细胞系的DNASTR谱_细胞团抽提
实验方法原理用 Qiagen®QIAamp®迷你试剂盒从细胞团提取 DNA；抽提到的 DNA 用SGMPlius®扩增，然后用 ABI377 DNA 测序仪进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，用GeneScan®和Genotyper®软件进行分析。实验材料Qiagen®DNA迷你试剂盒试剂、试剂盒无水乙醇磷酸缓冲液仪器、耗材小离心管离心机水浴或可以维持56℃的烤箱涡流混合器实验步骤一、开始实验前，必须准备以下试剂：(a)蛋白酶溶剂溶解：向 Qiagen® 冷冻干燥的蛋白酶中加适量蛋白酶溶剂。该溶液 2~8°C 保存 2 个月内稳定。(b)AW 1 和 AW 2 缓冲液：向装有 AW 1 和 AW 2 浓缩液的瓶子中加人适量无水乙醇。AW 1 和 AW 2 缓冲液室温下一年内稳定。(c)AL 缓冲液：用前颠倒充分混匀。二、操作步骤（试剂盒生产商的操作步骤，稍加修改）如果细胞不是以培养基悬浮的细胞悬液，从步骤 5 进行。如果收到的是在......阅读全文
细胞系的－DNA－STR－谱
细胞团抽提 用SGM Plus®进行扩增 利用ABI377DNA测序仪进行凝胶电泳 细胞系结果分析 实验方法原理 用 Qiage
细胞系的－DNA－STR－谱
实验材料 Qiagen®DNA迷你试剂盒试剂、试剂盒 无水乙醇磷酸缓冲液仪器、耗材 小离心管离心机水浴或可以维持56℃的烤箱涡流混合器实验步骤 一、开始实验前，必须准备以下试剂：(a)蛋白酶溶剂溶解：向 Qiagen® 冷冻干燥的蛋白酶中加适量蛋白酶溶剂。该溶液 2~8°C 保存 2 个月内稳定。(
细胞系的－DNA－STR－谱_细胞系结果分析
实验材料GeneScan®和Genotyper®软件PowerMac计算机实验步骤本节包括 2 个主要领域：分析利用GeneScan®分析软件中 DNA 程序收集软件收集到的原始数据，和利用Genotype®软件为前面用GeneScan®软件分析过的 DNA 谱中的指定等位基因名称。1. 打开凝胶图
细胞系的－DNA－STR－谱_细胞团抽提
实验方法原理用 Qiagen®QIAamp®迷你试剂盒从细胞团提取 DNA；抽提到的 DNA 用SGMPlius®扩增，然后用 ABI377 DNA 测序仪进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，用GeneScan®和Genotyper®软件进行分析。实验材料Qiagen®DNA迷你试剂盒试剂、试剂盒无水乙醇磷酸缓
细胞系的－DNA－STR－谱_用SGM－Plus®进行扩增
实验材料SGM Plus® PCR 混合物的各种成分试剂、试剂盒纯无菌水仪器、耗材热循环仪实验步骤1. 参照 ABI 的操作步骤，为待扩增样品准备足量的混合物，每个样品管包含：(a) AMPF/STR®PCR 反应混合物 21 μl(b) AMPF/STR®SGM Plus®引物一套 11 μl(c
细胞系的－DNA－STR－谱_利用ABI377DNA测序仪进行凝胶电泳
试剂、试剂盒TEMEDSGM Plus®凝胶上样混合液仪器、耗材ABI377 DNA 测序仪制胶材料凝胶装置材料冰或者电制冷板热循环仪凝胶板和凝胶盒缓冲液梢热传导板实验步骤1. 在烧杯中混合以下各成分，制备 4 % 聚丙烯酰胺凝胶（制胶材料：量筒、天平、过滤器（如 Sartolab 150 ml 滤
如何根据－STR－数据判断细胞系的身份？
收到细胞系鉴定结果以及 STR 信息，可以与参考数据库进行比对。如果细胞样本的每个 STR 位点和参考细胞 STR 位点都能重合匹配，即说明该细胞系正确，反之则说明你的细胞系可能被错误标记，交叉污染或发生遗传不稳定。一般说来，匹配度≥80%即可认为该细胞系正确，匹配度＜80%则说明该细胞系的来源需要
尚恩答疑－|－细胞系STR鉴定原理及结果解读
1. 匹配度大于多少时，可认为待测细胞系与标准细胞系具有相关性？匹配度大于80%（EV值大于0.8）时，可认为待测细胞系与标准细胞系具有相关性2. 某个小鼠细胞鉴定匹配到另一个小鼠细胞，一定是错误细胞系吗？不一定。首先去数据库确认该细胞系有没有公开的位点数据，如果有数据，且数据与检测结果匹配不上
为什么STR鉴定对于ATCC细胞系来说很重要
ATCC 成立于 1925 年，是大的生物资源中心，由美国 14 家生化、医学类行业协会组成的理事会负责管理，是一家全球性、非盈利生物标准品资源中心。 进行细胞系STR鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行，这些细胞可能是受赠于其它研究人员,也可能是从细胞库(如美国?ATCC,
细胞系的多位点DNA指纹检测——细胞系－Southern－印迹－DNA－制备
实验方法原理细胞中提取的 DNA 经限制性酶消化，利用 Southern 印迹技术将消化产物固定在尼龙膜上 [ Ausubel et al.，1996，2002 ]，与来自 M 13 噬菌体的标记 DNA 进行杂交。实验材料D-PBSHinfI酶及其缓冲液琼脂糖凝胶5×TBE储存液EDTA二钠盐6×
用细胞系提DNA的方法
细胞鉴别试验的方法有多种,根据检测目标分类包括细胞水平（形态、分类特征）、染色体水平、分子水平（生化、酶学、分子生物学特征）；根据方法学分类,包括细胞遗传学检测,免疫学检测,生物化学检测和分子生物学检测等.目前,常用的细胞鉴别试验方法包括细胞形态学检查、种属特异性抗原的检测、染色体核型分析、同功酶分
什么是细胞STR鉴定？
STR即短串联重复序列（Short Tandem Repeats），也称微卫星DNA（microsatellite DNA），是一段包含1-6bp的重复DNA序列。STR广泛存在于原核动物和真核动物中，人类中也不例外，约占人类基因组的3%。由于其多态性和高突变率，STR在生物学研究中得到了广泛的应用
细胞系错误鉴定：终结的开始（三）
交叉污染检测许多方法已被用来检测交叉污染，包括同工酶分析、核型分析、人类白细胞抗原（HLA）分型，免疫分型和DNA指纹识别。这些方法都可以鉴别出某一种细胞系，但是分辨能力各不一样。然而，这些方法在不同实验室所得到的数据却不尽相同，以致没有任何一种方法可以用来建立一个标准参考数据库。许多实验室利用ST
STR鉴定报告看不懂，希尔博士来解忧
STR是什么意思？ STR（Short Tandem Repeats，短串联重复序列）分析已被国际细胞系鉴定协会（ICLAC：International Cell Line Authentication Committee )、ATCC、NIST（美国国家标准局）等权威机构作为金标准应用于
分析细胞鉴定金标准STR（Short－TandemRepeat）短串联重复...
分析细胞鉴定金标准-STR（Short TandemRepeat）短串联重复序列STR（Short TandemRepeat，短串联重复序列）分析已被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。由于目前使用错误细胞情况非常严重，越来越多的杂志要求在投稿时提供细胞STR分析数据。经常有小伙
细胞系的多位点DNA指纹检测
细胞系 Southern 印迹 DNA 的制备 经标记的 M13 噬菌体 DNA 的制备 杂交 实验方法原理 细胞中提取的 DN
细胞系的多位点DNA指纹检测——杂交
实验方法原理用标记的 M13 mp9 DNA 与 Southern 印迹后的细胞 DNA 杂交，严格冲洗后，通过放射自显影技术，观察与 M13 序列结合的 DNA 片段分布图谱 [ Westneat et al.，1988 ] 。试剂、试剂盒严谨冲洗液预杂交 杂交液20×SSC 储存液实验步骤1.
细胞STR鉴定
细胞STR鉴定应用于生物医学研究领域的哺乳动物细胞被错误鉴定和交叉污染的问题，一直是一个普遍存在的突出问题。据统计，国外实验室有20%左右的细胞株被错误鉴定和交叉污染，NIH和ATCC近两年都对此发出呼吁，要求研究者对细胞进行鉴定。近年来，大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的
什么是STR
STR即短串联重复序列(short tandem repeat, STR)，也叫微卫星(microsatellite) 或简单重复序列(simple sequence repeats)，是由几个(多为2至4个)碱基对作为核心单位，串联重复形成的一类DNA序列，由于核心单位重复数目的变化，构成了STR
str测序原理
微卫星DNA又称短串联重复序列(short tandem repeats， STR) 、简单重复序列(simple sequence repeat， SSR)，指DNA基因组中小于10个核苷酸的简单重复序列，广泛存在于真核基因组中，多数以2～6个碱基为核心单位、串联重复排列的序列。 1974年，S
如何知道细胞系是否发生交叉污染了？
如果存在细胞系之间发生交叉污染，而且鉴定用的细胞可能有两种以上的细胞系时，那么在进行STR位点检测的时候，多个位点会出现两个以上的峰。峰高值表示该等位基因的信号强度，理论上峰值与样本的DNA浓度有直接的关系。因此，存在交叉污染的混合细胞系中，其中一个位点中某些峰会明显高于其他的峰，其中大峰是属于混合
细胞系错误鉴定：终结的开始
2010年5月ATCC SDO（Standards Development Organization）工作组在Nature review cancer杂志上发表了题为《Cell line misidentification：the beginning of the end》前瞻性报道。以下是全文
STR细胞鉴定意义
导读：新买到的细胞，实验室传了几代的细胞，又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞，被污染了么？ 鉴定正确么？用它做研究会影响实验结果么？ 没有经过相应的细胞鉴定，使用了被污染的细胞，经过大量的实验，写出一篇论文，但是结论被推翻，论文被召回，大量的时间、物力和人力被浪费，一切都要从头再来。背景介绍应
STR基因分型应用于细胞鉴定的意义
新买到的细胞，实验室传了几代的细胞，又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞，被污染了么？ 鉴定正确么？用它做研究会影响实验结果么？ 没有经过相应的细胞鉴定，使用了被污染的细胞，经过大量的实验，写出一篇论文，但是结论被推翻，论文被召回，大量的时间、物力和人力被浪费，一切都要从头再来。 背景介绍应用于
STR细胞鉴定意义
导读： 新买到的细胞，实验室传了几代的细胞，又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞，被污染了么？ 鉴定正确么？用它做研究会影响实验结果么？ 没有经过相应的细胞鉴定，使用了被污染的细胞，经过大量的实验，写出一篇论文，但是结论被推翻，论文被召回，大量的时间、物力和人力被浪费，一切都要从头再来。
细胞株STR鉴定(Cell－Line－STR－Authentication)－FAQs－(2)
1.细胞株进行STR鉴定时，进行比对、参考的数据库有哪些？答:国外数据库有ExPASy (Cellosaurus) 、ATCC (American type culture collection) 、DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikrorganismen and Zel
避免与其他细胞类型的组织培养污染
全球生物标准协会（GBSI）进行的在线调查结果证实了许多细胞科学家已经知道的情况。超过一半的受访者--52％ - “从未”对他们实验中使用的细胞系进行认证或其他与物种相关的质量控制测试。根据调查结果，百分之四十四的人从未进行过STR（短串联重复）DNA分析，这是公认的认证标准。虽然受访者更有可能进行
细胞系的多位点DNA指纹检测——经标记的－M13－噬菌体－DNA制备
实验方法原理用随机引物延伸法标记 M13mp9 DNA [ Finberg and Voglstein，1983 ]，并用葡聚糖柱（Sephadex） 纯化。实验材料模板HEPESDTM试剂氧核苷酸牛血清蛋白P-dGTPKlenow 酶试剂、试剂盒DTM试剂OL试剂标记缓冲液洗柱缓冲液仪器、耗材Se
什么是DNA谱带
基因表达谱(gene expression profile)：指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特定细胞或组织在特定状态下的基因表达种类和丰度信息,这样编制成的数据表就称为基因表达谱相同
要求细胞STR鉴定的期刊总结
已开始要求细胞STR鉴定的期刊： BioTechniquesInternational Journal of CancerCancer Discovery (AACR)Journal of Clinical Endocrinology & MetabolismCancer Epidemiology,