单细胞技术揭秘马铃薯—晚疫病菌互作图谱
马铃薯作为全球最重要的非谷物作物之一，长期受到晚疫病菌（Phytophthora infestans）的严重威胁，全球每年造成近百亿美元损失。虽然国际学术界和工业界自1845年以来长期开展晚疫病研究，但其致病机理和病程发展模式仍不完全清楚。 近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）研究员黄三文团队与南京农业大学植物保护学院/农林生物安全全国重点实验室教授董莎萌课题组合作，在《自然—植物》上在线发表了研究论文。该研究在单细胞分辨率下解析了马铃薯叶片与晚疫病菌互作的宿主微环境动态变化，提出了晚疫病病程新模型。 传统研究晚疫病致病机理多基于组织水平的转录组分析，难以充分揭示细胞异质性和空间协调性。单细胞空间转录组技术为解析晚疫病病程中的精细机制和模型提供了技术突破。 研究团队通过对接种晚疫病菌的马铃薯叶片进行空间转录组分析，成功获得了73271个高质量单细胞数据。通过整合细胞形......阅读全文
单细胞分离技术
单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲，我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术，并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1：目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员，都见过下面我们要介绍的传统的单细胞
单细胞测序技术的技术特点
单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行高通量测序分析的技术。 它具有以下几个重要特点和优势： 1. 揭示细胞异质性：能够发现细胞群体中不同细胞之间的细微差异，识别罕见细胞类型和细胞的不同状态。 2. 深入了解细胞发育和分化：追踪细胞从干细胞到成熟细胞的发育轨迹，揭
单细胞分离技术介绍
单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲，我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术，并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1：目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员，都见过下面我们要介绍的传统的单细胞
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别：空间信息获取普通单细胞测序技术：通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术：能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术：难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别：空间信息获取传统单细胞测序：通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序：能够在测定单细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序：难以直观地揭示基于
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术有何不同？
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术主要有以下几个方面的不同：空间信息获取传统单细胞测序技术通常无法提供细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序技术能够在获取单个细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在组织中的具体位置。细胞间相互作用研究传统技术难以直接揭示细
单细胞测序技术的技术优势
单细胞测序技术具有许多优势：揭示细胞异质性：能够发现不同细胞之间基因表达和遗传变异的差异。研究细胞发育和分化：追踪细胞在发育过程中的动态变化和谱系关系。解析复杂组织：剖析组织中各种细胞类型的组成和功能。助力疾病研究：在肿瘤学中，有助于了解肿瘤细胞的进化、异质性和耐药机制。
新型单细胞活性分析技术
近日，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究论文中，来自加利福尼亚大学的研究人员通过运用一种分析单一细胞基因活性的先进技术，鉴别出了人类大脑脑细胞的特性，该研究揭示，如今进行大规模的细胞调查分析比过去我们所认为的要更加高效，而且廉价。 研究者Arnold
单细胞分离技术应用于众多领域的单细胞分析
单细胞分离目前主要有三种选择：手动分离、荧光激活细胞分选和微流体技术。当然，除了成熟的方法，巧妙的新方法也在不断涌现，能以更高的准确性和特异性来分离单细胞。 将细胞分散到悬液中，会失去它们在组织里的位置信息。如果想了解单细胞所处的环境，就需要用到激光捕获显微切割技术，这种技术通过扫描组织切片来
解读单细胞RNAseq技术
多年来，跟踪一个单细胞的转录组，超出了我们的能力。但是现在，时代已经变了，新的单细胞RNA-seq方法，可以分析大量的细胞及它们的命运 多年来，跟踪一个单细胞的转录组，超出了我们的能力。但是现在，时代已经变了，新的单细胞RNA-seq方法，可以分析大量的细胞及它们的命运。 我们都参加过大型生日派
解读单细胞RNAseq技术
多年来，跟踪一个单细胞的转录组，超出了我们的能力。但是现在，时代已经变了，新的单细胞RNA-seq方法，可以分析大量的细胞及它们的命运。 我们都参加过大型生日派对：在拥挤的房间里，与许多人聊天、吃饭和庆祝。但是，试想你并不知道寿星是谁，只是像一个局外者看待这个派对。你可能会觉得整个事件看起来与
新型单细胞谱系追踪技术问世
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦研究团队开发出新型单细胞谱系示踪技术（DuTracer）。这一技术通过巧妙结合CRISPR-Cas9和Cas12a两种基因编辑工具，提升了细胞谱系追踪的精度和深度，为解析胚胎发育、器官再生和疾病机制提供了新工具。相关研究成果发表在《细胞报告》（Cell
单细胞分析技术的应用前景
单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景：在医学领域：疾病的早期诊断：能够在疾病症状出现之前检测到细胞层面的细微变化，实现超早期诊断。例如，在癌症的萌芽阶段，识别出具有恶变倾向的单个细胞，大幅提高患者的生存率。精准医疗：根据患者肿瘤细胞的单细胞特征，为其定制个性化的治疗方案，包括选择最有效的药物和
单细胞技术分类及应用（二）
什么是OEP呢？OEP的前身是2018年诺贝尔物理学奖获得者之一的Ashkin发明的Optical Tweeszer（OET）光镊技术，其原理是利用单个激光束通过高倍的显微物镜聚焦形成光阱，微观粒子受光压而束缚在光阱处，使用皮牛级别的力操纵和移动陷入光阱的微观粒子。这项技术在生物学上为单细胞
单细胞培养技术的概念
单细胞培养(single cell culture)是指从植物器官、愈伤组织或悬浮培养物中游离出单个细胞，在无菌条件下，进行体外生长、发育的技术。人们分离和培养植物单细胞的设想和实践都比较早，但成功地进行单细胞培养是随着更有效的培养基的发展以及从愈伤组织悬浮培养物分离单细胞的专门技术的建立才实现的。
单细胞分析技术的应用前景
单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景，主要体现在以下几个重要方面：癌症研究与治疗：肿瘤异质性分析：能够揭示肿瘤内部不同细胞的基因表达、突变和细胞周期状态等的差异，帮助理解肿瘤的发生、发展、转移机制以及耐药性的产生。精准治疗：指导个性化的癌症治疗方案，例如确定对特定药物敏感的肿瘤细胞亚群，从而提
单细胞分离技术的方法比较
单细胞分离技术：流式细胞分选术（Flow Cytometry Sorting）：通过细胞表面标志物的特异性抗体标记细胞，利用流体力学和激光技术，对细胞进行快速、准确的分离和分选。激光捕获显微切割技术（Laser Capture Microdissection，LCM）：利用激光束从组织切片中精确地切
单细胞技术画像一览
一、单细胞的应用根据单细胞的应用方向主要可以分为三大类：生长发育方向：胚胎、组织器官发育、细胞分化等肿瘤方向：肿瘤分子标志物，肿瘤异质性和微环境特征。免疫细胞方向：自身免疫疾病、血液系统病等免疫相关的疾病（重点关注T细胞和B细胞）具体可以分为8个方向：摘自单细胞scRNA-seq学习笔记1-单细胞测
益生菌单细胞技术联盟正式成立
近日，在2023中国肠道产业大会上，由中国科学院青岛生物能源与过程研究所（以下简称青岛能源所）牵头发起的益生菌单细胞技术联盟正式成立。益生菌单细胞技术联盟启动仪式 青岛能源所供图目前，市场上有大量的益生菌品牌和产品，但质量参差不齐，给消费者带来了极大的困扰，也阻碍了产业的健康发展。产生这一问题的根
单细胞技术分类及应用（一）
2019年10月22日，Biogen与日本Eisai宣布，经与FDA协商，计划于2020年初向FDA提交Aducanumab治疗阿尔兹海默症（AD）的上市申请。如果获批，Aducanumab将成为首个逆转疾病进展的AD药物。从技术角度看，Aducanumab也将有可能成为首个单B细胞测序来源的抗体药
当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映，因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年，组学研究飞速发展，处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进
Nature子刊报道单细胞技术突破
人类肠道是一件了不起的事情。每周，肠道都会再生一层新的内皮细胞，脱落的表面面积相当于一个小型公寓，并用新的细胞进行修复。几十年来，研究人员已经知道，负责这一改头换面行为的是肠道干细胞，但是直到今年，美国北卡大学教堂山分校（UNC）医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne
Nature新技术：CRISPR+单细胞测序=？
CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因组编辑技术是生物研究和新型靶向药物研发的有力工具。比如利用CRISPR筛选基因（pooled CRISPR screens），可以通过CRISPR gRNAs靶向成百上千个不同的基因，同时编辑许多细胞，然后实验筛选编辑细胞，gRNA可以帮助确定哪些基因对于生物
Science：单细胞分析？并行测序技术可以
近日，一项发表于国际杂志Science上的研究论文中，来自美国的研究者描述了一种新型的大规模并行技术，通过利用新一代测序技术来在单细胞水平上实现对基因表达的监测；研究者表示，单细胞分析对于理解人类造血系统的必要性及重要性不断凸显，如果没有这种分析的话，来自少许细胞的大量表达改变就和来自许多细胞的
单细胞技术让这些研究成为现实
如今，细胞群体的平均值数据已不再能够满足研究的需求。研究人员开始转向单细胞来探索基本的生物学。在这一期的《BioTechniques》上，Jeffrey Perkel博士介绍了让单细胞实验成为现实的技术。 2015年底，巴西卫生部门和世界卫生组织报告，新生儿中小头症的发病率急剧增加。没过多久，
Science：新型单细胞基因表达检测技术
发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文，证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo
单细胞技术让这些研究成为现实
生物通报道 如今，细胞群体的平均值数据已不再能够满足研究的需求。研究人员开始转向单细胞来探索基本的生物学。在这一期的《BioTechniques》上，Jeffrey Perkel博士介绍了让单细胞实验成为现实的技术。 2015年底，巴西卫生部门和世界卫生组织报告，新生儿中小头症的发病率急剧增加
－GEN报告重磅解析单细胞分析技术
本期GEN Market & Tech Analysis报告的重点是单细胞分析（Single Cell Analysis ，SCA）市场。 SCA的应用涉及多个的领域，包括癌症、神经科学等。目前，SCA主要应用于生命科学的研究领域，但报告认为，在未来的5-7年，SCA将对诊
高通量单细胞技术获得新突破
人类肠道是一件了不起的事情。每周，肠道都会再生一层新的内皮细胞，脱落的表面面积相当于一个小型公寓，并用新的细胞进行修复。几十年来，研究人员已经知道，负责这一改头换面行为的是肠道干细胞，但是直到今年，美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne
单细胞分离技术大揭秘，值得收藏
单细胞分离是研究中困难的步骤之一，目前的分离策略主要分为三类：手动分离、荧光激活的细胞分选和微流体技术。 在进行单细胞转录分析之前，我们需要确定自己拿到了正确的细胞。如果你想要的细胞已经处于悬浮状态（比如循环肿瘤细胞），而且含量相对比较丰富，那么流式细胞分析将是你的理想选择。如果样本是实体组织，