武汉病毒所基因组内16SrRNA基因差异性研究获进展
近期，中科院武汉病毒研究所周宁一研究员课题组在基因组内16S rRNA基因的差异性而导致的原核生物多样性高估研究方面取得重要进展。相关结果发表在10月的微生物学刊物Applied and Environmental Microbiology上，并被本期杂志选为亮点文章(Spotlight: Articles of Significant Interest Selected from This Issue by the Editors)。 自从Carl Woese应用16S rRNA基因来确定原核生物的亲缘关系，这个方法已成为原核生物系统发育和分子生态学研究中公认的经典标准。然而，该基因在原核生物内往往同时存在多个拷贝，而且拷贝之间的基因序列并不完全一致。因此，在原核生物生态学研究中，基于16S rRNA基因的菌群多样性分析会引起一定程度的高估。该组从目前2013个测序的原核生物基因组中，对16S ......阅读全文
武汉病毒所基因组内16S－rRNA基因差异性研究获进展
近期，中科院武汉病毒研究所周宁一研究员课题组在基因组内16S rRNA基因的差异性而导致的原核生物多样性高估研究方面取得重要进展。相关结果发表在10月的微生物学刊物Applied and Environmental Microbiology上，并被本期杂志选为亮点文章(Spotlight
青岛能源所等提出微生物组功能校正算法MetaApo
基于元基因组测序的微生物组功能分析和比较，在疾病诊断、生态监控、生物安全等领域具有应用价值，而高昂的成本限制了其更广泛应用。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心开发出微生物组功能校正算法Meta-Apo（Metagenomic Apochromat），为大规模的菌群功能比较提供
新型厌氧甲烷氧化细菌
中国科学院亚热带农业生态研究所研究员朱宝利和德国及瑞士的科研人员合作，在前期发现的基础上，基于微生物组学分析和代谢通路重建，从富含碘泉水的山洞内生物被膜（biofilm）宏基因组中，组装了一株新型厌氧甲烷氧化细菌——Candidatus Methylomirabilis iodofontis的基因组
分子生物学技术在微生物检验中的应用
分子生物学技术的迅速发展，拓展了微生物学检验方面的应用空间。该技术具有敏感、特异、安全和快速等特点，在微生物检验中发挥着日益重要的作用。本节简要介绍分子生物学技术在微生物检验中的应用，具体检测方法参见有关专著或试剂盒说明书。一、分子生物学技术在细菌分类中的应用细菌的传统分类法和数值分类法以表型特征相
细胞化学词汇核糖体小RNA
中文名称：核糖体小RNA英文名称：small ribosomal RNA定 义：(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA，除18S和16S rRNA，还包括5S和5.8S rRNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核
细胞化学词汇核糖体小RNA
中文名称：核糖体小RNA英文名称：small ribosomal RNA定 义：(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA，除18S和16S rRNA，还包括5S和5.8S rRNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核
细胞化学词汇核糖体小RNA
中文名称：核糖体小RNA英文名称：small ribosomal RNA定 义：(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA，除18S和16S rRNA，还包括5S和5.8S rRNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核
什么是核糖体小RNA？
中文名称核糖体小RNA英文名称small ribosomal RNA定 义(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA，除18S和16S rRNA，还包括5S和5.8S rRNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因
核糖体小RNA的概念和结构
中文名称核糖体小RNA英文名称small ribosomal RNA定 义(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA，除18S和16S rRNA，还包括5S和5.8S rRNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因
菌种检定16S－rDNA测序技术介绍
一、简介微生物鉴定是指借助现有的分类系统，通过对未知微生物的特征测定，对其进行细菌、酵母菌和霉菌大类的区分，或属、种及菌株水平确定的过程，它是药品微生物检验中的重要环节。菌种鉴定的常规手段包括形态学观察、生理生化特性鉴定和分子生物学鉴定等，而通过分子生物学的方法进行菌种鉴定不受生长培养基或分离物活性
rRNA的组成
rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起，形成核糖体（ribosome），如果把rRNA从核糖体上除掉，核糖体的结构就会发生塌陷。原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为沉降系数（sedimentation coefficient），当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时，此速度与粒
454用于人类微生物菌落项目
最近在Nature1及其他刊物中发表了多篇与人类微生物菌落项目(Human Microbiome Project)有关的文献，该项目已历时5年旨在发现人体不同部位的微生物菌落特征。而最近的这些文献的发表只是该项目大量数据的初步分析结果，随之而来的将是从更多分析方法角度带来的新的思路
影响土壤细菌的因素有哪些？
有研究表明，长期施肥会显著影响土壤细菌。稻田土壤是"迷失碳"的重要吸纳场所之一，也是温室气体（CH4和N2O等）的重要排放源。大气温室气体的动态变化与土壤碳氮转化的微生物过程紧密相关。以湖南桃江国家级稻田肥力变化长期定位试验点为平台。采用PCR-克隆测序和实时荧光定量PCR技术。研究不施肥（CK
真核基因组的中度重复顺序—rRNA基因的基本介绍
在原核生物如大肠杆菌基因组中，rRNA基因一共是七套；在真核生物中rRNA基因的重复次数更多。在真核生物基因组中18S和28S,rRNA基因是在同一转录单位中，低等的真核生物如酵母中，5SrRNA也和18S,28SrRNA在同一转录单位中；而在高等生物中，5SrRNA是单独转录的，而且其在基因组
核糖体RNA的组成
rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起，形成核糖体（ribosome），如果把rRNA从核糖体上除掉，核糖体的结构就会发生塌陷。原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为沉降系数（sedimentation coefficient），当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时，此速度与粒
核糖体RNA的组成
rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起，形成核糖体（ribosome），如果把rRNA从核糖体上除掉，核糖体的结构就会发生塌陷。原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为沉降系数（sedimentation coefficient），当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时，此速度与粒
核糖体RNA的组成
rRNA一般与 核糖体蛋白质结合在一起，形成 核糖体（ribosome），如果把rRNA从核糖体上除掉，核糖体的结构就会发生塌陷。 原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为 沉降系数（sedimentation coefficient），当用 超速离心测定一个粒子的沉淀速度
关于核糖体RNA的组成的介绍
rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起，形成核糖体（ribosome），如果把rRNA从核糖体上除掉，核糖体的结构就会发生塌陷。原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为沉降系数（sedimentation coefficient），当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时，此速度
rRNA的功能介绍
rRNA与多种蛋白质分子共同构成核蛋白体。核蛋白体相当于“装配机”，能促使tRNA所携带的氨基酰基缩合成肽。核蛋白体附着在mRNA上，并沿着mRNA长链的起始信号向终止信号移动。至于rRNA在蛋白质生物合成中的具体作用还不清楚。
rRNA转录加工过程
主要加工方式是切断。真核细胞的rRNA基因（rDNA）属于一种被称为丰富基因（redundant gene）族的DNA的序列，即染色体上一些相似或完全一样的纵列串联基因（tandem gene）单位的重复。由不能转录的间隔区（spacer）把这些单位分隔开。在这里，间隔区与内含子是不同的概念。在分类
rRNA的功能特点
rRNA与多种蛋白质分子共同构成核蛋白体。核蛋白体相当于“装配机”，能促使tRNA所携带的氨基酰基缩合成肽。核蛋白体附着在mRNA上，并沿着mRNA长链的起始信号向终止信号移动。至于rRNA在蛋白质生物合成中的具体作用还不清楚。
核糖体RNA的组成及结构
组成 rRNA一般与 核糖体蛋白质结合在一起，形成 核糖体（ribosome），如果把rRNA从核糖体上除掉，核糖体的结构就会发生塌陷。 原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为 沉降系数（sedimentation coefficient），当用 超速离心测定一个粒子的
当宏基因组遇上单细胞测序
日前，科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性，但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上，研究者人员向人们展示了在四个温泉样本
Techniques:培养、鉴定、和16s测序
微生物识别和诊断的分子技术 依赖培养的方法太慢，于是可以使用一些分子信号，如核苷酸、蛋白质、代谢化合物。 16s rRNA gene PCR在诊断微生物方面广泛使用。PCR-based 方法更为敏感和定量化： 1.qPCR：对扩增进行定量。扩增时在特定的靶向探针上加上荧光染料，裂解后造成荧
SD序列的作用
SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合，小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后，就指示了下游的AUG，即是蛋白质合成的起始密码子。
简述SD序列的作用
SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合,小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白质合成的起始密码子。
纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
发酵产氢菌株与混合培养系统种群生态研究
近年来基于乙醇型发酵制氢工艺和理论,开展了大量以提高该工艺的产氢效率、完善工程控制对策、实现工业化生产为最终目的的理论和应用研究。筛选出若干株产乙醇杆菌,获得了大量工程控制数据,研究取得了很大的进展。但是乙醇型发酵制氢工艺的工程控制对策还有待完善,产氢效率还有待进一步提高。尤其是混合菌种乙醇型发酵产
高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用（二）
二、肠道菌群与疾病发生之间的关联1. Gut Microbiota in Human Adults with Type 2 Diabetes Differs from Non-Diabetic Adults——2010《PLoS One》以往文献报道肠道菌群与人类代谢疾病之间存在着某种关联，为了研
科学家采用PCR快速筛选法分离肉制品中的肠球菌
据sciencedirect数据库消息，2013年4月《国际食品微生物杂志》刊登一项采用PCR快速筛选法分离肉与发酵肉制品中肠球菌的研究，研究人员利用此法成功分离出了29个肠球菌菌株。 肠球菌主要存在于人和动物的胃肠道中，也广泛分布在土壤、水和食物中。食品中的存在肠球菌往往会导致