MolCell:揭示RNA在调节癌细胞中基因表达上所扮演的关键角色
拓扑异构酶I(TOP1, Topoisomerase I)是一种能促使DNA放松并预防和消除转录过程中扭转应力(torsional stress)的重要酶类,然而,调节TOP1酶类活性背后的机制,目前研究人员并不清楚。近日,一篇发表在国际杂志Molecular Cell上题为“RNA interacts with topoisomerase I to adjust DNA topology”的研究报告中,来自美国西北大学等机构的科学家们通过研究揭示了RNA和TOP1酶类之间的相互作用,TOP1在很多人类癌症中都会过度表达,从而就能在转录过程中帮助调节DNA的功能,并未开发新型癌症疗法提供一定的信息。 这项研究或能为研究人员提供新的机制性见解,并能通过靶向作用RNA与小型化合物的结合界面来为开发新型化疗手段铺平道路;相关研究结果表明,抑制TOP1的RNA结合作用原理或许就类似于众所周知的TOP1抑制剂,比如喜树碱(campt......阅读全文
微RNA与癌细胞转移有关
一种正常作用之一可能是帮助细胞从胚胎的一部分向另一部分运动的微RNA,被发现在侵略性人类乳腺癌中高度表达,调控乳腺癌细胞的迁移、入侵和转移。微RNA(自然出现的单链RNA分子,参与基因调控)以前曾被发现能引起癌症,但这是首次关于它与癌细胞转移有关的报告。微RNA的功能目标似乎是HoxD10基因,它是
诱骗RNA结合蛋白不与癌细胞中的天然RNA分子结合
科学家也开始变得“狡猾”,开始用欺骗来对抗癌症。希伯莱大学的研究人员发明了一种诱饵,可以阻止癌症用于转移的RNA结合蛋白。 近年来,RNA结合蛋白在肿瘤生长中起着重要作用已经成为不争的事实。这些蛋白在所有细胞中都很活跃,尤其是在癌细胞中,它们与RNA分子结合,加速癌细胞的生长。不幸的是,目前还
可以促进癌细胞生长的非编码RNA
国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》发表西奈山伊坎医学院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章。研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌细胞中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响癌细胞的生长。 研究
癌细胞能教唆正常细胞释放“类”病毒RNA
乳腺癌为什么比其他肿瘤更具侵袭性?7月13日《Cell》报道了一项研究发现,癌细胞能迫使正常细胞像病毒一样生长,从而使肿瘤长大、抵抗治疗和扩散。科学家在患者(尤其是三阴性乳腺癌侵袭性病例)血液中发现了一种病毒类似物。宾夕法尼亚医学院的研究人员说,破解癌细胞的这一工作原理,将有望开辟针对性治疗方法
小条件性RNA分子可让癌细胞自我毁灭
如果癌症治疗能像计算机程序那样,根据条件执行任务,结果会怎样呢?物理学家组织网近日报道,加州理工学院的研究人员开发出一种小条件性RNA(核糖核酸)分子,它可以按照“如果……只有……才……”的逻辑命令来杀死变异细胞,极大程度地减轻了癌症治疗的副作用,研究论文发表在9月6日的美国《国家
科学家发现线粒体中的RNA修饰可促进癌细胞转移
肿瘤细胞在转移过程中会消耗远超正常细胞需要的能量,德国癌症研究中心的研究团队发现了与能量代谢相关的新型癌细胞转移的促进因素,相关成果在《Nature》发表,论文的标题为:Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met
PNAS:科学家发现小RNA新家族可促进癌细胞增殖
自从上世纪五十年代被发现,转运RNA以其识别和转运特定氨基酸帮助细胞以信使RNA为模版进行蛋白质合成的重要功能被大家所熟知。但最近一些研究提出一些新的概念,认为tRNA并不总是转录的最终产物,它们还为一些小RNA的产生提供来源。 近日,来自美国的科学家发现激素相关的乳腺癌和前列腺癌细胞还可以特
南京医科大学最新文章:癌细胞中的RNA表达模式
系统生物学认为, 生命体是一个复杂的动态变化网络, 对于生命的研究需要从整体出发, 研究生命网络中的这些复杂的相互作用和调控关系, 而不是仅孤立地研究各个网络中的节点。近期针对非编码RNA,来自南京医科大学的研究人员进行了深入探索,旨在构建全基因组水平编码-非编码 RNA调控网络, 探讨 ncR
Mol-Cell:揭示RNA在调节癌细胞中基因表达上所扮演的关键角色
拓扑异构酶I(TOP1, Topoisomerase I)是一种能促使DNA放松并预防和消除转录过程中扭转应力(torsional stress)的重要酶类,然而,调节TOP1酶类活性背后的机制,目前研究人员并不清楚。近日,一篇发表在国际杂志Molecular Cell上题为“RNA inter
RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中的作用...
RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中的作用机制作为环状RNA和RNA甲基化领域的领跑者,云序生物最近一个月捷报频传。RNA甲基化领域,云序m6ARNA甲基化测序服务协助上海交大余健秀组发表18年国内首篇10分以上RNA甲基化文章(“Nucleic Acid Research”,
RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移作用机制
作为环状RNA和RNA甲基化领域的领跑者,云序生物最近一个月捷报频传。RNA甲基化领域,云序m6ARNA甲基化测序服务协助上海交大余健秀组发表18年国内首篇10分以上RNA甲基化文章(“Nucleic Acid Research”,IF:10.162);环状RNA领域,云序环状RNA测序服务助力
RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中作用机制
环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存
RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上,但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足,Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动,将目的基因之标的序列以反向重复的方式,由
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育
RNA提取心得(组织RNA提取和培养细胞的RNA提取)
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80℃或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4℃,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后
癌细胞的“自述”
癌细胞的“自述”
癌细胞的类别
癌细胞有许多不同类别的,可根据它们起源的细胞类型来定义。上皮癌,常简称“癌”,这是由于大多数癌皆属此类,起源于身体内或外表面的上皮细胞。白血病,起源于负责产生新血细胞的组织,常见于骨髓。淋巴瘤和骨髓瘤,来源于免疫系统内的细胞。肉瘤,起源于结缔组织,包括脂肪、肌肉和骨骼。神经瘤,来源于大脑和脊髓细胞。
癌细胞的概述
癌细胞是一种变异的细胞。是产生癌症的病源,癌细胞与正常细胞不同,有无限增殖、可转化和易转移三大特点,能够无限增殖并破坏正常的细胞组织。癌细胞除了分裂失控外(能进行多极分裂),还会局部侵入周遭正常组织甚至经由体内循环系统或淋巴系统转移到身体其他部分。 癌细胞难以消灭,但心肌几乎不受癌症影响。
RNA干扰相关知识RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质,通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀,每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚,充分混匀,于 60
反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一种RNA-蛋白质复合物,通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC,miRNA组装miRISC。RISCs(无论siRISC还是miRISC)包括两种类型:切割型和不切割型。
ASCB:癌细胞同伙或为癌细胞发生转移铺平道路
近日,在举办的2015年美国细胞生物学学会年会上,来自范德堡大学的研究人员通过研究揭示了转移性肿瘤如何利用非癌性的成纤维细胞来制造迁移“高速公路”穿越周围的细胞外基质。 为了进行移动,转移的癌细胞需要招募非癌性的合作者,研究者怀疑是否这些秘密的癌症同盟会针对成纤维细胞发挥作用,成纤维细胞会分泌
科学家有望让癌细胞来杀死癌细胞
日前,一项发表在国际杂志Cancer Research上的研究报告中,来自肯塔基大学Markey癌症研究中心的科学家们通过研究发现,当对疗法敏感的癌细胞死亡时,其就会释放一种杀伤性的肽类来消除对疗法耐受性的癌细胞。 图片来源:University of Kentucky 肿瘤的复发是
Nature-commu:截断癌细胞交流通道-防止癌细胞转移
癌症转移与超过90%的癌症死亡有关。虽然有关肿瘤转移的研究越来越多,但癌症如何从原发部位迁移到其他部位仍然没有得到完全了解。最近来自美国哈佛大学布利甘和妇女医院的研究人员在国际学术期刊Nature communication上发表了一项最新研究进展,他们对于癌细胞如何扩展"势力范围"并通过"转移
RNA标记
RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes 32P-pCp 3' End-labeling
RNA提取
RNA提取(主要内容如下)Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum Basic Procedures for Handing
RNA降解
新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条件下将组织