北京:2025生物样本库建设技术攻关项目榜单聚焦基因测序、蛋白质组学等

2025年9月29日,北京市科学技术委员会、中关村科技园区管理委员会联合发布通知,以“揭榜挂帅”方式向社会公开征集2025年度生物样本库建设技术攻关项目。此次发布的榜单涵盖基因测序平台、蛋白质组学检测平台以及人工智能随访系统三大方向,旨在推动生物样本库建设,提升生物医药领域的创新能力和核心竞争力。 一、基因测序平台 基因测序平台的建设目标是建立高通量基因测序平台,实现从样本到数据的全流程自动化。该平台需具备以下关键指标: 自动化水平:全流程自动化,包括自动样本前处理和文库建库系统。 通量要求:测序读长不低于150bp,兼容靶向测序、全基因组测序及全基因组甲基化测序。 数据质量:人全基因组测序有效测序平均深度为30-35X,PE150平均测序质量Q30≥85%,基因组比对率≥99%。 生信分析能力:日处理能力不少于120人份全基因组测序数据。 成本控制:以5万例样本为测算依据,探索单样本基因测序极限成本。 考核......阅读全文

空间转录组测序样本准备指南

  一、外泌体研究热度持续攀升   外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,

空间转录组测序样本准备指南

  现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究,所以在样本冻存前至少10分钟,将异戊烷和液氮浴准备好(之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻,是因为液氮沸点比较低,直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴,导致不同区域降温不同步而改变内部形态,甚至组织碎裂)。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到

中国BIGD跻身国际生物组学数据库

  测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及

蛋白质组学常用数据库一览

  一蛋白质数据库  1.UniProt (The Universal Protein Resource)  网址:http://www.uniprot.org/  http://www.ebi.ac.uk/uniprot/  简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(瑞

《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临

《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成,但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现,蛋白质才是生命活动真正的执行者,所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究,试图找出人类疾病的致病机理,最终解决人类

活体肿瘤样本库与常规肿瘤生物样本库有什么区别?

  一、常规生物样本库  肿瘤在临床上有实体瘤和非实体瘤之分。来源于临床活检或外科手术的固体肿瘤组织,由病理医生决定切割组织的关键部份用于常规病理诊断,且在不影响常规病理诊断的情况下,组织的剩余部份被生物样本库切割收集,将肿瘤蜡块存储到样本库中。但是这种方式保存的样本,不能够保证保存下来的肿瘤块是否

青岛发布科技新政- 支持“揭榜挂帅”

9月19日,青岛市科技局印发《青岛市园区揭榜挂帅随发随评奖补实施办法》(以下简称《办法》),在青岛高新区“一区多园”等科技园区范围内建立企业技术需求揭榜攻关快速响应机制,推动高校、科研院所科技成果向产业转化,每个项目最高给予50万元奖补支持。《办法》聚焦各科技园区主导产业,重点关注科技型中小企业研发

生物样本库的信息系统

  生物样本库(Biobank)资源管理信息系统是为了便利于有效的管理生物样本和相关信息所建立的具有搜集、保存、检索和分析功能的信息系统。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核内容。为此:  生物样本库(Biobank)资源管理信息系统的功能包括但不限于:追踪捐赠者的问卷和知情同意,管理生物样本采集、

生物样本库的发展现状

  生物样本库(Biobank)是众多重要科研成果快速产业化、应用到临床,实现“转化医学”的重要保证,美国、欧洲以及国际卫生组织都投入了几亿到几百亿美元建立大型生物样本库。  进入二十一世纪以来,随着现代生物技术的快速发展,分子遗传学取得了巨大的发展,国外对于人类遗传资源的保护与开发研究势头强劲,主

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

生物样本库的推广势在必行如何安全存储和管理生物样本

  1. 标准化样本处理  生物样本种类繁多(主要分为5大类:组织样本、血液样本、核酸和蛋白质样本、冻存的细胞样本、组织切片和组织芯片),对样本进行标准化处理是构建样本库最重要也是最核心的一样工作。  1) 样本处理是对样本进行必要的分割、分装和处理,以使样本满足储存和将来使用的质量要求。样本的处理

蛋白质组学不能被基因组和转录组取代

基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质(isforms)等现象在基因水平无从表现

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

国家生物药技术创新中心核酸药物“揭榜挂帅”项目公示

根据国家生物药技术创新中心发布2022年国家生物药技术创新中心核酸药物“揭榜挂帅”技术攻关拟立项目公示清单,浙江大学上海高等研究院院长周如鸿教授“新型RNA适配体及相关药物的智能化设计与应用”项目入围其中。 “新型RNA适配体及相关药物的智能化设计与应用”项目以RNA适配体及相关药物智能化设计与优化

苏企“揭榜挂帅”推进制氢产业

  昨天从2024年度江苏省碳达峰碳中和科技创新专项资金拟立项目公示清单上了解到,全省拟立项14项中,吴江区的苏州科润新材料股份有限公司、苏州云帆氢能科技有限公司、苏州铂氢新能源科技有限公司采取“项目+课题”的形式申报的“揭榜挂帅”项目,是全省唯一拟立项的“揭榜挂帅”项目,也是苏州市唯一进入公示清单

创新积分制“揭榜挂帅”入围名单公布

科技部办公厅关于公布创新积分制“揭榜挂帅”入围名单的通知各有关省(自治区、直辖市)及计划单列市科技厅(委、局):为切实推动《加快构建科技金融体制有力支撑高水平科技自立自强的若干政策举措》(国科发资〔2025〕47号)落实落地,大力推广“创新积分制”,鼓励地方先行先试,开展各具特色的创新实践,科技部组

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验

仪器、耗材DBMS实验步骤3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验

实验步骤:3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作。因此,

宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用

  中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水(Acid mine drainage, AMD)中的微生物群落进行研究,相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。  本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样

微缩化技术在宏基因组测序建库中的应用

2020年伊始,突如其来的新冠疫情牵动着每个人的心。自武汉卫健委首发肺炎疫情情况通报后的短短一个星期,新型冠状病毒就在实验室中被检出,并获得了该病毒的全基因组序列。如此快速地确定病原体抢占研究先机,宏基因组测序技术功不可没。 宏基因组学(Metagenomics),以环境样品中的微生物群体为研究对象

基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作

  AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具,这使得BaseSp

微构工场生物医用材料任务“揭榜挂帅”PHA项目正式启航

10月31日,由清华大学、北京大学口腔医院和微构工场主办的生物医用材料创新论坛在北京成功举办。会上,“生物医用材料创新任务揭榜挂帅PHA项目”正式启航,三方将联合产学研加速生物医用材料PHA的攻关及转化,助力生物医用材料创新向中国“智”造发展。  中科院过程工程研究所马光辉院士、北京市经信局生物与医

生物医用材料创新任务揭榜挂帅(第二批)入围揭榜单位公示

  根据《关于组织开展生物医用材料创新任务揭榜挂帅(第二批)工作的通知》(工信厅联原函〔2025〕41号),工业和信息化部、国家药品监督管理局联合组织开展了遴选工作。为进一步听取社会各界意见,现将拟发布的生物医用材料创新任务揭榜挂帅(第二批)入围揭榜单位进行公示。  如有不同意见,请在公示期间将书面

生物样本蛋白质的提取

由于大部分蛋白质都能溶于水、稀盐、稀酸或稀碱溶液,所以蛋白质的提取一般是以水溶液为主,其中盐溶液和缓冲溶液对蛋白质的稳定性好、溶解度大,是提取蛋白质最常用的溶剂。当细胞粉碎后,用盐溶液或缓冲溶液提取蛋白质时,应注意以下一些条件。(1)盐浓度常用等渗盐溶液,尤其以0.02~0.05mol/L磷酸缓冲溶

蛋白质组学之逆袭:深度注释基因组(三)

人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的,将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识,同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设,以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具,使得人类能够横跨癌症基因组

蛋白质组学之逆袭:深度注释基因组(一)

申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完成了对多种物

蛋白质组学之逆袭:深度注释基因组(二)

针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤,分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起,从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵

人类基因组测序先驱欲进军生物医疗测序领域

J. Craig Venter(中)希望通过利用基因组学实现对抗衰老的目标。   美国人类基因组测序先驱J. Craig Venter将和其新创立的公司Human Longevity Inc.(HLI)进军生物医疗测序领域。HLI是“基因组学和细胞的诊断与治疗公司”,计划于今年夏季启动,终极目

人类基因组测序先驱欲进军生物医疗测序领域

J. Craig Venter(中)希望通过利用基因组学实现对抗衰老的目标   美国人类基因组测序先驱J. Craig Venter将和其新创立的公司Human Longevity Inc.(HLI)进军生物医疗测序领域。HLI是“基因组学和细胞的诊断与治疗公司”,计划于今年夏季启动,终极目标