新型碱基编辑系统助力水稻精准改良

近日,中国农业科学院作物科学研究所作物精准育种技术创新团队在我国自主知识产权基因编辑工具Cas12i3的基础上成功开发出新型碱基编辑系统,并利用该系统创制出抗除草剂水稻新种质。相关研究成果发表在《植物学报》(Journal of Integrative Plant Biology)上。Cas12i3作为我国自主研发的基因编辑工具,相较于国外主流工具,具有体积更小、更广的编辑适用范围等独特优势。然而,依托该工具的腺嘌呤碱基编辑器尚未成功开发,其胞嘧啶碱基编辑器在植物中编辑效率低。因此,针对该工具开发高效的碱基编辑系统,对丰富我国育种技术工具箱具有重要意义。研究团队构建了5个不同版本碱基编辑器并分别对其进行编辑效率系统评估。其中一种结合了两个特定功能单元的架构表现最优,能显著提升腺嘌呤、胞嘧啶碱基编辑效率,并扩大碱基编辑窗口。在水稻稳定转化株系中可将原有碱基编辑效率分别提升4.78倍和3.35倍。同时,研究团队利用该系统成功创制抗除......阅读全文

将CRISPRCas9在水稻中的基因组编辑效率提高37倍

  来自中国水稻研究所,中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员发表了题为“Increasing the efficiency of CRISPR-Cas9-VQR precise genome editing in rice”的文章,通过优化sgRNA的结构以及使用水稻内源性强启动子来驱动VQR变体

暂停一年后,基因编辑监管破冰!首款碱基编辑产品在美获批临床

  10月23日,基因编辑公司Verve Therapeutics宣布,用于治疗高胆固醇基因形式的碱基编辑疗法Verve-101的临床搁置已被解除。这是在患者体内进行单碱基编辑的疗法首次在美国获批进行临床试验。  VERVE-101是一款为治疗杂合子家族性高胆固醇血症(HeFH)而开发的单碱基编辑疗

水稻重要农艺性状蛋白功能活性的梯度获调节

广东省农业科学院水稻研究所副研究员谭健韬/研究员刘琦团队与华南农业大学教授祝钦泷团队合作,研究开发出植物精准碱基编辑器实现水稻重要农艺性状蛋白功能活性的梯度调节。近日,相关成果发表于《先进科学》(Advanced Science)。基于精准碱基编辑的植物内源蛋白功能梯度调节。研究团队供图该研究在国家

中国学者Nature-Biotechnology发文:植物基因CT单碱基新系统

   来自中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员发表了题为“Efficient C-to-T base editing in plants using a fusion of nCas9 and human APOBEC3A”,在前期研究基础上利用Cas9变体(nCas9-D10A)融合人类胞嘧啶脱

新一代碱基编辑技术开发方面取得重大突破

  碱基编辑(BE)作为一种前沿的基因组编辑技术,能够在基因组水平上实现精确、高效的单碱基编辑。常用的DNA碱基编辑器主要是通过将可编程的DNA结合蛋白(如Cas9)与碱基脱氨酶融合实现的。然而,这些碱基编辑器主要针对C和A碱基的直接编辑,并且它们所包含的脱氨酶可能导致非Cas9依赖的DNA或RNA

优化糖基化酶碱基编辑器研究取得新进展

GBE编辑器可实现碱基C-to-G的编辑,但其仍存在碱基编辑效率偏低、靶向位点范围受限等问题,这大大限制了GBE碱基编辑器的应用。因此,亟需对现有糖基化酶碱基编辑器进行优化,开发出碱基编辑效率高、靶向位点范围广的GBE突变体。近日,中国科学院天津工业生物技术研究所毕昌昊研究员带领的合成生物技术研究团

一种碱基编辑器成功修改活小鼠肠道细菌基因

  科学家设计了一种基因编辑工具,可以改变活小鼠肠道微生物组中的细菌。7月10日,相关研究成果发表于《自然》。  该工具是一种碱基编辑器,可以修改小鼠肠道内90%以上大肠杆菌菌落的靶基因。“我们一直梦想能够做到这一点。”法国巴黎生物技术公司Eligo Bioscience的联合创始人、合成生物学家X

单碱基修复基因编辑公司Beam获8700万美元A轮支持

  新闻事件   今天几位华人基因编辑科学家创建的单碱基修复基因编辑公司Beam获得8700万美元A轮支持。Editas的三位创始人MIT的张锋、哈佛的David Liu、和Mass General的Keith Young联手创立了Beam,CEO为Agios的原高管John Evans。本轮投

高彩霞团队开发出不依赖CRISPR的全新碱基编辑工具

  基因组编辑可以对生物体遗传信息进行精准、高效的修饰,已成为生命科学领域的一项颠覆性技术。通过融合nCas9(切口酶形式的Cas9)与脱氨酶,美国哈佛大学David Liu团队先后开发出胞嘧啶碱基编辑系统(Cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤碱基编辑系统(Adenine ba

我国科研人员开发新型普适高效的碱基编辑器

   在国家自然科学基金项目(项目编号:31730111、91540115、31600654 、31600619、31471241)等资助下,中国科学院上海生命科学研究院杨力研究组与上海科技大学生命学院陈佳研究组和黄行许研究组合作,成功开发出可高效介导甲基化胞嘧啶mC到胸腺嘧啶T的编辑碱基编

不依赖脱氨酶的碱基编辑器开发成功

  记者1月14日从中国科学院天津工业生物技术研究所获悉,该所研究员毕昌昊团队和研究员张学礼团队合作开发了不依赖脱氨酶(DAF)的新型碱基编辑器。该成果扩展了碱基编辑器的类型,为工业菌株改造和生物医药等领域研究提供了新的技术工具。相关研究成果近日发表于国际期刊《自然-生物技术》。  碱基对是形成DN

首次试验!人体碱基编辑降低坏胆固醇,有助预防心脏病

  胆固醇是体检中必须关注的一项。其中,低密度脂蛋白(LDL),即坏胆固醇,是导致动脉硬化、心脏病等的关键因素。  在11月12日于美国费城举行的美国心脏协会会议上,美国生物技术公司Verve Therapeutics报告了一种名为VERVE-101的治疗方法,可以使肝脏中的PCSK9基因永久性失活

基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术

  通过全基因组规模扰动文库的构建与筛选,从宏观基因组层面系统研究基因型与表型的对应关系,是微生物功能基因组学研究的重要方法。相较于单个基因扰动文库的构建与筛选,混合文库的构建与筛选可通过一次实验实现特定条件下对上千个基因的同时筛选,显著提高通量。近年来,CRISPR/Cas技术凭借着精简高效、可编

上海科技大学等团队构建新型高精准碱基编辑系统

   上海科技大学生命科学与技术学院教授陈佳、免疫化学研究所教授杨贝,中科院上海营养与健康研究所研究员杨力与武汉大学医学研究院教授殷昊合作研究构建了一种高精准碱基编辑系统,并依据其特性命名为变形式碱基编辑系统(简称tBEs)。5月10日,该研究成果在线发表于《自然—细胞生物学》。  据悉,研究人员利

华东师大科研团队填补碱基编辑领域最后一块拼图

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503069.shtm华东师范大学生命科学学院李大力教授团队继2022年10月在国际著名学术期刊 Nature Chemical Biology 报道新一代精准安全的腺嘌呤碱基编辑器ABE9以及11月在国际

非脱氨酶依赖的嘧啶碱基编辑器TBE获得进展

  DNA碱基编辑工具的进步为疾病治疗带来了巨大的希望,可修复由单核苷酸多态性(SNPs)【1】引起的单基因遗传疾病。目前,胞嘧啶碱基编辑器和腺嘌呤碱基编辑器主要依靠脱氨酶将胞嘧啶(C)或腺嘌呤(A)转化为尿嘧啶(U)或肌苷(I),脱氨后的U和I会分别被识别为胸腺嘧啶(T)和鸟嘌呤(G),从而促进C

糖基化酶碱基编辑器的机器学习研究进展

  碱基编辑技术可实现精确的碱基转换,当前,有三类碱基编辑器被广泛应用,包括胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor,CBE)、腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor,ABE)、糖基化酶碱基编辑器(glycosylase base editor,GBE)。  20

我国科学家开发更高精度的单碱基基因编辑工具

  单碱基编辑技术是一种是自2012年CRISPR/Cas9技术被发现以来最寄予厚望的高精度基因编辑技术,其中一种单碱基编辑技术BE3可以在不切断DNA双链的情况下精确地引入由C/G到T/A的点突变,另外一项单碱基编辑技术ABE7.10可以由T/A突变成C/G的技术,对于基因突变导致的遗传疾病的治疗

科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应

 脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图    日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作,首次证实线粒体碱基编辑器(DdCBE)会导致核基因组严重的脱靶效应,因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱基编辑器具有指导意义。相关研究成果在线发表在《

科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应

 脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图 日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作,首次证实线粒体碱基编辑器(DdCBE)会导致核基因组严重的脱靶效应,因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱

杨力课题组等开发出变形式碱基编辑新系统

  5月10日,Nature Cell Biology在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所研究员杨力课题组与合作者在碱基编辑研究领域发布的最新进展——Eliminating base-editor-induced genome-wide and transcriptome-wide off-ta

单碱基编辑系统在植物中建立mRNA剪接操控新方法

  mRNA前体的剪接是高等生物体内基因转录后加工的重要过程,传统mRNA的剪接遵循“GU-AG”法则,即主要剪接体包含三个保守的剪接位点,即位于内含子5’端的“GU”、3’端的“AG”和靠近3’端的分支点“A”。剪接体通过选择一种或多种剪接位点可将mRNA前体加工为一种或多种成熟的mRNA,即组成

天津工生所在构建新型双碱基编辑器方面取得进展

  碱基编辑器是基于CRISPR/Cas9发展的新一代基因组编辑技术,可诱导单个碱基的突变,而鲜有关于特异性介导A-to-G和C-to-G双突变的碱基编辑工具的研究。此外,关于碱基编辑系统与染色质环境之间的联系也少见报道。  近日,中国科学院天津工业生物技术研究所研究员毕昌昊带领的合成生物学技术研究

玉米和水稻基因组引导编辑效率提高3倍

科技日报北京12月29日电 (记者马爱平)近日,北京市农林科学院玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室基因组编辑团队与北京大学等单位合作,发现了新策略协同效应,在植物引导编辑技术研发方面取得了新突破,实现了玉米和水稻引导编辑效率平均可提高3倍以上,在多个低效靶点上甚至可提高10倍以上,并在人细胞中

朱健康等团队:师法自然-“敲高”基因获突破

  除了基因敲除、碱基编辑,提升基因功能是否还有其他的全新路径?中国农业大学植物保护学院姜临建与青岛清原化合物有限公司李华荣、中科院分子植物科学卓越创新中心朱健康、贵州大学宋宝安等研究人员开展合作,报道了一种“基因敲高”的新策略。11月15日,相关论文发表于《自然—植物》。  研究人员表示,这项研究

高彩霞研究组等合作建立优化植物基因组引导编辑系统

  近日,中科院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组与美国哈佛大学刘汝谦研究组合作,建立并优化了适用于植物的引导编辑系统(PPE),并在重要农作物水稻和小麦基因组中实现精确的碱基替换、增添或删除。相关成果近日在线发表于《自然—生物技术》。  基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组,从而大大加速植物育种进

科研人员建立植物基因组引导编辑技术体系

  基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组,从而大大加速植物育种的进程,是实现作物精准育种的重要技术突破。然而,作物的许多重要农艺性状是由基因组中的单个或少数核苷酸的改变或突变造成的。基于CRISPR/Cas系统的基因组编辑,可利用外源修复模板通过同源重组介导的修复方式(HDR)实现目标基因特定核苷酸

以自然为师-基因敲高获突破

  近日,中国农业大学植物保护学院姜临建与青岛清原化合物有限公司李华荣、中科院分子植物科学卓越创新中心朱健康、贵州大学宋宝安等研究人员开展合作,报道了一种“基因敲高”的新策略。11月15日,相关论文发表于《自然—植物》。  研究人员表示,这项研究进一步深化了对基因编辑工具的认知和理解。基因编辑创制基

遗传发育所在作物基因组单碱基编辑方法研究中取得进展

  单核苷酸点突变是作物许多重要农艺性状发生变异的遗传基础。单碱基的变异会导致氨基酸替换或蛋白质翻译终止,使基因功能发生改变,从而有可能产生优良的等位基因与优异性状。传统诱变及单碱基突变筛选技术(如TILLING)需要进行基因组规模的筛选,耗时、耗力且鉴定到的点突变数目和种类有限。基因组编辑技术,特

糖基化酶碱基编辑器的机器学习研究中获进展

  碱基编辑技术可实现精确的碱基转换,当前,有三类碱基编辑器被广泛应用,包括胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor,CBE)、腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor,ABE)、糖基化酶碱基编辑器(glycosylase base editor,GBE)。  20