测序技术已成为分子生物学实验中的重要的实验手段。本文主要简单回溯了测序技术的发展历史，介绍了
高通量测序技术——第二代测序技术
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(de
测序牛人发布蛋白单分子测序技术
人类生命的蓝图是三十亿碱基对组成的人类基因组。而DNA编码的蛋白质是几乎所有生命过程的主要执行者。 现在，美国亚利桑纳州立大学Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事，在纳米孔DNA测序技术的基础上，开发了能够精确鉴定氨基酸的蛋白单分子测序技术。这一技术不仅可以用
DNA测序技术的测序反应的介绍
1. 对于每组测序反应，标记四个0.5ml eppendorf管(G、A、T、C)。每管加入2ml适当的d/ddNTP混合物(d/ddNTP Mix)。各加入1滴(约20ml)矿物油，盖上盖子保存于冰上或4℃备用。 2. 对于每组四个测序反应,在一个eppendorf管中混合以下试剂： （1
DNA测序技术自动测序法介绍
自动测序法基因分析仪(即DNA测序仪)，采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法)，因此通过单引物PCR测序反应，生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物，使得四种荧光染料的测序PCR产物
检测循环肿瘤细胞中miRNA的新技术
越来越多的证据表明，循环肿瘤细胞(CTC)中的micrornA具有诊断和预后的潜力。然而，检测却并非易事。近日，西班牙的研究人员在《Science Reports》上介绍了一种方法，能利用原位杂交检测这种小的非编码RNA。 CTC是从原发性肿瘤脱落，然后进入循环系统的一种细胞。它们到达其他的
DNA测序技术的技术原理
化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段，造成碱基的特异性切割，产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物，经凝胶电泳分离。化学切割反应：包括碱基的修饰，修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物
基因测序技术原理
基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。[2] 自上世纪90年代初，学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基，然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。[2] 虽然这种方法检测可靠，但是价格不菲也是有目共睹的，一台仪
关注前沿测序技术
而在蛋白质测序方面，《The Scientists》杂志回顾了一下研究进展，文中提到，上个世纪70年代的生化学家在钻研细胞信号传递、循环和粘附的蛋白化学特征时遇到两个难题：高精度纯化蛋白和提纯低分子量蛋白。 比如，在人类破译干扰素结构之前的20多年中，很难对其进行纯化；血管紧缩素II（angi
高通量测序技术
没有测序的癌症诊断是不完整的，完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说，NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者，大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。 随
基因测序技术（一）
什么是基因测序 基因组携带了个体的全部遗传信息，基因测序能够加深对疾病尤其是恶性肿瘤的分子机制理解，在诊断与治疗方面都发挥着重要作用。从1953年沃森和克里克发现DNA分子双螺旋结构到2001年首个人类基因组图谱的绘制完成，越来越多的人们意识到基因测序在生物医学中的重要作用。 所谓基因测
双RNA测序技术
在发表于《自然》（Nature）杂志上的一篇研究论文中， 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现，采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术，可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制，以及在研究中获得的重要发现
基因测序技术展望
DNA测序技术从最开始的简单检测逐渐演变到今天的高通量测序，在过去的30年里，数据生成呈指数增长，而过去10年里，由于高通量测序，数据产生量呈超指数增长。并且，基因测序产生的数据已经在基础生物学等诸多领域产生了革命性的影响，应用范围渗透到考古学、刑事调查和产前诊断等多个行业。那么，未来基因测序会取得
纳米孔测序技术
测序长度和准确率的快速提升使得纳米孔测序有望颠覆DNA测序市场。纽约威尔康奈尔医学院的计算生物学家Christopher Mason喜欢在会议上表演一个“绝活”：他和同事先从志愿者手机上收集DNA样本，然后就能在一个小时内现场进行谱系分析，甚至叙述志愿者一天的生活细节。“我们能从留在手机上的DNA信
DNA测序技术综述
1977年，Sanger团队完成人类历史上第一个基因组序列噬菌体X174测序，并在3年后，成为“两度”获得诺贝尔化学奖的人（前一次是1958年）。Sanger测序技术诞生，让DNA片段的测序成为现实，此后这一技术独领风骚20多年。再后来的20年里，二代测序走向成熟、三代测序崭露头角，DNA测序技术以