科学家如何还原和挖掘海洋微生物基因数据?
·GOMC数据库为未来的研究提供了丰富的资源,包括开发新型生物技术产品、探索微生物的生态功能、研究微生物与环境变化的关系、开发新的疾病治疗方法等。基因是生命的“源代码”,其中不仅蕴藏着自然演化的奥秘,也囊括了数之不尽的生物工程资源。如何获取、分析和应用基因数据,是现代生物学的核心议题之一。近日,一支研究团队对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘,构建了迄今为止最为完整的海洋微生物基因数据库,并从其中发现了数种具有应用潜力的基因资源,包括新型基因编辑工具、抗菌肽和PET塑料降解酶等。该研究于2024年9月4日发表在《自然》(Nature)杂志上,团队成员来自华大生命科学研究院、山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构。海洋覆盖了地球表面约71%的面积,据估计,其中超90%的物种还未被发现。细菌、古菌、病毒等微生物是海洋世界中数量最多的“居民”,1毫升海水就有约100万个,是海洋生......阅读全文
解码“基因宝藏”:最全海洋微生物基因数据库出炉
9月4日晚,华大生命科学研究院(简称“华大”)联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构,在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源
科学家如何还原和挖掘海洋微生物基因数据?
·GOMC数据库为未来的研究提供了丰富的资源,包括开发新型生物技术产品、探索微生物的生态功能、研究微生物与环境变化的关系、开发新的疾病治疗方法等。基因是生命的“源代码”,其中不仅蕴藏着自然演化的奥秘,也囊括了数之不尽的生物工程资源。如何获取、分析和应用基因数据,是现代生物学的核心议题之一。近日,一支
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析,可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日,相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道,2021年,研究人员构建了一个目录,其中包含约3亿组陆地微生物和海洋微生物的基因。现在,沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516176.shtm迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析,可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日,相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道,
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道 山东大学供图微生物已在生物制造、
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等
细胞和基因技术有望揭开海洋微生物之谜
全球50%的氧气都是由海洋微生物产生。然而,这些微小的海洋生物在很大程度上仍然是科学界的一个谜。4月6日发表在《自然—方法学》的研究称,在全球100多名研究人员的努力下,科学家们找到了一种通过细胞和基因技术解开部分海洋生物细胞基因组的方法。添加到海洋原生生物(左)的基因在荧光显微镜下显示为绿点(
解码-“基因宝藏”!科学家揭示海洋微生物基因资源利用潜力
9月5日,记者在“千种海洋生物基因测序项目”暨全球海洋微生物基因库建设及应用成果联合发布会上获悉,华大生命科学研究院联合山东大学、英国东安格利亚大学等机构,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现大量具有应用潜力的基因资源。该研究为开发抗菌肽、新型基因编辑工具、PET塑料降解酶等提
什么是海洋微生物?
定义1:分布在海洋中的个体微小、形态结构简单的单细胞或多细胞生物。所属学科:水产学(一级学科);水产基础科学(二级学科)定义2:海洋中个体微小,构造简单的低等生物的总称。包括细菌、放线菌、霉菌、酵母、病毒、衣原体、支原体、噬菌体和微型藻及微型原生动物等。所属学科:资源科技(一级学科);海洋资源学(二
中法海洋卫星获得首批海洋动力环境数据
记者5日从自然资源部获悉,中法海洋卫星在轨运行1个月以来状态良好,已获取首批海洋动力环境数据。中法双方科学家确认,卫星上装载的两个微波载荷获取的海面风场与海洋波浪谱等海洋动力环境参数结果与真实海况基本一致。 中法海洋卫星于10月29日发射升空。据中法海洋卫星首席科学家、在轨测试工作组组长刘建强
首批《海洋数据开放共享目录》和首个“海洋云”发布
6月8日,在第16个世界海洋日暨第17个全国海洋宣传日上,自然资源部公开发布首批《海洋数据开放共享目录》和全国首个国家海洋大数据服务平台(海洋云)。海洋数据的开放共享是增强海洋经济发展新动能、支撑自然资源精细化管理、深度参与全球海洋治理、构建海洋命运共同体的必然要求,是加快海洋强国和数字中国建设的重
窥探海洋微生物的世界
“大多数浮游生物种群沿纬度呈多样性梯度分布,最靠近两极的生物多样性最低。” “微生物多样性及其基因表达在海洋微生物群落对不同地理环境变化的响应中发挥着不同的作用。” 近日,发表在《细胞》上的两篇论文利用塔拉海洋考察期间收集的样本和数据,分析了目前地球上的海洋生命多样性,为更好地了解气候变化
人类肠道微生物基因集-为研究提供精准数据支持
7月7日,由华南理工大学生物科学与工程学院博士研究生李俊桦为第一作者,与深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然—生物技术》上发表。这是“华工—华大”基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章。 据介绍,人
模拟海洋微生物生态系统创建仿生海洋电池
生物光伏是一种绿色的太阳能发电技术,合成微生物组正逐渐成为生物光伏新的发展形式。具有光电转化功能的海洋微生物生态系统,可以视为一个由太阳能充电的“海洋电池”。位于水柱层透光区的光合微生物,通过光合作用吸收太阳能固定二氧化碳,把电子存储到有机质中;位于沉积层的两类异养微生物(初级分解者和终端消费者
变暖威胁产氧海洋微生物
美国科学家研究显示,在中等和高升温情景下,原绿球藻——地球上最小、最丰富的光合生物以及一种重要的产氧生物,在热带海洋的种群规模到2100年或最多缩小51%。研究结果基于穿过太平洋船舶采集的十年期数据,提示这些细菌面对气候变化时可能比之前认为的更脆弱。相关研究9月8日发表于《自然-微生物学》。
海洋微生物的主要特征
嗜盐性海洋微生物最普遍的特点。真正的海洋微生物的生长必需海水。海水中富含各种无机盐类和微量元素。钠为海洋微生物生长与代谢所必需此外,钾、镁、钙、磷、硫或其他微量元素也是某些海洋微生物生长所必需的。 嗜冷性大约90%海洋环境的温度都在5℃以下,绝大多数海洋微生物的生长要求较低的温度,一般温度超过37℃
中外科学家合作建立全球最大海洋微生物组数据库
9月4日,国际顶级期刊《自然》(Nature)在线发表中外科学家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗
中外科学家合作建立全球最大海洋微生物组数据库
9月4日,国际顶级期刊《自然》(Nature)在线发表中外科学家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具
快速检测海洋微生物有新招
近日,海南大学南海海洋资源利用国家重点实验室研究员万逸带领的海洋微生物传感团队,在海洋微生物快速检测技术方面取得了一系列突破性新进展。相关成果发表在《化学综述》上。 该团队设计研发的FORBID荧光光电微生物检测仪基于上述研究成果,结合实验室优化的检测方法,以海洋病原微生物为靶标,通过实现海洋微
用海洋微生物种植新鲜蔬菜
7月12日,“向阳红03”船奔赴太平洋执行中国大洋45航次科考任务。长时间出海,能否吃到足够的新鲜蔬菜对人的健康十分重要。令科考队员们欣喜的是,在本航次中,国家海洋局第三海洋研究所最新的“基于海洋微生物特殊功能的新型栽培基质的研究”,或许能为船员们带来口福。 远洋航行期待“一抹绿”
国家海洋科学数据共享服务平台发布
我国海洋数据共享迈出重要一步。作为首批通过认定的8个重点领域科学数据共享平台之一,在19日举行的“2018中国海洋信息技术高端论坛”上,国家海洋科学数据共享服务平台正式发布。共享信息包括海洋多学科实测数据、分析预报产品和专题信息等,可以服务于海洋经济发展、环境保护、海域海岛管理、防灾减灾、权益维
世界微生物数据中心落户微生物所
在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上,经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过,中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出,成为世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms, WDCM)新的主持单位。 W
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
南海海洋所在海洋微生物次级代谢产物研究中取得进展
在海洋生态系统漫长的演化过程中,海洋微生物形成了适应严酷生存环境的独特机制,进化出基因型、代谢途径和生理生态功能的多样性,蕴藏着大量新颖的次级代谢产物。近十年来,海洋微生物逐渐成为药物研发的新源泉。 2009年开始,在中国科学院生物局工业生物技术领域重要方向项目“南海海洋工业微生物的资源开
海洋所孙超岷团队:发现可以“吃”塑料的海洋微生物
孙超岷团队成员正在研究“吃”碎片的海洋微生物。海洋微生物对聚酯型聚氨酯的降解图示。 仅仅一年时间,深耕海洋微生物研究的中国科学院海洋研究所孙超岷课题组就接连获得两项重大科研进展。“2021年,我们首次发现能有效降解塑料垃圾的海洋微生物菌群。今年,我们再次发现并培养出‘升级版’海洋微生物,不仅能有效
海洋二氧化碳数据发布
全球大洋1°×1°表层海水二氧化碳分压数据产品 海洋所供图 近日,由中科院海洋所研究员宋金明团队设计的国内首套全球海洋表层海水二氧化碳分压(pCO2)数据产品正式发布。该产品基于逐步前反馈神经网络(Stepwise FFNN)的pCO2数据产品重构算法,构建了1992年1月至2019
全国首个国家海洋大数据服务平台发布
在福建厦门举行的世界海洋日暨全国海洋宣传日主场活动上,自然资源部面向全社会公开发布首批《海洋数据开放共享目录》和全国首个国家海洋大数据服务平台(海洋云)。 该目录和平台由国家海洋信息中心研发。本次发布的《海洋数据开放共享目录》内容包括海洋7大学科、83类要素,整编集成我国自主获取海洋数据、自主研发
50年数据证实海洋Redfield-Ratio发生偏移
一项近日发表在《自然·地球科学》(Nature Geoscience)的国际合作研究首次以全球长期观测数据为基础,系统揭示了过去50年间海洋中碳(C)、氮(N)和磷(P)这三种关键元素的摩尔比发生了持续且结构性的变化。这一发现挑战了被海洋科学沿用数十年的“Redfield Ratio”(雷德菲尔德比
50年数据证实海洋Redfield-Ratio发生偏移
一项近日发表在《自然·地球科学》(Nature Geoscience)的国际合作研究首次以全球长期观测数据为基础,系统揭示了过去50年间海洋中碳(C)、氮(N)和磷(P)这三种关键元素的摩尔比发生了持续且结构性的变化。这一发现挑战了被海洋科学沿用数十年的“Redfield Ratio”(雷德菲尔德比
青岛建成全国首个海洋数据交易平台
6月19日,山东省政府新闻办召开“牢记嘱托 走在前 挑大梁 奋力谱写中国式现代化山东篇章”主题系列新闻发布会第六场,邀请山东省大数据局等介绍山东激发数据要素价值,服务和融入新发展格局情况。发布会上,青岛市大数据发展管理局党组书记、局长张艳就青岛在海洋数据汇聚和流通交易方面取得的突破进行了介绍。她表示