细胞系错误鉴定:终结的开始(三)

交叉污染检测许多方法已被用来检测交叉污染,包括同工酶分析、核型分析、人类白细胞抗原(HLA)分型,免疫分型和DNA指纹识别。这些方法都可以鉴别出某一种细胞系,但是分辨能力各不一样。然而,这些方法在不同实验室所得到的数据却不尽相同,以致没有任何一种方法可以用来建立一个标准参考数据库。许多实验室利用STR分型来鉴定人源细胞系。STR分型是一种用来做亲缘分析的方法,它的原理是在一单管中同时扩增多个多态性DNA片段。STR位点是由不同数目重复单元组成的重复DNA序列。每一个STR位点均能被扩增且扩增产物标记上不同颜色的荧光,使得扩增产物很容易通过片段大小和颜色来区分。STR分型快速、经济、易于自动化,能得到可重复的数据,且数据格式适合建立一个标准参考数据库。由于快速、鉴定的细胞系结果明确,STR分型的应用价值最大。STR分型——潜力及局限3-5个碱基重复的DNA重复序列已常规性地用来做亲缘鉴定、法医鉴定、以及鉴定在20年之前的大灾难中遇......阅读全文

细胞系错误鉴定:终结的开始(三)

交叉污染检测许多方法已被用来检测交叉污染,包括同工酶分析、核型分析、人类白细胞抗原(HLA)分型,免疫分型和DNA指纹识别。这些方法都可以鉴别出某一种细胞系,但是分辨能力各不一样。然而,这些方法在不同实验室所得到的数据却不尽相同,以致没有任何一种方法可以用来建立一个标准参考数据库。许多实验室利用ST

细胞系错误鉴定:终结的开始

  2010年5月ATCC SDO(Standards Development Organization)工作组在Nature review cancer杂志上发表了题为《Cell line misidentification:the beginning of the end》前瞻性报道。以下是全文

细胞系错误鉴定:终结的开始(一)

2010年5月ATCC SDO(Standards Development Organization)工作组在Nature review cancer杂志上发表了题为《Cell line misidentification:the beginning of the end》前瞻性报道。以下是

细胞系错误鉴定:终结的开始(二)

案例和影响交叉污染和错误鉴定已有一段很长的历史,这其中有许多的案例,我们很难去判断哪一个是最重要及代价最高的。已被描述的经典案例是Hela细胞污染(关于Hela细胞污染有好几个案例),令人惊奇的是,许多被Hela细胞污染的细胞系居然在一些备受尊敬的杂志上仍被使用,而这一使用距离它们最先发现为Hela

细胞系交叉污染或错误鉴定对研究是否有影响

细胞系交叉污染或错误鉴定对研究有影响。使用错误的细胞系或者是被污染的细胞系做研究,只会造成时间,金钱和精力的损失,以及造成实验结果的不一致和不可重复。因此如果用被污染或错误的细胞系做研究,在发表文章或做进一步研究时极有可能需要用正确的细胞再重复实验。

什么是细胞系鉴定?

所谓细胞系鉴定即通过STR(短串联重复)图谱所建立细胞系的遗传特征。一株细胞系的遗传特征确立后,细胞系可以通过定期的检测,以防止出现细胞系被误认或交叉污染的情况。

细胞系鉴定的办法和依据

细胞系鉴定目前主要基于国际身份认证委员会的标准。依据该标准,可以通过多重荧光PCR技术,对人源8个STR位点以及1个性别决定位点进行检测。

ABO血型系统鉴定错误的原因分析

  正确的血型鉴定是安全输血的关键,ABO血型系统有两个独特性质,一是血清中常存在的反应性强的抗体,而红细胞表面缺乏相应的抗原,二是许多组织细胞表面有规律的存在着ABH抗原,而分泌型的分泌液中也存在着ABH抗原,这两种独有的性质使ABO血型系统成为输血和器官移植中最重要的血型系统,输血前ABO血型鉴

为什么要进行细胞系鉴定?

首先进行细胞系STR鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行,这些细胞可能是受赠于其它研究人员,也可能是从细胞库(如美国 ATCC,AmericanTypeCultureCollection)得来。据估计,15-20%的实验室,实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系,或者与其它细胞系发

什么时候需细胞系鉴定?

1)当建立或获得一个新的细胞系时; 2)一个涉及到细胞试验项目开始/结束时; 3)在细胞冻存之前,或细胞已连续培养2~3个月时; 4)发表文章或申请课题经费前; 5)细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大时; 6)当实验室使用超过一种细胞系时,所有细胞系应先鉴定以排除交叉污染的可能。

为什么STR鉴定对于ATCC细胞系来说很重要

  ATCC 成立于 1925 年,是大的生物资源中心,由美国 14 家生化、医学类行业协会组成的理事会负责管理,是一家全球性、非盈利生物标准品资源中心。  进行细胞系STR鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行,这些细胞可能是受赠于其它研究人员,也可能是从细胞库(如美国?ATCC,

尚恩答疑-|-细胞系STR鉴定原理及结果解读

1.  匹配度大于多少时,可认为待测细胞系与标准细胞系具有相关性?匹配度大于80%(EV值大于0.8)时,可认为待测细胞系与标准细胞系具有相关性2.  某个小鼠细胞鉴定匹配到另一个小鼠细胞,一定是错误细胞系吗?不一定。首先去数据库确认该细胞系有没有公开的位点数据,如果有数据,且数据与检测结果匹配不上

AB0血型鉴定及交叉配血中常见错误

1.分型血清方面的原因(1)自制分型血清抗体:效价太低、亲和力不强,造成定型不准确。(2)患者纤维蛋白原增高或为异常蛋白血症:如多发性骨髓瘤,巨球蛋白血症等,可产生缗钱状假凝集。(3)患者输入了高分子血浆代用品或静脉注射造影剂等药物:可引起红细胞聚集,易误认为凝集。(4)血清中可能存在的不规则抗体:

ABO血型鉴定及交叉配血中常见错误解析

交叉配血是确定能否输血的重要依据,在血型鉴定的基础上,通过交叉配血试验进一步证实受血者和供血者之间不存在血型不合的抗原一抗体反应,以保证受血者的输血安全。两侧均不凝集可输血。若献血人红细胞与受血人血清(主侧)发生凝集应禁止输血;主侧不凝集,次侧(献血人血清与受血者红细胞)凝集,必要时可少量、慢速输血

阳离子的鉴定方法(三)

Cu2+1.取l滴Cu2+试液,加1滴6mol·L-1HAc酸化,加l滴K4[Fe(CN)6]溶液,红棕色沉淀出现,示有Cu2+2Cu2+  +  [Fe(CN)6]4- = Cu2[Fe(CN)6]↓1.在中性或弱酸性溶液中进行。如试液为强酸性,则用3mol·L-1NaAc调至弱酸性后进行。沉淀不

酵母菌的鉴定(三)

四、酵母菌生长曲线的测定试验 1、将培养24小时左右的酵母斜面菌种,用无菌水洗下菌苔,以3000转/分的速率离心,得菌体。将酵母菌体沉淀物再用无菌水洗2-3次后,制备酵母菌悬液(细胞数量约106左右/毫升),测数备用。 2、取上述菌悬液1毫升于盛有清亮的酵母增殖培养液的试管中,下培养,以此为起始时间

食管癌细胞系中干细胞样SP细胞的分离鉴定实验

实验材料 人食管癌细胞系试剂、试剂盒 胰酶RNA酶碘化丙啶四甲基偶氮唑盐小牛血清DMEMDMSOK2HPO4Na2HPO4NaCI仪器、耗材 无菌分选管400目细胞筛水浴锅离心机酶标仪电泳仪显微镜PCR仪实验步骤 一、材料准备1.  青霉素储存液(1)将青霉素小瓶中的80万单位的干粉充分溶解于8 m

《三体》中的科学哲学讲座开始了

嘉宾:王一 香港科技大学副教授主办: 墨子沙龙协办: 中国科大新创校友基金会 中国科学技术大学教育基金会 上海市浦东新区科学技术协会 上海市浦东新区科技和经济委员会 “一说《三体》——科学解读三体世界观”是继《一说万物》之后,墨子沙龙再次和王一老师合作,推出的线上系列科普直播活动

SEM灯丝寿命的终结

SEM灯丝寿命的终结 如何判断灯丝寿命的尽头?对于钨灯丝,你根本看不到它的到来。这意味着灯丝可能在成像或分析过程断裂,这会带来很多不便。来自灯丝的碎片也可能污染真空柱的其他部件,这不仅需要换灯丝,还要清理、甚至更换其他部件,如韦氏帽。 当然,可以在使用寿命结束前更换灯丝,但它没有得到充分利用,因此需

你的细胞有做过-STR-鉴定吗?

据统计约 30% 细胞系被交叉污染或错误辨识,因使用了交叉污染或错误辨识的细胞而导致研究结论错误、结果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果……,这浪费大量时间、精力和金钱。Everything was going along fine until they discovered their HeLa c

质粒DNA的分离、纯化和鉴定-(三)

操作步骤    一、 细菌的培养和收集    将含有质粒pBS的DH5α菌种接种在LB固体培养基(含50μg/ml Amp)中, 37℃培养12-24小时。用无菌牙签挑取单菌落接种到5ml LB液体培养基(含50μg/ml Amp)中,37℃振荡培养约12小时至对数生长后期。    二、 质粒DNA

进行细胞鉴定(Cell-Authentication)的根本原由-细胞错误识别被污染的危害及现状

2009年Nature号召建立细胞STR数据库、2010年IJC(Int J Cancer)期刊开始要求作者提供细胞鉴定报告、2011年ATCC的标准发展组织 (Standards Development Organization, SDO) 颁布了ASN-0002标准《Authentication

“GDP崇拜”能否终结?

  今年是实施“十二五”规划的第一年。中央关于“十二五”规划的《建议》指出,“十二五”时期,是全面建设小康社会的关键时期,是深化改革开放、加快转变经济发展方式的攻坚时期。  笔者认为,实际上,“关键时期”与“攻坚时期”这二者之间存在着内在的逻辑关联,从一定意义上说,全面建设小

这些电子工程师常犯的错误,你中招了吗?(三)

为什么两个电容并联:一是:同种类型的电容并联作用主要是扩容;二是:不同种类型的电容并联一般是一个感性强、一个感性弱。小容量电容高频信号易通过,大容量电容低频信号易通过。大电容在低频时能提供好的通路,而在高频时由于其寄生电感的存在阻抗将变大而无法提供滤波通路,所以大电容不能滤高频,而小电容在低频时阻抗

复制错误的概念

中文名称复制错误英文名称replication error定  义DNA复制过程中核苷酸配对发生错误的现象。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

Nature:死无对证的时代终结

  日前,冷泉港实验室(CSHL)研究团队在Nature上发表关于大脑切片的研究报道,称通过大脑切片可以准确地判断大鼠生前所接受的行为训练。这项研究为人们进一步理解大脑的学习和记忆编码机制提供了新的角度。  感觉的决定是基于感觉皮层神经元的活动,但是生物体如何学习将这种活动转化为合适的行为仍然有待摸

生命终结的暗示——回光返照

   回光返照现象主要发生于严重的器质性疾病的晚期病人,在濒临死亡时,机体调动尚未消耗殆尽的化学能量三磷酸腺苷会迅速变成二磷酸腺苷,突然释放出大量能量,供给各器官组织,尤其是神经系统和内分泌系统应激的动力,使奄奄一息的病人突然出现假性好转,如残灯复明,一明即散。    “回光返照”其实是对人临死

细胞系的-DNA-STR-谱_细胞系结果分析

实验材料GeneScan®和Genotyper®软件PowerMac计算机实验步骤本节包括 2 个主要领域:分析利用GeneScan®分析软件中 DNA 程序收集软件收集到的原始数据,和利用Genotype®软件为前面用GeneScan®软件分析过的 DNA 谱中的指定等位基因名称。1. 打开凝胶图

三丰粗糙度仪常见错误及解决方法

  存储卡  存储卡错误一:当卡被写保护时,执行存储卡的写,格式或删除要求。  解决方法:从插槽中重新移走存储卡,取消写保护。  存储卡错误二:存储卡保存的数据超出存储容量。  解决方法:插入一个新的存储卡并格式化。实行新的保存操作。  存储卡错误三:当读取存储卡时‚发生转存错误。  解决方法:确保

如何根据-STR-数据判断细胞系的身份?

收到细胞系鉴定结果以及 STR 信息,可以与参考数据库进行比对。如果细胞样本的每个 STR 位点和参考细胞 STR 位点都能重合匹配,即说明该细胞系正确,反之则说明你的细胞系可能被错误标记,交叉污染或发生遗传不稳定。一般说来,匹配度≥80%即可认为该细胞系正确,匹配度<80%则说明该细胞系的来源需要