国家生物信息中心合作发布面向流感病毒的基因组语言模型
近日,国家生物信息中心正式发布了面向流感病毒的基因组语言模型Influ-BERT。该模型基于Transformer架构,针对流感病毒基因组特征进行了深度优化,为流感病毒亚型鉴定、致病性预测等应用提供了一种高效、智能的计算解决方案。甲型流感病毒具有宿主范围广、抗原变异频繁等特点,对全球公共卫生构成持续威胁。传统的亚型鉴定方法在处理低频亚型或片段缺失数据时存在局限性。为此,研究团队收集并整合了约90万条流感病毒基因组序列构建专用语料库,以Transformer架构为核心,开发了定制化的Byte Pair Encoding(BPE)分词器,并针对词表大小进行专门优化。通过实施领域自适应预训练与任务特定微调的分阶段策略,Influ-BERT成功填补了通用基因组模型与流感特定领域知识之间的语义鸿沟,实现了对流感病毒基因组的精准建模。在性能评估中,Influ-BERT展现出优于传统的机器学习算法和通用基因组大模型的表征学习能力,实现了低频亚......阅读全文
英伟达推出生成式AI药物发现平台开启新布局
人工智能计算领导者英伟达(NVIDIA)在过去的一年里接连投资几家AI药物开发公司,其在药物开发领域的雄心壮志正在成为全世界的焦点。 日前,英伟达宣布了三项新举措,其中包括与安进(Amgen)子公司deCode进行新的合作。英伟达表示,deCode将利用英伟达的超级计算机和BioNeMo生成式人工智
新算法将物理问题转化为量子语言
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515050.shtm科技日报讯 (记者刘霞)谷歌公司科学家设计出一种算法,可将复杂的物理问题转化为量子物理学的语言,这可能使量子计算机变得更有用。相关论文发表于最近的《物理评论X》杂志。 新成果
语言型验电器的相关设计原理介绍
语言式高压验电器属于高压验电工具,由信号仪配用高压绝缘杆组成。 在验电时,信号仪可以自动检测带电体的电磁强度来确定被测导体是否带电,并且自动启动语音电路和灯光指示。 不同电压等级的验电器配用相应电压等级的绝缘杆,它具有体积小﹑重量轻﹑使用简单﹑携带方便等特点。 广泛用于
多模态同步语言神经影像数据集发布
大脑在加工语言时,需要实时调动多个脑区的神经元进行协同工作。构建高时空分辨率的神经影像数据可以帮助我们更好地了解各个脑区以及脑区之间的协同合作,对于探索大脑的语言加工机制至关重要。当前已有的开源数据主要针对英文采集,只包括单一模态的神经影像数据,如高空间分辨率的功能核磁共振(fMRI)或高时间分
多模态同步语言神经影像数据集发布
大脑在加工语言时,需要实时调动多个脑区的神经元进行协同工作。构建高时空分辨率的神经影像数据可以帮助我们更好地了解各个脑区以及脑区之间的协同合作,对于探索大脑的语言加工机制至关重要。当前已有的开源数据主要针对英文采集,只包括单一模态的神经影像数据,如高空间分辨率的功能核磁共振(fMRI)或高时间分
中风后,抓住语言康复关键期
除高致死率外,脑卒中还具有高致残率和高复发率的特点。据报道,存活下来的卒中患者中,近3/4合并有不同程度的残疾。语言能力衰退甚至丧失,就是严重后遗症之一。 语言能力是大脑功能的重要体现,其中枢存在于大脑中,在大脑半球、小脑以及脑干等各部分都有分布,可协作完成语言从提取分析、思维形成,到言语活
自闭症研究需警惕冒犯性语言
自20世纪80年代自闭症有了“临床”定义以来的几十年里,许多人一直主张将自闭症理解为神经多样性谱系中的正常部分,而不是一个需要“解决”的“问题”。尽管如此,在研究文献中,自闭症经常被使用医学或病理学语言来描述。 为了减少自闭症研究对相关群体的负面影响,科学家在一项研究中阐述了研究者在工作中应
语言虚拟机内存管理研究取得进展
近日,中国科学院软件研究所科研团队在语言虚拟机内存管理方面取得进展,涉及垃圾回收(GC)算法的跨语言性能评估以及面向大数据系统的新型垃圾回收器设计。在现代编程语言中,GC负责自动管理内存分配和回收,其效率直接影响用户程序的性能。目前,学术界和工业界主要通过对比评估单一语言运行环境下的GC实现,来分析
PNAS:言简意赅——语言表达的共同目的
这里有一个简单的问题:下面2个句子哪个表达的意思更明确? 1. "John threw out the old trash sitting in the kitchen." 2. "John threw the old trash sitting in the kitchen out."
草原土拨鼠有复杂语言-甚至超过人类
最新科学研究显示,草原土拨鼠可能拥有仅次于人类的语言能力,甚至 超过人类的灵长类近亲和海豚等高智商动物,这一结果令许多野生动物专家大跌眼镜。 据英国《每日电讯报》23日报道,美国北亚利桑那大学的一位生物学家发现,土拨鼠的叫声包含着丰富内容,可以描述颜色、大小、前进的方向
机器学习分析出语言多样性成因
人类至少有7000多种不同的语言,这种多样性强加了社会界限,对我们的认知和经济生活、思考方式以及人们之间的互动都产生了深远影响。 瑞士苏黎世大学(UZH)的研究人员在《英国皇家学会学报B》上发表文章称,他们在大型数据集上运用机器学习技术证明,当前的语言多样性在很大程度上是由于过去10000年过
蛋白质工程拓展免疫细胞语言
根据世界卫生组织统计,每年约600万人死于败血症,这些数字令人担忧。这种俗称“血液中毒”的疾病通常始于无害的感染。 一旦触发免疫系统过度反应,自身组织就会受到攻击和损伤。过度反应最终会导致危及生命的防御系统全面崩溃。仅在德国,死于败血症的人数就超过了艾滋病、结肠癌和乳腺癌的总和! 世界各地的
AI通过儿童眼睛和耳朵学习语言
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517076.shtm ?戴着头戴式摄像头的孩子捕捉到的视频帧。图片来源:纽约大学数据科学中心美国纽约大学研究人员开展了一项实验,他们通过一个孩子的眼睛和耳朵来训练多模式人工智能(AI)系统,使
鲁白:在科学殿堂,工作语言就是英语
在中国举办国际会议的工作语言问题,一直令组织者们头疼 究竟该使用中文还是英文作为工作语言,一直是令近年来在中国境内举办国际学术会议的组织者们头疼的问题,最近召开的2007生命科学前沿学术研讨会同样遇到这个问题。在会议召开前夕的媒体见面会上,大会组委会成员鲁白明确表示,“进入科学殿堂,工作语言就是英
雪貂基因组测序加深人类疾病研究
近日,一个国际研究团队进行了雪貂基因组测序,他们认为这将巩固雪貂作为研究人类呼吸道疾病如流感和囊性纤维化的生物模型。 研究人员检查了雪貂感染大范围流感病毒后基因随着时间推移的不同表达,通过研究囊性纤维化雪貂模型反映了人类疾病的发展。 基因分析中心的合著人Federica Di Palm
北京基因组所召开生物计算研讨会
10月27日下午,中国科学院北京基因组所组织召开了“北京基因组研究所计算生物学研讨会”,会议由所长吴仲义主持,书记杨卫平、副所长李俊雄、基因组所生物信息研究人员以及科技处相关人员参加了会议。 研讨会上,与会学者就目前计算生物学领域中涉及如何运用大规模高效的理论模型和数
测序仪巨头推出AI算法,预测致病基因突变
ChatGPT等大模型点燃人工智能新一轮热潮之际,另一种累积数百万年的天书般“语言”也在试图用该技术获得最新解码。近日,全球基因测序仪龙头因美纳(Illumina)宣布推出全新的人工智能算法PrimateAI-3D,以求更准确地预测患者致病基因突变。据美国国家卫生研究院发布的数据,每年生成的基因组数
科学家揭示心血管疾病家兔模型的基因组和转录组特征
6月1日,由中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组、美国密歇根大学医学中心和日本山梨大学分子病理系等单位研究人员合作完成的论文“Hyperlipidemia-associated gene variations and expression patterns revealed
除了指数增长模型和逻辑斯蒂增长模型,还有哪些增长模型?
除了指数增长模型和逻辑斯蒂增长模型,还有以下一些增长模型: **一、Gompertz 增长模型** 1. 特点: - Gompertz 模型也是描述种群增长的一种模型,其增长曲线也呈“S”型。与逻辑斯蒂增长模型相比,Gompertz 模型在初期增长相对较慢,然后逐渐加速,最后增长速度
港中大研发精准计算模型预测病毒基因演变
香港中文大学(港中大)2日公布,港中大医学院研究团队建立了一套精准计算模型“beth-1”,能准确预测病毒基因演变,有助在设计流感疫苗时选择最具代表性的病毒株。港中大医学院表示,流感病毒会持续出现基因进化演变,导致免疫逃脱,令已经感染过病毒或打过疫苗的人可能再次感染突变后的病毒,造成新的季节性流感高
我国在疫苗研发领域获重大突破-病毒可直接转化为疫苗
在国家科技重大专项、原973计划、自然科学基金的持续支持下,由北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室承当的“基于基因密码子扩展技术的新型人生长激素药物研究”取得突破性进展,课题组以流感病毒为模型,发明出人工控制病毒复制从而将病毒直接转化为疫苗的技术,即在保留病毒完整结构和感染力的情况下,
AI新模型精准预测细胞内基因活动
哥伦比亚大学瓦格洛斯内外科医学院团队开发了一种创新的人工智能(AI)模型——通用表达转换器(GET),该模型能够精确预测人类细胞内的基因活动,为理解细胞内部工作机制提供了全新视角。这项突破性成果可帮助科学家以前所未有的方式,探索从癌症到遗传疾病等一系列健康问题,推动医学研究向前迈进一大步。相关论文发
AI新模型精准预测细胞内基因活动
哥伦比亚大学瓦格洛斯内外科医学院团队开发了一种创新的人工智能(AI)模型——通用表达转换器(GET),该模型能够精确预测人类细胞内的基因活动,为理解细胞内部工作机制提供了全新视角。这项突破性成果可帮助科学家以前所未有的方式,探索从癌症到遗传疾病等一系列健康问题,推动医学研究向前迈进一大步。相关论文发
当ChatGPT遇上CRISPR
在探索CRISPR基因编辑系统的过程中,研究人员从温泉、泥炭沼泽、粪便甚至酸奶中搜寻各种微生物。现在,由于生成式人工智能的进步,他们可能只需按一下按钮就能设计出这些系统。 据《自然》报道,日前,研究人员公布了他们使用一种名为蛋白质语言模型的生成式人工智能工具,设计CRISPR基因编辑蛋白质的细
AI已能编写基因组,距离人造生命还有多久
2008年,研究人员报道了全球首个活体生物的人工合成基因组。他们通过化学方法合成了生殖支原体长达58万个核苷酸的基因组。后续研究又在细胞中“重启”了这类基因组,创造出科学家宣称的首例人工合成生命。 如今,研究人员已使用人工智能(AI)从头设计出完整的基因组序列,其中包括一个以生殖支原体为蓝本的
AI设计能提高蛋白质稳定性、精确度及效率
人工智能(AI)蛋白质设计正在走向“更快、更好、更强”。美国麻省总医院布莱根分院和贝斯以色列女执事医疗中心团队开发了一款名为EVOLVEpro的AI工具,被认为是蛋白质工程领域的一项重大突破。团队在最新一期《科学》杂志上展示了通过该工具设计的6种具有不同用途的蛋白质,证明了EVOLVEpro能够提高
A型流感病毒的病毒特性
1、易感性 对于流感病毒,人群普遍易感,感染或接种疫苗后1周出现抗体,2~3周达高峰,1~2个月后开始下降,1年左右降至较低水平,流感病毒3个型别之间无交叉免疫。 2、季节性 同许多其它的呼吸系统病毒性疾病相似,流感也是一种季节性疾病,它在夏季的发病率较低,冬季的发病率较高,但在某些地方这
怎样预防小儿流感病毒肺炎?
对流感病毒肺炎的预防,应先预防流感,掌握国内外疫情和病毒变异动态,人群免疫力状态,有利于疫情侦察,以便及时采取预防措施,加强卫生宣传教育,力争做到五早,即早发现、早诊断、早报告、早隔离、早治疗,同时尽力减少传播的机会,在流感流行期间,避免进入人员拥挤场所,患者的鼻咽分泌物及其污染物应随时消毒,可
禽流感病毒RNA提取protocol
1,用异硫氰酸胍提取1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时,另取同样多eppendorf管,加入400ul -20度预冷的异丙
甲型流感病毒的特性
易感性 对于流感病毒,人群普遍易感,感染或接种疫苗后1周出现抗体,2~3周达高峰,1~2个月后开始下降,1年左右降至较低水平,流感病毒3个型别之间无交叉免疫。 季节性 同许多其它的呼吸系统病毒性疾病相似,流感也是一种季节性疾病,它在夏季的发病率较低,冬季的发病率较高,但在某些地方这种病毒一