有哪些工具或方法可以用于分析ImmuneCellAtlas数据集？
以下是一些可用于分析 Immune Cell Atlas 数据集的工具和方法： 1. **Seurat**：这是一个常用的 R 包，用于单细胞 RNA 测序数据的分析，包括数据预处理、降维、聚类、差异表达分析等。 2. **Scanpy**：Python 中的单细胞分析库，提供了一系列数据分析和可视化的功能。 3. **Monocle**：用于构建单细胞的拟时序轨迹分析。 4. **Cell Ranger**：10x Genomics 平台配套的数据处理工具。 5. **Cytoscape**：用于构建和可视化细胞间相互作用网络。 6. **IPA (Ingenuity Pathway Analysis)**：可进行通路分析和基因调控网络的构建。 7. **GSEA (Gene Set Enrichment Analysis)**：用于基因集富集分......阅读全文
业界首个开源车路协同数据集发布
2月24日，业界首个基于真实场景的车路协同自动驾驶数据集DAIR-V2X正式发布，并面向用户提供下载使用。该数据集由清华大学智能产业研究院（AIR）联合北京市高级别自动驾驶示范区、北京车网科技发展有限公司、百度Apollo、北京智源人工智能研究院共同发布。据了解，此次发布的数据集首次实现在相同时空下
我国蛇类DNA条形码参考数据集发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498440.shtm
mtSC：单细胞类型自动鉴定的新方法
单细胞测序技术有助于刻画细胞层面的异质性，为进一步探索细胞功能和内在作用机制等奠定了基础。在单细胞转录组测序数据的分析过程中，细胞类型鉴定是必须且重要的一步。常规的细胞类型鉴定依赖于细胞类型标记基因，这种方法费时费力且不稳定，可重复性差，易导致不同实验室的鉴定结果不可比较。随着单细胞测序技术的迅
免疫电镜(Immune－electron－microscopy)原理
（一） 原理免疫电镜技术是免疫化学技术与电镜技术结合的产物，是在超微结构水平研究和观察抗原、抗体结合定位的一种方法学。它主要分为两大类：一类是免疫凝集电镜技术，即采用抗原抗体凝集反应后，再经负染色直接在电镜下观察；另一类则是免疫电镜定位技术。该项技术是利用带有特殊标记的抗体与相应抗原相结合，在电子
PIC－Crosslinking－and－Immune－Precipitation
References Fishburn et. al., 2005, Molecular Cell, vol. 18 #3: Experimental Procedures pg. 376Immobilized Template assay (Hahn lab website)NotesDTT mu
免疫电镜(Immune－electron－microscopy)原理
（一） 原理 免疫电镜技术是免疫化学技术与电镜技术结合的产物，是在超微结构水平研究和观察抗原、抗体结合定位的一种方法学。它主要分为两大类：一类是免疫凝集电镜技术，即采用抗原抗体凝集反应后，再经负染色直接在电镜下观察；另一类则是免疫电镜定位技术。该项技术是利用带有特殊标记的抗体与相应抗原相结合，在电
中国第三次冰川编目数据集发布
在2025年3月21日首个“世界冰川日”召开的“第三届全国冰冻圈科学大会”上，中国科学院西北生态环境资源研究院发布了中国第三次冰川编目数据集。西北研究院是我国最早从事冰川研究工作的科研单位，分别于2002年和2014年发布了第一次和第二次中国冰川编目，并公布了针对20世纪后半叶至本世纪初期中国冰川变
迄今全球最长序列泥石流观测数据集发布
近日，中国科学院成都山地灾害与环境研究所发布迄今时间跨度最长、要素最全的泥石流及其环境综合观测数据集。该数据集覆盖1961年至2024年，基于云南东川泥石流国家野外科学观测研究站（中国科学院东川泥石流观测研究站）的长期观测，详细记录了278次泥石流事件，包含17001阵次泥石流运动学参数，并提供了泥
我国第三次冰川编目数据集发布
在3月21日首个“世界冰川日”召开的第三届全国冰冻圈科学大会上，中国科学院西北生态环境资源研究院发布了中国第三次冰川编目数据集。根据第三次中国冰川编目，2020年前后中国最新冰川面积约为4.6万平方千米，冰川总条数约为6.9万条。与第一次中国冰川编目相比，20世纪60年代至2020年间，我国冰川面积
常用的基准单细胞测序数据集有哪些？
以下是一些较为常用的基准单细胞测序数据集：PBMC（外周血单核细胞）数据集：由 10x Genomics 等平台产生，常用于评估免疫细胞的分析方法。小鼠大脑数据集：例如艾伦脑科学研究所发布的相关数据集，有助于研究神经细胞的类型和功能。肿瘤相关数据集：如某些特定癌症类型的单细胞测序数据，可用于评估肿瘤
如何选择适合逻辑斯蒂增长模型的数据集？
选择适合逻辑斯蒂增长模型的数据集时，可以考虑以下几个关键因素：时间序列数据：数据集应包含种群数量随时间的观测值，以捕捉种群的增长趋势。完整的增长阶段：最好涵盖种群从初始增长到接近稳定的整个过程，包括增长初期、加速增长期、减速增长期以及接近环境容纳量的阶段。足够的数据点：要有相对较多的数据点，以充分描
全球生物质燃烧碳排放清单数据集建立
近日，中国科学院空天信息创新研究院遥感与数字地球重点实验室研究员石玉胜团队在全球生物质燃烧排放清单遥感估算领域取得进展。该团队利用风云3D极轨气象卫星火点监测数据，结合多源地基观测和卫星产品反演可燃生物量、燃烧因子和排放因子，量化全球生物质燃烧碳排放量，建立了日尺度高分辨率生物质燃烧碳排放清单数据集
单细胞测序基准数据集的标注方法有哪些？
单细胞测序基准数据集的标注方法主要包括以下几种： 1. 基于已知标志物的标注 - 利用已被广泛认可的特定细胞类型的标志物基因进行标注。例如，某些基因在特定细胞类型中特异性高表达，通过检测这些基因的表达水平来确定细胞类型。 2. 免疫组化或荧光染色验证 - 对组织样本进行免疫组
评估单细胞测序基准数据集质量的方法
评估单细胞测序基准数据集的质量可以从以下几个方面考虑：数据完整性检查基因表达矩阵中是否存在大量缺失值，以及细胞和基因的覆盖范围是否足够全面。测序深度和灵敏度评估每个细胞的平均测序深度，确保能够检测到低丰度的基因表达。细胞质量查看是否有指标用于评估细胞的质量，如线粒体基因比例、核糖体基因比例等，以排除
如何评估单细胞测序基准数据集的质量？
评估单细胞测序基准数据集的质量可以考虑以下几个方面： 1. 数据完整性 - 检查基因表达矩阵中是否存在大量缺失值，以及细胞数量和基因数量是否符合预期。 2. 测序深度和覆盖度 - 评估每个细胞的平均测序深度，确保能够充分捕获基因表达信息。低测序深度可能导致基因表达定量不准确。
小扎夫妇承诺资助1500万美元！改善人类健康和疾病
4月19日，Facebook创始人扎克伯格（Mark Zuckerberg）和妻子普莉希拉•陈（Priscilla Chan）成立的基金会Chan Zuckerberg Initiative（CZI）宣布投入1500万美元，资助85个研究项目，旨在开发支持人类细胞图谱的工具和数据集。Chan Z
Atlas™cDNA表达距阵(Expression－Array)
AtlasTM cDNA表达距阵(Expression Array)同时对588种/1176种关键基因做全景表达图谱分析同时对大量已知基因的表达进行大规模高通量(High-htroughput)分析检测关键基因在细胞关键功能中的角色只需简单的杂交步骤就在数年前，核酸矩阵技术只能在资金雄厚的大实验室开
揭秘早期哺乳动物的发育过程
由于小鼠的易实验性和强遗传性，其一直是生物医学研究中使用广泛的动物模型。但是，胚胎学研究发现，小鼠早期发育的许多方面与其他哺乳动物不同，从而使有关人类发育的推论复杂化。英国剑桥大学等研究团队合作构建了兔发育的形态学和分子图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Cell Biology》，题为
国际首个简牍字符检测与识别数据集正式发布
简牍是中国古代重要记录媒介，因材料脆弱及埋藏环境影响，字符模糊、缺损、布局复杂，人工识别困难。现有文献数字化技术在甲骨文等领域取得突破，但在简牍字符识别方面缺乏高质量数据集，限制了深度学习应用。近日，西北师范大学联合甘肃简牍博物馆推出国际首个面向深度学习任务的简牍字符检测与识别大规模数据集——Dee
药监局发布《疫苗追溯基本数据集》等3项标准
8月26日，国家药监局印发《疫苗追溯基本数据集》《疫苗追溯数据交换基本技术要求》《药品追溯系统基本技术要求》3项信息化标准。加上前期已于2019年4月发布的《药品信息化追溯体系建设导则》《药品追溯码编码要求》2项标准，疫苗信息化追溯体系建设所需的5项标准已经全部发布实施。 统一的标准规范是药品
单细胞测序基准数据集的建立流程是怎样的？
以下是建立单细胞测序基准数据集的一般流程： 1. 研究目标确定 - 明确建立数据集的目的，例如评估特定分析方法、研究特定疾病或细胞类型等。 2. 样本收集 - 从多个来源获取具有代表性的样本，包括不同组织、个体、疾病状态等。遵循伦理和法律规定进行样本采集。 3. 实验设计
单细胞测序基准数据集的使用方法有哪些？
以下是一些常见的单细胞测序基准数据集的使用方法： 1. 方法验证和比较 - 将新开发的分析方法应用于基准数据集，并与已有的成熟方法进行比较，以评估新方法的性能优势和局限性。 2. 算法优化和调参 - 通过在数据集上的多次试验，调整和优化分析算法的参数，以获得最佳的分析结果。
中国湖泊50年数据集发布：－数量面积均有增加
近日，中国科学院青藏高原研究所发布了中国50年湖泊数据集，并揭示了中国6大区域湖泊变化特征与潜在驱动机制，共享了中国过去50多年来大于1平方公里的湖泊变迁数据集。该数据集是目前首次基于历史地形图和超过3831景遥感卫星影像获得的长时间序列湖泊编目数据集，相较现有数据更新、更完整。 湖泊是重要
临床测序重磅成果！300多种肿瘤，突变数据集问世
肿瘤分子分析是精准肿瘤医学的基本组成部分，它能够识别基因以及通路中所发生的变化，这是个性化医疗的关键。不同组织复发性突变的存在，加上分子靶向治疗组合的扩大，这就需要灵活且综合性的方法来分析全癌谱中与临床相关的基因。 5月8日，Nature Medicine杂志在线发表了一篇“大作”，科学家们采
中国长时间序列积雪面积遥感产品数据集发布
积雪面积是研究水文和气候变化的重要因子，也是气候变化的指示器，对地表能量平衡、水体通量、水文过程、大气及其海洋循环等具有显著影响。1978年卫星数据观测表明，北半球积雪持续减少，模型模拟结果表明，温度每升高1℃，北半球积雪面积缩减100-280万平方公里。在全球升温背景下，一套长时间序列的高空间
药监局发布《疫苗追溯基本数据集》等3项标准
8月26日，国家药监局印发《疫苗追溯基本数据集》《疫苗追溯数据交换基本技术要求》《药品追溯系统基本技术要求》3项信息化标准。加上前期已于2019年4月发布的《药品信息化追溯体系建设导则》《药品追溯码编码要求》2项标准，疫苗信息化追溯体系建设所需的5项标准已经全部发布实施。 统一的标准规范是药品
鼎湖山站入选首届优秀共享开放遥感数据集
记者从中国科学院华南植物园获悉，广东鼎湖山森林生态系统国家野外科学观测研究站（以下简称鼎湖山站）于2020年底在《中国科学数据》发表的数据论文“2005–2018年鼎湖山森林生态系统定位研究站气象数据”，近日入选2021年度优秀共享开放遥感数据集优秀数据集奖名单。 据悉，这是鼎湖山站继今年2月2
单细胞测序基准数据集的应用场景有哪些？
单细胞测序基准数据集具有以下应用场景： 1. 算法和工具开发 - 用于测试和优化新的单细胞数据分析算法和工具，例如细胞聚类算法、差异表达基因检测方法、细胞轨迹推断模型等。 2. 性能比较与评估 - 对不同的单细胞测序分析方法和软件进行全面、客观的性能比较和评估，帮助研究人员选
时空稀疏小样本学习大规模神经形态数据集发布
近日，中科院自动化研究所研究员曾毅团队提出了一个用于时空稀疏小样本学习的大规模神经形态数据集——N-Omniglot，为脉冲神经网络的学习与训练提供了一个更具挑战性的基准。相关研究成果发表于自然出版社旗下期刊《科学数据》。 深度学习的成功在很大程度上归功于像ImageNet和COCO这样的数据集的引
对－LAS－数据集－3D－视图使用激光雷达
使用 3D 透视图查看 LAS 数据集是可视化和了解 LAS 数据集引用的激光雷达数据的一种更好的方式。LAS 数据集 3D 视图 窗口允许您将 LAS 数据集视为 ArcMap 中 3D 环境的点或表面。只能通过 ArcMap 中的 LAS 数据集 工具条使用 3D 视图。通过 3D 透视图，可以