基因组所完成开发RiceWiki数据库

近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重要的粮食作物之一,同时也是研究农作物及其他相关植物的重要模式生物。因此,水稻成为第一个全基因组测序的农作物。随着水稻基因组学和转录组学研究的深入,先后出现了BGI-RIS,TIGR,RAP-DB和RGKbase等专业数据库。这些数据库多是依赖专业人员的编辑更新,不仅费时费力,而且成本也逐渐增加,导致其更新速度远远落后于水稻数据的指数增长。RiceWiki数据库的优势在于汇集整个水稻研究领域的科研人员的智慧和力量,共同完善水稻基因的相关信息和数据更新,以期构建一部水稻基因的百科全书。 目前,RiceWiki已经整合了两个水稻栽培亚......阅读全文

我国首个寻亲DNA数据库在京建立

   科技日报消息,我国第一个专门面向失散人员的寻亲DNA数据库日前在京宣告建立。据数据库建设方中科院北京华大方瑞司法物证鉴定中心的有关负责人介绍,通过该库,寻亲工作将变得方便快捷。同时,该库将免费为我国失散人群提供寻亲帮助,包括港澳台地区。     据悉,该库的第一批样本检测用试剂已经得到了美国

全球首个冰川微生物数据库

青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的

代谢组学常使用的数据库

  代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。  目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD

全球最大自闭症数据库上线

  总部位于美国纽约的Simons基金会日前宣布,全球最大的自闭症数据库(SSC)正式上线并向全球科学家开放。目前已有来自美国、加拿大、中国、法国、冰岛、澳大利亚、爱尔兰、巴西和卡塔尔等17国家相关机构的自闭症研究人员,通过云端查询等方式使用了这一数据库。  SSC包含近2600个家庭的基因组序列数

TPC:中国数据库性能破世界纪录

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497431.shtm

武汉将建温室气体排放因子数据库

  武汉碳减排协会今天发布消息称,作为国家确定的7个碳排放权交易试点之一的武汉碳交易系统今年内将全面上线。   武汉碳减排协会会长程致舜说,交易系统技术层面的准备已经完成,不同物品在各环节的碳排放量都可以清楚地查询到。   据介绍,根据与法国波尔多市签署的友城合作协议,一个中法温室气体排放试点评

学术数据库免费时代何时来临

  “北大买不起知网,研究者看不起论文”,逐年上涨的论文数据库使用费令学术界叫苦不迭。26日是第16个世界知识产权日,让我们探讨一下如何在保护知识产权的同时,解决商业数据库“坐地起价”之怪现状。  学术资源的“商业化”  本月初,北京大学官网发布了通知,称因中国数据库商涨价过高,图书馆将停用“中国知

全球首个活人脑细胞数据库公布

  据美国《科学》杂志在线版29日消息称,艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库,该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上,这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源,同时以前所未有的独特性,帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。  2002年,微软公司共同创始人之一保罗·艾

英政府设数据库保留无罪者DNA

  据《自然》网站报道,今年早些时候,英国政府曾计划将无罪的普通人的DNA保留在其大型公安数据库中,一时间引起舆论纷纷。欧洲人权法庭后来裁决,无罪者的DNA不应该被保留。   近日据英国媒体报道,从一些泄露出来的电子邮件得知,英国政府仍然决定保留无罪者的DNA,但时间不是之前所称的12年,而是6年

欧盟酒精饮料地理标志进入公共数据库

  欧委会官网7月26日消息。公共数据库“eAmbrosia -欧盟地理标志注册”于2019年4月推出,现包含了在欧盟注册的烈酒地理标志(GIs)。可获取信息包括烈酒地理标志的应用、发布或注册状态,以及它们受到官方保护的法律依据。eAmbrosia的设计目标是成为欧盟地理标志(EU GIs)的一站式

中国盐湖资源与环境科学数据库建成

  9日,中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收,这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。  盐湖资源是中国西部地区特色资源之一,也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源,其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源成分关系国家的资源安全和战略安全,对

法律纠纷延迟大型毒性数据库启动

  研究人员表示,一个包含近万种化学物质的大型健康风险数据库或将让预测此前不存在任何数据的千万种消费化学品的毒性变得更加容易。但相关法律争议却意味着,他们不能像希望的那样公开这一数据库。 一个包含近万种化学物质的药物毒性数据库或能减少动物安全测试的需求。  “这个数据库具有能够挽救数百万动物的潜力

上海有机所推出含氟试剂数据库

  有机氟化合物由于独特的理化和生物性能,在医药、农药、先进材料等领域发挥作用。含氟试剂是发展有机氟化合物合成方法的基础,也是氟化学领域发展的基石。然而,含氟试剂的结构、性质、功能等信息分散于文献中,不便于合成化学家查找和使用。因此,亟需专业平台来全面了解和积累含氟试剂的结构、性质、功能等信息。近日

研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics

  大豆(Glycine max (L.) Merr.)是重要的粮油作物之一,其产量提升、品质改进关乎全球人口的需求和利益。高通量测序技术的发展促使大豆组学研究不断深入。实现大豆多维组学数据的整合分析,将会为大豆遗传育种提供有力支持。  近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组

首个CRISPR/Cas9靶序列数据库

  近期,来自美国国立卫生研究院和瑞典乌普萨拉大学的研究人员,在国际著名学术期刊《Nucleic Acids Research》上发表的一项研究中,首次提出了一个已在斑马鱼中经过实验验证的CRISPR/Cas9靶序列数据库。  CRISPR及CRISPR相关蛋白(Cas9),是在古细菌和细菌中发现的

各种模式生物必需基因在线数据库

Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation

化学键能数据库iBonD在京发布

  3月15日,清华大学基础分子科学中心和南开大学元素有机化学国家重点实验室程津培教授研究组在京发布了国际上首个涵盖全面、数据可靠、使用快捷方便、专业权威的网络版化学键能数据库iBonD1.0版。  键能是化学领域中最基础参数之一,因该参数直接反映出化合物的稳定性以及判断化学反应是否能发生,从而成为

天津工生所举行TotalPatentZL数据库培训

  为提高TotalPatent数据库在科研中的实际使用效果,7月13日,中科院天津工业生物技术研究所信息资源中心特邀LexisNexis北方区培训讲师岳亭为职工和研究生进行TotalPatent数据库培训。   岳亭介绍了TotalPatent数据库的内容、功能及检索方法,从

中国BIGD跻身国际生物组学数据库

  测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及

“中医药临床证据数据库”正式启动

  4月22日,中医药临床证据数据库”启动仪式在杭州举行。国家食品药品监督管理局原副局长任德权、中国工程院院士、天津中医药大学校长张伯礼、李兰娟院士、李幼平教授、牛津大学临床实验中心和流行病学研究中心主任、牛津大学中国项目主任陈铮明教授及出席第二届循证中医药学国际论坛大会的数百名代表共同参与见证。中

全球最大癌症基因数据库发布

  美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。   周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更

上海有机所推出含氟试剂数据库

有机氟化合物由于独特的理化和生物性能,在医药、农药、先进材料等领域发挥作用。含氟试剂是发展有机氟化合物合成方法的基础,也是氟化学领域发展的基石。然而,含氟试剂的结构、性质、功能等信息分散于文献中,不便于合成化学家查找和使用。因此,亟需专业平台来全面了解和积累含氟试剂的结构、性质、功能等信息。近日,中

“中国科学引文数据库”将面向全球推出

中国科学院国家科学图书馆近日与美国汤姆森科技信息集团共同宣布,将联手向全球推出“中国科学引文数据库”(CSCD),该数据库将依托ISI Web of Knowledge平台,让全世界更多的科研人员了解中国的科研发展及动态。 “中国科学引文数据库”由中国科学院历时20年组织研发,作为国内首个引文数据库

我国建成污染源信息数据库

  在召开的“全国污染源普查总结表彰电视电话会议”上,环保部部长周生贤说,首次全国污染源普查进行了规模空前的入户登记、调查核实,全面掌握了我国污染源排放的基本情况,建立了统一的全国污染源信息数据库,完善了环境统计方式方法等。   “普查成果来之不易,需把成果转化好、应用好。”周生贤强

欧盟酒精饮料地理标志进入公共数据库

  欧委会官网7月26日消息。公共数据库“eAmbrosia -欧盟地理标志注册”于2019年4月推出,现包含了在欧盟注册的烈酒地理标志(GIs)。可获取信息包括烈酒地理标志的应用、发布或注册状态,以及它们受到官方保护的法律依据。eAmbrosia的设计目标是成为欧盟地理标志(EU GIs)的一站式

中国盐湖资源与环境科学数据库建成

  9日,中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收,这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。           盐湖资源是中国西部地区特色资源之一,也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源,其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源

研究开发表观组关联分析数据库

  近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核

山西建立国内首家计生科学数据库

  被科学界誉为“试管婴儿之父”的美籍华人科学家张民觉先生研究资料数据库建设项目,近日在山西省人口计生委科学研究所启动。  张民觉是山西岚县人,他一生致力于生殖生理学科研究,是“试管婴儿”技术的奠基者,也是口服避孕药的发明人。张民觉虽身居海外,却时刻关注着祖国计生科学的发展,1991年将其

Science:全球首个活人脑细胞数据库公布

  据美国《科学》杂志在线版29日消息称,艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库,该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上,这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源,同时以前所未有的独特性,帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。  2002年,微软公司共同创始人之一保罗·艾

Nucleic-Acids-Research发布最全面的microRNA数据库

  基因是蛋白质的蓝图,而microRNA可以帮助细胞决定是否要根据这些蓝图制造蛋白。研究者们常常会面临这样的问题:某个与疾病有关的基因受到哪些microRNA的调控?或者,患者体内发现的某种microRNA负责调控什么基因?这些问题的答案,可以帮助医生和研究者们操纵机体中的致病蛋白水平(尤其是癌症