中科院最新PNAS文章
近日,PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展:“Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing repression”。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制,并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁,也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中,mRNA前体被剪接成为成熟的mRNA一般需要在多种蛋白质及snRNA的帮助下,经历两步转酯剪接反应来完成。目前对于第二步剪接反应的调控知之甚少。 冯英研究组在前期工作中发现了一种特殊的mRNA前体,该前体在剪接反应已经开启的情况下,仅将转酯反应进行到第一步即停止,第二步反应则被完全抑制。 冯英研究员指导的博......阅读全文
调控玉米性状-可变剪接“火”起来
最近,中国农业大学国家玉米改良中心田丰教授团队与杨小红教授团队合作研究,以368份玉米自交系未成熟籽粒为实验材料,定位玉米种全基因组水平QTL(数量性状位点),全面解析了其可变剪接的调控机制,并为研究表型变异提供了重要线索。相关论文近日发表在《植物细胞》杂志上。 可变剪接,这个早在上世纪就
调控玉米性状-可变剪接“火”起来
可变剪接,这个早在上世纪就被提出的概念,在近几年的研究中,又“火”了起来。科学家们发现,可变剪接不仅丰富蛋白质组多样性,还在生物体内起着重要的调控作用。 可变剪接是什么?这项研究有了什么新发现?是怎样得出来的?实验中的难点是什么?对之后的研究有怎样的借鉴意义?科技日报就此采访了该研究团队。
内含肽剪接调控以作为药物“开关”
含肽作为药物靶标的研究于内含肽这种可调控的作用机制,Bonnanl51为,通过改变剪接结构域上、下游的序列,自主设蛋白质内含肽,可以调控蛋白质的剪接。因为包含内含肽的前体蛋白无活性的,所以那些能阻断剪接的化学物质将具有重要的药用价值。由于目前在动物和人体正常新陈代谢中没有发现内含肽的报道,作为药
PNAS:RNA剪接调控研究方面新的进展
近日,PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制,并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁,也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中,mRNA前体被剪
内含肽的应用剪接调控以作为药物“开关”
含肽作为药物靶标的研究于内含肽这种可调控的作用机制,Bonnanl51为,通过改变剪接结构域上、下游的序列,自主设蛋白质内含肽,可以调控蛋白质的剪接。因为包含内含肽的前体蛋白无活性的,所以那些能阻断剪接的化学物质将具有重要的药用价值。由于目前在动物和人体正常新陈代谢中没有发现内含肽的报道,作为药靶标
tRAS(转录组可变剪接调控深度分析)
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程,对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化;根据对照和实验组,系统分析您样品中所蕴藏的可变剪接调控规律,中肯分析所揭示出的重要科学规律;让您快速“发现”所关注的生物学,医学和农业问题的答案。 我们
肺癌细胞中异常剪接的关键调控因子
Pre-mRNA可变剪接是一种增加基因组多样性和调控基因表达的重要机制。在肿瘤的发生发展过程中,许多剪接事件发生异常变化。然而,我们并不清楚这些异常剪接事件是如何产生的,异常剪接产物对肿瘤细胞的生物学功能产生什么影响。肺癌是最常见的恶性肿瘤之一,在全球范围是癌症相关致死的头号杀手。由于缺乏有效的
木薯剪接蛋白参与调控盐胁迫应答研究获进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499497.shtm近日,广东省科学院南繁种业研究所教授王振宇团队在选择性剪接调控作物盐胁迫应答方面取得重要进展。相关研究发表于《农业科学学报(英文版)》(Journal of Integrative A
营养所在RNA剪接调控研究中取得新进展
近日,PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展:Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
剪接复合体调控叶片衰老新机制获揭示
叶片作为植物的光合作用器官,对能量和物质的需求极大,直接影响着植物的生长。叶片衰老作为叶片生长的最终阶段,标志着叶片贡献的减弱。这一过程不仅受到外界环境、植物激素和叶片年龄等因素的调控,还在物质回收和再利用中发挥重要作用。叶片衰老的精细调控对于农业产出,尤其是粮食作物的产量和质量有着深远影响。根
新研究揭示可变剪接调控光形态建成的分子机制
太阳光不仅是植物光合作用的能量来源,也是一种重要的环境信号,调节植物的生长发育进程。其中幼苗光形态建成受光质、光量的精确调控,涉及不同的光受体和一系列信号调控因子。COP1是光形态建成的一个明星蛋白,它作为一种E3泛素连接酶,与目标蛋白互作并促进其降解,COP1在植物和动物中广泛存在。真核生物
Cell-Systems:构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示,人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控,其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子(trans-a
聚合酶链反应剪接的原理和应用
中文名称聚合酶链反应剪接英文名称PCR splicing定 义利用聚合酶链反应进行基因剪接以删除DNA中一段特定序列的方法。系设计两组引物,先分别扩增拟删除序列上下游两侧的序列,再用上游序列5′端引物和下游序列3′端引物用PCR反应进行连接。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二
GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院,中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
异常剪接
中文名异常剪接定 义指对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析隶属领域生物领域主要功能处理多顺反子性转录单元,调控转录效率和mRNA的稳定性,同时可以增加产物蛋白的多样性
RNA-剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
自剪接
自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶,核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种,称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接,但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老,且
上海生科院发现mRNA剪接蛋白对脂肪细胞分化的调控作用
近日,国际学术期刊Molecular and Cellular Biology在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所冯英组的最新研究进展SRSF10 regulates alternative splicing and is required for adipocyte d
上海生科院发现肺癌细胞中异常剪接的关键调控因子
4月10日,国际学术期刊PLOS Genetics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所惠静毅课题组题为The RNA-binding protein QKI suppresses cancer-associated aberrant splicing 的研究
miRNA与剪接因子相互作用调控胚胎干细胞的分子机制
该项研究发现在胚胎干细胞中miRNA介导调控了近六百个可变剪接事件,其中大部分是由miR-294所调控,包括Foxp1的可变剪接。结合RNA干扰和高通量测序发现,miR-294主要通过抑制剪接调控因子Muscle blind-like蛋白(Mbnl1/2)的表达来起作用的。有趣的是,分化过程
上海生科院揭示新RNA剪接因子调控植物脱落酸信号途径
9月25日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为An Arabidopsis PWI and RRM motif-containing protein is critical for pre-mR
北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制
中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中,发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合,促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016
剪接体
剪接体(英文:spliceosome)定义:由核小RNA(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。只与SMT蛋白理解与糖性一致。
剪接位点
中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定 义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
剪接重叠延伸聚合酶链反应的原理和应用特点
中文名称剪接重叠延伸聚合酶链反应英文名称splicing overlapping extension PCR;SOE-PCR定 义利用一系列聚合酶链反应,使产物两端彼此重叠,以便剪接成长片段,其间越过某段序列可使之缺失的PCR方法。一些基因工程抗体就是用此法制备的。应用学科生物化学与分子生物学(一
上海生科院发现mRNA剪接蛋白对肌肉分化和糖代谢的调控作用
11月11日,国际学术期刊Cell reports 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所冯英组的最新研究进展:SRSF10 plays a role in myoblast differentiation and glucose production via regulation
上海生科院揭示RNA可变剪接在细胞周期时序性的调控机制
3月25日,国际学术期刊Elife 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所王泽峰研究组的最新论文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。该工作
营养所揭示SRSF10调控mRNA选择性剪接的新机制
1月18日,Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所研究员冯英组的最新研究进展:Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reve
简述第Ⅳ类内含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因组共有约400个tRNA基因,含有内含子的基因仅占十分之一。内含子的长度从14到46个碱基对不等,它们之间并无保守序列,切除内含子的酶识别仅是共同的二级结构,而不是共同的序列。通常内含子插入到靠近反密码子处,与反密码子碱基配对,未成熟tRNA的反密码子环不存在,而是以插入的内含子所构成的
选择性剪接
中文名选择性剪接外文名alternative splicing别 名可变剪接作 用mRNA前体加工特 点表达水平的不同而导致不同的表型定义选择性剪接(也叫可变剪接)是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的过程,使得最终的蛋白