科学家构建迄今最大规模开放式核磁共振数据库
中国科学院上海药物研究所研究员郑明月团队开发了一种由大型语言模型驱动的NMR数据提取工具NMRExtractor,能够从海量开放获取的文献中自动提取实验性核磁共振(NMR)数据,并构建出了迄今为止规模最大的开放式NMR数据库NMRBank。5月28日,相关研究发表于《化学科学》。NMR光谱是化学研究中强大且应用广泛的技术之一,能够提供分子环境的详细信息,对结构和原子间相互作用非常敏感。在过去二十年中,研究人员开发了多个数据库用于存储分子的1H和13C NMR光谱,但这些数据库的规模仍较为有限。研究团队提出的NMRExtractor,可自动从科学文献中提取化合物名称、NMR条件和1H/13C NMR化学位移等关键信息。基于该工具,研究团队构建了NMRBank,其中包含225809条NMR数据记录,每条记录包括化合物的IUPAC名称、SMILES描述符、1H/13C NMR化学位移、模型赋予的置信度评分,以及文章PMID和期刊名称等......阅读全文
科学家构建迄今最大规模开放式核磁共振数据库
中国科学院上海药物研究所研究员郑明月团队开发了一种由大型语言模型驱动的NMR数据提取工具NMRExtractor,能够从海量开放获取的文献中自动提取实验性核磁共振(NMR)数据,并构建出了迄今为止规模最大的开放式NMR数据库NMRBank。5月28日,相关研究发表于《化学科学》。NMR光谱是化学研究
核磁共振
发现病变 核磁共振成像是一种利用核磁共振原理的最新医学影像新技术,对脑、甲状腺、肝、胆、脾、肾、胰、肾上腺、子宫、卵巢、前列腺等实质器官以及心脏和大血管有绝佳的诊断功能。与其他辅助检查手段相比,核磁共振具有成像参数多、扫描速度快、组织分辨率高和图像更清晰等优点,可帮助医生“看见”不易察觉的早期
期刊数据库更新
图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表的文章数量,
期刊数据库更新
图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表
核磁共振波谱仪核磁共振谱仪定义
核磁共振(nuclear magnetic resonance, NMR)是磁矩不为零的原子核,在外磁场作用自旋能级发生蔡曼分裂,共振吸收某一定频率的射频辐射的物理过程。并不是是所有原子核都能产生这种现象,原子核能产生核磁共振现象是因为具有核自旋。原子核自旋产生磁矩,当核磁矩处于静止外磁场中时产生进
核磁共振概述
1945年Bloch和Purcell分别领导两个小组同时独立地观察到核磁共振(Nuclear Magnetic Resonance, NMR),他们二人因此荣获1952年诺贝尔物理奖。1991年诺贝尔化学奖授予R.R. Ernst教授,以表彰他对二维核磁共振理论及傅里叶变换核磁共振的贡献。这两次诺贝
核磁共振现象
(一)核有磁性 1.核由质子和中子组成 2.质子带正电,中子不带电 3.所以,原子核带正电的 4.另外,有些核具有内秉角动量(自旋) 5.奇数核子 6.奇数原子序数,偶数核子 因而核有磁性 磁矩 描述磁场强度与方向的矢量 自旋角动量 旋磁比,每个核都有一特定的值。有正有负,核
核磁共振应用
发现病变核磁共振成像是一种利用核磁共振原理的最新医学影像新技术,对脑、甲状腺、肝、胆、脾、肾、胰、肾上腺、子宫、卵巢、前列腺等实质器官以及心脏和大血管有绝佳的诊断功能。与其他辅助检查手段相比,核磁共振具有成像参数多、扫描速度快、组织分辨率高和图像更清晰等优点,可帮助医生“看见”不易察觉的早期病变,已
核磁共振NMR
NMR(Nuclear Magnetic Resonance)为核磁共振。是磁矩不为零的原子核,在外磁场作用下自旋能级发生蔡曼分裂,共振吸收某一定频率的射频辐射的物理过程。核磁共振波谱学是光谱学的一个分支,其共振频率在射频波段,相应的跃迁是核自旋在核蔡曼能级上的跃迁。基本原理自旋量子数I不为零的核与
核磁共振原理
1.原子核的自旋 图 核磁共振原理图核磁共振主要是由原子核的自旋运动引起的。不同的原子 核,自旋运动的情况不同,它们可以用核的自旋量子数I来表示。自旋量子数与原子的质量数和原子序数之间存在一定的关系,大致分为三种情况:I为零的原子核 可以看作是一种非自旋的球体;I为1/2的原子核可以看作是一种电荷分
核磁共振波谱仪核磁共振的发生及过程
1.原子核在磁场中的能级分裂质子有自旋,是微观磁矩,磁矩的方向与旋转轴重合。在磁场中,这种微观磁矩的两种自旋态的取向不同,能量不再相等,磁矩与磁场同向平行的自旋态能级低于磁矩与磁场反向平行的自旋态,两种自旋态间的能量差△E与磁场强度H0成正比: 式中,h为普朗克常数;H0为磁场的磁场强度,单位为T(
GenBank数据库概述(三)
结构: 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划,另外也可以访问分子模型数据库(MMDB)和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB:分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库,结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库,主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性,如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级
GenBank数据库概述(四)
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍:1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 :把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起,包括序列,图谱,和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序:小鼠基因组计划的测序进展,HTG序列contigs(可以用大小和染色体号来浏览)由
GenBank数据库概述(一)
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库,一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合(UniGene),人类基因组基因图
GenBank数据库概述(二)
FTP GenBank and Daily Updates:1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述,下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1,国际标准组织(ISO)数据表示格式,下载
核磁共振波谱仪核磁共振谱仪发展现状
二十世纪后半叶,NMR技术和仪器发展十分快速,从永磁到超导,从60MHz到800MHz的NMR谱仪磁体的磁场差不多每五年提高一点五倍,这是被NMR在有机结构分析和医疗诊断上特有功能所促进的。现在有机化学研究中NMR已经成为分析常规测试手段,同样,在医疗上MRI(核磁共振成像仪器)亦成为某些疾病的诊断
核磁共振是什么
核磁共振是一种物理现象,作为一种分析手段广泛应用于物理、化学生物等领域。为了避免与核医学中放射成像混淆,把它称为核磁共振成像术(MRI),核磁共振CT。MRI是一种生物磁自旋成像技术,它是利用原子核自旋运动的特点,在外加磁场内,经射频脉冲激后产生信号,用探测器检测并输入计算机,经过处理转换在屏幕上显
什么是核磁共振
磁共振magneticresonance(MRI);固体在恒定磁场和高频交变电磁场的共同作用下,在某一频率附近产生对高频电磁场的共振吸收现象。在恒定外磁场作用下固体发生磁化,固体中的元磁矩均要绕外磁场进动。由于存在阻尼,这种进动很快衰减掉。但若在垂直于外磁场的方向上加一高频电磁场,当其频率与进动频率
核磁共振的原理
原子核的自旋。核磁共振主要是由原子核的自旋运动引起的。不同的原子核,自旋运动的情况不同,可以用核的自旋量子数I来表示。自旋量子数与原子的质量数和原子序数之间存在一定的关系。原子核是带正电荷的粒子,不能自旋的核没有磁矩,能自旋的核有循环的电流,会产生磁场,形成磁矩(μ)。当自旋核(spin nucle
核磁共振波谱方法
一种现代仪器分析法。在外加磁场B中,自旋量子数为I的核自旋可以有2I+1个不同的取向。例如1H,13C,19F,31P(I均为1/2),则有2个不同的取向。这是由于带正电荷的核自旋所产生的磁场,可以有与外磁场B相同的取向(具有位能E1),也可能相反(位能E2),在常态下,当E2>E1时,处于E1
核磁共振的原理
NMR(核磁共振)nuclear magnetic resonance。A phenomenon in which transitionsin the magnetic energy states of the nuclei of atoms are induced when the atoms a
什么是核磁共振
核磁共振(MRI)又叫核磁共振成像技术,是继CT 后医学影像学的又一重大进步。自20 世纪80 年代应用以来,它以极快的速度得到发展。其基本原理:是将人体置于特殊的磁场中,用无线电射频脉冲激发人体内氢原子核,引起氢原子核共振,并吸收能量。在停止射频脉冲后,氢原子核按特定频率发出射电信号,并将吸收的能
核磁共振的原理
NMR(核磁共振)nuclear magnetic resonance。A phenomenon in which transitionsin the magnetic energy states of the nuclei of atoms are induced when the atoms a
核磁共振(NMR)实验
核磁共振(Nuclear Magnetic Resonance),是指具有磁矩的原子核在静磁场中,受电磁波(通常为射频电磁振荡波RF)激发,而产生的共振跃迁现象。1945年12月,美国哈佛大学珀塞尔(E. M. Purcell)等人,首先观察到石腊样品中质子(即氢原子核)的核磁共振吸收信号。1946
核磁共振(NMR)原理
以氢核为例,由于带电核的旋转,会产生一个微小的磁场,一般而言,自旋杂乱无章,但若将其置于较强磁场中,其必定沿着磁场的方向重新排列,当核的自旋轴偏离了外加磁场的方向时,核自旋产生的磁场即会与外磁场相互作用,使原子核除了自旋之外,还会沿着圆锥形的侧面围绕原来的轴摆动,(类似于陀螺的摆动),这种运动方式称
核磁共振现象介绍
原子核是带正电荷的粒子,不能自旋的核没有磁矩,能自旋的核有循环的电流,会产生磁场,形成磁矩(μ)。μ=γP式中,P是角动量矩,γ是磁旋比,它是自旋核的磁矩和角动量矩之间的比值,因此是各种核的特征常数。当自旋核(spin nuclear)处于磁感应强度为B0的外磁场中时,除自旋外,还会绕B0运动,这种
核磁共振的原理
核磁共振用NMR(Nuclear Magnetic Resonance)为代号。1.原子核的自旋核磁共振主要是由原子核的自旋运动引起的。不同的原子核,自旋运动的情况不同,它们可以用核的自旋量子数I来表示。自旋量子数与原子的质量数和原子序数之间存在一定的关系,大致分为三种情况,见表8-1。I为零的原子
核磁共振的原理
核磁共振主要是由原子核的自旋运动引起的。不同的原子核,自旋运动的情况不同,它们可 以用核的自旋量子数I来表示。自旋量子数与原子的质量数和原子序数之间存在一定的关系,大致分为三种情况,如下表。分类质量数原子序数自旋量子数INMR信号I偶数偶数0无II偶数奇数1,2,3,…(I为整数)有III奇数奇数或
核磁共振的原理
核磁共振,全称“核磁共振成像(MRI)”。是一种医学影像诊断技术,亦称“核磁共振成像术”。利用人体组织中某种原子核的核磁共振现象,将所得射频信号经过电子计算机处理,重建出人体某一层面的图像,并据此作出诊断。 1924年W.泡利为了解释原子光谱的某些结构,提出原子核具有角动量(即自旋)的假说。194