施晓冰博士Cell发布表观遗传重要发现

谈到配送,就连联邦快递(Federal Express®)和UPS快递(UPS®)也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统,其影响了人体是否将会形成癌症。 组蛋白,这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员声称来自于他们的研究结果表明了,通过称作为YEATS domain的蛋白质阅读器(protein reader)来操控染色质及其组蛋白的一条可能的新途径。一些蛋白质阅读器附着到组蛋白的“尾巴”上,在基因激活中发挥重要的作用。 MD安德森癌症中心的表观遗传学和分子癌变助理教授施晓冰(Xiaobing Shi)说:“我们的研究结果表明了作为癌症治疗的潜在靶点YEATS domains的重要性。我们确定了YEATS是一种新型的组蛋白乙酰化‘阅读器’。” 施晓冰的研究结果发表在本月出版的《细胞》(Cel......阅读全文

染色质蛋白非组蛋白的介绍

  非组蛋白主要是指与特异DNA序列相结合的蛋白质,所以又称序列特异性DNA结合蛋白(sequence specific DNA binding protein)。利用凝胶延滞实验(gel retardation assay),可以在细胞抽提物中进行检测。首先制备一段带有放射性标记的已知特异序列的D

染色质蛋白组蛋白的相关介绍

  组蛋白是构成真核生物染色体的基本结构蛋白,富含带正电荷的Arg和Lys等碱性氨基酸,等电点一般在pH10.0以上,属碱性蛋白质,可以和酸性的DNA紧密结合,而且一般不要求特殊的核苷酸序列。  用聚丙烯酰胺凝胶电泳可以区分5种不同的组蛋白:H1、H2A、H2B、H3和H4。几乎所有真核细胞都含有这

简述染色质蛋白非组蛋白的特性

  ①酸碱性:组蛋白是碱性的,而非组蛋白则大多是酸性的。  ②多样性:非组蛋白占染色质蛋白的60%~70%,不同组织细胞中其种类和数量都不相同,代谢周转快。包括多种参与核酸代谢与修饰的酶类如DNA聚合酶和RNA聚合酶、HGM蛋白(high mobility group protein)、染色体支架蛋

染色质非组蛋白锌指模式简介

  负责 5S RNA、tRNA 和部分 snRNA 基因转录的RNA聚合酶Ⅲ所必须的转录因子。TFⅢ A 是首先被发现的锌指蛋白,由344个氨基酸组成。TFⅢ A 含有9个有规律的锌指重复单位,每个单位30个氨基酸残基,其中一对半胱氨酸和一对组氨酸与Zn2+形成配位键。每个锌指单位是一个DNA结合

染色质非组蛋白HMG框结构模式

  在发现一组丰富的高速泳动族蛋白(high mobility group protein)以后,首先命名HMG框结构模式。该结构由3个α螺旋组成 boomerang-shaped 结构模式,具有弯曲DNA的能力。因此,具有HMG框结构的转录因子又称为“构件因子(architectural fact

JBC:染色质重塑与癌症

  染色质的结构变化又称为染色质重塑(Chromatin remodeling),染色质重塑调节着基因转录、DNA修复、程序性细胞死亡等多种细胞基础过程。Stowers医学研究所的科学家们在前期研究的基础上深入解析了染色质重构的调控机制。   Stowers 研究所的研究人员进行了一系列生化实

染色质非组蛋白螺旋环螺旋结构模式

  HLH这一结构模式广泛存在于动、植物DNA结合蛋白中。HLH由40~50个氨基酸组成两个两性α螺旋,两个α螺旋中间被一个或几个β转角组成的环区所分开。每个α螺旋由15~16个氨基酸残基组成,并含有几个保守的氨基酸残基。具有疏水面和亲水面的两性α螺旋有助于二聚体的形成。α螺旋邻近的肽链 N 端也有

染色质非组蛋白亮氨酸拉链模式

  在构建转录复合物过程中,普遍涉及蛋白与蛋白之间的相互作用,形成二聚体是识别特异DNA序列蛋白的相互作用的共同原则,亮氨酸拉链就是富含Leu残基的一段氨基酸序列所组成的二聚化结构。这类序列特异性DNA结合蛋白家族,包括酵母的转录激活因子(GCN4)、癌蛋白Jun、Fos、Myc以及增强子结合蛋白(

染色质蛋白非组蛋白α螺旋转角α螺旋模式介绍

  这是最早在原核基因的激活蛋白和阻抑物中发现的。迄今已经在百种以上原核细胞和真核生物中发现这种最简单、最普遍的DNA结合蛋白的结构模式。这种蛋白与DNA结合时,形成对称的同型二聚体(symmetric homodimer)结构模式。构成同型二聚体的每个单体由20个氨基酸的小肽组成α螺旋-转角-α螺

Polycomb组蛋白与染色质相互作用的关键机制

  2021年6月,Genome Research杂志在线发表了法国巴黎萨克雷大学植物科学研究所Moussa Benhamed教授为通讯作者题为“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen

染色质基因分析可识别癌症起源

近日,美国杰克逊实验室(JAX)的研究人员开发出一种新方法,通过对开放染色质进行全基因组分析,来确定导致既定类型白血病的细胞类型。这一方法对白血病的诊疗具有重要作用。相关研究发表在《自然—通讯》杂志上。 每种癌症都始于一个单细胞的异变。知道了癌细胞的起源细胞,研究人员就可以分析出癌症的亚型

Science:组蛋白单点突变可导致罕见儿童癌症

  近日,国际学术期刊Science发表了一项最新研究进展,他们发现一种组蛋白编码基因发生缺陷与儿童恶性肿瘤的发生有关。来自美国威斯康星麦迪逊大学的Peter W. Lewis表示,大多数癌症的发生需要多个突变的共同作用,而他们发现的这个基因突变本身就足以导致形成肿瘤。  组蛋白除了用于形成核小体,

清华大学、德克萨斯大学Cell联合发布表观遗传重要发现

  谈到配送,就连联邦快递(Federal Express®)和UPS快递(UPS®)也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统,其影响了人体是否将会形成癌症。  组蛋白,这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自清华

施晓冰博士Cell发布表观遗传重要发现

  谈到配送,就连联邦快递(Federal Express®)和UPS快递(UPS®)也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统,其影响了人体是否将会形成癌症。  组蛋白,这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自德克

组蛋白分子伴侣DAXX和染色质重塑蛋白ATRX相互作用模式

  近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈勇研究组的最新研究成果,以Structural basis for DAXX interaction with ATRX为题,发表在Protein & Cell上,该成果揭示了组蛋白分子伴侣DAXX蛋白与染色质重塑蛋白ATRX相互作用

染色质,解锁癌症表观遗传学的钥匙

  表观遗传学指基因序列不变化的前提下,基因表达发生了可遗传的变化,包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色质改型调控基因表达的过程,涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。  众多研究已经证明,染色体畸变和染色质异

Genes-Dev解析致癌组蛋白突变引发癌症的分子机制

  来自清华大学医学院李海涛教授课题组7月31日在《基因与发育》(Genes&Development)杂志上发表了题为《Molecular basis for oncohistone H3 recognition by SETD2 methyltransferase》(甲基转移酶SETD2识别致癌组

《自然》揭示DNA损伤应答过程中染色质松散新机制

  4月16日,深圳大学医学部基础医学院、卡尔森国际肿瘤中心教授朱卫国团队在《自然》杂志在线发表最新研究。他们揭示了连接组蛋白H1脱酰胺化修饰促进染色质开放和DNA损伤修复的机制,为肿瘤放化疗的精准靶标设计夯实了理论基础,是肿瘤防治基础研究领域取得的突破性进展。  癌症现已成为世界范围内死亡的主要原

《自然》揭示DNA损伤应答过程中染色质松散新机制

  4月16日,深圳大学医学部基础医学院、卡尔森国际肿瘤中心教授朱卫国团队在《自然》杂志在线发表最新研究。他们揭示了连接组蛋白H1脱酰胺化修饰促进染色质开放和DNA损伤修复的机制,为肿瘤放化疗的精准靶标设计夯实了理论基础,是肿瘤防治基础研究领域取得的突破性进展。  癌症现已成为世界范围内死亡的主要原

组蛋白H3K36M突变促癌机制中的关键因素

  PNAS | 路超团队等揭示组蛋白H3K36M突变促癌机制中的关键因素  染色质异常调控导致癌症发生的机制是当前的研究热点之一。随着近些年来TCGA等大规模肿瘤基因组测序计划的开展,关键染色质调控基因在各类癌症中均发现有频繁突变。然而令研究者意外的是,在几种儿童癌症中发现了大量组蛋白突变的迹象【

Science揭示癌症表观遗传新机制

   在细胞核中,染色体DNA与称作为组蛋白的结构蛋白紧密结合,生物学家们把这种DNA—蛋白质混合物叫做染色质。直到大约20年前,组蛋白都被视作是核“伙伴”,是DNA链环绕的包装物质。而近年来,生物学家们大大增进了对DNA/组蛋白互作支配基因表达机制的理解。  2012年,来自多个研究机构的研究人员

microRNA的肿瘤抑制因子角色

美国南加州大学的研究人员报道说,一种新的方法通过活化癌细胞基因组中保护性的microRNA的表达,从而使致癌基因的表达水平显著降低。这篇发表在6月的Cancer Cell杂志上的文章证明已知能调节基因表达的制剂还能够影响调节性的RNA。这种调节性的RNA即为microRNA,它能充当正常细胞中的肿瘤

PTMab直播预告-|-组蛋白新型酰化修饰ChIP介绍

基因组信息以染色质的形式存储在细胞核中,147bp DNA 缠绕组蛋白八聚体形成染色质最小单元核小体。核心组蛋白的柔性 N 末端以及球状核心结构域存在大量共价修饰,如乙酰化、甲基化和磷酸化等。组蛋白赖氨酸乙酰化中和了赖氨酸的正电荷,削弱了组蛋白和DNA的相互作用,从而形成更开放的染色质状态,更高的D

北京大学Cell子刊探究明星抑癌基因新功能

  来自北京大学、康奈尔大学Weill医学院的研究人员在新研究中证实,PTEN通过与组蛋白H1相互作用控制了染色质凝聚,这一研究发现发表在9月4日的《Cell Reports》杂志上。  北京大学基础医学院的尹玉新(Yuxin Yin)教授以及康奈尔大学Weill医学院的Wen H. Shen是这篇

朱冰:表观遗传学过去,现在,未来

  由北京生命科学研究所朱冰研究组领衔完成的Science研究论文,揭示出染色质的紧密程度能调节组蛋白H3K27甲基化酶复合体PRC2的催化活性,从而影响基因转录,这有助于解析基因转录调控以及基因沉默的重要机制。为了更深入追踪这项研究的具体内容,生物通特联系了朱冰研究员,就几个方面请教了他。   

李海涛教授携手华人科学家发表表观遗传重要成果

  来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心、清华大学生命科学学院的研究人员在新研究中证实了,ZMYND11是组蛋白变异体H3.3特异性的H3K36me3“阅读器”蛋白,其将组蛋白变体介导的转录延伸控制与肿瘤抑制关联起来。这一重要研究发现在线发表在3月2日的《自然》(Nature)杂志上。   清华大学

清华Nature子刊发表表观遗传学新成果

  生物通报道:高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。通过“读取”模块识别组蛋白共价修饰是表观遗传学调控的一个主要机制。  最近人们发现了多种组蛋白赖氨酸酰化,比如巴豆酰化(Kcr)、丁酰化(Kbu

Nature子刊;阐析细胞记忆背后的秘密

  我们的细胞总是在不断地分裂从而维持身体的功能。在每次细胞分裂时,我们的DNA密码、染色质以及染色质结构都必须进行忠实地复制以保留细胞关于自身身份的记忆。来自哥本哈根大学生物技术研究及创新中心(BRIC)的研究人员,开发出了一种新技术揭示了这一复制过程的一些动态事件和细胞记忆的秘密。研究结果发表在

新载体大大提升哺乳动物细胞的蛋白产量

  科学家们用细胞系或细菌表达外源蛋白已经有三十多年历史了,这些技术已经在绝大多数实验室得到了普及。然而,像新药开发这样的应用需要大批量的蛋白,现有的表达体系难以胜任。日前研究人员在Nucleic Acids Research杂志上发表文章,展示了一类新型的重组蛋白表达载体。这种载体可以克服表观遗传

Nature揭示基因调控新机制

  由来自新加坡国立癌症中心、法国国家科研中心分子细胞及遗传学研究所等处的科学家们组成的一个研究小组,获得了一项有关基因调控机制的重要研究发现。这项研究发表在1月30日的《自然》(Nature)杂志上。   利用新加坡国立癌症中心炎症生物学实验室Patrick Reilly博士开发的一种转基因