新技术有望叩开疾病研究的“黑匣子”
8月28日，由华大生命科学研究院牵头建设的基因组多维解析技术全国重点实验室联合多家机构，在《细胞》发布最新版本的时空组学技术Stereo-seq V2。该技术成功解决了困扰医学界多年的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本分析难题，首次实现了在同一张组织切片上，同时对人体细胞和入侵微生物的基因活动进行高分辨率“现场直播”。该技术如同一把万能钥匙，有望打开医学界存档临床病理样本的“黑匣子”，唤醒沉睡的医学宝藏，推动生命科学研究从“看见细胞”到“看懂细胞与微生物战场”的精准医学时代。修复病理样本信息FFPE（福尔马林固定石蜡包埋）是一种经典的生物组织保存技术，可以理解为制作“组织标本琥珀”。在世界各地的医院病理科，保存着海量的FFPE样本，医生从患者身上取下病理组织（如肿瘤活检），先用福尔马林溶液将其“定格”，再用石蜡包裹，使其能在室温下长期保存。通过切片，科学家们可以从这些样本中提取出DNA、RNA和蛋白质等组学信息进行疾病研究。然......阅读全文
基于高通量测序技术（NGS）的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂的检测范围
基于高通量测序技术（NGS）的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂的检测范围可以包括哪些基因及位点？ 基于高通量测序技术（NGS）检测人福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂，针对特定的适应证，其检测范围基于方法学特点一般包括多个变异基因及变异位点。 上述变异基因及位
Naica数字PCR技术对NSCLC患者血浆中EGFR相关突变检测的应用
非小细胞肺癌（NSCLC）肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一，已成为我国城市人口恶性肿瘤死亡原因的第一位。其中，非小细胞肺癌约占所有肺癌的80%，约75%的患者发现时已处于中晚期，5年生存率很低。而非小细胞肺癌中最常见，且有针对性靶向药物的突变就是“表皮生长因子受体”（EGFR）突变。表皮生长因子受体
数字PCR技术在DNA甲基化检测中的应用
DNA甲基化是目前研究最多的表观遗传修饰之一，发生于CpG二核苷酸序列C5位置的胞嘧啶上，多发生于CpG岛上，研究发现，DNA甲基化参与调节多种细胞过程，包括胚胎发育，转录，X染色体失活，基因组印迹、染色体稳定性等。许多研究发现，DNA甲基化在一系列的疾病（如癌症等）起到十分重要的作用。在癌症患者中
赛默飞牵手诺华、辉瑞开发基于NGS的伴随诊断新市场
赛默飞11月18日宣布与诺华、辉瑞两大制药公司签订长期合作协议共同开发和商业化基于基因测序的伴随诊断市场，此次协作将重点针对多个非小细胞肺癌药物项目的开发。 在此次协议中，赛默飞将利用Ion PGM Dx系统（被FDA列为二类医疗器械）和Oncomine assays开发伴随诊断市场。诺华肿瘤
Fluidigm推出成像质谱流式策略以服务临床试验
加利福尼亚南旧金山时间2019年12月10日(环球新闻在线报道)——多通道组织成像领域的全球领导者Fluidigm公司(纳斯达克：FLDM)近日宣布，其推出的经病理学验证的Maxpar®抗体数量总数已超过100个。基于Imaging Mass Cytometry技术(IMCTM)，这些抗体可被应
赛默飞推出全新肿瘤试剂－助力免疫治疗研究
2018年7月19日，上海——科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技（以下简称：赛默飞）宣布推出基于高通量测序技术（NGS）的Oncomine TCR Beta-SR Assay（SR = Short Reads）试剂。该产品可用于全面评估免疫系统的多样性，从而评价人体对感染、疫苗、细胞免疫治疗
首个基于国产高通量测序仪的肿瘤基因检测试剂盒获批
2019年8月29日，吉因加的Gene+ Seq-200和Gene+ Seq-2000基因测序仪双双通过国家药品监督管理局（NMPA）的批准上市。 据悉，测序仪应用范围为：在临床上用于对来源于人体样本的脱氧核糖核酸（DNA）进行测序，以检测基因变化，这些基因变化可能导致存在疾病或易感性。该仪
【综述】2016年新一代测序技术
新一代测序几乎影响了生物学领域的每一个角落，科学家们用这一技术测序基因组、评估遗传学变异、定量基因表达、研究表观遗传学调控和探索微观生命。新一代测序市场如今异常繁荣，但开发者们并没有停下自己的脚步。在最近的基因组生物学技术进展年会（AGBT）上，各大公司纷纷推出了自己的新产品。这些创新旨在推动新
Geneuity采用赛默飞Oncomine技术扩大其医药服务范围
分析测试百科网讯 2015年7月15日，加利福尼亚州卡尔斯巴德 -Geneuity是一家分子诊断和病理测试制药的医疗设备公司，同时也是合同研究组织整合的领导者。今天，该公司宣布，它正在采用赛默飞新一代测序（NGS）技术OncomineFocusAssay扩大其检测服务范围，并计划提供给
我国学者首次发现分子标记物有效预测鼻咽癌远处转移
中山大学肿瘤防治中心马骏团队在世界范围内首次报道了一组可有效预测局部晚期鼻咽癌转移的mRNA（信使RNA）分子标签。相关成果日前在线发表于《柳叶刀—肿瘤学》杂志。图片来源于网络 据了解，约70%的鼻咽癌患者在就诊时已经处于局部区域晚期（无远处转移），而局部区域晚期鼻咽癌患者中仍有20%~30%
华大基因肺癌分析软件获批－实现检测全流程资质认证
近日，深圳华大基因股份有限公司（以下简称“华大基因”）全资子公司华大生物科技（武汉）有限公司的非小细胞肺癌突变基因分析软件，获得湖北省药品监督管理局颁发的医疗器械注册证，具体信息如下： 该产品为独立软件，通过软件分析数据可对非小细胞肺癌的福尔马林固定石蜡包埋（简称FFPE）病理组织样本的基因突
核酸提取仪应用领域
几乎在每个实验室，与生物分子相关的分离纯化工作都是十分重要，且必不可少的。但要对多个样品进行纯化还是相当困难的，不仅需要选择合适的纯化技术，而且工作量也特别大，很难满足当前飞速发展对高通量样品进行提取纯化的需求。磁珠自动核酸提取纯化系统是使用磁珠法技术，可广泛应用于基因组学、疾控医疗、食品安全、法医
福尔马林：保存标本－帮助DNA和RNA的提取
在历史上人们使用了各种固定液（各种浓度的乙醇和福尔马林，目前公认的固定液是10%的中性福尔马林溶液）。马尔福林基本的固定能力是通过蛋白质交联，从而使固定物质更加牢固。福尔马林还可以作为适合基因组研究的培养基，比如DNA和RNA的提取研究。 DNA和RNA的恢复，对于许多科学领域和医学专业都非常
FDA批准首个基于二代测序（NGS）的伴随诊断试剂盒
2016年12月19日，美国食品和药物管理局（FDA）批准了Foundation Medicine公司的FoundationFocus CDxBRCA产品，成为市场上第一个基于二代测序的伴随诊断试剂盒。 该产品被批准用于鉴定携带BRCA突变的晚期卵巢癌患者，这些患者更易对Clovis Onco
JCI：应用FISH技术检测肿瘤microRNA
霍华德•休斯医学研究所(HHMI)的研究人员通过微调荧光探针的设计以及RNA固定技术，开发出一种检测和定量肿瘤活检样本中microRNA分子的方法。这种新的荧光原位杂交(FISH)技术实现了肿瘤类型的鉴定。《The Journal of Clinical Investigation》杂志近日
新技术破解临床样本分析难题
8月29日，记者从华大生命科学研究院获悉，该研究院牵头建设的基因组多维解析技术全国重点实验室联合多家机构，共同开发出时空组学技术Stereo-seq V2。该技术攻克了困扰医学界多年的福尔马林固定石蜡包埋样本分析难题，并实现在同一张组织切片上，同时对人体细胞（宿主）和入侵微生物的基因活动进行高分
赵可吉博士Nature发布重要测序技术
DNase I超敏感位点（DHS）是对DNaseⅠ高度敏感的活性染色质区域。哺乳动物细胞的DHS定位，能够提供转录调控元件和染色质状态的重要信息，一直是科学家们的研究热点。DNase测序（DNase-seq）是进行全基因组DHS分析的常用方法，不过DNase-seq需要数百万细胞，大大限制了该技
科学家利用机器学习解开临床癌症样本中的基因组密码
分析癌症基因组中的突变过程有助于在早期发现和准确诊断癌症，并可以揭示某些癌症患者对治疗产生耐药性的原因。 临床癌症样本是一个巨大的资源，可以为分子诊断技术提供更全面的支持，使特定的癌症患者与适合的癌症疗法相匹配，从而达到最好的治疗效果。然而，由于临床癌症样本中的DNA质量较差（如福尔马林会对D
RNASeq和线粒体测序介绍
如今NGS已能够快速经济地阅读数亿个reads，所及之处远超越基因组学（如RNA测序使转录组学发生革命性变化）。尽管NGS取得了诸多进步，但依然存在一些重大的挑战。日前，牛津大学举办的“NGS七周年大会”聚焦了NGS面临的挑战，此次会议阐述了NGS领域最令人生畏的障碍，同时也阐述了跨越这些障碍的技术
生物样品的低温保存
生命科学研究中组学技术的发展以及临床医疗领域新一代检测技术的进步，促进了对生物样品的需求，也促进了生物样品的采集、保存等环节的正规化、规模化。生物样品的保存，不外常温和低温两种方式。常温保存能耗少、环保，有时也非常方便，是一种有潜力的保存方式。一些机构正在积极探索不同的常温保存技术。上海伯豪生物也推
辞旧迎新，ChIP都有哪些新玩法
如果研究者们想知道蛋白在做什么，他们通常会采取直接的方式：免疫共沉淀能知道蛋白A和蛋白B有没有在一起，ChIP能确定蛋白A是否与核酸序列B结合。 染色质免疫共沉淀ChIP可以鉴定与指定蛋白结合的DNA序列，其基础理念能追溯到几十年前。如今ChIP已经成为了表观基因组学的一个基本工具，与新一代测
技术推荐－|－ChIP的新玩法
如果研究者们想知道蛋白在做什么，他们通常会采取直接的方式：免疫共沉淀能知道蛋白A和蛋白B有没有在一起，ChIP能确定蛋白A是否与核酸序列B结合。 染色质免疫共沉淀ChIP可以鉴定与指定蛋白结合的DNA序列，其基础理念能追溯到几十年前。如今ChIP已经成为了表观基因组学的一个基本工具，与新一代测
NGS文库制备新品实现5hmC分析
近年来，新一代测序(NGS)平台在甲基化研究中开始崭露头角。它们带来了非常灵敏的DNA甲基化图谱，以单分子分辨率覆盖整个CpG岛。然而，对于时下热门的5-hmC研究，似乎还缺乏专门的样品制备工具。为此，Zymo Research公司近日推出两款新的NGS文库制备试剂盒，适用于全基因组范围的5
FDA批准罗氏诊断试剂盒VENTANA用于肺癌诊断
近日，罗氏公司宣布美国FDA批准了其诊断性试剂盒VENTANA PD-L1（SP142）作为补充诊断，以鉴定治疗经治转移性非小细胞肺癌（NSCLC）患者的PD-L1表达水平，这些病人考虑使用肿瘤免疫疗法TECENTRIQ（atezolizumab）。 2016年5月18日首个PD-L1单抗at
3D－CNV鉴定实验CN
拷贝数变异 (CNV) 是基因座的野生型拷贝数相比参考基因组增加或减少造成的基因组失衡。这些基因组改变从小的 (小于10 kb) 插入或缺失到大的 (超过1 Mb)、复杂的多等位基因复制均有。CNV是人类基因组中最常见的遗传变异，与多种疾病有关，包括癌症或遗传性疾病易感性 [1, 2]。
Affymetrix无创非侵入性膀胱癌基因组分析获得资助
2016年3月8日，来自加州圣克拉拉的消息 -Affymetrix公司（纳斯达克代码：AFFX）今天宣布已经获得了Innovate UK（IUK）的一项资助，以证明利用该公司的OncoScan® FFPE Assay Kit对尿液样本进行非侵入性的膀胱癌基因组分析的健康医疗和经济价值。膀胱癌在
安捷伦收购二代测序知识产权－未来将大力拓展诊断业务
安捷伦收购强大的二代测序系列知识产权分子和样本条形码系列知识产权巩固了安捷伦在下一代测序靶向富集解决方案的领导地位，这一系列知识产权旨在提高二代测序检测的准确度和灵敏度 2017年7月27日，北京——安捷伦科技公司（NYSE: A）（“安捷伦”）今天宣布，已成功收购 Population Gene
LifeTech扩大突变筛查产品线
Life Technologies公司近日宣布，它将扩大Ion AmpliSeq™ 产品线，推出Comprehensive Cancer Panel和Inherited Disease Panel。这些独一无二的分析板，再加上Ion AmpliSeq Designer V1.2、I
赛默飞推出最新下一代基因测序仪Ion－GeneStudio－S5系列
2018年1月10日，旧金山。Thermo Fisher科技已经发布了两款基于半导体测序技术的新型测序仪器 -Ion GeneStudio S5 Prime和Ion GeneStudio S5 Plus。图片来源于Thermo Fisher 此外，在周二的摩根大通医疗保健会议上的发言中，集团C
何为质谱流式系统？富鲁达给你答案
Fluidigm10月份推出了Hyperion™组织质谱成像系统，使研究人员在肿瘤和组织中可同时检测到更多的蛋白标记物，解决了在科研和临床研究中，经常困扰工作人员的难题。 Fluidigm（富鲁达）公司上周宣布，公司第三季度的收入达2470万美元，与2016年同期的2220万美元相比增长12%