美科学家研发新技术可确定DNA序列源于母亲还是父亲
据物理学家组织网11月4日(北京时间)报道,美国科学家在最新一期的《自然·生物技术》杂志上撰文指出,他们研发出的一项新技术能成功解决DNA 测序领域的一个“疑难杂症”——确定某个特定的遗传序列来自母亲还是父亲。最新研究将有助于科学家们更好地评估基因变异对疾病的影响,加速器官捐赠的匹配过程并帮助科学家们更好地理解人类的迁移模式。 该研究的领导者、加州大学圣地亚哥医学院路德维希癌症研究中心的任兵(音译)表示:“这项名为‘HaploSeq’的技术将帮助医生们更好地评估个人罹患某种疾病的风险,从而为个性化医疗开辟道路。” 任兵说:“现在,花费5000美元、一周时间就能获得个人基因组测序的结果。在并不遥远的未来,每个人的基因组都将被测序,但这个美好的场景中也有不和谐之音。除了性激素,其他每种激素都拥有两个副本:分别来自父亲和母亲。现有技术无法对每个基因的这两个副本进行区分,从而给遗传分析蒙上了阴影。” 任兵强调说......阅读全文
我国完成小麦A基因组测序
本报讯(记者丁佳)5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和
盘点最新基因组测序成果
the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者: 种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae) 基因组:~2.86 billion bp 人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年
Nature突破:香蕉基因组测序
由法国的研究人员领导的一个国际小组近日完成了对香蕉品种小果野蕉(Musa acuminata)的基因组测序,并开始分析这一基因组草图。相关研究成果发布在了7月11日的《自然》(Nature)杂志上。 研究人员采用Roche 454、Sanger和Illumina的测序方法绘制出了双单倍
让基因组测序绕过PCR
在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-
什么是基因组测序技术
自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法",人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法",其实是一种
基因组测序拯救鸮鹦鹉
为了保护极度濒危的新西兰鸮鹦鹉kakapo,几乎所有剩余个体的基因组都已被测序,这为其保护管理提供了重要信息。 新西兰鸮鹦鹉kakapo(Strigops habroptila)有几个特性。它是世界上最重的鹦鹉,有的雄性甚至超过3公斤,被认为有达90年的最长寿命。它是唯一一种不会飞的鹦鹉,通过
测序基因组勘探食品污染
上周,两家公司因李斯特菌食品感染发令召回其所有产品。Sabra Dippin召回30,000例鹰嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未发现因食用该公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪萨斯州的蓝铃冰激淋工厂(Blue Bell Creameries)已确认有少量食品原料已感染李斯特菌,目
关于插入序列的遗传性特性介绍
插入序列是编码转座所需的酶的一种转座子,它的两侧是短反向末端重复序列。转座子插入的靶序列在插入过程中被复制,在转座子两端先形成两个短正向重复序列。正向重复序列(DR,direct repeat)的长度为5-9bp,是任一转座子的特征。IS是细菌染色体和质粒的正常组成成分。标准的大肠杆菌含有任何一
RNA测序发现杂交蝉遗传证据
据英国《通讯·生物学》杂志近日发表的一项动物学研究,日本科学家通过RNA测序,出乎意料地发现了13年蝉与近亲17年蝉杂交的遗传证据,而这两种蝉至少221年才相遇一次。研究显示,杂交蝉在极其漫长时间里都维持了各自不同的生命周期,目前科学家无法就这种平行趋异演化给出遗传学解释。长期以来,周期蝉的生命
半导体测序助力胎儿遗传测试
来自中国广州医科大学等机构的科研人员报告了一种基于半导体的DNA测序平台可能有助于增加胎儿遗传测试的速度并减少成本。 近来基于大规模平行测序的方法已经促进了迅速的、非侵入式的出生前遗传测试,这种测试通过分析母亲血浆中流动的无细胞DNA从而测试被称为非整倍性的染色体拷贝数的异常。
重大测序成果,改写绵羊遗传史
在当前羊肉价格不断攀升、羊毛织品价格下跌之时,一项突破性的新研究利用先进的遗传测序技术,重写了绵羊沿着古老的丝绸之路育种及交易的历史。研究发现可以帮助发展中国家的当代牧民维持或恢复对于食物和经济安全至关重要的一些有价值的性状)。 这一发表在《MolecularBiologyandEvoluti
鸟枪法如何测序
全基因组鸟枪法测序(Whole Genome Shotgun Sequencing)无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱,采用最经济有效基因组鸟枪法测序/鸟枪法Shotgun测序(Whole Genome Shotgun Sequencing)无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱,采用最经济有效的实
一文读懂高通量测序技术与研究(套路和实例分析)
导语 高通量测序技术和普通基因测序最大的不同在于,高通量测序能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,也就是基因测序里的“批处理”。 高通量测序经过近十年来的迅猛发展,已经深入到生命科学的各个领域,不仅有力地推动了基础研究的发展,也在逐渐征服临床应用。所谓的高通量测序技术,又名大规模平
PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列
来自中科院遗传与发育生物学研究所,四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章,对一个籼稻基因组蜀恢498(R498)进行PacBio单分子测序,结合遗传图谱和
基因测序的前世今生-你get到了么?
文章长图来源:生物探索 DNA的序列测定是分子生物学研究中的一项非常重要和关键的内容。在基础生物学研究和众多的应用领域中,如诊断,生物技术,法医生物学,生物系统学中,DNA序列知识已成为不可缺少的知识。具有现代的DNA测序技术的快速测序速度已经有助于达到测序完整的DNA序列,或多种类型的基因组测序
细胞遗传学家的新工具和新希望
细胞遗传学意在确定一个基因组中与众不同的结构特征。这说起来容易,做起来难。多年来,研究人员手头的工具很有限,只有吉姆萨染色、FISH和DNA芯片。新兴的DNA测序技术将细胞遗传学的分辨率提高到前所未有的水平,缩小了分子细胞遗传学和分子遗传学之间的距离。 然而,测序,想说爱你不容易。测序读长
一篇就够了,带你了解高通量测序!
说到近十年来发展最迅猛的生物技术,首先想到了高通量测序,我们研究基因组学都离不开它。目前,高通量测序已经深入到生命科学的各个领域,不仅有力地推动了基础研究的发展,也在逐渐征服临床应用。所谓的高通量测序技术,又名大规模平行测序,是将 DNA(或者 cDNA)随机片段化、加接头,制备测序文库,通过对文库
“条形码”序列测序(BRBseq)廉价且高效
RNA测序是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。如今,这种全基因组表达分析是基因组研究的标准工具,因为它们依赖于高通量技术,而这些技术本身已经变得广泛可用。 尽管如此,RNA测序仍然是昂贵和费时的,因为它首先需要昂贵的准备一个完整的基因组库——由细胞RNA生成的DNA池——同时数据本身
DNA序列和大规模DNA测序策略的探讨(图)
人类基因组计划的核心内容之一是基因组测序。随着人类基因组图谱趋于完成,人类基因的 定位克隆、鉴定分析直至全基因组测序取得了突破性进展,测序策略的成熟、测序方法的改进、自动测序仪的广泛应用、计算机数据分析系统的扩展以及测序分析能力的提高, 大大推进了大规模DNA测序的进程。第一节 DNA测序的基本方法
首个完整人类基因组序列公布
由美国国家人类基因组研究所、加利福尼亚大学圣克鲁斯分校、华盛顿大学等机构研究人员领衔的国际科研团队3月31日公布了首个完整、无间隙的人类基因组序列。与这项重大成果相关的6篇论文当天发表在美国《科学》杂志上。美国国家人类基因组研究所在一份公报中表示,人类基因组含有约30亿个DNA(脱氧核
我国完成朱鹮全基因组序列图谱绘制
4月15日,深圳华大基因研究院与西安交通大学联合在西安公布了濒危野生动物朱鹮的全基因组序列图谱,这是继鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,我国完成 的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱。朱鹮这种被称为“东方宝石”的珍稀鸟类目前世界仅存千余只,这一研究成果将对于挽救和保护朱
科学家完成辣椒全基因组序列测定
由我国科技人员主导完成的“栽培种和野生种辣椒的全基因组测序揭示辣椒属的驯化与特异性”研究论文,今年3月在国际著名期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)刊发。该论文的正式发表,标志着辣椒基因组序列成功解码,我国辣椒基础性研究取得重大进展,进入分子育种阶段。 美国农艺学会主席、新墨西哥州立大学
蚕“姑娘”终于有了完整的基因组序列
西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室教授代方银团队首次获得了家蚕W染色体完整基因组序列,并揭示鳞翅目昆虫W染色体起源与进化的新机制。日前,相关研究成果在线发表于《科学进展》。雌蚕。课题组供图雄蚕。课题组供图在昆虫中,性染色体组成以XX/XY系统为主,而鳞翅目昆虫性染色体组成与大部分昆虫不同,
科学家破译“纯种马”基因组序列
马有90多种遗传疾病与人类的遗传疾病相似 一个国际科研小组11月5日报告说,他们破译了“纯种马”的基因组序列。这项研究成果将刊登在6日出版的新一期《科学》杂志上。 报告中所指的“纯种马”最早是300多年前英国培育的一种名贵赛马品种,后被一些欧美和亚洲国家引进,主要用于赛马和马
首次测定南极抗冻鱼基因组序列
近,包括美国东北大学H. William Detrich教授在内的一个国际研究小组,首次测定了南极抗冻鱼(Antarctic notothenioid fish)的基因组序列。他说,这一突破性成果,将阐明动物对寒冷水域独特的进化适应性,将有助于揭示鱼类如何应对海水温度上升,由于气候变化,预计接下
三篇Nature-Methods:定位基因组的调控序列
科学家们利用染色质对DNase消化和Tn5转座的敏感性,对基因组的调控序列进行定位和解读。 近来越来越多的证据显示,许多遗传学差异并非直接影响基因,而是改变控制基因开/关的调控序列。近期Nature Methods杂志上发表了三篇文章,介绍了在基因组中定位调控序列的新技术,阐述了进行数
科学家提出基因测序数据分类新标准
有助于开发出更有效的疫苗;更迅速应对潜在公共卫生突发事件 最近,美国洛斯阿拉莫斯国家实验室(LANL)的一个遗传学小组和一国际财团联合提出了一套旨在阐明可公开获取的基因测序数据信息的质量标准。新标准最终可使遗传研究人员开发出更有效的疫苗,或有助于公共健康部门或安全人员更迅速地应对潜在的公共卫生
海洋所完成凡纳滨对虾基因组并构建高密度遗传连锁图谱
近日,中国科学院海洋研究所海洋动物生殖与遗传工程课题组利用高通量测序技术,对凡纳滨对虾的基因组进行了基因组探查(Survey)分析,并在此基础上成功构建全球标记密度最高的对虾遗传连锁图谱。 基因组探查(Survey)分析结果显示,凡纳滨对虾基因组中重复序列和杂合度比例均很高,其高复杂度使得国际
最新研究揭示全球海洋遗传资源序列ZL分布情况
2018年6月6日出版的《科学进展》杂志(Science Advances)发表的最新研究报告显示,总部位于德国的世界最大化学品生产商巴斯夫公司注册了1988年至今的全球所有海洋遗传资源序列(Marine Genetic resources, MGRs)ZL的47%。该研究报告显示,通过对已记
新算法将更好组装DNA序列-检测特殊遗传突变
刊登在国际杂志Bioinformatics上的一项研究论文中,来自杨百翰大学(Brigham Young University)的研究人员开发了一种新方法来进行人类基因组的装配,而且这或许可以帮助鉴别引发常见遗传障碍的新型突变。 这种新方法依赖于一种新算法,其可以非常敏感地检测DNA序列的特异