CellRes：我国学者开发零样本突变效应预测模型
蛋白质序列上的氨基酸突变可导致蛋白质功能发生变化，并与酶失活、遗传疾病和病毒免疫逃逸等生物过程密切相关。精确预测氨基酸突变效应对指导蛋白质设计改造等下游应用具有显著意义。 通过探索蛋白质适应度景观并识别潜在有利突变，突变效应预测方法能够解决定向进化和理性设计策略面临的诸多挑战，并可缩短时间周期、降低人力成本、避免对拟改造蛋白结构与功能的先验知识依赖等。然而，由于庞大的突变体空间、复杂的氨基酸相互作用和突变上位效应，突变效应预测和涉及数十点突变的蛋白质设计改造仍然困难重重。 2024年7月5日，军事医学研究院生物信息中心王升启、舒文杰研究员团队联合南京医科大学生殖医学与子代健康全国重点实验室张军研究员团队和之江实验室朱世强教授团队，在 Cell Research 期刊发表了题为：Zero-shot prediction of mutation effects with multimodal deep representat......阅读全文
Cell－Res：我国学者开发零样本突变效应预测模型
蛋白质序列上的氨基酸突变可导致蛋白质功能发生变化，并与酶失活、遗传疾病和病毒免疫逃逸等生物过程密切相关。精确预测氨基酸突变效应对指导蛋白质设计改造等下游应用具有显著意义。 通过探索蛋白质适应度景观并识别潜在有利突变，突变效应预测方法能够解决定向进化和理性设计策略面临的诸多挑战，并可缩短时间周期
我国学者开发全新痴呆风险预测模型
中新网上海9月26日电 (孙国根 陈静)中国专家开展多学科交叉联合攻关，利用生物医学大数据与人工智能算法开发了全新的痴呆风险预测模型，并将其命名为UKB-DRP。民众在相关页面输入待测个体的相关信息，就可以获取其五年、十年及更长时间的痴呆发病风险。 该模型是一款可同时对全因痴呆及其主要亚型(阿尔
北大学者最新Cell－Res发现毛色决定关键基因
北京大学生命科学学院，生命科学联合中心罗述金研究组2017年3月10日在《Cell Research》上发表论文，通过全基因组关联分析和生化功能验证，揭示了除了白虎毛色基因SLC45A2以外的另一毛色决定关键基因CORIN。这是该课题组于2013年在《Current Biology》以封面文章发
开发出新型预测模型来预测HIV疗法的效果
艾滋病毒非常可怕，尤其是其自身非常好的自适应性，如果HIV对于某一个靶点药物产生了变异，那么就变相宣布了此疗法的失败。为了尽量降低HIV的防御机制，医生们会使用许多种药物联合的方法来治疗患者，这种方法就可以使得病毒对特定药物耐受之前经历相当长的变异过程。 近日，刊登在国际杂志PLoS Co
我国学者开发精神疾病共病的分层神经认知模型
在国家自然科学基金项目（批准号：T2122005）等资助下，北京大学贾天野教授团队，联合清华大学、复旦大学等单位，在精神疾病共病的神经机制研究方面取得进展。研究成果以“外化与内化行为共病的层级神经认知模型（Hierarchical Neurocognitive Model of External
我国学者以鲸须为样本研制结构逐级复杂的仿生结构模型
近日，中国科学院深圳先进技术研究院（下称深圳先进院）人体组织与器官退行性研究中心在海洋生物材料及仿生研究方面取得新发现和重要进展，为仿生高性能复合材料研发提供新的设计与制备思路，该研究成果以“Lessons from the ocean: whale baleen fracture resist
美开发出预测植物响应干旱影响的模型
一项新的美国地质调查研究表明，植物对干旱的承受力随着所在地形不同表现得差异显著，植物结构和土壤类型都会成为影响其耐旱性的因素。 未来气候模型项目显示，近期在包括美国西南部等世界缺水地区的高温和持续干旱呈现加强趋势。这种温暖和干燥的情况对植物会产生负面影响，也会引起野生动物栖息地和生态系统的退化
新思路！学者使用基础模型化解小样本学习问题
如何让模型算法仅利用“少量、低质量的有标注样本”，就能实现或接近“大量、高质量、有标注数据的样本”所能达到的结果，是小样本学习领域的关键问题。为此，之江实验室前沿基础研究中心博士后邵帅为小样本计算研究提出了新思路。他的思路是，通过利用已有基础模型资源的优势潜力，实现下游任务中小样本测试数据的精准分类
新思路！学者使用基础模型化解小样本学习问题
如何让模型算法仅利用“少量、低质量的有标注样本”，就能实现或接近“大量、高质量、有标注数据的样本”所能达到的结果，是小样本学习领域的关键问题。为此，之江实验室前沿基础研究中心博士后邵帅为小样本计算研究提出了新思路。 他的思路是，通过利用已有基础模型资源的优势潜力，实现下游任务中小样本测试数据的
学者开发出MIST模型解析T细胞功能
暨南大学基础医学与公共卫生学院教授罗钧洪团队基于变分自编码器深度学习框架开发了人工智能模型Multi-Insight for T cell（MIST），针对scRNA-seq与scTCR-seq数据的联合分析，创新性地构建了跨组学数据深度融合、可解释性和适配性强的分析框架。近日，相关成果发表于《
中国学者Cell－Res揭示新型组蛋白伴侣分子
来自中国医学科学院北京协和医学院、北京生命科学研究所、中科院生物物理研究所的研究人员报告称，他们鉴别出了一个哺乳动物H2A.Z特异性的伴侣蛋白Anp32e。这一研究发现在线发表在3月11日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 北京生命科学研究所的朱冰(Bing Zhu)
能预测碱基编辑效果的新模型开发成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519847.shtm
能预测碱基编辑效果的新模型开发成功
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）动物表观基因组学创新团队研发出一种预测碱基编辑效果的新模型，该模型大幅提升了预测碱基编辑器在基因组内源靶位点编辑效果的准确性。相关研究成果发表在《细胞发现》（Cell Discovery）上。碱基编辑技术是一
－Nature：科学家开发出流感病毒预测模型
流感病毒每年都有新变化，如果能提前预测下一次流感病毒的进化方向，就能提前研制出更有针对性的疫苗。英国新一期《自然》杂志就刊登了这样一项研究成果，一种新的预测模型有望帮助人们预判未来流感病毒的特征。 流感病毒的进化是个复杂的过程，其本质是不同毒株间的相互竞争，目的就是能更有效地感
日本开发出可预测卵巢功能的AI模型
日本东京大学日前发布新闻公报称，该校研究人员参与的团队成功开发出一款可预测卵巢功能的人工智能（AI）模型，能够通过简单的问诊和少量采血数据预测女性卵巢功能，有望为备孕和不孕症治疗提供支持。 卵巢功能低下是导致不孕症的重要原因之一，目前广泛使用抗缪勒管激素检查来评估女性卵巢储备功能、反映剩余卵泡数量
著名学者朱健康教授Cell－Res解析重要植物信号机制
来自中国科学院上海生命科学研究院、普渡大学的研究人员在新研究中揭示了，ABA受体蛋白家族中的一个差异性成员：PYL13在ABA和应激信号中独特的作用模式。相关论文发表在11月5日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 文章的通讯作者是中科院上海生命科学研究院的朱健康(Ji
中国学者Cell－Res揭示miRNA在血液发生中的作用
造血干细胞是一群维持生命体正常生理功能所必须的多能造血祖细胞，可以产生各种成熟的血细胞包括红系、髓系和淋系细胞等。以往的研究主要集中在信号通路和转录因子的调控作用，而关于表观遗传学因素，例如microRNA，在血液发生中的作用研究较少。 中科院动物研究所刘峰研究员领导的血液与心血管发育研究
中科院学者Cell－Res获CRISPR/Cas9－技术重要进展
来自中科院神经科学研究所，苏州非人灵长类研究平台等处的研究人员发表了题为“Homology-mediated end joining-based targeted integration using CRISPR/Cas9”的文章，设计了一种以同源臂介导的末端接合（Homology-Mediat
Cell－Systems：构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示，人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控，其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法
研究背景 随着计算生物学的快速发展，我们正处于一个由数据驱动的生物信息学新时代。蛋白质，作为生命活动的执行者，其结构和功能预测一直是科学研究的核心问题。近年来，深度学习技术的突破性进展，尤其是蛋白质语言模型的兴起，为研究者们提供了一个全新的视角来了解蛋白质在生命体内所扮演的角色。 蛋白质语言
清华大学王栋－鲁志Cell－Res发文揭示肿瘤转移新模型
肿瘤转移是指肿瘤细胞从原发部位向渐进定植的远处器官移动，是导致肿瘤病人死亡的主要原因。据统计，大约有90%的肿瘤病人死于转移。转移过程中，癌细胞从原位组织浸出扩散，定殖于与原位组织不同的远端组织。 一百多年前，英国的外科医生Stephan Paget提出了关于肿瘤转移的“种子与土壤”学说，即转
研究人员开发出稀土矿电驱开采预测模型
近日，中国科学院广州地球化学研究所研究员朱建喜团队，针对离子吸附型稀土矿开发出电驱开采回收预测模型。团队通过设计响应面实验模拟电驱开采过程，从离子传输动力学与电荷量生成机制角度，系统阐明了稀土离子在风化壳中的电动回收过程。相关成果发表于《应用物理快报》（Applied Physics Letters
我国学者提出超临界磁压热效应
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/509881.shtm近日，中国科学院大学教授苏刚团队与合作者利用自己发展的精确高效有限温度张量重正化群方法，完整给出了Shastry-Sutherland晶格量子磁性模型的压力—温度相图，发现该相图与水
学者开发新模型：用“生物年龄”筛查血栓风险
近日，中山大学孙逸仙纪念医院心血管外科教授黄楷团队联合国际生物数据库，创新地开发了一个基于“生物衰老率”的新型血栓风险识别模型——VTE PhenoAgeAccel，为血栓高危人群超早期识别高危血栓提供了更精准的策略。相关成果发表于《美国血液病学杂志》（American Journal of Hem
我国学者发现新型寨卡病毒突变
5月18日《自然》发表的一篇论文称，研究人员发现了一种寨卡病毒突变，寨卡病毒在近来的疫情中传播速度较快，可能源于这种突变。在此前已知的一种会影响蚊子感染黄病毒（黄病毒包括寨卡病毒和登革热病毒等）的蛋白质里，研究人员发现了所述突变。 寨卡病毒是一种通过伊蚊属蚊子传播给人类的虫媒病毒，在法属波利尼
我国学者提出用好大语言模型实用策略
中新网合肥5月10日电 (记者 吴兰)当前，大语言模型的应用日益广泛，覆盖从文本生成到复杂问题解决等多个领域，如何更好利用AI工具？记者10日从中国科学技术大学获悉，该校心理学系林志成特任研究员近日在其评论文章中研究提出一项实用策略，帮助更好理解和利用先进的人工智能工具，有效发挥人工智能模型交互的最
我国学者提出用好大语言模型实用策略
当前，大语言模型的应用日益广泛，覆盖从文本生成到复杂问题解决等多个领域，如何更好利用AI工具？记者10日从中国科学技术大学获悉，该校心理学系林志成特任研究员近日在其评论文章中研究提出一项实用策略，帮助更好理解和利用先进的人工智能工具，有效发挥人工智能模型交互的最大潜力。在《自然人类行为》(Natur
学者提出融合多模态数据的荔枝霜疫霉病预测模型
近日，华南农业大学电子工程学院（人工智能学院）高级实验师陆健强课题组首次提出了融合多模态数据的荔枝霜疫霉病预测模型，为荔枝霜疫霉病的精准预测提供了新的研究思路与方法。相关成果发表于《IEEE物联网期刊》（IEEE Internet of Things Journal）。荔枝是我国南方的重要经济作物，
中科院学者连发两篇Cell－Res文章获CRISPR技术重要突破
基因编辑工具的快速发展令整个生物学研究领域疯狂，目前第三代DNA剪刀的主角是CRISPR，这是一种比其前身更快更便宜的工具。近期来自中科院神经科学研究所的杨辉研究组与多个研究组合作，在Cell Research杂志上发表了多篇文章，获得了CRISPR-Cas9技术的重要突破。 研究组成员通过与
中科院学者Cell－Res建立新型单倍体胚胎干细胞系
单倍体细胞为研究重要的生命科学问题提供了手段，但是，单倍体细胞一般只存在于低等生物中。最近的研究表明，可以从小鼠中建立孤雄或者孤雌的单倍体胚胎干细胞系，从而提出了更具挑战性的问题，即是否能从非人灵长类中获得单倍体的细胞系? 7月16日，国际著名学术期刊Cell Res发表了中国科学院生