新系统可同时在DNA多位点进行修改
新一期《自然·通讯》杂志发表一项基因组学重大突破：美国耶鲁大学团队成功将在同一细胞中编辑多个DNA位点的能力提升了2倍，并有效减少了对附近基因位点的非预期突变。新成果使基因编辑的范围和精度同时得以扩大。如果将DNA比作一部包含30亿字符的庞大手稿，那么这项新技术意味着从此可以同时在不同章节中进行多处修改，而不仅仅局限于同一页上的个别单词。尽管现有基因组编辑技术已能实现对人类基因组中约30亿个碱基对中的单个碱基进行修改或删除，但在同时编辑多个位点方面能力有限，有时还会错误地影响邻近的DNA序列。为解决这一问题，研究团队采用了CRISPR相关蛋白Cas12（一种与Cas9类似、具备精准切割DNA能力的“分子剪刀”），并结合引导RNA（gRNA）系统进行定向编辑。之所以选择Cas12，是因为它天然具有处理多个gRNA的能力。为了提升编辑精度，研究团队对gRNA进行了优化，包括缩短其长度或调整RNA碱基组成。利用这一新系统，团队不仅显著......阅读全文
酶的活性位点的定义
酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙，底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合，如：氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如，底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上，也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上，或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合
如何寻找转录起始位点
一、引物延伸分析（primer extension analysis） 引物延伸分析用于定量mRNA的量，测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端， 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域，随后用RNA作为模板，用反转录酶延伸引物得到cDNA，
如何寻找转录起始位点？
一、引物延伸分析（primer extension analysis）引物延伸分析用于定量mRNA的量，测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端， 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域，随后用RNA作为模板，用反转录酶延伸引物得到cDNA，用变
新基因编辑技术“RNA桥”来了！
科学家在两项独立研究中描述了一种新的基因组编辑技术，能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列，实现这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法或比现有技术更有优势，例如有望比现有技术进行更精准、有效的大规模基因组编辑，以及能介导重组而非造成需要修复的断裂。相关研究近
降DNA剪切速度增强基因编辑特异性，脱靶指数降低3000倍
近日，一项近日发表于Nature Biotechnology的题为“Enhancing gene editing specificity by attenuating DNA cleavage kinetics”研究中，来自Sangamo Therapeutics， Inc.公司的研究人员在Ed
使用“RNA桥”的新基因编辑技术问世
《自然》6月26日发表的两篇论文描述了一种新的基因组编辑技术，这种技术能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列，这项技术有望成为这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法可能比现有技术更有优势，比如有望进行比后者更精准有效的大规模基因组编辑，以及能够实现基因组的介
使用“RNA桥”的新基因编辑技术问世
《自然》6月26日发表的两篇论文描述了一种新的基因组编辑技术，这种技术能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列，这项技术有望成为这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法可能比现有技术更有优势，比如有望进行比后者更精准有效的大规模基因组编辑，以及能够实现基因组的介
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸。其中，丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点，因为其结构末端含有羟基，羟基很活泼，可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说，蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话，很大程度上就是磷酸化位点。
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸。其中，丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点，因为其结构末端含有羟基，羟基很活泼，可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说，蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话，很大程度上就是磷酸化位点。
四问“基因编辑婴儿”
“首例免疫艾滋病基因编辑婴儿”一石激起千层浪。记者注意到，两天来，科学界、法学界不少人对上述基因编辑婴儿行为提出质疑。有专家认为，基因编辑对人类获益有限，而风险是长远和不可预期的。一些法学界人士也指出，所谓的“基因编辑婴儿”涉嫌违法。 1问 “基因编辑”技术难度如何？ 中科院院士：是一项门
盘点基因编辑新利器
CRISPR-Cas9工具让科学家几乎能随意改变基因组。人们称赞它比以往的技术明显更简单、更廉价及更通用。CRISPR-Cas9在全球各地的实验室中大放光彩，并带来了一些医学和基础研究的新应用。 但该技术也有其局限性。美国加州大学圣地亚哥分校生物工程师Prashant Mali指出，它擅长到
基因的体外编辑介绍
由于体内的细胞发生变异，功能失调甚至癌变，一种简单的方法是“修复”体外的细胞，然后将其注入体内，以恢复最初受损的功能。最典型的例子是近年来流行的CAR-T技术（在体外用病毒转染T细胞，使其能够识别肿瘤表面的某些蛋白质），以及在体外编辑干细胞。这种方法的优点是可以管理的。毕竟，编辑是在身体之外进行的。
基因编辑工具的开发
基因编辑已经被越来越广泛的用于生物学的研究和应用当中，例如合成生物学，基因治疗，药物靶点发现，mRNA剪接，蛋白定向进化等等。我们在使用各种各样的基因编辑工具时，不禁感叹这些工具是多么的精巧绝伦。但科研人员发现基因编辑工具，改进这些工具的功能、效率并非易事。高效、精准、便捷的基因编辑工具，一直是人们
基因编辑的执行手段
1）基因敲除：如果想使某个基因的功能丧失，可以在这个基因上产生DSB，非同源末端连接（NHEJ）修复的过程中往往会产生DNA的插入或删除（indel），造成移码突变，从而实现基因敲除。 2）特异突变引入：如果想把某个特异的突变引入到基因组上，需要通过同源重组来实现，这时候要提供一个含有特异突变同源
如何看待基因编辑技术
基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”，实现对特定DNA片段的敲除、加入等。而CRISPR/Cas9技术自问世以来，就有着其它基因编辑技术无可比拟的优势，技术不断改进后，更被认为能够在活细胞中最有效、最便捷地“编辑”任何基因。
基因编辑技术是什么
基因编辑技术不断发展，到现在已发展到第三代基因编辑技术。第三代基因技术CRISPR/Cas克服了传统基因操作的周期长、效率低、应用窄等缺点。作为一种最新涌现的基因组编辑工具，CRISPR/Cas能够完成RNA导向的DNA识别以及编辑。通过一段序列特异性向导RNA分子（sequence- specif
基因编辑的精准“剪刀”
在中国科学院干细胞与再生医学创新研究院一楼科普平台里，展示着几项最新研究成果。在干细胞药物、再生医学、解密衰老等项目中，几个小试剂盒显得有些单薄，却有重要的价值和意义。“这是一种能够快速检测新冠病毒的试剂盒，与传统的检测方法相比，它不需依赖复杂的仪器设备，更便捷、更简单、更快速。大家都做过核酸检
新基因编辑技术“RNA桥”来了！
科学家在两项独立研究中描述了一种新的基因组编辑技术，能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列，实现这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法或比现有技术更有优势，例如有望比现有技术进行更精准、有效的大规模基因组编辑，以及能介导重组而非造成需要修复的断裂。相关研究近
“RNA桥”新基因编辑技术问世
RNA桥。图片来源：Visual Science本报讯 《自然》6月26日发表的两篇论文描述了一种新的基因组编辑技术，这种技术能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列，这项技术有望成为这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法可能比现有技术更有优势，比如有望进行比
2024年中国基因编辑技术发展现状及趋势分析－CRISPR/Cas优势明显
行业主要上市公司：金斯瑞(HK.1548)、凯赛生物(688065.SH)、华熙生物(688363.SH)、华恒生物(688639.SH)、川宁生物(301301.SZ)等本文核心数据：ZFNs技术;TALENs技术;CRISPR-Cas技术;基因编辑技术发展趋势——第一代基因编辑技术：ZFNs技术
超小型编辑器实现动物高效基因编辑
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519726.shtm
基因编辑专家亓磊：未来人类可以通过编辑基因根治癌症
11月6日，2016年腾讯WE大会在北京北展剧场举行，腾讯公司首席探索官David Wallerstein、奇点大学联合创始人Peter Diamandis等人参加大会，并就航空、引力波、科技艺术、AR等前沿话题发表演讲。 基因编辑领域专家、斯坦福大学生物工程系和化学与系统生物学系助理教授亓磊
敲除这个基因位点，我们就不会患上心血管疾病？
在过去的十年中，科学家们在数十亿人的DNA中发现了一种神秘的“基因幽灵”，无论采用什么饮食，增加运动或者医疗手段，都会增加人体患上心脏病，动脉瘤或中风的风险。 近期，来自Scripps研究所的研究人员通过精确切割基因组中的DNA罪魁祸首，揭开了这一医学之谜，取得了重大突破，防止与这些破坏性疾病
RISPR标记基因位点，揭示人类细胞染色体空间组织
在真核细胞的细胞核中，基因组会被核小体包裹形成染色质[1]，而染色质在空间上的分布是否有一定的规律是长期以来科学家们在努力研究的问题。了解其分布规律有利于增强对于细胞核的组织结构以及一些重要细胞活动的理解[2-4]。本研究利用改良的CRISPR/Cas9系统在二倍体活细胞中对随机选中的基因组位点
李平华团队开发出高通量研究玉米基因位点新技术
李平华（左二）和研究生查看模式植物长势 山东农大供图 10月9日，《自然—通讯》在线发表了山东农业大学农学院教授李平华等中外科学家合作研究成果。他们探索出高通量研究玉米转录因子调控位点的新技术，利用大规模转录因子数据重新构建了玉米叶片基因表达调控网络，使玉米基因编辑不再“大海捞针”。 玉米是世界
研究AtoI－RNA编辑位点在后生动物中的分布和演化驱动力
2021年5月17日，北京大学生命科学学院陆剑研究员课题组在WIREs RNA发表题为“Evolutionary driving forces of A-to-I editing in metazoans”的综述论文。 由ADAR（adenosine deaminase acting on R
能预测碱基编辑效果的新模型开发成功
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）动物表观基因组学创新团队研发出一种预测碱基编辑效果的新模型，该模型大幅提升了预测碱基编辑器在基因组内源靶位点编辑效果的准确性。相关研究成果发表在《细胞发现》（Cell Discovery）上。碱基编辑技术是一
SMRT测序改善CRISPR效果的评估
新兴的CRISPR技术在短短一年多的时间内掀起了基因组编辑的热潮。然而，对于这些基因改造手段的效率和结果，我们仍难以评估。目前的一些工具如荧光报告基因、克隆分析，缺乏生成报告细胞系时所需的灵敏度。高通量测序方法虽然能克服这一问题，但无奈读长太短，而供体DNA模板往往很长。 到目前为止，还没
Mol－Cell：科学家破解出新型CRISPR代码
近日，一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中，来自Francis Crick研究所的科学家们通过研究发现了一组简单的规则或能决定人类细胞中CRISPR/Cas9基因编辑的精准性，相关研究结果或能帮助科学家们改善实验室和临床中基因编辑技术的效率和安全性。尽管如今科学界已经广泛
李国红/朱明昭组揭示H2A.Z对DNA复制起始位点调控
已知大部分生物的遗传信息都储存在双链DNA上，遗传信息的精确传递对生命的繁衍和进化至关重要。而这个信息传递过程依赖于DNA复制这一基本的细胞活动。DNA复制包含起始、延伸和终止三个步骤。细胞在G1期时，复制起始识别复合物(Origin Recognition Complex, ORC)识别染色质