尚恩答疑|细胞系STR鉴定原理及结果解读
1. 匹配度大于多少时,可认为待测细胞系与标准细胞系具有相关性?匹配度大于80%(EV值大于0.8)时,可认为待测细胞系与标准细胞系具有相关性2. 某个小鼠细胞鉴定匹配到另一个小鼠细胞,一定是错误细胞系吗?不一定。首先去数据库确认该细胞系有没有公开的位点数据,如果有数据,且数据与检测结果匹配不上,说明为错误细胞系。如果该细胞系没有公开位点数据,则不能完全肯定是错误细胞系。由于小鼠品系不多,都是近交系(即近亲交配),很容易出现同品系细胞相互匹配到的问题,需要根据细胞形态、功能、特异性marker等具体判断细胞正确性。3. 没有STR位点信息的细胞怎么鉴定正确性?综合细胞形态、种属鉴定、功能实验结果或特异性marker进一步确认细胞正确性。4. 原代细胞需要做鉴定嘛?由于原代细胞传代次数较少,一般不会选择STR鉴定进行溯源。且来源于同一个体的杂细胞也无法通过STR鉴定来区分。因此鉴定原代细胞正确性和纯度常选择......阅读全文
尚恩答疑-|-细胞系STR鉴定原理及结果解读
1. 匹配度大于多少时,可认为待测细胞系与标准细胞系具有相关性?匹配度大于80%(EV值大于0.8)时,可认为待测细胞系与标准细胞系具有相关性2. 某个小鼠细胞鉴定匹配到另一个小鼠细胞,一定是错误细胞系吗?不一定。首先去数据库确认该细胞系有没有公开的位点数据,如果有数据,且数据与检测结果匹配不上
细胞系的-DNA-STR-谱_细胞系结果分析
实验材料GeneScan®和Genotyper®软件PowerMac计算机实验步骤本节包括 2 个主要领域:分析利用GeneScan®分析软件中 DNA 程序收集软件收集到的原始数据,和利用Genotype®软件为前面用GeneScan®软件分析过的 DNA 谱中的指定等位基因名称。1. 打开凝胶图
为什么STR鉴定对于ATCC细胞系来说很重要
ATCC 成立于 1925 年,是大的生物资源中心,由美国 14 家生化、医学类行业协会组成的理事会负责管理,是一家全球性、非盈利生物标准品资源中心。 进行细胞系STR鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行,这些细胞可能是受赠于其它研究人员,也可能是从细胞库(如美国?ATCC,
细胞STR鉴定
细胞STR鉴定应用于生物医学研究领域的哺乳动物细胞被错误鉴定和交叉污染的问题,一直是一个普遍存在的突出问题。据统计,国外实验室有20%左右的细胞株被错误鉴定和交叉污染,NIH和ATCC近两年都对此发出呼吁,要求研究者对细胞进行鉴定。近年来,大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的
那么STR的鉴定结果能说明什么呢?
STR的鉴定结果能证明以下问题: 1. 是否为人源细胞;2. 是否为标准细胞系;3. 是否存在物种内交叉污染。
STR细胞鉴定意义
导读: 新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从头再来。
STR细胞鉴定意义
导读:新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从头再来。背景介绍应
细胞系的-DNA-STR-谱
细胞团抽提 用SGM Plus®进行扩增 利用ABI377DNA测序仪进行凝胶电泳 细胞系结果分析 实验方法原理 用 Qiage
细胞系的-DNA-STR-谱
实验材料 Qiagen®DNA迷你试剂盒试剂、试剂盒 无水乙醇磷酸缓冲液仪器、耗材 小离心管离心机水浴或可以维持56℃的烤箱涡流混合器实验步骤 一、开始实验前,必须准备以下试剂:(a)蛋白酶溶剂溶解:向 Qiagen® 冷冻干燥的蛋白酶中加适量蛋白酶溶剂。该溶液 2~8°C 保存 2 个月内稳定。(
骨髓单核细胞系统指标解读结果
正常值: 原单核细胞:0~0.003 (0~0.3%)。 幼单核细胞:0~0.006 (0~0.6%)。 单核细胞: 0.01~0.062 (1.0%~6.2%)。 高于正常值: 增多:急性和慢性单核细胞白血病(急性以原始和幼稚型为主,慢性以成熟型为主),慢性感染。
什么是细胞STR鉴定?
STR即短串联重复序列(Short Tandem Repeats),也称微卫星DNA(microsatellite DNA),是一段包含1-6bp的重复DNA序列。STR广泛存在于原核动物和真核动物中,人类中也不例外,约占人类基因组的3%。由于其多态性和高突变率,STR在生物学研究中得到了广泛的应用
STR鉴定报告看不懂,希尔博士来解忧
STR是什么意思? STR(Short Tandem Repeats,短串联重复序列)分析已被国际细胞系鉴定协会(ICLAC:International Cell Line Authentication Committee )、ATCC、NIST(美国国家标准局)等权威机构作为金标准应用于
细胞株STR鉴定(Cell-Line-STR-Authentication)-FAQs-(2)
1.细胞株进行STR鉴定时,进行比对、参考的数据库有哪些?答:国外数据库有ExPASy (Cellosaurus) 、ATCC (American type culture collection) 、DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikrorganismen and Zel
为什么要做细胞STR鉴定
您又是否有过这样的经历…… 新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从
为什么要做细胞STR鉴定
您又是否有过这样的经历…… 新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从
为什么要做细胞STR鉴定?
您是否有过这样的经历…… 在科研工作结束之际,被你所投稿的杂志要求提供细胞STR鉴定报告,而此时你研究中使用的细胞是否被污染,将决定你几个月甚至长达几年科研工作的成败。您又是否有过这样的经历…… 新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它
为什么要进行STR鉴定?
据统计,约18%~30%细胞系被交叉污染或错误辨识,使用该细胞可能导致研究结论错误、结果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果等。2009年起,NIH和ATCC呼吁研究者对细胞进行STR鉴定并着手建立细胞STR数据库。如今,细胞STR鉴定已是鉴别细胞身份及交叉污染的金标准。多数权威期刊也要求作者投稿时提供
为什么要做细胞STR鉴定
您是否有过这样的经历…… 在科研工作结束之际,被你所投稿的杂志要求提供细胞STR鉴定报告,而此时你研究中使用的细胞是否被污染,将决定你几个月甚至长达几年科研工作的成败。 您又是否有过这样的经历…… 新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被
str测序原理
微卫星DNA又称短串联重复序列(short tandem repeats, STR) 、简单重复序列(simple sequence repeat, SSR),指DNA基因组中小于10个核苷酸的简单重复序列,广泛存在于真核基因组中,多数以2~6个碱基为核心单位、串联重复排列的序列。 1974年,S
如何根据-STR-数据判断细胞系的身份?
收到细胞系鉴定结果以及 STR 信息,可以与参考数据库进行比对。如果细胞样本的每个 STR 位点和参考细胞 STR 位点都能重合匹配,即说明该细胞系正确,反之则说明你的细胞系可能被错误标记,交叉污染或发生遗传不稳定。一般说来,匹配度≥80%即可认为该细胞系正确,匹配度<80%则说明该细胞系的来源需要
细胞鉴定和细胞STR分型鉴定的区别
STR鉴定:基因座位上的等位基因可通过PCR(聚合酶链式反应)扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别,随后通过一定的计算方法 ,能的交叉污染的细胞系名称。细胞鉴定,str只是目前常用的一种,除了STR 还有其它鉴定方法。
要求细胞STR鉴定的期刊总结
已开始要求细胞STR鉴定的期刊: BioTechniquesInternational Journal of CancerCancer Discovery (AACR)Journal of Clinical Endocrinology & MetabolismCancer Epidemiology,
细胞系的-DNA-STR-谱_细胞团抽提
实验方法原理用 Qiagen®QIAamp®迷你试剂盒从细胞团提取 DNA;抽提到的 DNA 用SGMPlius®扩增,然后用 ABI377 DNA 测序仪进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,用GeneScan®和Genotyper®软件进行分析。实验材料Qiagen®DNA迷你试剂盒试剂、试剂盒无水乙醇磷酸缓
你的细胞有做过-STR-鉴定吗?
据统计约 30% 细胞系被交叉污染或错误辨识,因使用了交叉污染或错误辨识的细胞而导致研究结论错误、结果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果……,这浪费大量时间、精力和金钱。Everything was going along fine until they discovered their HeLa c
分析细胞鉴定金标准STR(Short-TandemRepeat)短串联重复...
分析细胞鉴定金标准-STR(Short TandemRepeat)短串联重复序列STR(Short TandemRepeat,短串联重复序列)分析已被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。由于目前使用错误细胞情况非常严重,越来越多的杂志要求在投稿时提供细胞STR分析数据。经常有小伙
细胞系的-DNA-STR-谱_用SGM-Plus®进行扩增
实验材料SGM Plus® PCR 混合物的各种成分试剂、试剂盒纯无菌水仪器、耗材热循环仪实验步骤1. 参照 ABI 的操作步骤,为待扩增样品准备足量的混合物,每个样品管包含:(a) AMPF/STR®PCR 反应混合物 21 μl(b) AMPF/STR®SGM Plus®引物一套 11 μl(c
什么是细胞系鉴定?
所谓细胞系鉴定即通过STR(短串联重复)图谱所建立细胞系的遗传特征。一株细胞系的遗传特征确立后,细胞系可以通过定期的检测,以防止出现细胞系被误认或交叉污染的情况。
细胞系错误鉴定:终结的开始(三)
交叉污染检测许多方法已被用来检测交叉污染,包括同工酶分析、核型分析、人类白细胞抗原(HLA)分型,免疫分型和DNA指纹识别。这些方法都可以鉴别出某一种细胞系,但是分辨能力各不一样。然而,这些方法在不同实验室所得到的数据却不尽相同,以致没有任何一种方法可以用来建立一个标准参考数据库。许多实验室利用ST
STR基因分型应用于细胞鉴定的意义
新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从头再来。 背景介绍应用于
细胞系错误鉴定:终结的开始
2010年5月ATCC SDO(Standards Development Organization)工作组在Nature review cancer杂志上发表了题为《Cell line misidentification:the beginning of the end》前瞻性报道。以下是全文