中国科学家NatureGenetics发布重要基因组草图

来自国家人类基因组南方研究中心、新疆医科大学第一附属医院和复旦大学等处的研究人员,成功绘制出了细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)的基因组序列草图。这一研究提供了关于这种寄生虫与宿主的相互作用、养分吸收、节裂(strobilization)、生殖、免疫逃避和成熟机制的一些新认识,并为我们提供了一个平台推动开发出新的有效包虫病治疗和控制干预措施。相关成果发表在9月8日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。 国家人类基因组南方研究中心的陈竺(Zhu Chen)院士和王升跃(Shengyue Wang)研究员,复旦大学的周雁(Yan Zhou)博士,澳大利亚QIMR Berghofer医学研究所的Donald P McManus教授以及新疆医科大学第一附属医院的张文宝(Wenbao Zhang)教授是这篇论文的共同通讯作者。 细粒棘球绦虫属带科、棘球属,是一......阅读全文

PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列

  来自中科院遗传与发育生物学研究所,四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章,对一个籼稻基因组蜀恢498(R498)进行PacBio单分子测序,结合遗传图谱和

我国首例输入性裂谷热病毒全基因组序列测定完成

  记者从国家质量监督检验检疫总局获悉:7月24日凌晨,该局和军事医学科学院微生物流行病研究所联合攻关,获得了我国首例输入性裂谷热病例的病毒全基因组序列。  “测序结果确认了该输入性病例为非洲流行的裂谷热病毒感染所致。”军事医学科学院微生物流行病研究所研究员童贻刚告诉科技日报记者,经测定,该病毒基因

两个菠菜野生种高质量基因组序列发布

近日,国际期刊《新植物学家》(New Phytologist)在线发表了两个高质量的菠菜野生种基因组序列。这项研究由中国农业科学院蔬菜花卉研究所菠菜遗传育种课题组钱伟团队完成,揭示了菠菜的染色体结构,并解析其重要的驯化性状。该研究为进一步利用菠菜野生资源、培育优质菠菜品种具有重要意义。两个菠菜野生种

我国科学家绘制出毛白杨基因组序列框架图

  我国林木基因组学研究取得突破。北京林业大学的科学家们选用百年古树作为测序的样本,利用最新的全基因组鸟枪法测序和拼接策略,绘制完成了毛白杨的基因组序列图谱,标志着毛白杨分子育种进入基因组时代。  在“985”平台建设资金支持下,北林大林木育种国家工程实验室的专家们用短短的6个月完成了这一

我国科学家绘制完成鲤鱼全基因组序列图谱

  鲤科鱼类是我国最重要的水产养殖种类,年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上,其中鲤鱼不仅是我国也是世界性的重要养殖鱼类。5月6日,中国“鲤鱼基因组计划”学术报告会暨新闻发布会在京举行。由中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施

两个菠菜野生种高质量基因组序列发布

近日,国际期刊《新植物学家》(New Phytologist)在线发表了两个高质量的菠菜野生种基因组序列。这项研究由中国农业科学院蔬菜花卉研究所菠菜遗传育种课题组钱伟团队完成,揭示了菠菜的染色体结构,并解析其重要的驯化性状。该研究为进一步利用菠菜野生资源、培育优质菠菜品种具有重要意义。两个菠菜野生种

揭秘口腔细菌Fretibacterium-fastidiosum的完整基因组序列-助力牙周病研究

人类口腔微生物组由多种细菌组成。由于体外培养存在挑战,并非所有口腔细菌都被充分研究。在这项研究中,研究人员报告了一种最近发现的口腔细菌 —— 苛求弗雷特杆菌(Fretibacterium fastidiosum)的完整基因组序列。口腔微生物组包含 700 多种细菌,其中超过三分之一尚未被培养出来。苛

寄生虫感染与寄生虫特点

寄生虫是单细胞或多细胞动物,其生活史相当复杂,它们都具有一定的感染阶段,只有达到感染阶段时医学教育网搜集|整理,始能感染人体。寄生虫侵入宿主,并能在宿主体内寄生、发育而建立感染。寄生虫对人体都是有害的,所引起的疾病称寄生虫病。当然寄生虫危害的程度有轻重不同,主要依据寄生虫和宿主之间相互关系的平衡程度

研究人员发现:霍乱正改变人类基因组

  生命演化到今天,人类似乎已经进入最完美的状态。我们的基因组是否已经稳定?改变是否还在发生?科学家们一直在寻找答案。一项新研究表明,当代人类也在进化,而引发这种进化的,竟然是霍乱。研究人员发现的证据证明:在霍乱流行的孟加拉国,人们的基因已经找到了对抗霍乱的办法。这是发生在当代的人类进化案

研究人员首次破译艾滋病病毒完整基因组

  新华网华盛顿8月6日电 美国北卡罗来纳大学6日报告说,该校的一个科研小组成功破译了艾滋病病毒的完整基因组。这对于人类理解艾滋病病毒感染人体的机制,寻找抗“艾”新疗法提供了有力帮助。   相关论文发表在6日出版的英国《自然》杂志上。研究小组负责人凯文·威克斯介绍说,艾滋病病毒的遗传信息由单链核糖

研究人员发布最新版树鼩基因组注释

  树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物,是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短(约6周),饲养成本低,单胎产仔数较高(每胎2-5只)等特点,在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前,树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建,是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究

研究人员构建人类阴道微生物基因组库

6月21日,深圳市宝安中医院(集团)副院长黄链莎、转化医学中心助理研究员孙文与大连医科大学副教授鄢秋龙等课题组的最新合作成果发表于《自然—微生物学》。人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统,各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖、对立统一的关系,其间的平衡关乎女性生殖健康及胎

两篇Nature子刊发表基因组测序成果为新药开发提供新线索

  科学家们对造成盘尾丝虫病的寄生虫进行基因组测序,揭示了这种寄生虫的活动方式,鉴定了可以被现有药物靶标的蛋白,为新药和疫苗开发提供了线索。这项研究以两篇文章的形式发表在本周的Nature Microbiology杂志上。  据世界卫生组织(WHO)统计,全世界有一千八百万人受到盘尾丝虫病的影响,主

寄生虫演化过程寄生虫检验

从自然生活演化为寄生生活,寄生虫经历了漫长的适应宿主环境的过程。寄生生活使寄生虫对寄生环境的适应性以及寄生虫的形态结构和生理功能发生了变化。(一)对环境适应性的改变在演化过程中,寄生虫长期适应于寄生环境,在不同程度上丧失了独立生活的能力,对于营养和空间依赖性越大的寄生虫,其自生生活的能力就越弱;寄生

Genome-Biology:新技术90分钟完成全基因组序列分析

  美国国家儿童医院(Nationwide Children's Hospital)的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件,表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。  第一个人类基因组测序完成耗时大约13年,耗费30亿美元,而现在技术测序技术的

绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱完成

  绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱已经由中国烟草完成。这是全球第一套烟草全基因组序列图谱,也是继马铃薯和番茄基因组之后全球完成的第三种茄科植物全基因组序列图谱。该绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱是目前已知植物基因组序列图谱中基因组最大、组装精度最高、组装结果最好的2个图谱。绒毛

解析斑鳖的全基因组序列及其适应性进化基础

  斑鳖(Rafetus swinhoei)是目前地球上现存体型最大的鳖类物种,其背甲长度可达1.5米、体重可达115公斤。此外,斑鳖也是全球目前最濒危的龟鳖类物种。在2019年初,全球已经明确记录的斑鳖个体仅仅只有4只。然而,2019年4月13日,我国的雌性个体意外死亡(这也是当时全球唯一确定性别

马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功

中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队,对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装,获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒(T2T)的基因组完成图(DM8.1),并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中,发现了

胡萝卜基因组序列草图绘出-特有基因决定颜色营养价值

  来自美国的一个研究小组称,他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序,绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称,这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程,对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。  胡萝卜和生菜、

一种全新的酶可对抗寄生的基因组TE序列

  科学家们发现了一种名为 PUCH 的酶,它对于阻止寄生 DNA 序列在我们基因组中的传播至关重要。 这一发现可以让我们深入了解我们的身体如何识别和对抗内部威胁(如基因组寄生虫)和外部威胁(如病毒和细菌)。  德国美因茨分子生物学研究所 (IMB) 的 René Ketting 教授团队与奥地利维

瑞丽:此次疫情病毒基因组序列与德尔塔变异株高度同源

  7月7日,记者从瑞丽市新冠肺炎疫情防控新闻发布会(第三场)上获悉,为加快基因测序速度,云南省疾控中心紧急调运一台基因测序设备到瑞丽,设立临时基因测序实验室,并派出专业技术人员对检出的阳性样本进行新冠肺炎基因测序。目前,已完成7份阳性样本测序,结果表明,基因组序列与德尔塔(Delta)变异株高度同

科学家公布恶性疟原虫大批量基因组序列

  近期《自然—遗传学》公布了大量采集的恶性疟原虫的基因测序结果。疟原虫是导致疟疾产生的病因所在,这项研究结果有助我们更好地了解疟原虫为对青篙素这种近期在东南亚流行的抗疟疾首选药物产生抗药性而发生的进化过程。   Dominic Kwiatkowski等人从西非和东南亚的10个地区的825个近

一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列

一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列

揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用

  Cell Research | 沈晓骅/孙育杰课题组合作揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用  哺乳动物基因组DNA全长近2  m,经过多层有序组织与折叠后分布于直径5-10 μm的细胞核中。染色质高级结构对基因表达,细胞分化和胚胎发育起着至关重要的作用。其中,基因组A/B区隔化(A/B c

西北农林科技大学PLOSGenetics发表红枣基因组序列测序结果

高品质的干枣基因组序列,以及从其近缘种树木的基因序列,能够阐明这种人类已经种植超过7000年的古老果树的驯化历史。近期,西北农林科技大学与美国康奈尔大学Boyce Thompson植物研究(BTI)以及北京林业大学的研究人员合作,对中国干枣进行了基因组测序,相关结果发表在12月22日的《PLOS G

Nature:深入解析绦虫基因组

  第一次研究人员绘制出了绦虫(tapeworm)的基因组图谱,揭示出了一些现有药物可能发挥作用的潜在药物靶点。这一基因组为我们提供了一个新的资源,为开发出针对这些致人衰弱的疾病急需的有效治疗提供了更快捷的途径。这一研究发表在《自然》(Nature)杂志上。   在世界卫生组织标注的17种遭受忽视

寄生虫可能会“盗用”宿主基因控制宿主思维

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511479.shtm成年马毛虫的外观如同面条一样,看起来像摆动的马毛。它们在水中生活和繁殖,其后代只能在其他动物体内发育,通常是陆生昆虫,如螳螂。一旦它们在宿主中完成生长,马毛虫必须说服宿主淹死自己,以

日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱

  据日本共同社报道,日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。  DNA一共有4种碱基排列组合,人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片,对大量切片同时

安捷伦授予临床基因组研究人员Peter-Robinson“思想领袖奖”

  分析测试百科网讯 2016年11月29日,安捷伦科技宣布将安捷伦思想领袖奖授予给Peter Robinson, M.D., MSC,以表彰其对临床基因组学和计算生物学的贡献。在今年早些时候,中国中医科学院中药研究所所长陈士林(详见本网报道:中药研究所所长陈士林获得“安捷伦思想领袖奖”)和癌症研究