我国学者与海外合作者在利用人工智能识别潜在RNA病毒研究方面取得进展

图 使用人工智能对全球病毒圈的深度挖掘 在国家自然科学基金项目(批准号:82341118、32270160)等资助下,中山大学医学院施莽教授团队、阿里云李兆融团队,联合悉尼大学Edward Holmes教授团队,在人工智能(artificial intelligence,AI)算法识别潜在的RNA病毒种(species)及RNA病毒超群(supergroups)研究方面取得进展。相关成果以“利用人工智能揭示隐藏的RNA病毒圈(Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere)”为题,于2024年10月9日在《细胞》(Cell)杂志在线发表。论文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01085-7。 病毒是地球生态系统的重要组成部分,与人类健康关系密切。目前人类对病毒多样性的认......阅读全文

美研究人员利用可编辑RNA疫苗技术发明寨卡病毒候选疫苗

  利用可编辑RNA疫苗技术,美国麻省理工学院的研究人员发明出一种寨卡病毒候选疫苗。这种疫苗由信使RNA簇构成,信使RNA簇被封装到一种纳米微粒中,一旦进入细胞,RNA将转译为蛋白质并引发宿主免疫反应。研究人员认为,这种疫苗效果如同合成病毒,但不是病原体、不会传染,人类可以控制疫苗表达的时间。因为它

预防寨卡病毒感染的单剂接种环状RNA疫苗研究获进展

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员冯立强、巫林平与广州实验室研究员陈凌等合作,在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的支持下,利用环状环状RNA编码寨卡病毒抗原,探索了一种单剂接种即可预防寨卡病毒感染且无登革病毒感染增强风险的疫苗新策略。相关成果发表于《自然-通讯》。编码EDIII及

病毒蛋白与基因组RNA-构筑DNA蛋白复合结构多级可控构筑

  生物大分子在自然进化中发展出一套独特的“自下而上”自组装方式进行各种复合结构的可控装配,为多功能生物纳米材料的加工制备提供了绝佳范例。其中,核酸-蛋白质纳米复合体系的可控构筑,不仅将实现生物学上两种基本组装模式的有效结合,以提供愈加复杂的生物结构模板,还有助于体内生物大分子相互作用的深入理解,对

新型冠状病毒RNA不具备整合进宿主基因组的能力

       SARS-CoV-2是一种具有高度传播性的单股正链RNA病毒,是COVID-19严重流行的病因。SARS-CoV-2具备高传染性特性,并通过侵犯多器官系统而引起严重临床症状。本研究聚焦新冠病毒RNA基因组是否整合到受其感染的宿主细胞基因组的可能性。       2021年8月2日,中国

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

新冠病毒重要药物靶点RNA聚合酶精细结构获解析

  近日,“上海科技大学—清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构,揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。  3月17日,相关

RNA修饰对新冠病毒2019nCoV多个方面能力影响的研究应用

随着新冠病毒肺炎疫情在全世界大范围的爆发,我们不得不加紧步伐开拓对新冠病毒2019-nCoV的了解。古人云:知己知彼,百战不殆。疫情伊始,由于缺乏对2019-nCoV新冠病毒的了解,我们付出了惨痛的代价。至今,我们仍然没有找到对抗2019-nCoV新冠病毒的有力武器。作为一种容易变化的RNA病毒,新

赛默飞推出AcroMetrix新冠病毒RNA对照品-有2种不同浓度

  分析测试百科网讯 2020年3月31日,赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific)宣布推出AcroMetrix冠状病毒2019(COVID-19)RNA Control,这是其最新的质量控制产品,可用于验证COVID-19分子诊断测试。  为了与最近爆发的新冠肺炎抗争,赛

空气中测出新冠病毒RNA,气溶胶真的可以传播新冠肺炎吗

据世界卫生组织报道,截至欧洲中部时间27日10时(北京时间27日16时),全球新冠肺炎确诊病例已到达2878196例,死亡超过198668例。 随着全球新冠肺炎疫情升温,人类对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的研究越来越多,虽然人类认识SARS-CoV-2已经3个多月了,但关于新冠的不解之谜越来

RNA病毒聚合酶具有一个与宿主适应相关的特征区域

  RNA病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,简称RdRP)是一类独特的核酸聚合酶,在病毒基因组复制和转录过程中发挥核心作用,是抗病毒药物研究的热点靶标。病毒的RdRP由于可与其他功能域融合或与其他病毒蛋白共折叠,其整体结构多样性较高,但其催

科学家揭示A型流感病毒RNA聚合酶复合体结构

  A型流感病毒RNA聚合酶复合体四体总体结构及二体、四体、单体之间的转换  1月22日,Molecular Cell 杂志在线发表了题目为Cryo-EM Structure of Influenza Virus RNA Polymerase Complex at 4.3 Å Resolu

RNA提取

RNA提取(主要内容如下)Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum  Basic Procedures for Handing

RNA降解

新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如  果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条件下将组织

RNA电泳

RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and  TransferUsing glyoxal

指导RNA

中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定  义一种小分子RNA,约含60~80个核苷酸,在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息,可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调

RNA标记

RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes  32P-pCp 3' End-labeling

RNA电泳

·         RNA Gel (Crawford Lab)·         Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. ·         Northern

RNA-电泳

①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样

RNA-Electrophoresis

Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th

Quantitating-RNA

RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an

RNA-剪接

中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定  义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

RNA标记

RNA标记是将标记物(如放射性同位素、荧光素或酶)共价地连接到RNA,通过检测标记物,进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛,在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求: 1.  操作简单,灵敏度高 2.  不影响碱基配对的特异性 3.  不影响RN

RNA干扰相关知识Small-interfering-RNA(siRNA)

Small interfering RNA(siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。

关于小干扰RNA的RNA激活介绍

  已经发现dsRNA还可以激活基因表达,这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa,称为“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。

利用新的RNA成像技术开发的冠状病毒检测试剂盒

  西蒙弗雷泽大学的研究人员将使用他们的先进成像技术--Mango(因为它明亮的颜色)--来开发冠状病毒测试工具。他们是对加拿大卫生研究院(CIHR)最近宣布的帮助解决COVID-19的快速资助机会做出反应的一小部分加拿大研究人员之一。  SFU的博士后研究员Lena Dolgosheina和分子生

国内首个乙肝病毒前基因组RNA检测试剂盒上市

专项启动会合影。(北医供图) 近日,国内首个血清乙型肝炎病毒前基因组RNA荧光定量检测试剂盒获国家药品监督管理局批准上市。意味着这一可作为慢性乙肝患者安全停药指导依据的新靶标将正式进入临床应用,可在各级医院开展检测。 该试剂盒由北京大学基础医学院鲁凤民教授团队和北京热景生物技术股份有限

研究团队解析新冠病毒重要药物靶点RNA聚合酶精细结构

  近日,“上海科技大学—清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构,揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。新型冠状病毒RdRp

病毒-ADP-核糖转移酶将RNA与宿主蛋白偶联在一起

  在此之前,人们一直认为 RNA 和蛋白只是在细胞过程中发生短暂的相互作用。在一项新的研究中,来自德国马克斯-普朗克陆地微生物研究所的研究人员发现,事实并非如此:细菌病毒---也称为噬菌体---在发育周期中会将特定的 RNA 与宿主蛋白“粘合”在一起。这种称为RNAylation的化学修饰可能为噬

干扰素调控因子1基础表达能促进肝细胞抵抗多种RNA病毒

  目前的细胞对RNA病毒的固有免疫模型主要是由病毒引发的诱导抗病毒反应,这种反应是由RIG-I类受体或toll类受体发起的,这些受体通过干扰素调控因子(IRFs)感知病原体相关的分子模式,并向下游发出信号;诱导合成I型和III型干扰的转录因子IRF1。  今日,一项刊登在国际杂志Nature Mi

北大游富平等揭示识别病毒RNA模式识别受体的新机制

  病原体模式识别受体(PRR)是识别外来危险信号的感受器,并且传递信号给细胞内的效应分子,从而调动细胞进行免疫应答。所有已知的病毒RNA PRR都具有核外定位。然而,对于许多病毒,在感染过程中通过复制在细胞核中产生双链RNA(dsRNA)。dsRNA是一种重要的PAMP,病毒感染宿主细胞产生的ds